MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_009633	A	6	6	4548091	4548096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103002	NC_009633	TAA	2	6	4548176	4548181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103003	NC_009633	TTA	3	9	4548220	4548228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103004	NC_009633	TA	3	6	4548232	4548237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103005	NC_009633	AGG	2	6	4548258	4548263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103006	NC_009633	CAG	2	6	4548359	4548364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392114
103007	NC_009633	AAAAT	2	10	4548389	4548398	80 %	20 %	0 %	0 %	150392114
103008	NC_009633	AAG	2	6	4548467	4548472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392114
103009	NC_009633	CAG	2	6	4548486	4548491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392114
103010	NC_009633	TCA	2	6	4548506	4548511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392114
103011	NC_009633	AAG	2	6	4548518	4548523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392114
103012	NC_009633	GAA	2	6	4548576	4548581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392114
103013	NC_009633	T	6	6	4548582	4548587	0 %	100 %	0 %	0 %	150392114
103014	NC_009633	T	6	6	4548591	4548596	0 %	100 %	0 %	0 %	150392114
103015	NC_009633	ATA	2	6	4548725	4548730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392114
103016	NC_009633	TCA	2	6	4548804	4548809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392114
103017	NC_009633	C	6	6	4548872	4548877	0 %	0 %	0 %	100 %	150392114
103018	NC_009633	TCAA	2	8	4548884	4548891	50 %	25 %	0 %	25 %	150392114
103019	NC_009633	TAA	2	6	4548909	4548914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392114
103020	NC_009633	GCT	2	6	4548948	4548953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392114
103021	NC_009633	CAT	2	6	4549018	4549023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392114
103022	NC_009633	ACA	2	6	4549068	4549073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392114
103023	NC_009633	TTG	3	9	4549079	4549087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392114
103024	NC_009633	TATGAA	2	12	4549146	4549157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392114
103025	NC_009633	GAT	2	6	4549165	4549170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392114
103026	NC_009633	ATC	2	6	4549188	4549193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392114
103027	NC_009633	TTA	2	6	4549202	4549207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103028	NC_009633	AGA	2	6	4549219	4549224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103029	NC_009633	CTT	2	6	4549237	4549242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103030	NC_009633	ATT	2	6	4549252	4549257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103031	NC_009633	TTCT	2	8	4549261	4549268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103032	NC_009633	ACT	2	6	4549277	4549282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103033	NC_009633	TA	4	8	4549295	4549302	50 %	50 %	0 %	0 %	150392115
103034	NC_009633	TGT	2	6	4549354	4549359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392115
103035	NC_009633	ATCT	2	8	4549526	4549533	25 %	50 %	0 %	25 %	150392115
103036	NC_009633	AATCCC	2	12	4549578	4549589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150392115
103037	NC_009633	TGGA	2	8	4549597	4549604	25 %	25 %	50 %	0 %	150392115
103038	NC_009633	ATC	2	6	4549606	4549611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392115
103039	NC_009633	CATA	2	8	4549628	4549635	50 %	25 %	0 %	25 %	150392115
103040	NC_009633	AT	3	6	4549783	4549788	50 %	50 %	0 %	0 %	150392115
103041	NC_009633	CTA	2	6	4549814	4549819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392115
103042	NC_009633	ATA	2	6	4549854	4549859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392115
103043	NC_009633	GAT	2	6	4549884	4549889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392115
103044	NC_009633	TTA	2	6	4549891	4549896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392115
103045	NC_009633	CTTC	2	8	4549964	4549971	0 %	50 %	0 %	50 %	150392115
103046	NC_009633	A	6	6	4550067	4550072	100 %	0 %	0 %	0 %	150392115
103047	NC_009633	CTT	2	6	4550123	4550128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392115
103048	NC_009633	ATC	2	6	4550152	4550157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392115
103049	NC_009633	TAC	2	6	4550216	4550221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392115
103050	NC_009633	TCTT	2	8	4550224	4550231	0 %	75 %	0 %	25 %	150392115
103051	NC_009633	CTA	2	6	4550246	4550251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392115
103052	NC_009633	TTG	2	6	4550281	4550286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392115
103053	NC_009633	ATC	2	6	4550301	4550306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392115
103054	NC_009633	TA	3	6	4550320	4550325	50 %	50 %	0 %	0 %	150392115
