MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_009484	GCCGAA	2	12	341980	341991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259315
9003	NC_009484	CCG	2	6	341999	342004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9004	NC_009484	CGC	2	6	342018	342023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9005	NC_009484	GCC	3	9	342055	342063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9006	NC_009484	CCG	2	6	342065	342070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9007	NC_009484	GCC	2	6	342079	342084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9008	NC_009484	GTG	2	6	342146	342151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259315
9009	NC_009484	CAT	2	6	342152	342157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259315
9010	NC_009484	CGGC	2	8	342158	342165	0 %	0 %	50 %	50 %	148259315
9011	NC_009484	CCG	2	6	342218	342223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9012	NC_009484	CGC	2	6	342241	342246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9013	NC_009484	GCC	2	6	342290	342295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259315
9014	NC_009484	TGC	2	6	342333	342338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259315
9015	NC_009484	GC	3	6	342420	342425	0 %	0 %	50 %	50 %	148259315
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9017	NC_009484	CGA	2	6	342486	342491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259315
9018	NC_009484	GC	3	6	342549	342554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_009484	TGA	2	6	342569	342574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9021	NC_009484	CCG	2	6	342638	342643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9022	NC_009484	GAA	2	6	342678	342683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_009484	CGA	2	6	342714	342719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259316
9024	NC_009484	CAT	4	12	342746	342757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259316
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9030	NC_009484	CCG	2	6	342913	342918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259316
9031	NC_009484	CAT	2	6	342924	342929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259316
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9034	NC_009484	CTG	2	6	342993	342998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259316
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9037	NC_009484	TGA	2	6	343105	343110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259316
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9040	NC_009484	CGT	2	6	343175	343180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259316
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9042	NC_009484	TCG	2	6	343273	343278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259316
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9055	NC_009484	CGAT	2	8	343711	343718	25 %	25 %	25 %	25 %	148259316
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9061	NC_009484	GGCC	2	8	343886	343893	0 %	0 %	50 %	50 %	148259317
9062	NC_009484	CTG	2	6	343906	343911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259317
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9245	NC_009484	CCG	2	6	348747	348752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259320
9246	NC_009484	CCG	2	6	348758	348763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259320
9247	NC_009484	GCG	2	6	348764	348769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259320
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9250	NC_009484	GCC	2	6	348825	348830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259320
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9308	NC_009484	CGCA	2	8	350725	350732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9309	NC_009484	CCGG	2	8	350736	350743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9310	NC_009484	GCC	2	6	350751	350756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9312	NC_009484	CAT	2	6	350768	350773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9314	NC_009484	ATG	2	6	350851	350856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259322
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9316	NC_009484	ATC	2	6	350929	350934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259322
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9318	NC_009484	CGG	2	6	350966	350971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259322
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9341	NC_009484	CGA	2	6	351893	351898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259324
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9353	NC_009484	GCC	2	6	352281	352286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259324
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9357	NC_009484	CGGC	2	8	352347	352354	0 %	0 %	50 %	50 %	148259324
9358	NC_009484	CG	3	6	352357	352362	0 %	0 %	50 %	50 %	148259324
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9488	NC_009484	GAT	2	6	356261	356266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259326
9489	NC_009484	CCG	2	6	356275	356280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259326
9490	NC_009484	CGA	2	6	356284	356289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259326
9491	NC_009484	CCGC	2	8	356329	356336	0 %	0 %	25 %	75 %	148259326
9492	NC_009484	CGC	2	6	356344	356349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259326
9493	NC_009484	CGG	3	9	356378	356386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259326
9494	NC_009484	CGATCG	2	12	356407	356418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259326
9495	NC_009484	CCG	2	6	356419	356424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259326
9496	NC_009484	GCC	2	6	356442	356447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259326
9497	NC_009484	GCGCC	2	10	356454	356463	0 %	0 %	40 %	60 %	148259326
9498	NC_009484	CGG	2	6	356472	356477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259326
9499	NC_009484	CGCGG	2	10	356478	356487	0 %	0 %	60 %	40 %	148259326
9500	NC_009484	CGG	2	6	356498	356503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259326

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