MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 3245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009349	TCA	2	6	153406	153411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301375
3002	NC_009349	TCA	2	6	153437	153442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301375
3003	NC_009349	GT	3	6	153455	153460	0 %	50 %	50 %	0 %	145301375
3004	NC_009349	CAA	2	6	153542	153547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301375
3005	NC_009349	ATG	2	6	153595	153600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301375
3006	NC_009349	GCG	2	6	153626	153631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301375
3007	NC_009349	GCT	2	6	153668	153673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301375
3008	NC_009349	GTT	2	6	153674	153679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301375
3009	NC_009349	T	7	7	153698	153704	0 %	100 %	0 %	0 %	145301375
3010	NC_009349	TTC	2	6	153712	153717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301375
3011	NC_009349	ACC	2	6	153726	153731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301375
3012	NC_009349	TGG	2	6	153753	153758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301375
3013	NC_009349	GTG	2	6	153760	153765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301375
3014	NC_009349	ACT	2	6	153769	153774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301375
3015	NC_009349	GCTG	2	8	153778	153785	0 %	25 %	50 %	25 %	145301375
3016	NC_009349	GTC	2	6	153795	153800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301375
3017	NC_009349	TCC	2	6	153810	153815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301375
3018	NC_009349	CAGC	2	8	153848	153855	25 %	0 %	25 %	50 %	145301375
3019	NC_009349	CAG	2	6	153875	153880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301375
3020	NC_009349	CAG	2	6	153882	153887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301375
3021	NC_009349	TCA	3	9	153913	153921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301375
3022	NC_009349	TCA	2	6	153934	153939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301375
3023	NC_009349	CGCC	2	8	153986	153993	0 %	0 %	25 %	75 %	145301375
3024	NC_009349	TGG	2	6	154002	154007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301375
3025	NC_009349	GCA	2	6	154043	154048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301375
3026	NC_009349	ATC	2	6	154081	154086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301375
3027	NC_009349	GTA	2	6	154110	154115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301375
3028	NC_009349	CGG	2	6	154339	154344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301375
3029	NC_009349	GA	3	6	154534	154539	50 %	0 %	50 %	0 %	145301375
3030	NC_009349	GAT	2	6	154560	154565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301375
3031	NC_009349	AG	4	8	154580	154587	50 %	0 %	50 %	0 %	145301375
3032	NC_009349	AGCG	2	8	154728	154735	25 %	0 %	50 %	25 %	145301375
3033	NC_009349	GCA	2	6	154751	154756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301375
3034	NC_009349	CGC	2	6	154801	154806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301375
3035	NC_009349	CCA	2	6	154894	154899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301375
3036	NC_009349	GGT	2	6	154907	154912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301375
3037	NC_009349	GAGT	2	8	155007	155014	25 %	25 %	50 %	0 %	145301375
3038	NC_009349	CAGG	2	8	155072	155079	25 %	0 %	50 %	25 %	145301375
3039	NC_009349	AGG	2	6	155091	155096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301375
3040	NC_009349	AAC	2	6	155185	155190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301375
3041	NC_009349	CGT	2	6	155237	155242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_009349	TCC	2	6	155322	155327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_009349	ATG	2	6	155348	155353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_009349	AAGG	2	8	155356	155363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009349	AC	3	6	155428	155433	50 %	0 %	0 %	50 %	145301376
3046	NC_009349	GGGCG	2	10	155523	155532	0 %	0 %	80 %	20 %	145301376
3047	NC_009349	GCG	2	6	155535	155540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301376
3048	NC_009349	ACCA	2	8	155895	155902	50 %	0 %	0 %	50 %	145301376
3049	NC_009349	GTG	2	6	155958	155963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301376
3050	NC_009349	GGC	2	6	156061	156066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_009349	G	6	6	156171	156176	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009349	GT	3	6	156233	156238	0 %	50 %	50 %	0 %	145301377
3053	NC_009349	TCA	2	6	156290	156295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301377
3054	NC_009349	CGA	2	6	156333	156338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301377
3055	NC_009349	ACG	2	6	156341	156346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301377
3056	NC_009349	TC	3	6	156364	156369	0 %	50 %	0 %	50 %	145301377
3057	NC_009349	CT	3	6	156372	156377	0 %	50 %	0 %	50 %	145301377
3058	NC_009349	TAC	2	6	156643	156648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301377
3059	NC_009349	GGC	2	6	156659	156664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301377
3060	NC_009349	GCC	2	6	156698	156703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301377
3061	NC_009349	GT	3	6	156784	156789	0 %	50 %	50 %	0 %	145301377
3062	NC_009349	GAG	2	6	156895	156900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301377
3063	NC_009349	CGA	2	6	156906	156911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301377
3064	NC_009349	TCA	2	6	156980	156985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301377
