MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008782	CAG	2	6	650144	650149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593044
18002	NC_008782	TGA	2	6	650152	650157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121593044
18003	NC_008782	GCT	2	6	650209	650214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593044
18004	NC_008782	TCCA	2	8	650223	650230	25 %	25 %	0 %	50 %	121593044
18005	NC_008782	CGTGG	2	10	650237	650246	0 %	20 %	60 %	20 %	121593044
18006	NC_008782	CAG	3	9	650300	650308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593044
18007	NC_008782	GAT	2	6	650348	650353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121593044
18008	NC_008782	CGG	2	6	650364	650369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593044
18009	NC_008782	CG	3	6	650415	650420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18010	NC_008782	GGCG	2	8	650446	650453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18011	NC_008782	CGGCG	2	10	650493	650502	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18012	NC_008782	GTG	2	6	650504	650509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_008782	GAG	2	6	650540	650545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_008782	CGG	2	6	650565	650570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_008782	ACG	2	6	650600	650605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18016	NC_008782	TGCGG	2	10	650619	650628	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18017	NC_008782	T	6	6	650652	650657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_008782	ACC	2	6	650676	650681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18019	NC_008782	GCCTG	2	10	650780	650789	0 %	20 %	40 %	40 %	121593045
18020	NC_008782	AGC	2	6	650818	650823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18021	NC_008782	TCT	2	6	650935	650940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121593045
18022	NC_008782	CGC	4	12	650954	650965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593045
18023	NC_008782	GCC	2	6	650970	650975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593045
18024	NC_008782	TGG	2	6	651013	651018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593045
18025	NC_008782	ACT	2	6	651019	651024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593045
18026	NC_008782	GAC	2	6	651096	651101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18027	NC_008782	GGC	2	6	651102	651107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593045
18028	NC_008782	GCT	2	6	651116	651121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18029	NC_008782	GC	3	6	651137	651142	0 %	0 %	50 %	50 %	121593045
18030	NC_008782	CGC	2	6	651200	651205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593045
18031	NC_008782	ATC	2	6	651261	651266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593045
18032	NC_008782	ACC	3	9	651282	651290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121593045
18033	NC_008782	GCT	2	6	651329	651334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18034	NC_008782	TGG	2	6	651409	651414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593045
18035	NC_008782	TGA	2	6	651439	651444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121593045
18036	NC_008782	GTG	2	6	651462	651467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593045
18037	NC_008782	GC	3	6	651509	651514	0 %	0 %	50 %	50 %	121593045
18038	NC_008782	GCC	2	6	651567	651572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593045
18039	NC_008782	GGC	2	6	651605	651610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593045
18040	NC_008782	ACC	2	6	651633	651638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121593045
18041	NC_008782	TCA	2	6	651655	651660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593045
18042	NC_008782	CAT	2	6	651815	651820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593045
18043	NC_008782	CTG	2	6	651822	651827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18044	NC_008782	GCC	2	6	651835	651840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593045
18045	NC_008782	CACC	2	8	651929	651936	25 %	0 %	0 %	75 %	121593045
18046	NC_008782	ACG	2	6	651946	651951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18047	NC_008782	TGC	2	6	651967	651972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18048	NC_008782	CGA	2	6	651983	651988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18049	NC_008782	GC	3	6	651996	652001	0 %	0 %	50 %	50 %	121593045
18050	NC_008782	GAA	2	6	652010	652015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121593045
18051	NC_008782	CGA	2	6	652043	652048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593045
18052	NC_008782	GCC	2	6	652053	652058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593045
18053	NC_008782	GCT	2	6	652128	652133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_008782	AGT	2	6	652144	652149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_008782	GC	3	6	652227	652232	0 %	0 %	50 %	50 %	121593046
18056	NC_008782	TGG	2	6	652244	652249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593046
18057	NC_008782	GGC	2	6	652252	652257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593046
18058	NC_008782	GCC	2	6	652294	652299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593046
18059	NC_008782	CGA	2	6	652356	652361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18060	NC_008782	GCT	2	6	652386	652391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18061	NC_008782	CG	3	6	652418	652423	0 %	0 %	50 %	50 %	121593046
18062	NC_008782	GC	3	6	652442	652447	0 %	0 %	50 %	50 %	121593046
18063	NC_008782	GGC	2	6	652449	652454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593046
18064	NC_008782	TGGC	2	8	652469	652476	0 %	25 %	50 %	25 %	121593046
18065	NC_008782	CGG	2	6	652506	652511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593046
18066	NC_008782	CTGC	2	8	652521	652528	0 %	25 %	25 %	50 %	121593046
