MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 3245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	CCT	2	6	103	108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009349	ATC	2	6	159	164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009349	TGC	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
4	NC_009349	CT	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	145301212
5	NC_009349	TCCA	2	8	334	341	25 %	25 %	0 %	50 %	145301212
6	NC_009349	CTC	2	6	346	351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301212
7	NC_009349	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301212
8	NC_009349	GCT	2	6	522	527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
9	NC_009349	GAG	2	6	532	537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301212
10	NC_009349	ACT	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301212
11	NC_009349	CGG	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301212
12	NC_009349	CTG	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
13	NC_009349	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
14	NC_009349	CAAGGC	2	12	987	998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
15	NC_009349	GGTG	2	8	1002	1009	0 %	25 %	75 %	0 %	145301212
16	NC_009349	TCG	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
17	NC_009349	CTT	2	6	1056	1061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301212
18	NC_009349	GAAC	2	8	1101	1108	50 %	0 %	25 %	25 %	145301212
19	NC_009349	GGTCAA	2	12	1227	1238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301212
20	NC_009349	AGC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
21	NC_009349	AC	3	6	1325	1330	50 %	0 %	0 %	50 %	145301212
22	NC_009349	AGCA	2	8	1429	1436	50 %	0 %	25 %	25 %	145301212
23	NC_009349	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
24	NC_009349	TGC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
25	NC_009349	AGC	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
26	NC_009349	CAA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
27	NC_009349	CAA	3	9	1842	1850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
28	NC_009349	CTG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
29	NC_009349	CGAACA	2	12	1910	1921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301213
30	NC_009349	AGC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
31	NC_009349	CTGTGG	2	12	2099	2110	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301213
32	NC_009349	ACCT	2	8	2115	2122	25 %	25 %	0 %	50 %	145301213
33	NC_009349	TAC	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301213
34	NC_009349	CTG	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
35	NC_009349	TGAGC	2	10	2198	2207	20 %	20 %	40 %	20 %	145301213
36	NC_009349	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
37	NC_009349	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
38	NC_009349	CTG	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
39	NC_009349	GAT	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301213
40	NC_009349	CGA	2	6	2359	2364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
41	NC_009349	GTCA	2	8	2370	2377	25 %	25 %	25 %	25 %	145301213
42	NC_009349	ACA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
43	NC_009349	AGC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301214
44	NC_009349	CAC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301214
45	NC_009349	TGA	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301214
46	NC_009349	TCG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009349	TAC	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009349	ATC	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009349	AAAAAT	2	12	3332	3343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009349	TAC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009349	CAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301215
52	NC_009349	TTA	3	9	3400	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301215
53	NC_009349	TGGA	2	8	3412	3419	25 %	25 %	50 %	0 %	145301215
54	NC_009349	AT	3	6	3421	3426	50 %	50 %	0 %	0 %	145301215
55	NC_009349	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
56	NC_009349	CCT	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
57	NC_009349	TAA	2	6	3528	3533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
58	NC_009349	TGG	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301215
59	NC_009349	TGTAT	2	10	3555	3564	20 %	60 %	20 %	0 %	145301215
60	NC_009349	CCT	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
61	NC_009349	G	7	7	3704	3710	0 %	0 %	100 %	0 %	145301215
62	NC_009349	AAT	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
63	NC_009349	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
64	NC_009349	TTG	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301215
65	NC_009349	CAG	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
66	NC_009349	CGT	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
67	NC_009349	AG	3	6	4095	4100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009349	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
69	NC_009349	TCA	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
70	NC_009349	T	7	7	4143	4149	0 %	100 %	0 %	0 %	145301216
71	NC_009349	TTA	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
72	NC_009349	TTG	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301216
73	NC_009349	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
74	NC_009349	GTC	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
