MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008782	ACGC	2	8	120952	120959	25 %	0 %	25 %	50 %	121592542
3502	NC_008782	TGA	2	6	121011	121016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592542
3503	NC_008782	CTAT	2	8	121056	121063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_008782	CCA	2	6	121121	121126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592543
3505	NC_008782	GGCG	2	8	121148	121155	0 %	0 %	75 %	25 %	121592543
3506	NC_008782	CTG	2	6	121164	121169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592543
3507	NC_008782	GCC	2	6	121176	121181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592543
3508	NC_008782	CG	3	6	121199	121204	0 %	0 %	50 %	50 %	121592543
3509	NC_008782	CGC	2	6	121211	121216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592543
3510	NC_008782	TCG	2	6	121240	121245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592543
3511	NC_008782	CGGC	2	8	121255	121262	0 %	0 %	50 %	50 %	121592543
3512	NC_008782	CAC	2	6	121265	121270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592543
3513	NC_008782	AGCG	2	8	121305	121312	25 %	0 %	50 %	25 %	121592543
3514	NC_008782	GTG	2	6	121329	121334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592543
3515	NC_008782	ACA	2	6	121336	121341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592543
3516	NC_008782	GCGG	2	8	121350	121357	0 %	0 %	75 %	25 %	121592543
3517	NC_008782	GCA	2	6	121366	121371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592543
3518	NC_008782	GC	5	10	121380	121389	0 %	0 %	50 %	50 %	121592543
3519	NC_008782	TGG	2	6	121411	121416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592543
3520	NC_008782	CAC	2	6	121568	121573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592543
3521	NC_008782	GCT	2	6	121646	121651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592543
3522	NC_008782	GTG	2	6	121674	121679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592543
3523	NC_008782	CCA	2	6	121708	121713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592543
3524	NC_008782	TGCG	2	8	121792	121799	0 %	25 %	50 %	25 %	121592543
3525	NC_008782	CG	3	6	121819	121824	0 %	0 %	50 %	50 %	121592543
3526	NC_008782	CTT	2	6	121898	121903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592543
3527	NC_008782	CGC	2	6	121918	121923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592543
3528	NC_008782	CGT	2	6	121928	121933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592543
3529	NC_008782	GAA	2	6	121934	121939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592543
3530	NC_008782	TGC	2	6	121963	121968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592543
3531	NC_008782	GCC	2	6	122008	122013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592543
3532	NC_008782	CGG	2	6	122015	122020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592543
3533	NC_008782	GCC	2	6	122024	122029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592543
3534	NC_008782	TGG	2	6	122047	122052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592543
3535	NC_008782	GC	3	6	122074	122079	0 %	0 %	50 %	50 %	121592543
3536	NC_008782	AGG	2	6	122113	122118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008782	TCC	3	9	122133	122141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121592544
3538	NC_008782	GCC	2	6	122149	122154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592544
3539	NC_008782	CGG	2	6	122168	122173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592544
3540	NC_008782	CG	3	6	122214	122219	0 %	0 %	50 %	50 %	121592544
3541	NC_008782	GTG	2	6	122229	122234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592544
3542	NC_008782	GCA	2	6	122261	122266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592544
3543	NC_008782	GGC	2	6	122267	122272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592544
3544	NC_008782	GC	4	8	122282	122289	0 %	0 %	50 %	50 %	121592544
3545	NC_008782	CGCTG	2	10	122345	122354	0 %	20 %	40 %	40 %	121592544
3546	NC_008782	ATCGAC	2	12	122463	122474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	121592544
3547	NC_008782	TGC	2	6	122494	122499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592544
3548	NC_008782	TCA	2	6	122539	122544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592544
3549	NC_008782	CCA	2	6	122572	122577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592544
3550	NC_008782	ATG	2	6	122619	122624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592544
3551	NC_008782	CG	3	6	122626	122631	0 %	0 %	50 %	50 %	121592544
3552	NC_008782	GCCCG	2	10	122681	122690	0 %	0 %	40 %	60 %	121592544
3553	NC_008782	GCG	2	6	122711	122716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592544
3554	NC_008782	TCG	2	6	122817	122822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592544
3555	NC_008782	CGG	2	6	122864	122869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592544
3556	NC_008782	TCG	2	6	122871	122876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592544
3557	NC_008782	CGG	2	6	122882	122887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592544
3558	NC_008782	GC	3	6	122897	122902	0 %	0 %	50 %	50 %	121592544
3559	NC_008782	CCA	2	6	122997	123002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592545
3560	NC_008782	GGT	2	6	123046	123051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592545
3561	NC_008782	CG	3	6	123080	123085	0 %	0 %	50 %	50 %	121592545
3562	NC_008782	CGGGCG	2	12	123096	123107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592545
3563	NC_008782	GCG	2	6	123123	123128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592545
3564	NC_008782	CGC	2	6	123142	123147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592545
3565	NC_008782	CGG	2	6	123163	123168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592545
3566	NC_008782	CTGC	2	8	123187	123194	0 %	25 %	25 %	50 %	121592545
3567	NC_008782	TGC	2	6	123216	123221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592545
3568	NC_008782	TGC	2	6	123238	123243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592545
3569	NC_008782	CTGGCG	2	12	123278	123289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121592545
3570	NC_008782	TCA	2	6	123297	123302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592545
3571	NC_008782	CG	4	8	123314	123321	0 %	0 %	50 %	50 %	121592545
3572	NC_008782	GTG	2	6	123350	123355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592545
3573	NC_008782	GCG	2	6	123365	123370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592545
3574	NC_008782	CG	3	6	123384	123389	0 %	0 %	50 %	50 %	121592545
3575	NC_008782	TGG	2	6	123390	123395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592545
