MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 4752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009467	CG	4	8	171090	171097	0 %	0 %	50 %	50 %	148243775
4002	NC_009467	GC	4	8	171098	171105	0 %	0 %	50 %	50 %	148243775
4003	NC_009467	TC	3	6	171198	171203	0 %	50 %	0 %	50 %	148243775
4004	NC_009467	CGA	2	6	171218	171223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243775
4005	NC_009467	CGA	2	6	171261	171266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243775
4006	NC_009467	CCCG	2	8	171309	171316	0 %	0 %	25 %	75 %	148243775
4007	NC_009467	TGCG	2	8	171332	171339	0 %	25 %	50 %	25 %	148243775
4008	NC_009467	TCT	2	6	171442	171447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243776
4009	NC_009467	TCG	2	6	171448	171453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243776
4010	NC_009467	GC	3	6	171473	171478	0 %	0 %	50 %	50 %	148243776
4011	NC_009467	CTTTCT	2	12	171524	171535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243776
4012	NC_009467	GC	3	6	171571	171576	0 %	0 %	50 %	50 %	148243776
4013	NC_009467	CGG	2	6	171590	171595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243776
4014	NC_009467	GGC	2	6	171674	171679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243776
4015	NC_009467	TGG	3	9	171687	171695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243776
4016	NC_009467	CCAG	2	8	171757	171764	25 %	0 %	25 %	50 %	148243776
4017	NC_009467	TGC	2	6	171854	171859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243776
4018	NC_009467	GC	4	8	171880	171887	0 %	0 %	50 %	50 %	148243776
4019	NC_009467	TGA	2	6	171895	171900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243776
4020	NC_009467	ACGCTC	2	12	172017	172028	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243776
4021	NC_009467	CG	3	6	172029	172034	0 %	0 %	50 %	50 %	148243776
4022	NC_009467	GGGC	2	8	172068	172075	0 %	0 %	75 %	25 %	148243776
4023	NC_009467	GTC	2	6	172092	172097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243776
4024	NC_009467	GGCT	2	8	172176	172183	0 %	25 %	50 %	25 %	148243776
4025	NC_009467	TCC	2	6	172282	172287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243776
4026	NC_009467	GCC	2	6	172290	172295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243776
4027	NC_009467	CGG	2	6	172309	172314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243776
4028	NC_009467	GCT	2	6	172373	172378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243776
4029	NC_009467	GCA	2	6	172395	172400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243776
4030	NC_009467	GCG	2	6	172413	172418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243776
4031	NC_009467	CGG	2	6	172568	172573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243776
4032	NC_009467	TC	4	8	172589	172596	0 %	50 %	0 %	50 %	148243776
4033	NC_009467	TG	3	6	172636	172641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_009467	CCA	2	6	172678	172683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_009467	GCC	2	6	172723	172728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_009467	ACCAA	2	10	172731	172740	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4037	NC_009467	AGA	2	6	172764	172769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_009467	TCGGGT	2	12	172776	172787	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4039	NC_009467	ATT	2	6	172835	172840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_009467	TCCCA	2	10	172846	172855	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4041	NC_009467	GAC	2	6	172896	172901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_009467	TAAT	2	8	172920	172927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009467	TGGC	2	8	172936	172943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_009467	GCCGG	2	10	172947	172956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4045	NC_009467	CCT	2	6	173022	173027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_009467	GAC	2	6	173264	173269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_009467	TGAC	2	8	173326	173333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_009467	CGGT	2	8	173335	173342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_009467	GCT	2	6	173356	173361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_009467	ACT	2	6	173486	173491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_009467	TCAT	2	8	173502	173509	25 %	50 %	0 %	25 %	148243777
4052	NC_009467	TCG	2	6	173576	173581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243777
4053	NC_009467	GCC	2	6	173639	173644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243777
4054	NC_009467	C	7	7	173687	173693	0 %	0 %	0 %	100 %	148243777
4055	NC_009467	ATAC	2	8	173777	173784	50 %	25 %	0 %	25 %	148243777
4056	NC_009467	GGC	2	6	173819	173824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243777
4057	NC_009467	GTT	2	6	173873	173878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243777
4058	NC_009467	AAGCT	2	10	173917	173926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4059	NC_009467	CAT	2	6	173940	173945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_009467	CGC	2	6	173949	173954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_009467	GT	3	6	173996	174001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009467	TGA	2	6	174015	174020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_009467	CAT	2	6	174037	174042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_009467	ATC	2	6	174131	174136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_009467	ACA	2	6	174137	174142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_009467	ATGA	2	8	174205	174212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_009467	AGC	2	6	174362	174367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_009467	CGGA	2	8	174399	174406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_009467	TGA	2	6	174441	174446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_009467	CAC	2	6	174455	174460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_009467	CGCAT	2	10	174471	174480	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4072	NC_009467	AAT	2	6	174580	174585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_009467	CCGA	2	8	174659	174666	25 %	0 %	25 %	50 %	148243778