103055	NC_009633	TTA	2	6	4550480	4550485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392115
103056	NC_009633	TTGC	2	8	4550499	4550506	0 %	50 %	25 %	25 %	150392115
103057	NC_009633	TC	3	6	4550518	4550523	0 %	50 %	0 %	50 %	150392115
103058	NC_009633	AG	3	6	4550529	4550534	50 %	0 %	50 %	0 %	150392115
103059	NC_009633	AAT	2	6	4550551	4550556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392115
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103067	NC_009633	CT	3	6	4550860	4550865	0 %	50 %	0 %	50 %	150392115
103068	NC_009633	CAT	2	6	4550900	4550905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392115
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103073	NC_009633	TGA	2	6	4551095	4551100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392115
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103077	NC_009633	TAA	2	6	4551287	4551292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392115
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103082	NC_009633	ATA	2	6	4551676	4551681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103083	NC_009633	TAT	2	6	4551705	4551710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103084	NC_009633	T	6	6	4551716	4551721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103085	NC_009633	T	7	7	4551756	4551762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103086	NC_009633	ATAA	2	8	4551765	4551772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103089	NC_009633	TGT	2	6	4552007	4552012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392116
103090	NC_009633	CTG	2	6	4552021	4552026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392116
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103100	NC_009633	TGTT	2	8	4552324	4552331	0 %	75 %	25 %	0 %	150392116
103101	NC_009633	GTT	4	12	4552329	4552340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392116
103102	NC_009633	CTG	2	6	4552360	4552365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392116
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103105	NC_009633	TGT	2	6	4552403	4552408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392116
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103109	NC_009633	TTGT	2	8	4552467	4552474	0 %	75 %	25 %	0 %	150392116
103110	NC_009633	ACT	2	6	4552505	4552510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392116
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103112	NC_009633	TCC	2	6	4552593	4552598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103113	NC_009633	ATTT	2	8	4552606	4552613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103114	NC_009633	TA	3	6	4552655	4552660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103115	NC_009633	T	7	7	4552678	4552684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103116	NC_009633	AAT	2	6	4552744	4552749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103118	NC_009633	T	6	6	4552814	4552819	0 %	100 %	0 %	0 %	150392117
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103233	NC_009633	CTGT	2	8	4558066	4558073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103234	NC_009633	T	6	6	4558081	4558086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103235	NC_009633	AAT	2	6	4558095	4558100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392124
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103240	NC_009633	TCA	3	9	4558215	4558223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392124
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103471	NC_009633	CTT	2	6	4568627	4568632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392140
103472	NC_009633	CTT	2	6	4568636	4568641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392140
103473	NC_009633	AAG	2	6	4568676	4568681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392140
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103489	NC_009633	TCT	2	6	4569205	4569210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392141
103490	NC_009633	CGCCAC	2	12	4569249	4569260	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	150392141
103491	NC_009633	CAG	2	6	4569291	4569296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392141
103492	NC_009633	CTTTT	2	10	4569327	4569336	0 %	80 %	0 %	20 %	150392141
103493	NC_009633	CTT	2	6	4569339	4569344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392141
103494	NC_009633	CCT	2	6	4569392	4569397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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103496	NC_009633	CAA	2	6	4569475	4569480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392142
103497	NC_009633	CCTAA	2	10	4569596	4569605	40 %	20 %	0 %	40 %	150392143
103498	NC_009633	TTC	2	6	4569609	4569614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392143
103499	NC_009633	GTT	2	6	4569702	4569707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392143
103500	NC_009633	CCA	2	6	4569772	4569777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392143

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