MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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81002	NC_009484	GGTCAT	2	12	2838751	2838762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148261566
81003	NC_009484	CCT	2	6	2838825	2838830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148261567
81004	NC_009484	GC	3	6	2838856	2838861	0 %	0 %	50 %	50 %	148261567
81005	NC_009484	TCGG	2	8	2838866	2838873	0 %	25 %	50 %	25 %	148261567
81006	NC_009484	TGAGGA	2	12	2838939	2838950	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148261567
81007	NC_009484	AGA	2	6	2838951	2838956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148261567
81008	NC_009484	TTGC	2	8	2838967	2838974	0 %	50 %	25 %	25 %	148261567
81009	NC_009484	CG	3	6	2838980	2838985	0 %	0 %	50 %	50 %	148261567
81010	NC_009484	CCG	2	6	2839008	2839013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261567
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81012	NC_009484	ACG	2	6	2839055	2839060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261567
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81017	NC_009484	AGC	2	6	2839187	2839192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261567
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81118	NC_009484	GCA	2	6	2842325	2842330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261571
81119	NC_009484	CG	3	6	2842366	2842371	0 %	0 %	50 %	50 %	148261571
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81151	NC_009484	T	8	8	2843627	2843634	0 %	100 %	0 %	0 %	148261572
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81227	NC_009484	TGC	2	6	2846209	2846214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261574
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81230	NC_009484	GCC	3	9	2846251	2846259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261574
81231	NC_009484	TCCG	2	8	2846267	2846274	0 %	25 %	25 %	50 %	148261574
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81349	NC_009484	GCC	2	6	2849881	2849886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261577
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81352	NC_009484	CGC	2	6	2850016	2850021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261577
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81454	NC_009484	GC	3	6	2853359	2853364	0 %	0 %	50 %	50 %	148261581
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81459	NC_009484	GCCGC	2	10	2853487	2853496	0 %	0 %	40 %	60 %	148261581
81460	NC_009484	GGC	2	6	2853497	2853502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261581
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81462	NC_009484	GGC	2	6	2853556	2853561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261581
81463	NC_009484	CGC	2	6	2853588	2853593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261581
81464	NC_009484	CCAG	2	8	2853604	2853611	25 %	0 %	25 %	50 %	148261581
81465	NC_009484	GCC	2	6	2853644	2853649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261581
81466	NC_009484	CGC	2	6	2853667	2853672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261581
81467	NC_009484	CGC	2	6	2853681	2853686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261581
81468	NC_009484	TCC	2	6	2853705	2853710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148261581
81469	NC_009484	GC	3	6	2853723	2853728	0 %	0 %	50 %	50 %	148261581
81470	NC_009484	CGT	2	6	2853734	2853739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261581
81471	NC_009484	ATC	2	6	2853756	2853761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148261581
81472	NC_009484	GGC	2	6	2853762	2853767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81473	NC_009484	CGA	2	6	2853805	2853810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261582
81474	NC_009484	GTC	2	6	2853839	2853844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261582
81475	NC_009484	GGC	2	6	2853845	2853850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261582
81476	NC_009484	CG	3	6	2853867	2853872	0 %	0 %	50 %	50 %	148261582
81477	NC_009484	CGG	2	6	2853877	2853882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261582
81478	NC_009484	CTG	2	6	2853905	2853910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261582
81479	NC_009484	TCA	2	6	2853913	2853918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148261582
81480	NC_009484	CAC	2	6	2853983	2853988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148261582
81481	NC_009484	TGT	2	6	2854003	2854008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148261582
81482	NC_009484	CG	3	6	2854023	2854028	0 %	0 %	50 %	50 %	148261582
81483	NC_009484	GCC	2	6	2854082	2854087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261582
81484	NC_009484	GCT	2	6	2854103	2854108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261582
81485	NC_009484	GCC	3	9	2854130	2854138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261582
81486	NC_009484	GGC	2	6	2854139	2854144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261582
81487	NC_009484	TCA	2	6	2854147	2854152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148261582
81488	NC_009484	GAT	2	6	2854157	2854162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148261582
81489	NC_009484	GCG	2	6	2854170	2854175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261582
81490	NC_009484	TCC	2	6	2854209	2854214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148261582
81491	NC_009484	TCG	2	6	2854237	2854242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261582
81492	NC_009484	GCG	2	6	2854260	2854265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261582
81493	NC_009484	GAA	2	6	2854355	2854360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148261582
81494	NC_009484	GCG	2	6	2854363	2854368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261582
81495	NC_009484	GCC	2	6	2854409	2854414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261582
81496	NC_009484	CGC	2	6	2854415	2854420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261582
81497	NC_009484	CGA	2	6	2854429	2854434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261582
81498	NC_009484	GAC	2	6	2854469	2854474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261582
81499	NC_009484	CCG	4	12	2854491	2854502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261582
81500	NC_009484	TGA	2	6	2854504	2854509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148261582

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