4074	NC_009467	CGGTG	2	10	174676	174685	0 %	20 %	60 %	20 %	148243778
4075	NC_009467	GAG	2	6	174771	174776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243778
4076	NC_009467	GGC	2	6	174777	174782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243778
4077	NC_009467	GCA	2	6	174845	174850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243778
4078	NC_009467	TCG	2	6	174854	174859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243778
4079	NC_009467	CAT	2	6	174897	174902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243778
4080	NC_009467	C	6	6	174952	174957	0 %	0 %	0 %	100 %	148243779
4081	NC_009467	CAG	2	6	174973	174978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243779
4082	NC_009467	GCAG	2	8	174997	175004	25 %	0 %	50 %	25 %	148243779
4083	NC_009467	GTG	2	6	175008	175013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243779
4084	NC_009467	TCGGCC	2	12	175062	175073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243779
4085	NC_009467	TCT	2	6	175141	175146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_009467	TCA	2	6	175188	175193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_009467	TGCC	2	8	175219	175226	0 %	25 %	25 %	50 %	148243780
4088	NC_009467	GTTCG	2	10	175242	175251	0 %	40 %	40 %	20 %	148243780
4089	NC_009467	CCGC	2	8	175254	175261	0 %	0 %	25 %	75 %	148243780
4090	NC_009467	CAC	2	6	175272	175277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243780
4091	NC_009467	GCCT	2	8	175315	175322	0 %	25 %	25 %	50 %	148243780
4092	NC_009467	TCT	2	6	175392	175397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243780
4093	NC_009467	GCC	2	6	175409	175414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243780
4094	NC_009467	TC	3	6	175422	175427	0 %	50 %	0 %	50 %	148243780
4095	NC_009467	TGC	2	6	175436	175441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243780
4096	NC_009467	ATC	2	6	175514	175519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243780
4097	NC_009467	CTC	2	6	175543	175548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_009467	CG	3	6	175550	175555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_009467	CCGG	2	8	175587	175594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_009467	CAA	2	6	175748	175753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_009467	ACG	2	6	175762	175767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_009467	GCG	2	6	175831	175836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243781
4103	NC_009467	CCG	2	6	175847	175852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243781
4104	NC_009467	GATG	2	8	175899	175906	25 %	25 %	50 %	0 %	148243781
4105	NC_009467	AAG	2	6	175975	175980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243781
4106	NC_009467	CCG	2	6	176010	176015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243781
4107	NC_009467	GCA	2	6	176022	176027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243781
4108	NC_009467	GCA	2	6	176073	176078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243781
4109	NC_009467	GC	4	8	176080	176087	0 %	0 %	50 %	50 %	148243781
4110	NC_009467	CTG	2	6	176092	176097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243781
4111	NC_009467	ATC	2	6	176186	176191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243781
4112	NC_009467	GC	3	6	176270	176275	0 %	0 %	50 %	50 %	148243781
4113	NC_009467	GCG	2	6	176333	176338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243781
4114	NC_009467	GCG	2	6	176374	176379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243781
4115	NC_009467	TGCG	2	8	176443	176450	0 %	25 %	50 %	25 %	148243781
4116	NC_009467	TGC	2	6	176486	176491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243781
4117	NC_009467	TCA	2	6	176492	176497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243781
4118	NC_009467	CGGCT	2	10	176503	176512	0 %	20 %	40 %	40 %	148243781
4119	NC_009467	GC	3	6	176514	176519	0 %	0 %	50 %	50 %	148243781
4120	NC_009467	GAC	2	6	176545	176550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243781
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4122	NC_009467	CG	3	6	176701	176706	0 %	0 %	50 %	50 %	148243781
4123	NC_009467	CCGT	2	8	176712	176719	0 %	25 %	25 %	50 %	148243781
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4125	NC_009467	CGA	2	6	176859	176864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243781
4126	NC_009467	TGC	2	6	176876	176881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243781
4127	NC_009467	GAT	2	6	176904	176909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243781
4128	NC_009467	AT	3	6	176908	176913	50 %	50 %	0 %	0 %	148243781
4129	NC_009467	GC	3	6	176972	176977	0 %	0 %	50 %	50 %	148243781
4130	NC_009467	GCG	2	6	177017	177022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243782
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4132	NC_009467	CGC	2	6	177063	177068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243782
4133	NC_009467	AGCG	2	8	177087	177094	25 %	0 %	50 %	25 %	148243782
4134	NC_009467	ACGCT	2	10	177133	177142	20 %	20 %	20 %	40 %	148243782
4135	NC_009467	GCG	2	6	177168	177173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243782
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4139	NC_009467	GCGCTC	2	12	177417	177428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243782
4140	NC_009467	TGC	2	6	177460	177465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243782
4141	NC_009467	TGC	2	6	177499	177504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243782
4142	NC_009467	CGG	2	6	177574	177579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243782
4143	NC_009467	CAG	2	6	177654	177659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243782
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4146	NC_009467	ACCGG	2	10	177760	177769	20 %	0 %	40 %	40 %	148243782
