MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75502	NC_009633	GCTA	2	8	3321480	3321487	25 %	25 %	25 %	25 %	150391016
75503	NC_009633	TTA	2	6	3321626	3321631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150391016
75504	NC_009633	GCT	2	6	3321643	3321648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150391016
75505	NC_009633	GTA	2	6	3321713	3321718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150391016
75506	NC_009633	AAT	2	6	3321730	3321735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150391016
75507	NC_009633	AAT	2	6	3321741	3321746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150391016
75508	NC_009633	CTAGT	2	10	3321767	3321776	20 %	40 %	20 %	20 %	150391016
75509	NC_009633	TTC	2	6	3321792	3321797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150391016
75510	NC_009633	CT	3	6	3321806	3321811	0 %	50 %	0 %	50 %	150391016
75511	NC_009633	TAT	2	6	3321816	3321821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150391016
75512	NC_009633	TTG	2	6	3321822	3321827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150391016
75513	NC_009633	ATA	2	6	3321856	3321861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150391016
75514	NC_009633	TAT	2	6	3321885	3321890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150391016
75515	NC_009633	AAGCT	2	10	3321911	3321920	40 %	20 %	20 %	20 %	150391016
75516	NC_009633	AAT	2	6	3321952	3321957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150391016
75517	NC_009633	ATG	2	6	3322000	3322005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150391016
75518	NC_009633	TCC	2	6	3322007	3322012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75519	NC_009633	TAC	2	6	3322053	3322058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75520	NC_009633	GTA	2	6	3322066	3322071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75521	NC_009633	TTA	2	6	3322082	3322087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75522	NC_009633	CT	3	6	3322151	3322156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75523	NC_009633	TAT	2	6	3322216	3322221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75524	NC_009633	TAA	2	6	3322354	3322359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75525	NC_009633	AAT	2	6	3322368	3322373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75526	NC_009633	AGTT	2	8	3322392	3322399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75527	NC_009633	ATG	2	6	3322433	3322438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150391017
75528	NC_009633	TATGGA	2	12	3322442	3322453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150391017
75529	NC_009633	TAG	2	6	3322491	3322496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150391017
75530	NC_009633	TA	3	6	3322504	3322509	50 %	50 %	0 %	0 %	150391017
75531	NC_009633	TGG	2	6	3322561	3322566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150391017
75532	NC_009633	ATG	2	6	3322569	3322574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150391017
75533	NC_009633	AGG	2	6	3322661	3322666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75534	NC_009633	ATA	2	6	3322681	3322686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75535	NC_009633	GAA	2	6	3322731	3322736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75536	NC_009633	GAT	2	6	3322839	3322844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75537	NC_009633	ACA	2	6	3322850	3322855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75538	NC_009633	T	6	6	3322969	3322974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75539	NC_009633	ATT	2	6	3322980	3322985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75540	NC_009633	TA	3	6	3323010	3323015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75541	NC_009633	GTA	2	6	3323045	3323050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75542	NC_009633	A	6	6	3323067	3323072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75543	NC_009633	A	7	7	3323136	3323142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75544	NC_009633	GCTTT	2	10	3323150	3323159	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75545	NC_009633	ATATT	2	10	3323230	3323239	40 %	60 %	0 %	0 %	150391018
75546	NC_009633	CTG	2	6	3323277	3323282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150391018
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75548	NC_009633	ACCT	2	8	3323507	3323514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75549	NC_009633	TTC	2	6	3323515	3323520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75550	NC_009633	AG	3	6	3323536	3323541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75551	NC_009633	ATG	2	6	3323573	3323578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75552	NC_009633	TC	3	6	3323583	3323588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75553	NC_009633	T	6	6	3323641	3323646	0 %	100 %	0 %	0 %	150391019
75554	NC_009633	ATAA	2	8	3323741	3323748	75 %	25 %	0 %	0 %	150391019
75555	NC_009633	TAT	2	6	3323751	3323756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150391019
75556	NC_009633	AAT	2	6	3323772	3323777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150391019
75557	NC_009633	TTGA	2	8	3323813	3323820	25 %	50 %	25 %	0 %	150391019
75558	NC_009633	ATA	2	6	3323825	3323830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150391019
75559	NC_009633	CAT	2	6	3323934	3323939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150391019
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75561	NC_009633	GCT	2	6	3324065	3324070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150391019
75562	NC_009633	TTA	2	6	3324077	3324082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150391019
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75568	NC_009633	TTTC	2	8	3324276	3324283	0 %	75 %	0 %	25 %	150391019
75569	NC_009633	T	6	6	3324384	3324389	0 %	100 %	0 %	0 %	150391019
75570	NC_009633	T	6	6	3324392	3324397	0 %	100 %	0 %	0 %	150391019
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75588	NC_009633	T	8	8	3325695	3325702	0 %	100 %	0 %	0 %	150391019
75589	NC_009633	CCAT	2	8	3325760	3325767	25 %	25 %	0 %	50 %	150391019
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75605	NC_009633	AAT	2	6	3326298	3326303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75608	NC_009633	TA	3	6	3326483	3326488	50 %	50 %	0 %	0 %	150391021
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75611	NC_009633	TTA	2	6	3326661	3326666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150391021
75612	NC_009633	AT	3	6	3326673	3326678	50 %	50 %	0 %	0 %	150391021
75613	NC_009633	TAA	3	9	3326681	3326689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150391021
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