MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_009484	ACC	2	6	247711	247716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259233
6503	NC_009484	GCC	2	6	247726	247731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259233
6504	NC_009484	CGG	2	6	247738	247743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259233
6505	NC_009484	CGC	2	6	247758	247763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259233
6506	NC_009484	GGC	2	6	247777	247782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259233
6507	NC_009484	AGC	2	6	247848	247853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259233
6508	NC_009484	AC	3	6	247860	247865	50 %	0 %	0 %	50 %	148259233
6509	NC_009484	TTC	2	6	247866	247871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259234
6510	NC_009484	CCG	2	6	247880	247885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259234
6511	NC_009484	TTC	2	6	247938	247943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259234
6512	NC_009484	CGC	2	6	247949	247954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259234
6513	NC_009484	GGT	2	6	248015	248020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259234
6514	NC_009484	GCT	2	6	248033	248038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6515	NC_009484	GGC	2	6	248039	248044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259234
6516	NC_009484	GCT	2	6	248045	248050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6517	NC_009484	CGC	2	6	248069	248074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259234
6518	NC_009484	TCG	2	6	248149	248154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6519	NC_009484	GAC	2	6	248165	248170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6520	NC_009484	GCT	2	6	248180	248185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6521	NC_009484	GCCGG	2	10	248193	248202	0 %	0 %	60 %	40 %	148259234
6522	NC_009484	TGC	2	6	248212	248217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6523	NC_009484	CGG	2	6	248225	248230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259234
6524	NC_009484	GCT	2	6	248255	248260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6525	NC_009484	TGT	2	6	248275	248280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259234
6526	NC_009484	GTGG	2	8	248286	248293	0 %	25 %	75 %	0 %	148259234
6527	NC_009484	GCC	2	6	248301	248306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259234
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6529	NC_009484	TGC	2	6	248335	248340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259234
6530	NC_009484	TGA	2	6	248362	248367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259234
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6533	NC_009484	CGG	2	6	248435	248440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259234
6534	NC_009484	GCC	2	6	248475	248480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259234
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6537	NC_009484	GCG	2	6	248520	248525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
6538	NC_009484	GCGG	2	8	248617	248624	0 %	0 %	75 %	25 %	148259235
6539	NC_009484	AGGGT	2	10	248636	248645	20 %	20 %	60 %	0 %	148259235
6540	NC_009484	CGG	2	6	248654	248659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
6541	NC_009484	GCC	2	6	248705	248710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259235
6542	NC_009484	GAC	2	6	248725	248730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259235
6543	NC_009484	CAG	3	9	248731	248739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259235
6544	NC_009484	GCC	2	6	248761	248766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259235
6545	NC_009484	TCG	2	6	248786	248791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259235
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6547	NC_009484	GCG	2	6	248925	248930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
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6549	NC_009484	GC	4	8	248977	248984	0 %	0 %	50 %	50 %	148259235
6550	NC_009484	GCG	2	6	249039	249044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
6551	NC_009484	GCCCG	2	10	249049	249058	0 %	0 %	40 %	60 %	148259235
6552	NC_009484	CGT	2	6	249082	249087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259235
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6554	NC_009484	TCG	2	6	249128	249133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259235
6555	NC_009484	GGC	2	6	249154	249159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
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6560	NC_009484	GCGCG	2	10	249357	249366	0 %	0 %	60 %	40 %	148259235
6561	NC_009484	CG	4	8	249397	249404	0 %	0 %	50 %	50 %	148259235
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6570	NC_009484	CGG	2	6	249789	249794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
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6572	NC_009484	CGG	2	6	249838	249843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
6573	NC_009484	CGGCAT	2	12	249903	249914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259235
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6575	NC_009484	CGG	2	6	249997	250002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259235
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6578	NC_009484	CGA	2	6	250050	250055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259235
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6583	NC_009484	GAT	2	6	250371	250376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_009484	AACA	2	8	250454	250461	75 %	0 %	0 %	25 %	148259236
6585	NC_009484	TCCC	2	8	250463	250470	0 %	25 %	0 %	75 %	148259236
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6589	NC_009484	CG	3	6	250583	250588	0 %	0 %	50 %	50 %	148259236
6590	NC_009484	GTG	2	6	250673	250678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259236
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6592	NC_009484	ATC	2	6	250744	250749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6594	NC_009484	GGT	2	6	250802	250807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259237
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6598	NC_009484	GGC	2	6	250882	250887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259237
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6603	NC_009484	GC	4	8	251206	251213	0 %	0 %	50 %	50 %	148259237
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6609	NC_009484	GCCG	2	8	251411	251418	0 %	0 %	50 %	50 %	148259237
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6612	NC_009484	GGC	3	9	251477	251485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259237
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6615	NC_009484	AGAA	2	8	251553	251560	75 %	0 %	25 %	0 %	148259237
6616	NC_009484	GCA	2	6	251573	251578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259237
6617	NC_009484	GCC	2	6	251589	251594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259237
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6620	NC_009484	GTC	2	6	251737	251742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259238
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6622	NC_009484	GCGGG	2	10	251815	251824	0 %	0 %	80 %	20 %	148259238
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6740	NC_009484	CCCGG	2	10	256266	256275	0 %	0 %	40 %	60 %	148259241
6741	NC_009484	CGG	2	6	256284	256289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259241
6742	NC_009484	GTGG	2	8	256297	256304	0 %	25 %	75 %	0 %	148259241
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6867	NC_009484	CAT	2	6	260607	260612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
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6982	NC_009484	CAG	3	9	266229	266237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
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6984	NC_009484	ATG	2	6	266292	266297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259248
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6986	NC_009484	GCG	2	6	266446	266451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6987	NC_009484	GGC	2	6	266554	266559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6988	NC_009484	AGC	2	6	266584	266589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259248
6989	NC_009484	GGC	2	6	266590	266595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259248
6990	NC_009484	CGC	2	6	266810	266815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6991	NC_009484	AGCC	2	8	266852	266859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6992	NC_009484	CGGGGA	2	12	266892	266903	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6993	NC_009484	G	6	6	266909	266914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6994	NC_009484	CG	3	6	266930	266935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6995	NC_009484	GC	3	6	266985	266990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6996	NC_009484	GAAA	2	8	267052	267059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6997	NC_009484	CCG	2	6	267103	267108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259249
6998	NC_009484	CCGCT	2	10	267181	267190	0 %	20 %	20 %	60 %	148259249
6999	NC_009484	GCC	2	6	267206	267211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259249
7000	NC_009484	TGT	2	6	267221	267226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259249

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