3576	NC_008782	GC	3	6	123407	123412	0 %	0 %	50 %	50 %	121592545
3577	NC_008782	CGA	2	6	123445	123450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592545
3578	NC_008782	GC	3	6	123521	123526	0 %	0 %	50 %	50 %	121592545
3579	NC_008782	GCTC	2	8	123570	123577	0 %	25 %	25 %	50 %	121592545
3580	NC_008782	CGT	2	6	123600	123605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592545
3581	NC_008782	AGG	2	6	123615	123620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592545
3582	NC_008782	GCT	2	6	123672	123677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592545
3583	NC_008782	TGAACG	2	12	123763	123774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121592546
3584	NC_008782	CAA	2	6	123839	123844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592546
3585	NC_008782	CTG	2	6	123939	123944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592546
3586	NC_008782	GGGCCT	2	12	123977	123988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121592546
3587	NC_008782	GC	3	6	124038	124043	0 %	0 %	50 %	50 %	121592546
3588	NC_008782	TGG	2	6	124120	124125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592546
3589	NC_008782	CTG	2	6	124215	124220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592546
3590	NC_008782	GC	3	6	124280	124285	0 %	0 %	50 %	50 %	121592546
3591	NC_008782	AGC	2	6	124297	124302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592546
3592	NC_008782	GACG	2	8	124307	124314	25 %	0 %	50 %	25 %	121592546
3593	NC_008782	CGA	2	6	124319	124324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592546
3594	NC_008782	GC	3	6	124329	124334	0 %	0 %	50 %	50 %	121592546
3595	NC_008782	CGC	2	6	124430	124435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592546
3596	NC_008782	CGCC	2	8	124557	124564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3597	NC_008782	ACA	2	6	124571	124576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_008782	GGC	2	6	124630	124635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592547
3599	NC_008782	GGGGCC	2	12	124638	124649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592547
3600	NC_008782	GTG	2	6	124696	124701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592547
3601	NC_008782	ACC	2	6	124723	124728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592547
3602	NC_008782	GCC	2	6	124787	124792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592547
3603	NC_008782	TGG	2	6	124808	124813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592547
3604	NC_008782	GAG	2	6	124879	124884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592547
3605	NC_008782	CACGA	2	10	124966	124975	40 %	0 %	20 %	40 %	121592547
3606	NC_008782	GCC	2	6	124981	124986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592547
3607	NC_008782	GCG	2	6	124991	124996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592547
3608	NC_008782	CG	3	6	125022	125027	0 %	0 %	50 %	50 %	121592547
3609	NC_008782	CGG	3	9	125061	125069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592547
3610	NC_008782	TGA	2	6	125081	125086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592547
3611	NC_008782	GCT	2	6	125091	125096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592547
3612	NC_008782	GC	4	8	125113	125120	0 %	0 %	50 %	50 %	121592547
3613	NC_008782	GGT	2	6	125136	125141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592547
3614	NC_008782	GC	3	6	125194	125199	0 %	0 %	50 %	50 %	121592547
3615	NC_008782	TGG	2	6	125210	125215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592547
3616	NC_008782	GC	3	6	125246	125251	0 %	0 %	50 %	50 %	121592547
3617	NC_008782	CTG	3	9	125326	125334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592547
3618	NC_008782	GCC	2	6	125389	125394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592547
3619	NC_008782	CG	4	8	125407	125414	0 %	0 %	50 %	50 %	121592547
3620	NC_008782	GCT	2	6	125460	125465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592547
3621	NC_008782	CGT	2	6	125490	125495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592547
3622	NC_008782	GGC	2	6	125511	125516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592547
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3803	NC_008782	CGC	2	6	131987	131992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3804	NC_008782	CGT	2	6	132006	132011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3853	NC_008782	C	7	7	133925	133931	0 %	0 %	0 %	100 %	121592554
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3857	NC_008782	GGT	2	6	134057	134062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592554
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3859	NC_008782	GTC	2	6	134081	134086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592554
3860	NC_008782	TGG	2	6	134197	134202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592554
3861	NC_008782	CGC	2	6	134302	134307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3862	NC_008782	GCCC	2	8	134323	134330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3863	NC_008782	GCGG	2	8	134349	134356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3864	NC_008782	CAAA	2	8	134396	134403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3865	NC_008782	GAC	2	6	134405	134410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3866	NC_008782	AGA	2	6	134422	134427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592555
3867	NC_008782	GGT	4	12	134441	134452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592555
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3869	NC_008782	TGGCGC	2	12	134485	134496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121592555
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3992	NC_008782	GGC	2	6	138553	138558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592558
3993	NC_008782	CCGCCA	2	12	138578	138589	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	121592558
3994	NC_008782	CGC	2	6	138635	138640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592558
3995	NC_008782	GCC	2	6	138733	138738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592558
3996	NC_008782	GCG	2	6	138791	138796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592558
3997	NC_008782	CTA	2	6	138820	138825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_008782	TCAT	2	8	138857	138864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3999	NC_008782	GCC	2	6	138892	138897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592559
4000	NC_008782	GGC	2	6	138934	138939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592559

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