MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY07

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009473	TTC	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009473	T	7	7	134	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009473	TTG	2	6	222	227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009473	TTAA	2	8	250	257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009473	T	7	7	299	305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009473	TAT	2	6	393	398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009473	AAT	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009473	AAT	2	6	480	485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009473	CTT	2	6	549	554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009473	ATG	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009473	T	6	6	572	577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009473	CCGA	2	8	615	622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009473	ATA	2	6	628	633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009473	AAT	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009473	ATA	3	9	667	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009473	ATA	2	6	705	710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009473	AAATA	2	10	711	720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009473	TAAAGC	2	12	723	734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009473	ATCC	2	8	739	746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009473	TAT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009473	AAAT	2	8	771	778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009473	ATA	2	6	785	790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009473	TAA	2	6	831	836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009473	CAT	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009473	ATT	2	6	849	854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009473	ATG	2	6	881	886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009473	CAG	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244128
28	NC_009473	TCG	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244128
29	NC_009473	CTC	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009473	CT	3	6	1116	1121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009473	GCC	2	6	1238	1243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009473	TGG	2	6	1333	1338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009473	AGC	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009473	T	6	6	1487	1492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009473	ATC	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009473	CTC	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009473	TGG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009473	TAC	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009473	TGG	2	6	1621	1626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009473	TCG	2	6	1727	1732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009473	TAGCG	2	10	1761	1770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009473	TGA	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009473	GGC	2	6	1825	1830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009473	GCC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009473	CGA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009473	CGAC	2	8	1905	1912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009473	ACG	2	6	1941	1946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009473	CCA	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009473	GCT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009473	GCC	2	6	2025	2030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009473	TGAG	2	8	2090	2097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009473	AT	3	6	2177	2182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009473	GCT	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009473	AGC	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009473	C	7	7	2255	2261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_009473	T	6	6	2289	2294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009473	CT	3	6	2301	2306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009473	GTC	2	6	2340	2345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009473	GCC	2	6	2376	2381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009473	AGCG	2	8	2395	2402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009473	ACGC	2	8	2443	2450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009473	GC	3	6	2455	2460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009473	GGC	2	6	2534	2539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009473	GGCGCG	2	12	2573	2584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009473	GCG	2	6	2676	2681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009473	T	6	6	2721	2726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009473	GCCGG	2	10	2781	2790	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009473	TGG	2	6	2844	2849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244129
69	NC_009473	CTG	2	6	2873	2878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244129
70	NC_009473	CCG	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244129
71	NC_009473	CG	3	6	2921	2926	0 %	0 %	50 %	50 %	148244129
72	NC_009473	CCA	2	6	3025	3030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244129
73	NC_009473	CAC	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244129
74	NC_009473	GGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244129
75	NC_009473	TGC	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244129
76	NC_009473	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244129
77	NC_009473	GGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244129
78	NC_009473	CGG	2	6	3321	3326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244129
79	NC_009473	TGC	2	6	3420	3425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244130
80	NC_009473	CGG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
81	NC_009473	TGG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244130
82	NC_009473	GCG	2	6	3525	3530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
83	NC_009473	GGGCAG	2	12	3542	3553	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148244130
84	NC_009473	CCTG	2	8	3673	3680	0 %	25 %	25 %	50 %	148244130
85	NC_009473	GGC	2	6	3794	3799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
86	NC_009473	GGC	2	6	3851	3856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
87	NC_009473	GTG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244130
88	NC_009473	ATG	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244130
89	NC_009473	CGG	2	6	4159	4164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
90	NC_009473	CGG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
91	NC_009473	CGG	2	6	4237	4242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
92	NC_009473	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244130
93	NC_009473	GGC	2	6	4385	4390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
94	NC_009473	GCG	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244130
95	NC_009473	CGA	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009473	AAC	2	6	4508	4513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009473	TGC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009473	C	6	6	4597	4602	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_009473	GC	3	6	4615	4620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009473	CGGA	2	8	4659	4666	25 %	0 %	50 %	25 %	148244131
101	NC_009473	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244131
102	NC_009473	AGC	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244131
103	NC_009473	GC	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	148244131
104	NC_009473	AGG	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244131
105	NC_009473	CGC	2	6	4770	4775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244131
106	NC_009473	AGCGG	2	10	4808	4817	20 %	0 %	60 %	20 %	148244131
107	NC_009473	ATCG	2	8	4875	4882	25 %	25 %	25 %	25 %	148244131
108	NC_009473	GGC	2	6	4925	4930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244131
109	NC_009473	GCCC	2	8	4950	4957	0 %	0 %	25 %	75 %	148244131
110	NC_009473	TTGCC	2	10	5045	5054	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009473	GC	3	6	5097	5102	0 %	0 %	50 %	50 %	148244132
112	NC_009473	GGC	2	6	5115	5120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244132
113	NC_009473	CGA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244132
114	NC_009473	C	6	6	5219	5224	0 %	0 %	0 %	100 %	148244132
115	NC_009473	GCG	2	6	5236	5241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244132
116	NC_009473	TGAGCC	2	12	5265	5276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148244132
117	NC_009473	GAC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244132
118	NC_009473	GGCG	2	8	5396	5403	0 %	0 %	75 %	25 %	148244132
119	NC_009473	GC	4	8	5425	5432	0 %	0 %	50 %	50 %	148244132
120	NC_009473	AGG	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244132
121	NC_009473	GCC	2	6	5455	5460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244132
122	NC_009473	GGGC	2	8	5482	5489	0 %	0 %	75 %	25 %	148244132
123	NC_009473	GC	3	6	5505	5510	0 %	0 %	50 %	50 %	148244132
124	NC_009473	CCA	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244132
125	NC_009473	CCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.