MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_009484	GTC	2	6	646508	646513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259590
17503	NC_009484	CAT	2	6	646579	646584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259590
17504	NC_009484	AGC	2	6	646634	646639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259590
17505	NC_009484	GAT	2	6	646669	646674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259590
17506	NC_009484	GTTCG	2	10	646681	646690	0 %	40 %	40 %	20 %	148259590
17507	NC_009484	GCC	2	6	646696	646701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259590
17508	NC_009484	GAT	2	6	646707	646712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259590
17509	NC_009484	GAG	2	6	646756	646761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259590
17510	NC_009484	GAT	2	6	646765	646770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259590
17511	NC_009484	CTT	2	6	646780	646785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259590
17512	NC_009484	CTT	2	6	646819	646824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259590
17513	NC_009484	TCG	2	6	646949	646954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259590
17514	NC_009484	GGCG	2	8	646977	646984	0 %	0 %	75 %	25 %	148259590
17515	NC_009484	GGC	2	6	647043	647048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259590
17516	NC_009484	CAC	2	6	647092	647097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259590
17517	NC_009484	ATG	2	6	647113	647118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259590
17518	NC_009484	GA	3	6	647120	647125	50 %	0 %	50 %	0 %	148259590
17519	NC_009484	TCG	2	6	647135	647140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259590
17520	NC_009484	TCG	2	6	647153	647158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259590
17521	NC_009484	TGA	2	6	647178	647183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259590
17522	NC_009484	T	6	6	647299	647304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17523	NC_009484	A	6	6	647324	647329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17524	NC_009484	A	6	6	647342	647347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_009484	CGG	2	6	647379	647384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17526	NC_009484	GCCG	2	8	647407	647414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17527	NC_009484	AAAG	2	8	647501	647508	75 %	0 %	25 %	0 %	148259591
17528	NC_009484	CGG	2	6	647631	647636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259591
17529	NC_009484	AGG	2	6	647642	647647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259591
17530	NC_009484	TGG	2	6	647661	647666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259591
17531	NC_009484	GTCC	2	8	647694	647701	0 %	25 %	25 %	50 %	148259591
17532	NC_009484	TCG	2	6	647722	647727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259591
17533	NC_009484	GATCC	2	10	647746	647755	20 %	20 %	20 %	40 %	148259591
17534	NC_009484	GC	3	6	647814	647819	0 %	0 %	50 %	50 %	148259592
17535	NC_009484	CGA	2	6	647831	647836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17536	NC_009484	GAT	2	6	647865	647870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259592
17537	NC_009484	CAGC	2	8	647883	647890	25 %	0 %	25 %	50 %	148259592
17538	NC_009484	CTG	2	6	647988	647993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17539	NC_009484	GCA	2	6	648005	648010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17540	NC_009484	ACCAG	2	10	648014	648023	40 %	0 %	20 %	40 %	148259592
17541	NC_009484	AGC	3	9	648049	648057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17542	NC_009484	TGC	2	6	648064	648069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17543	NC_009484	CAG	2	6	648099	648104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17544	NC_009484	CCGG	2	8	648119	648126	0 %	0 %	50 %	50 %	148259592
17545	NC_009484	CAG	2	6	648132	648137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17546	NC_009484	CTG	2	6	648148	648153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17547	NC_009484	GCC	2	6	648210	648215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259592
17548	NC_009484	GCA	2	6	648293	648298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259592
17549	NC_009484	CGG	2	6	648413	648418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259592
17550	NC_009484	TTG	2	6	648571	648576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_009484	TG	3	6	648591	648596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_009484	ATAA	2	8	648617	648624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17553	NC_009484	GAT	2	6	648693	648698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259593
17554	NC_009484	TGC	2	6	648715	648720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259593
17555	NC_009484	CTC	2	6	648789	648794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259593
17556	NC_009484	GGC	2	6	648795	648800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259593
17557	NC_009484	TGC	2	6	648814	648819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259593
17558	NC_009484	CGG	2	6	648833	648838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259593
17559	NC_009484	GC	3	6	648873	648878	0 %	0 %	50 %	50 %	148259593
17560	NC_009484	ATC	2	6	648891	648896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259593
17561	NC_009484	CGA	2	6	648953	648958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259593
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17565	NC_009484	GCGG	2	8	649123	649130	0 %	0 %	75 %	25 %	148259593
17566	NC_009484	ACC	2	6	649152	649157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259593
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17572	NC_009484	TCG	2	6	649411	649416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259594
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17615	NC_009484	CGG	2	6	650804	650809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259594
17616	NC_009484	TCCGC	2	10	650822	650831	0 %	20 %	20 %	60 %	148259594
17617	NC_009484	CG	3	6	650858	650863	0 %	0 %	50 %	50 %	148259594
17618	NC_009484	GATC	2	8	650864	650871	25 %	25 %	25 %	25 %	148259594
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17982	NC_009484	GCA	3	9	661102	661110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259604
17983	NC_009484	TCGCGC	2	12	661111	661122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259604
17984	NC_009484	GGC	2	6	661123	661128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259604
17985	NC_009484	GGC	2	6	661132	661137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259604
17986	NC_009484	GTCGC	2	10	661159	661168	0 %	20 %	40 %	40 %	148259604
17987	NC_009484	TCA	2	6	661171	661176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259604
17988	NC_009484	TCG	2	6	661177	661182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259604
17989	NC_009484	CAC	2	6	661202	661207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259604
17990	NC_009484	CAG	2	6	661350	661355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259604
17991	NC_009484	CCG	2	6	661373	661378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259604
17992	NC_009484	ATC	2	6	661399	661404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259604
17993	NC_009484	CG	3	6	661421	661426	0 %	0 %	50 %	50 %	148259604
17994	NC_009484	CGC	2	6	661454	661459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259604
17995	NC_009484	CAC	2	6	661466	661471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259604
17996	NC_009484	TTC	2	6	661527	661532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259604
17997	NC_009484	CGC	2	6	661589	661594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259604
17998	NC_009484	CTG	2	6	661596	661601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259604
17999	NC_009484	AGA	2	6	661627	661632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259604
18000	NC_009484	GCC	2	6	661636	661641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259604

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