3065	NC_009349	CAG	2	6	157048	157053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301377
3066	NC_009349	GCA	2	6	157058	157063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301377
3067	NC_009349	CAG	2	6	157084	157089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301377
3068	NC_009349	TCC	2	6	157196	157201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301377
3069	NC_009349	TGG	2	6	157238	157243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301377
3070	NC_009349	CAC	2	6	157300	157305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301377
3071	NC_009349	ATC	2	6	157309	157314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301377
3072	NC_009349	CCAG	2	8	157321	157328	25 %	0 %	25 %	50 %	145301377
3073	NC_009349	CCG	2	6	157380	157385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301377
3074	NC_009349	GAGTTT	2	12	157411	157422	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	145301377
3075	NC_009349	ACCA	2	8	157482	157489	50 %	0 %	0 %	50 %	145301377
3076	NC_009349	GTT	2	6	157506	157511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301377
3077	NC_009349	GAAG	2	8	157536	157543	50 %	0 %	50 %	0 %	145301377
3078	NC_009349	CCCGC	3	15	157646	157660	0 %	0 %	20 %	80 %	145301377
3079	NC_009349	GAG	2	6	157717	157722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301377
3080	NC_009349	CGAG	2	8	157774	157781	25 %	0 %	50 %	25 %	145301377
3081	NC_009349	CAT	2	6	157782	157787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301377
3082	NC_009349	A	6	6	157825	157830	100 %	0 %	0 %	0 %	145301377
3083	NC_009349	TAC	2	6	157871	157876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301377
3084	NC_009349	GCC	2	6	157906	157911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301377
3085	NC_009349	A	6	6	157928	157933	100 %	0 %	0 %	0 %	145301377
3086	NC_009349	TGTC	2	8	157955	157962	0 %	50 %	25 %	25 %	145301377
3087	NC_009349	AGC	2	6	158003	158008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301377
3088	NC_009349	CGG	2	6	158015	158020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301377
3089	NC_009349	TTC	2	6	158143	158148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301377
3090	NC_009349	AAG	2	6	158173	158178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301377
3091	NC_009349	CCTG	2	8	158233	158240	0 %	25 %	25 %	50 %	145301377
3092	NC_009349	AGGCA	2	10	158274	158283	40 %	0 %	40 %	20 %	145301377
3093	NC_009349	CCA	2	6	158300	158305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301377
3094	NC_009349	TGA	3	9	158407	158415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301378
3095	NC_009349	GGC	2	6	158444	158449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301378
3096	NC_009349	GGA	2	6	158510	158515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301378
3097	NC_009349	CT	3	6	158538	158543	0 %	50 %	0 %	50 %	145301378
3098	NC_009349	TGG	2	6	158635	158640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301378
3099	NC_009349	GAA	2	6	158762	158767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301379
3100	NC_009349	GAT	2	6	158816	158821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301379
3101	NC_009349	TGA	2	6	158870	158875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301379
3102	NC_009349	CCT	2	6	158902	158907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301379
3103	NC_009349	CTG	2	6	158914	158919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301379
3104	NC_009349	AGTC	2	8	158950	158957	25 %	25 %	25 %	25 %	145301379
3105	NC_009349	CCA	2	6	159003	159008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301379
3106	NC_009349	GTC	2	6	159015	159020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301379
3107	NC_009349	CTA	2	6	159094	159099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301379
3108	NC_009349	CCCT	2	8	159282	159289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3109	NC_009349	ATC	2	6	159323	159328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_009349	GCC	2	6	159416	159421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301380
3111	NC_009349	G	6	6	159461	159466	0 %	0 %	100 %	0 %	145301380
3112	NC_009349	CTGA	2	8	159653	159660	25 %	25 %	25 %	25 %	145301380
3113	NC_009349	GA	3	6	159662	159667	50 %	0 %	50 %	0 %	145301380
3114	NC_009349	TTC	2	6	159707	159712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301380
3115	NC_009349	TCA	2	6	159804	159809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301380
3116	NC_009349	GCT	2	6	159871	159876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
3117	NC_009349	GAG	2	6	159950	159955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301380
3118	NC_009349	GGC	2	6	160051	160056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301380
3119	NC_009349	TGG	2	6	160072	160077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301380
3120	NC_009349	CTG	2	6	160133	160138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
3121	NC_009349	TGC	2	6	160142	160147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
3122	NC_009349	ATG	2	6	160148	160153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301380
3123	NC_009349	G	6	6	160158	160163	0 %	0 %	100 %	0 %	145301380
3124	NC_009349	TGAT	2	8	160203	160210	25 %	50 %	25 %	0 %	145301380
3125	NC_009349	AGC	2	6	160215	160220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301380
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3127	NC_009349	CTG	2	6	160346	160351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301380
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3227	NC_009349	AGT	2	6	165558	165563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3244	NC_009349	ATCA	2	8	166619	166626	50 %	25 %	0 %	25 %	145301384
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.