MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_009633	ATCCA	2	10	4641203	4641212	40 %	20 %	0 %	40 %	150392213
105002	NC_009633	ACC	2	6	4641317	4641322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392213
105003	NC_009633	TACAGC	2	12	4641356	4641367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392213
105004	NC_009633	CCA	2	6	4641387	4641392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392213
105005	NC_009633	CAG	2	6	4641460	4641465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392213
105006	NC_009633	TAA	2	6	4641475	4641480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392213
105007	NC_009633	AAT	3	9	4641584	4641592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392213
105008	NC_009633	AATAA	2	10	4641615	4641624	80 %	20 %	0 %	0 %	150392213
105009	NC_009633	CTG	2	6	4641718	4641723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392213
105010	NC_009633	ATA	2	6	4641754	4641759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392213
105011	NC_009633	CCA	3	9	4641762	4641770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392213
105012	NC_009633	CA	3	6	4641769	4641774	50 %	0 %	0 %	50 %	150392213
105013	NC_009633	TGC	2	6	4641806	4641811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392213
105014	NC_009633	TGTAAA	2	12	4641884	4641895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392213
105015	NC_009633	AATT	2	8	4641920	4641927	50 %	50 %	0 %	0 %	150392213
105016	NC_009633	CT	3	6	4641944	4641949	0 %	50 %	0 %	50 %	150392213
105017	NC_009633	ACG	2	6	4641987	4641992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392213
105018	NC_009633	CT	3	6	4642051	4642056	0 %	50 %	0 %	50 %	150392213
105019	NC_009633	TAAT	2	8	4642075	4642082	50 %	50 %	0 %	0 %	150392213
105020	NC_009633	AGC	2	6	4642097	4642102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392213
105021	NC_009633	TAA	2	6	4642211	4642216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392213
105022	NC_009633	CCT	2	6	4642224	4642229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150392213
105023	NC_009633	CAA	2	6	4642237	4642242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392213
105024	NC_009633	GCA	2	6	4642248	4642253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392213
105025	NC_009633	ATG	2	6	4642269	4642274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392213
105026	NC_009633	TAA	2	6	4642318	4642323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392213
105027	NC_009633	T	7	7	4642359	4642365	0 %	100 %	0 %	0 %	150392214
105028	NC_009633	T	6	6	4642381	4642386	0 %	100 %	0 %	0 %	150392214
105029	NC_009633	AATTC	2	10	4642500	4642509	40 %	40 %	0 %	20 %	150392214
105030	NC_009633	CT	4	8	4642534	4642541	0 %	50 %	0 %	50 %	150392214
105031	NC_009633	CTTTA	2	10	4642622	4642631	20 %	60 %	0 %	20 %	150392214
105032	NC_009633	GAA	2	6	4642639	4642644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392214
105033	NC_009633	TTC	2	6	4642713	4642718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392214
105034	NC_009633	TG	3	6	4642725	4642730	0 %	50 %	50 %	0 %	150392214
105035	NC_009633	TAA	2	6	4642735	4642740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392214
105036	NC_009633	TTAC	2	8	4642773	4642780	25 %	50 %	0 %	25 %	150392214
105037	NC_009633	TCA	2	6	4642797	4642802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392214
105038	NC_009633	CAT	2	6	4642843	4642848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392214
105039	NC_009633	CCA	2	6	4642914	4642919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392214
105040	NC_009633	CCA	2	6	4642929	4642934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392214
105041	NC_009633	CTT	2	6	4642978	4642983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392214
105042	NC_009633	ATTCCA	2	12	4643013	4643024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392214
105043	NC_009633	AGC	2	6	4643057	4643062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392214
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105045	NC_009633	T	6	6	4643256	4643261	0 %	100 %	0 %	0 %	150392214
105046	NC_009633	TCC	2	6	4643291	4643296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150392214
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105050	NC_009633	TCT	2	6	4643469	4643474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392214
105051	NC_009633	CTG	2	6	4643560	4643565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392214
105052	NC_009633	TTA	2	6	4643622	4643627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392214
105053	NC_009633	ACT	2	6	4643676	4643681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392214
105054	NC_009633	CT	3	6	4643680	4643685	0 %	50 %	0 %	50 %	150392214
105055	NC_009633	AAGC	2	8	4643687	4643694	50 %	0 %	25 %	25 %	150392214
105056	NC_009633	A	6	6	4643919	4643924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105057	NC_009633	CCT	2	6	4643925	4643930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105058	NC_009633	TCATT	2	10	4643931	4643940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105059	NC_009633	ATT	2	6	4643944	4643949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105060	NC_009633	A	6	6	4644004	4644009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105061	NC_009633	A	6	6	4644021	4644026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105062	NC_009633	TTTAC	2	10	4644070	4644079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105063	NC_009633	AATT	2	8	4644106	4644113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105064	NC_009633	TAAT	2	8	4644154	4644161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105065	NC_009633	ATT	2	6	4644175	4644180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105066	NC_009633	ACTT	2	8	4644185	4644192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105067	NC_009633	ATT	2	6	4644203	4644208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105068	NC_009633	T	7	7	4644260	4644266	0 %	100 %	0 %	0 %	150392215
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105070	NC_009633	TAGCT	2	10	4644302	4644311	20 %	40 %	20 %	20 %	150392215
105071	NC_009633	T	7	7	4644360	4644366	0 %	100 %	0 %	0 %	150392215
105072	NC_009633	ATT	2	6	4644401	4644406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392215
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105098	NC_009633	TCTT	2	8	4645614	4645621	0 %	75 %	0 %	25 %	150392215
105099	NC_009633	CCT	2	6	4645648	4645653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105100	NC_009633	CAT	2	6	4645660	4645665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105101	NC_009633	TAT	2	6	4645678	4645683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105102	NC_009633	TTA	2	6	4645711	4645716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392216
105103	NC_009633	A	6	6	4645755	4645760	100 %	0 %	0 %	0 %	150392216
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105106	NC_009633	CAC	2	6	4645858	4645863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392216
105107	NC_009633	CTT	2	6	4645908	4645913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392216
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105111	NC_009633	TCAA	2	8	4646009	4646016	50 %	25 %	0 %	25 %	150392216
105112	NC_009633	AG	3	6	4646018	4646023	50 %	0 %	50 %	0 %	150392216
105113	NC_009633	TGT	2	6	4646058	4646063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392216
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105115	NC_009633	T	6	6	4646143	4646148	0 %	100 %	0 %	0 %	150392216
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105117	NC_009633	AGG	2	6	4646263	4646268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150392216
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105133	NC_009633	AC	3	6	4646890	4646895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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105219	NC_009633	TAA	2	6	4651114	4651119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392222
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105230	NC_009633	T	8	8	4651830	4651837	0 %	100 %	0 %	0 %	150392222
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