MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_009484	GCC	2	6	496971	496976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259463
13502	NC_009484	CCG	2	6	497048	497053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259463
13503	NC_009484	GCG	2	6	497151	497156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259463
13504	NC_009484	TGA	2	6	497180	497185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259463
13505	NC_009484	CGAT	2	8	497224	497231	25 %	25 %	25 %	25 %	148259463
13506	NC_009484	CGA	2	6	497318	497323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259463
13507	NC_009484	CGG	2	6	497331	497336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259463
13508	NC_009484	GC	4	8	497369	497376	0 %	0 %	50 %	50 %	148259463
13509	NC_009484	TGCG	2	8	497423	497430	0 %	25 %	50 %	25 %	148259463
13510	NC_009484	CGA	2	6	497437	497442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259464
13511	NC_009484	CGG	2	6	497463	497468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259464
13512	NC_009484	TTC	2	6	497582	497587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259464
13513	NC_009484	ACG	2	6	497604	497609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259464
13514	NC_009484	CTG	2	6	497632	497637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259464
13515	NC_009484	GT	3	6	497683	497688	0 %	50 %	50 %	0 %	148259464
13516	NC_009484	ATC	2	6	497726	497731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259464
13517	NC_009484	CAA	2	6	497768	497773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259464
13518	NC_009484	CGGG	2	8	497791	497798	0 %	0 %	75 %	25 %	148259464
13519	NC_009484	CAG	2	6	497801	497806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259464
13520	NC_009484	CGT	2	6	497815	497820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259464
13521	NC_009484	CGA	2	6	497902	497907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_009484	CAA	2	6	497957	497962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_009484	TAAT	3	12	498008	498019	50 %	50 %	0 %	0 %	148259465
13524	NC_009484	A	6	6	498036	498041	100 %	0 %	0 %	0 %	148259465
13525	NC_009484	GT	3	6	498061	498066	0 %	50 %	50 %	0 %	148259465
13526	NC_009484	GCA	2	6	498106	498111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259465
13527	NC_009484	CATG	2	8	498125	498132	25 %	25 %	25 %	25 %	148259465
13528	NC_009484	CGT	2	6	498133	498138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259465
13529	NC_009484	TGC	2	6	498144	498149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259465
13530	NC_009484	T	6	6	498255	498260	0 %	100 %	0 %	0 %	148259465
13531	NC_009484	CGGC	2	8	498295	498302	0 %	0 %	50 %	50 %	148259466
13532	NC_009484	GCG	3	9	498395	498403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259466
13533	NC_009484	CCAGC	2	10	498419	498428	20 %	0 %	20 %	60 %	148259466
13534	NC_009484	GGC	2	6	498506	498511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259466
13535	NC_009484	CG	3	6	498570	498575	0 %	0 %	50 %	50 %	148259466
13536	NC_009484	GATC	2	8	498659	498666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13537	NC_009484	GCG	2	6	498736	498741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_009484	AT	3	6	498776	498781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_009484	GT	3	6	498789	498794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_009484	CTGT	2	8	498871	498878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13541	NC_009484	GTG	2	6	498929	498934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259467
13542	NC_009484	GAT	2	6	498938	498943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259467
13543	NC_009484	CGG	2	6	498952	498957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259467
13544	NC_009484	GTG	2	6	498962	498967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259467
13545	NC_009484	CGGG	2	8	499012	499019	0 %	0 %	75 %	25 %	148259467
13546	NC_009484	GGC	2	6	499033	499038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259467
13547	NC_009484	TGC	2	6	499074	499079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259467
13548	NC_009484	CGGG	2	8	499080	499087	0 %	0 %	75 %	25 %	148259467
13549	NC_009484	GAT	2	6	499172	499177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259467
13550	NC_009484	CGG	2	6	499198	499203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259467
13551	NC_009484	CTG	2	6	499328	499333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259467
13552	NC_009484	GATC	2	8	499363	499370	25 %	25 %	25 %	25 %	148259467
13553	NC_009484	GCT	2	6	499390	499395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259467
13554	NC_009484	GGAG	2	8	499447	499454	25 %	0 %	75 %	0 %	148259467
13555	NC_009484	AGA	2	6	499518	499523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259467
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13558	NC_009484	GCTC	2	8	499755	499762	0 %	25 %	25 %	50 %	148259468
13559	NC_009484	CGA	2	6	499770	499775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259468
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13561	NC_009484	AGGC	2	8	499845	499852	25 %	0 %	50 %	25 %	148259468
13562	NC_009484	CTG	2	6	499922	499927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259468
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13564	NC_009484	GGGT	2	8	500068	500075	0 %	25 %	75 %	0 %	148259468
13565	NC_009484	CTG	2	6	500081	500086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259468
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13567	NC_009484	GCG	2	6	500119	500124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259468
13568	NC_009484	GCT	2	6	500140	500145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259468
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13570	NC_009484	CCG	2	6	500278	500283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259468
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13572	NC_009484	CGC	2	6	500440	500445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259468
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13589	NC_009484	GCC	3	9	501431	501439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259469
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13594	NC_009484	GTCG	2	8	501512	501519	0 %	25 %	50 %	25 %	148259469
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13602	NC_009484	CGA	2	6	501856	501861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259469
13603	NC_009484	GCCT	2	8	502001	502008	0 %	25 %	25 %	50 %	148259469
13604	NC_009484	ACG	2	6	502022	502027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259469
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13606	NC_009484	TCG	2	6	502065	502070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259469
13607	NC_009484	GGC	2	6	502194	502199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259469
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13613	NC_009484	ATTG	2	8	502444	502451	25 %	50 %	25 %	0 %	148259469
13614	NC_009484	GC	3	6	502452	502457	0 %	0 %	50 %	50 %	148259469
13615	NC_009484	GGGC	2	8	502459	502466	0 %	0 %	75 %	25 %	148259469
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13618	NC_009484	GTC	2	6	502881	502886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259470
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13620	NC_009484	GCC	2	6	502937	502942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259470
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13861	NC_009484	GAAG	2	8	512413	512420	50 %	0 %	50 %	0 %	148259475
13862	NC_009484	AAT	2	6	512441	512446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259475
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13983	NC_009484	GAT	2	6	516747	516752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259480
13984	NC_009484	CGGC	2	8	516759	516766	0 %	0 %	50 %	50 %	148259480
13985	NC_009484	GCGG	2	8	516767	516774	0 %	0 %	75 %	25 %	148259480
13986	NC_009484	ATC	2	6	516775	516780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259480
13987	NC_009484	GGCC	2	8	516795	516802	0 %	0 %	50 %	50 %	148259480
13988	NC_009484	CCA	2	6	516836	516841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259480
13989	NC_009484	GGC	2	6	516843	516848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259480
13990	NC_009484	GTG	2	6	516925	516930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259480
13991	NC_009484	GAA	2	6	516996	517001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259480
13992	NC_009484	GCCG	2	8	517040	517047	0 %	0 %	50 %	50 %	148259480
13993	NC_009484	GCC	2	6	517063	517068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259480
13994	NC_009484	CGA	2	6	517083	517088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259480
13995	NC_009484	CGT	2	6	517098	517103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259480
13996	NC_009484	GGC	2	6	517126	517131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259480
13997	NC_009484	TGAAC	2	10	517139	517148	40 %	20 %	20 %	20 %	148259480
13998	NC_009484	CCG	2	6	517158	517163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13999	NC_009484	GTTGA	2	10	517166	517175	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14000	NC_009484	CGG	2	6	517177	517182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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