75	NC_009349	TAT	2	6	4326	4331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
76	NC_009349	CAGC	2	8	4377	4384	25 %	0 %	25 %	50 %	145301216
77	NC_009349	CAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301216
78	NC_009349	TTGGT	2	10	4495	4504	0 %	60 %	40 %	0 %	145301216
79	NC_009349	ATG	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
80	NC_009349	TGG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
81	NC_009349	TGG	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
82	NC_009349	GCT	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
83	NC_009349	CAAT	2	8	4695	4702	50 %	25 %	0 %	25 %	145301216
84	NC_009349	TCC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301216
85	NC_009349	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
86	NC_009349	TCA	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
87	NC_009349	ATTG	2	8	4774	4781	25 %	50 %	25 %	0 %	145301216
88	NC_009349	AC	3	6	4877	4882	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
89	NC_009349	TGC	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
90	NC_009349	AG	3	6	4935	4940	50 %	0 %	50 %	0 %	145301216
91	NC_009349	TGG	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
92	NC_009349	AC	3	6	5135	5140	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
93	NC_009349	TGTA	2	8	5235	5242	25 %	50 %	25 %	0 %	145301216
94	NC_009349	GGCAG	2	10	5276	5285	20 %	0 %	60 %	20 %	145301216
95	NC_009349	ATGGTA	2	12	5327	5338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009349	ACCG	2	8	5368	5375	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009349	ACT	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009349	ATT	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009349	AGT	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009349	TCC	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009349	CCA	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009349	GAG	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009349	ACCC	2	8	5786	5793	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_009349	TCA	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009349	AC	3	6	5906	5911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009349	TCG	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009349	CAT	2	6	6125	6130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009349	GGC	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301217
109	NC_009349	TCA	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301217
110	NC_009349	TTG	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301217
111	NC_009349	GTC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301217
112	NC_009349	GTTG	2	8	6299	6306	0 %	50 %	50 %	0 %	145301217
113	NC_009349	GAT	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
114	NC_009349	TGA	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
115	NC_009349	CTCAC	2	10	6543	6552	20 %	20 %	0 %	60 %	145301217
116	NC_009349	AGG	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301217
117	NC_009349	GAG	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301218
118	NC_009349	ATGA	2	8	6802	6809	50 %	25 %	25 %	0 %	145301218
119	NC_009349	CTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301218
120	NC_009349	TGG	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301218
121	NC_009349	ACC	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301218
122	NC_009349	CTG	2	6	7152	7157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009349	ATT	2	6	7174	7179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009349	TGT	2	6	7201	7206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009349	CGG	2	6	7320	7325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301219
126	NC_009349	GCCT	2	8	7364	7371	0 %	25 %	25 %	50 %	145301219
127	NC_009349	A	6	6	7391	7396	100 %	0 %	0 %	0 %	145301219
128	NC_009349	TGC	2	6	7436	7441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301219
129	NC_009349	GC	3	6	7456	7461	0 %	0 %	50 %	50 %	145301219
130	NC_009349	TGG	2	6	7491	7496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
131	NC_009349	CGA	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301219
132	NC_009349	GTG	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
133	NC_009349	CTC	2	6	7580	7585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009349	AGC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
135	NC_009349	CAGC	2	8	7671	7678	25 %	0 %	25 %	50 %	145301220
136	NC_009349	CTG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
137	NC_009349	GTC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
138	NC_009349	GCC	3	9	8016	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
139	NC_009349	ATG	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
140	NC_009349	CTG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
141	NC_009349	GCC	2	6	8127	8132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
142	NC_009349	GGT	2	6	8184	8189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
143	NC_009349	GGCG	2	8	8238	8245	0 %	0 %	75 %	25 %	145301220
144	NC_009349	ACC	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
145	NC_009349	GCTC	2	8	8288	8295	0 %	25 %	25 %	50 %	145301220
146	NC_009349	GGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
147	NC_009349	GGC	2	6	8318	8323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
148	NC_009349	CTG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
149	NC_009349	GAA	2	6	8353	8358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301220
150	NC_009349	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