18067	NC_008782	GC	3	6	652593	652598	0 %	0 %	50 %	50 %	121593046
18068	NC_008782	GGT	2	6	652608	652613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593046
18069	NC_008782	CGG	2	6	652752	652757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593046
18070	NC_008782	TGG	2	6	652760	652765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593046
18071	NC_008782	ACG	2	6	652775	652780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18072	NC_008782	CGA	2	6	652785	652790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18073	NC_008782	GC	3	6	652827	652832	0 %	0 %	50 %	50 %	121593046
18074	NC_008782	GCCAAG	2	12	652834	652845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18075	NC_008782	GCC	3	9	652877	652885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593046
18076	NC_008782	TGC	2	6	652967	652972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18077	NC_008782	GCT	2	6	653007	653012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18078	NC_008782	GGC	2	6	653062	653067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593046
18079	NC_008782	AGC	2	6	653102	653107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18080	NC_008782	CTG	2	6	653118	653123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593046
18081	NC_008782	GTG	2	6	653143	653148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593046
18082	NC_008782	G	6	6	653172	653177	0 %	0 %	100 %	0 %	121593046
18083	NC_008782	TTC	2	6	653194	653199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121593046
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18085	NC_008782	TTC	2	6	653256	653261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121593047
18086	NC_008782	GC	3	6	653294	653299	0 %	0 %	50 %	50 %	121593047
18087	NC_008782	CAG	2	6	653307	653312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593047
18088	NC_008782	GC	3	6	653319	653324	0 %	0 %	50 %	50 %	121593047
18089	NC_008782	G	6	6	653357	653362	0 %	0 %	100 %	0 %	121593047
18090	NC_008782	CCA	2	6	653449	653454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121593047
18091	NC_008782	GC	4	8	653465	653472	0 %	0 %	50 %	50 %	121593047
18092	NC_008782	TGCGC	2	10	653513	653522	0 %	20 %	40 %	40 %	121593047
18093	NC_008782	TGG	2	6	653578	653583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593047
18094	NC_008782	GGC	2	6	653627	653632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593047
18095	NC_008782	TCG	2	6	653661	653666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593047
18096	NC_008782	CCA	2	6	653689	653694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121593047
18097	NC_008782	GC	3	6	653699	653704	0 %	0 %	50 %	50 %	121593047
18098	NC_008782	CA	3	6	653723	653728	50 %	0 %	0 %	50 %	121593047
18099	NC_008782	CTT	2	6	653732	653737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121593047
18100	NC_008782	GCC	2	6	653776	653781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593047
18101	NC_008782	GTG	2	6	653799	653804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593047
18102	NC_008782	CAT	2	6	653810	653815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593047
18103	NC_008782	GCT	2	6	653837	653842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593047
18104	NC_008782	CGCCTG	2	12	653886	653897	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121593047
18105	NC_008782	GTC	2	6	653946	653951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593047
18106	NC_008782	GCG	2	6	654061	654066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18107	NC_008782	TCC	2	6	654103	654108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121593048
18108	NC_008782	CTG	2	6	654151	654156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593048
18109	NC_008782	CAC	2	6	654159	654164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121593048
18110	NC_008782	CGA	2	6	654219	654224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593048
18111	NC_008782	GC	3	6	654247	654252	0 %	0 %	50 %	50 %	121593048
18112	NC_008782	ACC	2	6	654274	654279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121593048
18113	NC_008782	CGG	2	6	654287	654292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593048
18114	NC_008782	GCA	2	6	654347	654352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593048
18115	NC_008782	ACG	2	6	654452	654457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593048
18116	NC_008782	CGA	2	6	654498	654503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593048
18117	NC_008782	GCC	2	6	654514	654519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593048
18118	NC_008782	CTA	2	6	654525	654530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593048
18119	NC_008782	CAGC	2	8	654552	654559	25 %	0 %	25 %	50 %	121593048
18120	NC_008782	AGCGCG	2	12	654569	654580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121593048
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18129	NC_008782	CCG	2	6	654834	654839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18224	NC_008782	ACC	2	6	658656	658661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18225	NC_008782	TCA	3	9	658843	658851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593052
18226	NC_008782	TAC	2	6	658899	658904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593052
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18228	NC_008782	CAAGC	2	10	658956	658965	40 %	0 %	20 %	40 %	121593052
18229	NC_008782	CG	3	6	658974	658979	0 %	0 %	50 %	50 %	121593052
18230	NC_008782	TGC	2	6	659002	659007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593052
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18236	NC_008782	ACCA	2	8	659281	659288	50 %	0 %	0 %	50 %	121593053
18237	NC_008782	CGG	2	6	659322	659327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593053
18238	NC_008782	ACG	2	6	659387	659392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593053
