MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_009484	CGCGGG	2	12	454644	454655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12503	NC_009484	GC	4	8	454673	454680	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12504	NC_009484	GGC	2	6	454681	454686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12505	NC_009484	CCG	2	6	454693	454698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259416
12506	NC_009484	CG	3	6	454727	454732	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12507	NC_009484	GCG	3	9	454730	454738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12508	NC_009484	TGG	2	6	454739	454744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259416
12509	NC_009484	CCG	2	6	454783	454788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259416
12510	NC_009484	CG	3	6	454793	454798	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12511	NC_009484	GGCT	2	8	454824	454831	0 %	25 %	50 %	25 %	148259416
12512	NC_009484	GCG	2	6	454864	454869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12513	NC_009484	CG	3	6	454881	454886	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12514	NC_009484	GAT	2	6	454915	454920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259416
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12516	NC_009484	GC	4	8	455020	455027	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12517	NC_009484	CGT	2	6	455055	455060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
12518	NC_009484	GGC	2	6	455086	455091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12519	NC_009484	GCGCG	2	10	455094	455103	0 %	0 %	60 %	40 %	148259416
12520	NC_009484	CGGCCT	2	12	455112	455123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259416
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12523	NC_009484	TTCGGC	2	12	455173	455184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
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12525	NC_009484	CGG	2	6	455250	455255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12526	NC_009484	CGG	2	6	455258	455263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12527	NC_009484	GC	3	6	455269	455274	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12528	NC_009484	CGG	2	6	455304	455309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12529	NC_009484	GCGCG	2	10	455325	455334	0 %	0 %	60 %	40 %	148259416
12530	NC_009484	GCC	2	6	455414	455419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259416
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12532	NC_009484	TCGA	2	8	455474	455481	25 %	25 %	25 %	25 %	148259416
12533	NC_009484	GCA	2	6	455541	455546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259416
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12535	NC_009484	CGCC	2	8	455673	455680	0 %	0 %	25 %	75 %	148259416
12536	NC_009484	GCG	2	6	455699	455704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12537	NC_009484	GGGTCG	2	12	455753	455764	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148259416
12538	NC_009484	GCCGC	2	10	455817	455826	0 %	0 %	40 %	60 %	148259416
12539	NC_009484	GCA	2	6	455870	455875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259416
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12542	NC_009484	CTGTG	2	10	456019	456028	0 %	40 %	40 %	20 %	148259416
12543	NC_009484	CGGCTT	2	12	456036	456047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
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12547	NC_009484	CGGCCT	2	12	456192	456203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259416
12548	NC_009484	CGCGC	2	10	456204	456213	0 %	0 %	40 %	60 %	148259416
12549	NC_009484	CGGG	2	8	456224	456231	0 %	0 %	75 %	25 %	148259416
12550	NC_009484	CGG	2	6	456246	456251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12551	NC_009484	CGG	2	6	456285	456290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259416
12552	NC_009484	CG	4	8	456300	456307	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12553	NC_009484	GCTTCG	2	12	456353	456364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
12554	NC_009484	GC	3	6	456382	456387	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12555	NC_009484	GC	3	6	456422	456427	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12556	NC_009484	CG	5	10	456453	456462	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12557	NC_009484	CGT	2	6	456507	456512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
12558	NC_009484	GCT	2	6	456539	456544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
12559	NC_009484	GC	5	10	456561	456570	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12560	NC_009484	CCGGCG	2	12	456574	456585	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12561	NC_009484	GC	3	6	456697	456702	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12562	NC_009484	CTG	2	6	456706	456711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
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12564	NC_009484	GTC	2	6	456721	456726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259416
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12569	NC_009484	GC	3	6	456824	456829	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12570	NC_009484	CGGG	2	8	456838	456845	0 %	0 %	75 %	25 %	148259416
12571	NC_009484	ATC	2	6	456878	456883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259416
12572	NC_009484	CG	5	10	456933	456942	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
12573	NC_009484	CTGCCG	2	12	456971	456982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259416
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12575	NC_009484	GCA	2	6	457088	457093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259416
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12578	NC_009484	CAGCG	2	10	457172	457181	20 %	0 %	40 %	40 %	148259416
12579	NC_009484	ATG	2	6	457220	457225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259416
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12581	NC_009484	CG	3	6	457304	457309	0 %	0 %	50 %	50 %	148259416
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12584	NC_009484	CTCC	2	8	457366	457373	0 %	25 %	0 %	75 %	148259417
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12587	NC_009484	CGT	2	6	457432	457437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259417
12588	NC_009484	GC	3	6	457458	457463	0 %	0 %	50 %	50 %	148259417
12589	NC_009484	CTT	2	6	457466	457471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259417
12590	NC_009484	GGC	2	6	457481	457486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259417
12591	NC_009484	CGT	2	6	457493	457498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259417
12592	NC_009484	GCG	2	6	457518	457523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259417
12593	NC_009484	TGCG	2	8	457590	457597	0 %	25 %	50 %	25 %	148259417
12594	NC_009484	ATA	2	6	457619	457624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259417
12595	NC_009484	GC	3	6	457639	457644	0 %	0 %	50 %	50 %	148259417
12596	NC_009484	GCGT	2	8	457749	457756	0 %	25 %	50 %	25 %	148259417
12597	NC_009484	CGG	2	6	457870	457875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259417
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12599	NC_009484	AG	3	6	457896	457901	50 %	0 %	50 %	0 %	148259417
12600	NC_009484	TAG	2	6	457931	457936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259417
12601	NC_009484	ACG	2	6	457940	457945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259417
12602	NC_009484	TGT	2	6	457971	457976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_009484	GCG	2	6	458061	458066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12604	NC_009484	GGT	2	6	458278	458283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259418
12605	NC_009484	GC	4	8	458284	458291	0 %	0 %	50 %	50 %	148259418
12606	NC_009484	TCA	2	6	458373	458378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259418
12607	NC_009484	TGC	2	6	458379	458384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259418
12608	NC_009484	CTACGA	2	12	458419	458430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148259418
12609	NC_009484	GTC	3	9	458495	458503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259418
12610	NC_009484	GCC	2	6	458534	458539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259418
12611	NC_009484	GCT	2	6	458548	458553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259418
12612	NC_009484	GCC	3	9	458579	458587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259418
12613	NC_009484	ATC	2	6	458729	458734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259419
12614	NC_009484	CTGCC	2	10	458742	458751	0 %	20 %	20 %	60 %	148259419
12615	NC_009484	GC	4	8	458756	458763	0 %	0 %	50 %	50 %	148259419
12616	NC_009484	TTG	2	6	458826	458831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259419
12617	NC_009484	GCCT	2	8	458838	458845	0 %	25 %	25 %	50 %	148259419
12618	NC_009484	GC	3	6	458869	458874	0 %	0 %	50 %	50 %	148259419
12619	NC_009484	CGC	2	6	458913	458918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259419
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