MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 44772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009053	TGA	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207489
2	NC_009053	TAT	2	6	158	163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207489
3	NC_009053	TTG	2	6	337	342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207489
4	NC_009053	TCG	2	6	376	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207489
5	NC_009053	T	6	6	392	397	0 %	100 %	0 %	0 %	126207489
6	NC_009053	CGG	2	6	445	450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207489
7	NC_009053	TC	3	6	463	468	0 %	50 %	0 %	50 %	126207489
8	NC_009053	AGC	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207489
9	NC_009053	AGA	2	6	494	499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207489
10	NC_009053	CCAA	2	8	577	584	50 %	0 %	0 %	50 %	126207489
11	NC_009053	CAA	2	6	603	608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207489
12	NC_009053	GGT	2	6	657	662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207489
13	NC_009053	TTA	2	6	684	689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207489
14	NC_009053	CGGT	2	8	694	701	0 %	25 %	50 %	25 %	126207489
15	NC_009053	TGA	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207489
16	NC_009053	AAG	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207489
17	NC_009053	TAA	2	6	923	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207489
18	NC_009053	ATT	2	6	933	938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207489
19	NC_009053	A	6	6	959	964	100 %	0 %	0 %	0 %	126207489
20	NC_009053	GAA	2	6	978	983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207489
21	NC_009053	TGA	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207489
22	NC_009053	AGA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207489
23	NC_009053	A	6	6	1282	1287	100 %	0 %	0 %	0 %	126207489
24	NC_009053	ACA	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207489
25	NC_009053	TCGC	2	8	1351	1358	0 %	25 %	25 %	50 %	126207489
26	NC_009053	CGG	2	6	1430	1435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207489
27	NC_009053	AAG	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207489
28	NC_009053	ATT	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009053	ACA	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207490
30	NC_009053	AGC	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207490
31	NC_009053	TAA	2	6	1653	1658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207490
32	NC_009053	AGC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207490
33	NC_009053	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207490
34	NC_009053	GTTA	2	8	1857	1864	25 %	50 %	25 %	0 %	126207490
35	NC_009053	ATTTA	2	10	1881	1890	40 %	60 %	0 %	0 %	126207490
36	NC_009053	TGAT	2	8	1979	1986	25 %	50 %	25 %	0 %	126207490
37	NC_009053	ACGG	2	8	2080	2087	25 %	0 %	50 %	25 %	126207490
38	NC_009053	TTA	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207490
39	NC_009053	GTGA	2	8	2191	2198	25 %	25 %	50 %	0 %	126207490
40	NC_009053	GT	3	6	2237	2242	0 %	50 %	50 %	0 %	126207490
41	NC_009053	GTG	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207490
42	NC_009053	TGCG	2	8	2369	2376	0 %	25 %	50 %	25 %	126207490
43	NC_009053	GCGT	2	8	2405	2412	0 %	25 %	50 %	25 %	126207490
44	NC_009053	AAG	3	9	2462	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207490
45	NC_009053	TGG	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207490
46	NC_009053	GCT	2	6	2603	2608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207490
47	NC_009053	CCG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207490
48	NC_009053	CTTT	2	8	2679	2686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009053	AAAG	2	8	2695	2702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009053	ATT	2	6	2715	2720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009053	TTC	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009053	AAGC	2	8	2800	2807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009053	GACAA	2	10	2865	2874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009053	A	6	6	2889	2894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009053	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009053	AG	3	6	2988	2993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009053	AT	3	6	2997	3002	50 %	50 %	0 %	0 %	126207491
58	NC_009053	ATC	2	6	3019	3024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207491
59	NC_009053	AAT	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207491
60	NC_009053	TC	3	6	3046	3051	0 %	50 %	0 %	50 %	126207491
61	NC_009053	TAATTT	2	12	3069	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207491
62	NC_009053	TTG	2	6	3115	3120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207491
63	NC_009053	T	6	6	3128	3133	0 %	100 %	0 %	0 %	126207491
64	NC_009053	CGGT	2	8	3144	3151	0 %	25 %	50 %	25 %	126207491
65	NC_009053	ATT	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207491
66	NC_009053	AGA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207491
67	NC_009053	TGA	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207491
68	NC_009053	GGTC	2	8	3242	3249	0 %	25 %	50 %	25 %	126207491
69	NC_009053	A	6	6	3259	3264	100 %	0 %	0 %	0 %	126207491
70	NC_009053	TTA	2	6	3370	3375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207491
