MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009484	CGGT	2	8	140846	140853	0 %	25 %	50 %	25 %	148259148
3502	NC_009484	TGA	2	6	140874	140879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259148
3503	NC_009484	GCG	2	6	140970	140975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259148
3504	NC_009484	CGG	2	6	141005	141010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259148
3505	NC_009484	G	6	6	141018	141023	0 %	0 %	100 %	0 %	148259148
3506	NC_009484	TGC	2	6	141030	141035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259148
3507	NC_009484	CGA	2	6	141037	141042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259148
3508	NC_009484	GAAA	2	8	141084	141091	75 %	0 %	25 %	0 %	148259149
3509	NC_009484	GCG	2	6	141100	141105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3510	NC_009484	CGA	2	6	141152	141157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259149
3511	NC_009484	TCG	2	6	141205	141210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259149
3512	NC_009484	CCAG	2	8	141211	141218	25 %	0 %	25 %	50 %	148259149
3513	NC_009484	CGG	2	6	141239	141244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3514	NC_009484	GTG	2	6	141246	141251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259149
3515	NC_009484	CG	3	6	141263	141268	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3516	NC_009484	TGC	2	6	141283	141288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259149
3517	NC_009484	CG	3	6	141303	141308	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3518	NC_009484	GGC	3	9	141311	141319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3519	NC_009484	GCC	2	6	141351	141356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3520	NC_009484	CGGC	2	8	141358	141365	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3521	NC_009484	CGG	2	6	141377	141382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3522	NC_009484	AGC	2	6	141422	141427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259149
3523	NC_009484	CG	3	6	141476	141481	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3524	NC_009484	CGG	2	6	141494	141499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3525	NC_009484	CCG	2	6	141504	141509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3526	NC_009484	TGC	2	6	141526	141531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259149
3527	NC_009484	CGG	2	6	141539	141544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3528	NC_009484	CAC	2	6	141596	141601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259149
3529	NC_009484	CGGC	2	8	141613	141620	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3530	NC_009484	CGG	2	6	141665	141670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3531	NC_009484	GCC	2	6	141690	141695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3532	NC_009484	AGGGC	2	10	141698	141707	20 %	0 %	60 %	20 %	148259149
3533	NC_009484	GGCC	2	8	141738	141745	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3534	NC_009484	CCG	2	6	141778	141783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3535	NC_009484	CG	3	6	141823	141828	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3536	NC_009484	TCGCCT	2	12	141844	141855	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148259149
3537	NC_009484	GGT	2	6	141866	141871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259149
3538	NC_009484	TGC	2	6	141910	141915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259149
3539	NC_009484	GGT	2	6	141929	141934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259149
3540	NC_009484	CGG	2	6	141941	141946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3541	NC_009484	CGC	2	6	141950	141955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3542	NC_009484	CAA	2	6	141956	141961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259149
3543	NC_009484	GC	3	6	141968	141973	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3544	NC_009484	TGC	2	6	141989	141994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259149
3545	NC_009484	CGC	2	6	142013	142018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3546	NC_009484	CCG	2	6	142020	142025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3547	NC_009484	GCG	2	6	142065	142070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
3548	NC_009484	GC	3	6	142082	142087	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3549	NC_009484	CGC	2	6	142094	142099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259149
3550	NC_009484	GCCG	2	8	142120	142127	0 %	0 %	50 %	50 %	148259149
3551	NC_009484	CG	3	6	142375	142380	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3552	NC_009484	GCTC	2	8	142404	142411	0 %	25 %	25 %	50 %	148259150
3553	NC_009484	TCCGT	2	10	142415	142424	0 %	40 %	20 %	40 %	148259150
3554	NC_009484	GCTC	2	8	142515	142522	0 %	25 %	25 %	50 %	148259150
3555	NC_009484	TAT	2	6	142600	142605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148259150
3556	NC_009484	TGG	2	6	142637	142642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259150
3557	NC_009484	CG	4	8	142676	142683	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3558	NC_009484	GCC	2	6	142723	142728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3559	NC_009484	TGC	2	6	142737	142742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3560	NC_009484	TCGG	2	8	142760	142767	0 %	25 %	50 %	25 %	148259150
3561	NC_009484	CGC	2	6	142770	142775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3562	NC_009484	CGC	2	6	142902	142907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3563	NC_009484	CCG	2	6	142926	142931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3564	NC_009484	CGA	2	6	142983	142988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3565	NC_009484	CCG	2	6	143018	143023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3566	NC_009484	CGTG	2	8	143028	143035	0 %	25 %	50 %	25 %	148259150
3567	NC_009484	CG	3	6	143103	143108	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3568	NC_009484	CGC	2	6	143117	143122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3569	NC_009484	CGA	2	6	143169	143174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3570	NC_009484	ACG	2	6	143218	143223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3571	NC_009484	T	8	8	143259	143266	0 %	100 %	0 %	0 %	148259150
3572	NC_009484	TCC	2	6	143288	143293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259150
3573	NC_009484	GCC	2	6	143294	143299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3574	NC_009484	TC	3	6	143319	143324	0 %	50 %	0 %	50 %	148259150