151	NC_009349	CGG	2	6	8467	8472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
152	NC_009349	AAC	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301220
153	NC_009349	AT	3	6	8654	8659	50 %	50 %	0 %	0 %	145301220
154	NC_009349	AG	3	6	8662	8667	50 %	0 %	50 %	0 %	145301220
155	NC_009349	CGG	2	6	8732	8737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
156	NC_009349	GCC	2	6	8743	8748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
157	NC_009349	CCA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
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159	NC_009349	GCAG	2	8	8862	8869	25 %	0 %	50 %	25 %	145301220
160	NC_009349	GGC	2	6	8914	8919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
161	NC_009349	GAT	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
162	NC_009349	CCCCT	2	10	8942	8951	0 %	20 %	0 %	80 %	145301220
163	NC_009349	GGC	2	6	8962	8967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
164	NC_009349	GCA	2	6	9036	9041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
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166	NC_009349	TGC	2	6	9290	9295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301221
167	NC_009349	G	7	7	9372	9378	0 %	0 %	100 %	0 %	145301221
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170	NC_009349	TCGCC	2	10	9504	9513	0 %	20 %	20 %	60 %	145301221
171	NC_009349	TCAC	2	8	9530	9537	25 %	25 %	0 %	50 %	145301221
172	NC_009349	AGCG	2	8	9548	9555	25 %	0 %	50 %	25 %	145301221
173	NC_009349	CAT	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301221
174	NC_009349	C	6	6	9641	9646	0 %	0 %	0 %	100 %	145301221
175	NC_009349	AGGG	2	8	9681	9688	25 %	0 %	75 %	0 %	145301221
176	NC_009349	GTT	2	6	9693	9698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301221
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243	NC_009349	TAAT	2	8	12991	12998	50 %	50 %	0 %	0 %	145301224
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252	NC_009349	GTT	2	6	13481	13486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301224
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261	NC_009349	T	6	6	13811	13816	0 %	100 %	0 %	0 %	145301224
262	NC_009349	GGT	2	6	13854	13859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301225
263	NC_009349	TA	3	6	13902	13907	50 %	50 %	0 %	0 %	145301225
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266	NC_009349	T	6	6	14069	14074	0 %	100 %	0 %	0 %	145301225
267	NC_009349	CG	3	6	14279	14284	0 %	0 %	50 %	50 %	145301225
268	NC_009349	A	6	6	14312	14317	100 %	0 %	0 %	0 %	145301225
269	NC_009349	ACC	2	6	14347	14352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301225
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271	NC_009349	TGGA	2	8	14380	14387	25 %	25 %	50 %	0 %	145301225
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275	NC_009349	CAC	2	6	14499	14504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301225
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279	NC_009349	CAA	3	9	14743	14751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_009349	TGA	2	6	14802	14807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_009349	ATTT	2	8	14907	14914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_009349	TAA	2	6	19738	19743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
374	NC_009349	TAATT	2	10	19756	19765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_009349	A	6	6	19787	19792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_009349	AAT	2	6	20751	20756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_009349	GTT	2	6	20791	20796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
389	NC_009349	TTTGA	2	10	20833	20842	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
390	NC_009349	A	9	9	20877	20885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_009349	AC	4	8	20910	20917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
392	NC_009349	GGA	2	6	20925	20930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
393	NC_009349	TCA	2	6	20945	20950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_009349	GTAA	2	8	20955	20962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
395	NC_009349	CCT	2	6	21112	21117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
396	NC_009349	TCT	2	6	21154	21159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_009349	AAC	2	6	21169	21174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_009349	TAC	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_009349	C	6	6	21219	21224	0 %	0 %	0 %	100 %	145301233
400	NC_009349	TTG	2	6	21285	21290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301233
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429	NC_009349	GGA	2	6	22614	22619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301235
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459	NC_009349	ATG	2	6	24255	24260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_009349	TGT	2	6	24320	24325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_009349	TGG	2	6	24344	24349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_009349	CAT	2	6	25271	25276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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486	NC_009349	CAC	2	6	25603	25608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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489	NC_009349	A	6	6	25719	25724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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