MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_009484	GCGCC	2	10	573209	573218	0 %	0 %	40 %	60 %	148259531
15503	NC_009484	TCGTGC	2	12	573380	573391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259531
15504	NC_009484	GAC	2	6	573405	573410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259531
15505	NC_009484	GGC	2	6	573444	573449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259531
15506	NC_009484	CGG	2	6	573482	573487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259531
15507	NC_009484	GCCG	2	8	573491	573498	0 %	0 %	50 %	50 %	148259531
15508	NC_009484	CGG	2	6	573505	573510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259531
15509	NC_009484	AGG	2	6	573518	573523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259531
15510	NC_009484	GA	3	6	573547	573552	50 %	0 %	50 %	0 %	148259531
15511	NC_009484	GCG	2	6	573557	573562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259531
15512	NC_009484	CGGC	2	8	573572	573579	0 %	0 %	50 %	50 %	148259531
15513	NC_009484	GGC	3	9	573655	573663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259531
15514	NC_009484	GCG	2	6	573680	573685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259531
15515	NC_009484	GGC	2	6	573690	573695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259531
15516	NC_009484	GGGC	2	8	573866	573873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15517	NC_009484	GCG	2	6	573892	573897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_009484	GCG	2	6	573914	573919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259532
15519	NC_009484	TGGC	2	8	573967	573974	0 %	25 %	50 %	25 %	148259532
15520	NC_009484	GA	3	6	573976	573981	50 %	0 %	50 %	0 %	148259532
15521	NC_009484	CCG	2	6	574016	574021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259532
15522	NC_009484	AGA	2	6	574033	574038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259532
15523	NC_009484	GTC	2	6	574110	574115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259532
15524	NC_009484	CCG	2	6	574140	574145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259532
15525	NC_009484	ACG	2	6	574146	574151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259532
15526	NC_009484	GGT	3	9	574193	574201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259532
15527	NC_009484	CGG	2	6	574226	574231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259532
15528	NC_009484	CG	3	6	574254	574259	0 %	0 %	50 %	50 %	148259532
15529	NC_009484	GA	3	6	574264	574269	50 %	0 %	50 %	0 %	148259532
15530	NC_009484	ATC	2	6	574329	574334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259532
15531	NC_009484	CGGCG	2	10	574400	574409	0 %	0 %	60 %	40 %	148259532
15532	NC_009484	GCC	2	6	574465	574470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15533	NC_009484	GGC	2	6	574471	574476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_009484	GCG	2	6	574509	574514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_009484	CGGGG	2	10	574573	574582	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15536	NC_009484	CTG	2	6	574589	574594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_009484	CGG	2	6	574599	574604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_009484	CAT	2	6	574626	574631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259533
15539	NC_009484	CCT	2	6	574640	574645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259533
15540	NC_009484	GCCG	2	8	574706	574713	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15541	NC_009484	GGC	2	6	574812	574817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259533
15542	NC_009484	CGCC	2	8	574818	574825	0 %	0 %	25 %	75 %	148259533
15543	NC_009484	CCG	2	6	574832	574837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259533
15544	NC_009484	CG	3	6	574843	574848	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15545	NC_009484	CGC	2	6	574916	574921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259533
15546	NC_009484	CG	3	6	574945	574950	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15547	NC_009484	ATCT	2	8	574951	574958	25 %	50 %	0 %	25 %	148259533
15548	NC_009484	CG	3	6	574970	574975	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15549	NC_009484	ATTG	2	8	575022	575029	25 %	50 %	25 %	0 %	148259533
15550	NC_009484	TGA	2	6	575033	575038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259533
15551	NC_009484	CG	3	6	575047	575052	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15552	NC_009484	TCG	2	6	575087	575092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259533
15553	NC_009484	C	7	7	575230	575236	0 %	0 %	0 %	100 %	148259533
15554	NC_009484	CG	3	6	575245	575250	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15555	NC_009484	CGC	2	6	575277	575282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259533
15556	NC_009484	GCG	3	9	575320	575328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259533
15557	NC_009484	CTT	2	6	575331	575336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259533
15558	NC_009484	GC	3	6	575346	575351	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15559	NC_009484	CG	3	6	575389	575394	0 %	0 %	50 %	50 %	148259533
15560	NC_009484	CTC	2	6	575460	575465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_009484	GC	3	6	575671	575676	0 %	0 %	50 %	50 %	148259534
15562	NC_009484	GCT	2	6	575712	575717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259534
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15565	NC_009484	GGCG	2	8	575799	575806	0 %	0 %	75 %	25 %	148259534
15566	NC_009484	CGAA	2	8	576052	576059	50 %	0 %	25 %	25 %	148259535
15567	NC_009484	GAT	2	6	576102	576107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259535
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15569	NC_009484	TGA	2	6	576150	576155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259535
15570	NC_009484	GCG	2	6	576240	576245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259535
15571	NC_009484	GCCGG	2	10	576255	576264	0 %	0 %	60 %	40 %	148259535
15572	NC_009484	TGCCGA	2	12	576318	576329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259535
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15581	NC_009484	GGC	2	6	576643	576648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15582	NC_009484	CG	3	6	576697	576702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15583	NC_009484	CCT	2	6	576747	576752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15584	NC_009484	TCGT	2	8	576765	576772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15612	NC_009484	ACC	2	6	577801	577806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259536
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15622	NC_009484	AAT	2	6	578258	578263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259536
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15723	NC_009484	ACCGG	2	10	582719	582728	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15724	NC_009484	TGC	2	6	582737	582742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15861	NC_009484	GCA	2	6	588109	588114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259542
15862	NC_009484	GCG	3	9	588117	588125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259542
15863	NC_009484	CGG	2	6	588140	588145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259542
15864	NC_009484	GC	3	6	588157	588162	0 %	0 %	50 %	50 %	148259542
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15869	NC_009484	GCGCG	2	10	588310	588319	0 %	0 %	60 %	40 %	148259542
15870	NC_009484	GAG	2	6	588362	588367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259542
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15875	NC_009484	AGC	2	6	588503	588508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259543
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15877	NC_009484	CGA	2	6	588513	588518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259543
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15880	NC_009484	GGTATT	2	12	588550	588561	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148259543
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15884	NC_009484	CGG	2	6	588768	588773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259543
15885	NC_009484	CGG	2	6	588790	588795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259543
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15892	NC_009484	CG	3	6	589098	589103	0 %	0 %	50 %	50 %	148259543
15893	NC_009484	GC	3	6	589145	589150	0 %	0 %	50 %	50 %	148259544
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15908	NC_009484	A	7	7	589585	589591	100 %	0 %	0 %	0 %	148259544
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15981	NC_009484	TC	3	6	593037	593042	0 %	50 %	0 %	50 %	148259547
15982	NC_009484	GC	3	6	593061	593066	0 %	0 %	50 %	50 %	148259547
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15985	NC_009484	GCC	2	6	593125	593130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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