4147	NC_009467	GC	3	6	177780	177785	0 %	0 %	50 %	50 %	148243782
4148	NC_009467	GAT	2	6	177788	177793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243782
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4154	NC_009467	GCT	3	9	178027	178035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243783
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4158	NC_009467	CGC	2	6	178174	178179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243783
4159	NC_009467	TTC	2	6	178190	178195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243783
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4161	NC_009467	GCT	2	6	178225	178230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243783
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4167	NC_009467	GC	3	6	178486	178491	0 %	0 %	50 %	50 %	148243783
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4179	NC_009467	GAT	2	6	179112	179117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243784
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4182	NC_009467	CCGG	2	8	179303	179310	0 %	0 %	50 %	50 %	148243784
4183	NC_009467	CTT	2	6	179343	179348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243784
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4192	NC_009467	GAT	2	6	179782	179787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4193	NC_009467	CTC	2	6	179810	179815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4195	NC_009467	CG	3	6	179887	179892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4196	NC_009467	TTG	2	6	179914	179919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4199	NC_009467	AACCG	2	10	180004	180013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4200	NC_009467	ATC	2	6	180045	180050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4201	NC_009467	TGA	2	6	180120	180125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4203	NC_009467	CAT	2	6	180182	180187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4205	NC_009467	GCG	2	6	180227	180232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4215	NC_009467	CGAGA	2	10	180595	180604	40 %	0 %	40 %	20 %	148243785
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4220	NC_009467	ATC	2	6	180717	180722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243786
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4227	NC_009467	CCG	2	6	181087	181092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4228	NC_009467	CGC	2	6	181158	181163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243787
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4230	NC_009467	CGG	2	6	181238	181243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243787
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4233	NC_009467	CAA	2	6	181481	181486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243787
4234	NC_009467	ACG	3	9	181507	181515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243787
4235	NC_009467	CTG	2	6	181530	181535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243787
4236	NC_009467	GCG	2	6	181571	181576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243787
4237	NC_009467	CCA	2	6	181702	181707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243788
4238	NC_009467	GCG	2	6	181722	181727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243788
4239	NC_009467	CGCA	2	8	181811	181818	25 %	0 %	25 %	50 %	148243788
4240	NC_009467	GCG	2	6	181821	181826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243788
4241	NC_009467	CGAT	2	8	181872	181879	25 %	25 %	25 %	25 %	148243788
4242	NC_009467	TGCC	2	8	181961	181968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_009467	GAG	2	6	182032	182037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_009467	A	6	6	182072	182077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_009467	GCC	2	6	182098	182103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4246	NC_009467	ATCA	2	8	182124	182131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4247	NC_009467	CTTC	2	8	182145	182152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4248	NC_009467	CTC	2	6	182215	182220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4249	NC_009467	AT	3	6	182255	182260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_009467	CTA	2	6	182410	182415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243789
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4253	NC_009467	CCG	2	6	182542	182547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243789
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4257	NC_009467	ACC	2	6	182699	182704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4258	NC_009467	CGG	2	6	182705	182710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_009467	GTC	2	6	182717	182722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4347	NC_009467	CCA	2	6	186806	186811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243792
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4352	NC_009467	ATC	2	6	186900	186905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243792
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4360	NC_009467	CAA	2	6	187280	187285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243792
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4368	NC_009467	C	6	6	187625	187630	0 %	0 %	0 %	100 %	148243792
4369	NC_009467	AAG	2	6	187698	187703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243792
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4372	NC_009467	GTCG	2	8	187952	187959	0 %	25 %	50 %	25 %	148243793
4373	NC_009467	CGA	2	6	188020	188025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243793
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4497	NC_009467	CG	4	8	194236	194243	0 %	0 %	50 %	50 %	148243798
4498	NC_009467	GCT	2	6	194251	194256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243798
4499	NC_009467	CGGCG	2	10	194257	194266	0 %	0 %	60 %	40 %	148243798
4500	NC_009467	GCA	2	6	194338	194343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243798

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