MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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89002	NC_009484	ATCGAT	2	12	3099571	3099582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148261815
89003	NC_009484	TTC	2	6	3099590	3099595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148261815
89004	NC_009484	GCG	2	6	3099600	3099605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261815
89005	NC_009484	GCC	2	6	3099618	3099623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261815
89006	NC_009484	GTC	2	6	3099634	3099639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261815
89007	NC_009484	CATG	2	8	3099675	3099682	25 %	25 %	25 %	25 %	148261815
89008	NC_009484	CATG	2	8	3099705	3099712	25 %	25 %	25 %	25 %	148261815
89009	NC_009484	GC	3	6	3099783	3099788	0 %	0 %	50 %	50 %	148261815
89010	NC_009484	CCGGA	2	10	3099828	3099837	20 %	0 %	40 %	40 %	148261815
89011	NC_009484	CGC	2	6	3099849	3099854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261815
89012	NC_009484	GAT	2	6	3099862	3099867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148261815
89013	NC_009484	GC	3	6	3099888	3099893	0 %	0 %	50 %	50 %	148261815
89014	NC_009484	GCC	2	6	3100029	3100034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261815
89015	NC_009484	ATC	2	6	3100078	3100083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148261815
89016	NC_009484	TGG	2	6	3100110	3100115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148261815
89017	NC_009484	CGT	2	6	3100132	3100137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261815
89018	NC_009484	CGT	2	6	3100155	3100160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261815
89019	NC_009484	CCA	2	6	3100227	3100232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148261815
89020	NC_009484	CCCGG	2	10	3100256	3100265	0 %	0 %	40 %	60 %	148261815
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89022	NC_009484	CCG	2	6	3100326	3100331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261815
89023	NC_009484	CTG	2	6	3100369	3100374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261815
89024	NC_009484	CAT	2	6	3100383	3100388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148261815
89025	NC_009484	GCA	2	6	3100395	3100400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261815
89026	NC_009484	CTG	2	6	3100544	3100549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89027	NC_009484	TAA	2	6	3100571	3100576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148261816
89028	NC_009484	TGATC	2	10	3100632	3100641	20 %	40 %	20 %	20 %	148261816
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89032	NC_009484	GC	3	6	3100795	3100800	0 %	0 %	50 %	50 %	148261816
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89035	NC_009484	CGG	2	6	3100862	3100867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261816
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89044	NC_009484	CCG	2	6	3101117	3101122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261816
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89054	NC_009484	TGA	2	6	3101405	3101410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148261817
89055	NC_009484	GCC	2	6	3101415	3101420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261817
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89468	NC_009484	GCT	2	6	3116304	3116309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261834
89469	NC_009484	TCGC	2	8	3116350	3116357	0 %	25 %	25 %	50 %	148261834
89470	NC_009484	CTG	2	6	3116398	3116403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261834
89471	NC_009484	CG	3	6	3116410	3116415	0 %	0 %	50 %	50 %	148261834
89472	NC_009484	CTC	2	6	3116486	3116491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89473	NC_009484	ATC	2	6	3116492	3116497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89474	NC_009484	TC	3	6	3116503	3116508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89475	NC_009484	TTC	2	6	3116519	3116524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89476	NC_009484	CGGCG	2	10	3116535	3116544	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89477	NC_009484	CGC	2	6	3116551	3116556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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89479	NC_009484	AAG	2	6	3116611	3116616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148261835
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89481	NC_009484	CTT	2	6	3116703	3116708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148261835
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89492	NC_009484	TCC	2	6	3117245	3117250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148261836
89493	NC_009484	TCCT	2	8	3117298	3117305	0 %	50 %	0 %	50 %	148261836
89494	NC_009484	TCG	3	9	3117364	3117372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261836
89495	NC_009484	CGC	2	6	3117377	3117382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261836
89496	NC_009484	GCG	2	6	3117458	3117463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261836
89497	NC_009484	CG	3	6	3117509	3117514	0 %	0 %	50 %	50 %	148261836
89498	NC_009484	CG	3	6	3117582	3117587	0 %	0 %	50 %	50 %	148261836
89499	NC_009484	GCC	3	9	3117594	3117602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261836
89500	NC_009484	CCG	2	6	3117658	3117663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261836

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