3575	NC_009484	GGC	2	6	143340	143345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259150
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3577	NC_009484	CGCGAT	2	12	143370	143381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3578	NC_009484	GAT	2	6	143388	143393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259150
3579	NC_009484	GCT	2	6	143453	143458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3580	NC_009484	ACCA	2	8	143467	143474	50 %	0 %	0 %	50 %	148259150
3581	NC_009484	GCT	2	6	143478	143483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3582	NC_009484	CTG	2	6	143527	143532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3583	NC_009484	ATC	2	6	143548	143553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259150
3584	NC_009484	CG	3	6	143587	143592	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3585	NC_009484	GGC	2	6	143598	143603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259150
3586	NC_009484	CGA	2	6	143637	143642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
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3588	NC_009484	GCGT	2	8	143657	143664	0 %	25 %	50 %	25 %	148259150
3589	NC_009484	CGC	2	6	143809	143814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3590	NC_009484	CTG	2	6	143848	143853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3591	NC_009484	CGA	2	6	143880	143885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3592	NC_009484	GC	3	6	143958	143963	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3593	NC_009484	CGG	2	6	144128	144133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259150
3594	NC_009484	GGTG	2	8	144134	144141	0 %	25 %	75 %	0 %	148259150
3595	NC_009484	ATC	2	6	144199	144204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259150
3596	NC_009484	ACG	2	6	144215	144220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3597	NC_009484	ATC	2	6	144307	144312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259150
3598	NC_009484	CGC	2	6	144318	144323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3599	NC_009484	CGGC	2	8	144347	144354	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3600	NC_009484	CCGGCA	2	12	144365	144376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148259150
3601	NC_009484	GC	3	6	144398	144403	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3602	NC_009484	ATCTTC	2	12	144466	144477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148259150
3603	NC_009484	GCA	2	6	144487	144492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3604	NC_009484	TCG	2	6	144539	144544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3605	NC_009484	TCG	2	6	144626	144631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3606	NC_009484	ACCG	2	8	144646	144653	25 %	0 %	25 %	50 %	148259150
3607	NC_009484	CCG	2	6	144665	144670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3608	NC_009484	CGC	2	6	144705	144710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
3609	NC_009484	TGG	2	6	144733	144738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259150
3610	NC_009484	CGG	2	6	144758	144763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259150
3611	NC_009484	GA	3	6	144835	144840	50 %	0 %	50 %	0 %	148259150
3612	NC_009484	CGG	2	6	144878	144883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_009484	GAGG	2	8	144887	144894	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_009484	CGG	2	6	144964	144969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259151
3615	NC_009484	GACC	2	8	144994	145001	25 %	0 %	25 %	50 %	148259151
3616	NC_009484	CGG	2	6	145014	145019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259151
3617	NC_009484	CGG	2	6	145027	145032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259151
3618	NC_009484	CAT	2	6	145042	145047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259151
3619	NC_009484	CT	3	6	145056	145061	0 %	50 %	0 %	50 %	148259151
3620	NC_009484	TTC	2	6	145154	145159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259151
3621	NC_009484	TCC	2	6	145188	145193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259151
3622	NC_009484	GCCA	2	8	145196	145203	25 %	0 %	25 %	50 %	148259151
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3741	NC_009484	TTGCG	2	10	149996	150005	0 %	40 %	40 %	20 %	148259153
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3851	NC_009484	C	6	6	154082	154087	0 %	0 %	0 %	100 %	148259155
3852	NC_009484	CGG	2	6	154096	154101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259155
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3857	NC_009484	CTG	2	6	154405	154410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259155
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3859	NC_009484	CGGT	2	8	154565	154572	0 %	25 %	50 %	25 %	148259155
3860	NC_009484	CGG	3	9	154614	154622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259155
3861	NC_009484	CGC	2	6	154636	154641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259155
3862	NC_009484	CG	3	6	154759	154764	0 %	0 %	50 %	50 %	148259155
3863	NC_009484	GATC	2	8	154776	154783	25 %	25 %	25 %	25 %	148259155
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3866	NC_009484	ATC	2	6	154853	154858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259155
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3988	NC_009484	TCT	2	6	159038	159043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259159
3989	NC_009484	ATCTTC	2	12	159100	159111	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148259159
3990	NC_009484	CGC	3	9	159126	159134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259159
3991	NC_009484	CCG	2	6	159172	159177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259160
3992	NC_009484	CG	3	6	159187	159192	0 %	0 %	50 %	50 %	148259160
3993	NC_009484	CGC	2	6	159245	159250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259160
3994	NC_009484	GCC	2	6	159267	159272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259160
3995	NC_009484	CTG	2	6	159305	159310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259160
3996	NC_009484	CCGC	2	8	159346	159353	0 %	0 %	25 %	75 %	148259160
3997	NC_009484	CGT	2	6	159398	159403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259160
3998	NC_009484	CCGACC	2	12	159463	159474	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148259160
3999	NC_009484	CGC	2	6	159497	159502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259160
4000	NC_009484	GC	3	6	159575	159580	0 %	0 %	50 %	50 %	148259160

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