MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_009484	GTTCCT	2	12	533598	533609	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148259497
14503	NC_009484	GTC	2	6	533623	533628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14504	NC_009484	GGC	2	6	533635	533640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259497
14505	NC_009484	TGC	2	6	533691	533696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14506	NC_009484	CAG	2	6	533704	533709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14507	NC_009484	CAC	2	6	533743	533748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259497
14508	NC_009484	CGT	2	6	533749	533754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14509	NC_009484	CAC	2	6	533782	533787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259497
14510	NC_009484	GTC	2	6	533828	533833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14511	NC_009484	GAT	2	6	533863	533868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259497
14512	NC_009484	CAC	2	6	533884	533889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259497
14513	NC_009484	CCG	2	6	533975	533980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259497
14514	NC_009484	CGC	3	9	534084	534092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259497
14515	NC_009484	CGC	2	6	534121	534126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259497
14516	NC_009484	GC	3	6	534162	534167	0 %	0 %	50 %	50 %	148259497
14517	NC_009484	GCT	2	6	534231	534236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14518	NC_009484	CTG	2	6	534283	534288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14519	NC_009484	CTG	2	6	534349	534354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14520	NC_009484	ACG	3	9	534398	534406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259497
14521	NC_009484	GGC	2	6	534412	534417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259497
14522	NC_009484	GGT	2	6	534553	534558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259497
14523	NC_009484	GC	3	6	534594	534599	0 %	0 %	50 %	50 %	148259497
14524	NC_009484	GCCG	2	8	534602	534609	0 %	0 %	50 %	50 %	148259497
14525	NC_009484	CGA	2	6	534615	534620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259497
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14527	NC_009484	TGA	2	6	534666	534671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259497
14528	NC_009484	CGGC	2	8	534720	534727	0 %	0 %	50 %	50 %	148259497
14529	NC_009484	GGC	3	9	534754	534762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259497
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14531	NC_009484	CGC	2	6	534784	534789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259497
14532	NC_009484	GAGGG	2	10	534816	534825	20 %	0 %	80 %	0 %	148259497
14533	NC_009484	CGC	2	6	534874	534879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259497
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14535	NC_009484	TG	3	6	535059	535064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_009484	ACA	2	6	535129	535134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_009484	GAAA	2	8	535155	535162	75 %	0 %	25 %	0 %	148259498
14538	NC_009484	CGC	2	6	535171	535176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259498
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14543	NC_009484	CGGC	2	8	535323	535330	0 %	0 %	50 %	50 %	148259498
14544	NC_009484	GAC	2	6	535367	535372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259498
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14558	NC_009484	TCA	2	6	535983	535988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259498
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14563	NC_009484	CAG	2	6	536303	536308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259498
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14567	NC_009484	CGG	2	6	536419	536424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14569	NC_009484	GGC	2	6	536578	536583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259499
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14732	NC_009484	CCT	2	6	543230	543235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14733	NC_009484	CA	3	6	543307	543312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14734	NC_009484	CGGAG	2	10	543319	543328	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14735	NC_009484	TCT	2	6	543431	543436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14736	NC_009484	CTCCC	2	10	543479	543488	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14737	NC_009484	T	8	8	543517	543524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14738	NC_009484	GCAT	2	8	543527	543534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14981	NC_009484	TGA	2	6	553163	553168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259513
14982	NC_009484	ACGA	2	8	553170	553177	50 %	0 %	25 %	25 %	148259513
14983	NC_009484	CCG	2	6	553183	553188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259513
14984	NC_009484	CGA	2	6	553205	553210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259513
14985	NC_009484	TGCCGC	2	12	553253	553264	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259513
14986	NC_009484	GAC	2	6	553326	553331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259513
14987	NC_009484	CGAT	2	8	553387	553394	25 %	25 %	25 %	25 %	148259513
14988	NC_009484	CTT	2	6	553458	553463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259513
14989	NC_009484	CGGC	2	8	553523	553530	0 %	0 %	50 %	50 %	148259513
14990	NC_009484	GC	3	6	553554	553559	0 %	0 %	50 %	50 %	148259513
14991	NC_009484	GGC	2	6	553566	553571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259513
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14993	NC_009484	TCA	2	6	553589	553594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259513
14994	NC_009484	ATG	2	6	553633	553638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259513
14995	NC_009484	CGA	2	6	553730	553735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259513
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14999	NC_009484	GCT	2	6	553826	553831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259513
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