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18241	NC_008782	TGC	2	6	659535	659540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18242	NC_008782	TGC	2	6	659555	659560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18243	NC_008782	T	7	7	659589	659595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18244	NC_008782	GCG	2	6	659616	659621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18245	NC_008782	GAAA	2	8	659633	659640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18246	NC_008782	CTG	2	6	659665	659670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18247	NC_008782	CGC	3	9	659671	659679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18248	NC_008782	TCCGC	2	10	659689	659698	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18249	NC_008782	GC	3	6	659714	659719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18250	NC_008782	CGCTG	2	10	659729	659738	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18251	NC_008782	GGC	2	6	659739	659744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18252	NC_008782	GGA	2	6	659835	659840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18253	NC_008782	GGC	2	6	659940	659945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18254	NC_008782	CTG	2	6	659956	659961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18256	NC_008782	CTT	2	6	660015	660020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18257	NC_008782	AGG	2	6	660090	660095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18258	NC_008782	CTG	3	9	660169	660177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18259	NC_008782	TCC	2	6	660205	660210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18260	NC_008782	CGG	2	6	660253	660258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18262	NC_008782	GCC	2	6	660279	660284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18264	NC_008782	GATG	2	8	660318	660325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18265	NC_008782	GC	3	6	660336	660341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18266	NC_008782	ACT	2	6	660398	660403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18269	NC_008782	CGGA	2	8	660502	660509	25 %	0 %	50 %	25 %	121593054
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18274	NC_008782	GCT	2	6	660662	660667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593054
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18279	NC_008782	GCCC	2	8	660917	660924	0 %	0 %	25 %	75 %	121593055
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18282	NC_008782	TGA	2	6	661055	661060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121593055
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18284	NC_008782	GAC	2	6	661074	661079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593055
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18291	NC_008782	T	6	6	661293	661298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18292	NC_008782	GCTG	2	8	661379	661386	0 %	25 %	50 %	25 %	121593056
18293	NC_008782	GCCA	2	8	661410	661417	25 %	0 %	25 %	50 %	121593056
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18348	NC_008782	CGAA	2	8	663673	663680	50 %	0 %	25 %	25 %	121593057
18349	NC_008782	CCG	4	12	663696	663707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121593057
18350	NC_008782	AGC	2	6	663711	663716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593057
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18352	NC_008782	GTTG	2	8	663772	663779	0 %	50 %	50 %	0 %	121593057
18353	NC_008782	CAGG	2	8	663788	663795	25 %	0 %	50 %	25 %	121593057
18354	NC_008782	GTC	2	6	663798	663803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593057
18355	NC_008782	GTT	2	6	663809	663814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121593057
18356	NC_008782	TG	3	6	663837	663842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18357	NC_008782	GGC	2	6	663989	663994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18358	NC_008782	A	6	6	664000	664005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18359	NC_008782	AATC	2	8	664014	664021	50 %	25 %	0 %	25 %	121593058
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18467	NC_008782	GGT	2	6	667674	667679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18468	NC_008782	CGC	2	6	667687	667692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18472	NC_008782	CAT	4	12	667797	667808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593062
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18482	NC_008782	GGT	3	9	668091	668099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121593062
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18484	NC_008782	GGGC	2	8	668159	668166	0 %	0 %	75 %	25 %	121593062
18485	NC_008782	GCT	2	6	668178	668183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121593062
18486	NC_008782	GCG	2	6	668228	668233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593062
18487	NC_008782	GC	3	6	668286	668291	0 %	0 %	50 %	50 %	121593062
18488	NC_008782	CGA	2	6	668295	668300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593062
18489	NC_008782	CAT	2	6	668313	668318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593062
18490	NC_008782	GCTG	2	8	668345	668352	0 %	25 %	50 %	25 %	121593062
18491	NC_008782	TAC	2	6	668386	668391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121593062
18492	NC_008782	GGC	2	6	668436	668441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593062
18493	NC_008782	GGCG	2	8	668469	668476	0 %	0 %	75 %	25 %	121593062
18494	NC_008782	GC	4	8	668508	668515	0 %	0 %	50 %	50 %	121593062
18495	NC_008782	GC	3	6	668520	668525	0 %	0 %	50 %	50 %	121593062
18496	NC_008782	CG	3	6	668571	668576	0 %	0 %	50 %	50 %	121593062
18497	NC_008782	CGA	2	6	668589	668594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121593062
18498	NC_008782	GC	3	6	668596	668601	0 %	0 %	50 %	50 %	121593062
18499	NC_008782	GCG	2	6	668603	668608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121593062
18500	NC_008782	CG	4	8	668607	668614	0 %	0 %	50 %	50 %	121593062

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