71	NC_009053	GCA	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207491
72	NC_009053	TGCG	2	8	3572	3579	0 %	25 %	50 %	25 %	126207491
73	NC_009053	TG	4	8	3833	3840	0 %	50 %	50 %	0 %	126207491
74	NC_009053	GAT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207491
75	NC_009053	CAA	2	6	4060	4065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207491
76	NC_009053	TAAA	2	8	4077	4084	75 %	25 %	0 %	0 %	126207491
77	NC_009053	A	6	6	4082	4087	100 %	0 %	0 %	0 %	126207491
78	NC_009053	T	6	6	4107	4112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009053	ATTT	2	8	4124	4131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009053	TGA	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207492
81	NC_009053	CGC	2	6	4150	4155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207492
82	NC_009053	ACCGCC	2	12	4169	4180	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126207492
83	NC_009053	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	126207492
84	NC_009053	AAT	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207492
85	NC_009053	GTT	2	6	4363	4368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207492
86	NC_009053	TTTC	2	8	4429	4436	0 %	75 %	0 %	25 %	126207492
87	NC_009053	TACCG	2	10	4541	4550	20 %	20 %	20 %	40 %	126207492
88	NC_009053	GTT	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207492
89	NC_009053	T	6	6	4625	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	126207492
90	NC_009053	ATGATC	2	12	4631	4642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126207492
91	NC_009053	AAT	2	6	4674	4679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207492
92	NC_009053	TG	3	6	4741	4746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009053	ATA	2	6	4774	4779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009053	TAG	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009053	AAAT	2	8	4849	4856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009053	TTC	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207493
97	NC_009053	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207493
98	NC_009053	A	7	7	5085	5091	100 %	0 %	0 %	0 %	126207493
99	NC_009053	ACGA	2	8	5128	5135	50 %	0 %	25 %	25 %	126207493
100	NC_009053	CGC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207493
101	NC_009053	A	6	6	5265	5270	100 %	0 %	0 %	0 %	126207493
102	NC_009053	CGG	2	6	5289	5294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207493
103	NC_009053	CGG	2	6	5328	5333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207493
104	NC_009053	GGTGCG	2	12	5392	5403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126207493
105	NC_009053	CAT	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207493
106	NC_009053	CCGA	2	8	5536	5543	25 %	0 %	25 %	50 %	126207493
107	NC_009053	ATT	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207493
108	NC_009053	AGA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207493
109	NC_009053	CAA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207493
110	NC_009053	TG	3	6	5692	5697	0 %	50 %	50 %	0 %	126207493
111	NC_009053	A	6	6	5746	5751	100 %	0 %	0 %	0 %	126207493
112	NC_009053	ATT	2	6	5779	5784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207493
113	NC_009053	GCG	2	6	5785	5790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207493
114	NC_009053	CGGT	2	8	5882	5889	0 %	25 %	50 %	25 %	126207493
115	NC_009053	ATT	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207493
116	NC_009053	AAT	2	6	6002	6007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207493
117	NC_009053	ATTA	2	8	6012	6019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009053	A	7	7	6046	6052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009053	TTAT	2	8	6070	6077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009053	A	6	6	6084	6089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009053	TGT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009053	ATA	2	6	6123	6128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009053	CGC	2	6	6187	6192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207494
124	NC_009053	CCA	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126207494
125	NC_009053	T	6	6	6311	6316	0 %	100 %	0 %	0 %	126207494
126	NC_009053	TTA	2	6	6321	6326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207494
127	NC_009053	ATC	2	6	6389	6394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207494
128	NC_009053	CTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207494
129	NC_009053	CGTT	2	8	6438	6445	0 %	50 %	25 %	25 %	126207494
130	NC_009053	GATT	2	8	6456	6463	25 %	50 %	25 %	0 %	126207494
131	NC_009053	ACG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207494
132	NC_009053	GA	3	6	6586	6591	50 %	0 %	50 %	0 %	126207494
133	NC_009053	CGT	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207494
134	NC_009053	CCG	2	6	6714	6719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207494
135	NC_009053	TAA	2	6	6791	6796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207494
136	NC_009053	GTTT	2	8	6831	6838	0 %	75 %	25 %	0 %	126207494
137	NC_009053	GTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207494
138	NC_009053	TTTA	2	8	7073	7080	25 %	75 %	0 %	0 %	126207494
139	NC_009053	AAT	2	6	7194	7199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207494
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