MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_008782	CG	3	6	575389	575394	0 %	0 %	50 %	50 %	121592980
16003	NC_008782	AAC	2	6	575441	575446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_008782	G	8	8	575533	575540	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_008782	TGGC	2	8	575543	575550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16006	NC_008782	GCT	2	6	575555	575560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_008782	GGC	2	6	575588	575593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_008782	GC	3	6	575637	575642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16009	NC_008782	CGCT	2	8	575661	575668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16010	NC_008782	GCC	2	6	575674	575679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16011	NC_008782	GCCCA	2	10	575717	575726	20 %	0 %	20 %	60 %	121592981
16012	NC_008782	TGC	2	6	575745	575750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16013	NC_008782	CGC	2	6	575751	575756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592981
16014	NC_008782	TGC	2	6	575775	575780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16015	NC_008782	AGG	2	6	575781	575786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592981
16016	NC_008782	GGCT	2	8	575798	575805	0 %	25 %	50 %	25 %	121592981
16017	NC_008782	TGG	2	6	575812	575817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592981
16018	NC_008782	AGC	2	6	575820	575825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16019	NC_008782	CAA	2	6	575884	575889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592981
16020	NC_008782	TCA	2	6	575943	575948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592981
16021	NC_008782	CGC	2	6	575973	575978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592981
16022	NC_008782	AAC	2	6	575993	575998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592981
16023	NC_008782	CCGG	2	8	576047	576054	0 %	0 %	50 %	50 %	121592981
16024	NC_008782	CAC	2	6	576079	576084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592981
16025	NC_008782	ACG	2	6	576174	576179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16026	NC_008782	CCA	2	6	576237	576242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592981
16027	NC_008782	CCA	2	6	576258	576263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592981
16028	NC_008782	CCG	2	6	576276	576281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592981
16029	NC_008782	GCG	2	6	576285	576290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592981
16030	NC_008782	AGC	2	6	576318	576323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16031	NC_008782	CTG	2	6	576332	576337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16032	NC_008782	GTC	2	6	576368	576373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16033	NC_008782	GAGC	2	8	576397	576404	25 %	0 %	50 %	25 %	121592981
16034	NC_008782	GTG	2	6	576425	576430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592981
16035	NC_008782	AGCGCC	2	12	576450	576461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121592981
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16040	NC_008782	TGC	2	6	576564	576569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16041	NC_008782	ACA	2	6	576630	576635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592981
16042	NC_008782	TCA	2	6	576636	576641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592981
16043	NC_008782	GCT	2	6	576678	576683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592981
16044	NC_008782	GCG	2	6	576777	576782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592981
16045	NC_008782	ACG	2	6	576783	576788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592981
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16047	NC_008782	CATG	2	8	576843	576850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16048	NC_008782	CGG	2	6	576954	576959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_008782	CCATG	2	10	576994	577003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16050	NC_008782	CGC	2	6	577092	577097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16051	NC_008782	CCTG	2	8	577194	577201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16052	NC_008782	CGC	2	6	577238	577243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592982
16053	NC_008782	GCCT	2	8	577245	577252	0 %	25 %	25 %	50 %	121592982
16054	NC_008782	GGC	2	6	577294	577299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592982
16055	NC_008782	CGA	2	6	577306	577311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592982
16056	NC_008782	GCA	2	6	577384	577389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592982
16057	NC_008782	CGC	2	6	577399	577404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592982
16058	NC_008782	GC	3	6	577407	577412	0 %	0 %	50 %	50 %	121592982
16059	NC_008782	GC	4	8	577449	577456	0 %	0 %	50 %	50 %	121592982
16060	NC_008782	G	6	6	577511	577516	0 %	0 %	100 %	0 %	121592982
16061	NC_008782	GTG	2	6	577523	577528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592982
16062	NC_008782	CGA	2	6	577648	577653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592982
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16064	NC_008782	CCG	2	6	577743	577748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592982
16065	NC_008782	CGCAG	2	10	577834	577843	20 %	0 %	40 %	40 %	121592982
16066	NC_008782	GCC	2	6	577853	577858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592982
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16069	NC_008782	C	6	6	578023	578028	0 %	0 %	0 %	100 %	121592982
16070	NC_008782	CCTC	2	8	578052	578059	0 %	25 %	0 %	75 %	121592982
16071	NC_008782	GCG	2	6	578130	578135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592982
16072	NC_008782	CGC	2	6	578192	578197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592982
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16074	NC_008782	GGGCT	2	10	578264	578273	0 %	20 %	60 %	20 %	121592982
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16076	NC_008782	C	6	6	578319	578324	0 %	0 %	0 %	100 %	121592982
16077	NC_008782	CCCA	2	8	578426	578433	25 %	0 %	0 %	75 %	121592982
16078	NC_008782	CA	3	6	578475	578480	50 %	0 %	0 %	50 %	121592982
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16081	NC_008782	GCT	2	6	578599	578604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592982
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16088	NC_008782	GCA	2	6	578919	578924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592982
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16090	NC_008782	GGGCT	2	10	578969	578978	0 %	20 %	60 %	20 %	121592982
16091	NC_008782	GCTG	2	8	579000	579007	0 %	25 %	50 %	25 %	121592982
16092	NC_008782	GC	3	6	579027	579032	0 %	0 %	50 %	50 %	121592982
16093	NC_008782	GC	3	6	579056	579061	0 %	0 %	50 %	50 %	121592982
16094	NC_008782	GCATGT	2	12	579082	579093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121592982
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16102	NC_008782	CTG	2	6	579640	579645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592983
16103	NC_008782	TGG	3	9	579668	579676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592983
16104	NC_008782	GACC	2	8	579677	579684	25 %	0 %	25 %	50 %	121592983
16105	NC_008782	CG	3	6	579709	579714	0 %	0 %	50 %	50 %	121592983
16106	NC_008782	CG	4	8	579756	579763	0 %	0 %	50 %	50 %	121592983
16107	NC_008782	GTCC	2	8	579789	579796	0 %	25 %	25 %	50 %	121592983
16108	NC_008782	TGC	2	6	579812	579817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592983
16109	NC_008782	TCA	2	6	579839	579844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592983
16110	NC_008782	CTG	2	6	579865	579870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592983
16111	NC_008782	TTCCGG	2	12	579880	579891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592983
16112	NC_008782	GCC	2	6	579913	579918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592983
16113	NC_008782	GC	3	6	579924	579929	0 %	0 %	50 %	50 %	121592983
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16115	NC_008782	GC	3	6	579991	579996	0 %	0 %	50 %	50 %	121592983
16116	NC_008782	GCG	2	6	580007	580012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592983
16117	NC_008782	CGA	2	6	580098	580103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592983
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16119	NC_008782	AGC	2	6	580138	580143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592983
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16121	NC_008782	GC	3	6	580167	580172	0 %	0 %	50 %	50 %	121592984
16122	NC_008782	CTG	2	6	580173	580178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592984
16123	NC_008782	TGGC	2	8	580224	580231	0 %	25 %	50 %	25 %	121592984
16124	NC_008782	GGT	2	6	580256	580261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592984
16125	NC_008782	GGC	2	6	580301	580306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592984
16126	NC_008782	GCA	2	6	580313	580318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592984
16127	NC_008782	GC	3	6	580319	580324	0 %	0 %	50 %	50 %	121592984
16128	NC_008782	GCT	2	6	580328	580333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592984
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16130	NC_008782	TCT	2	6	580369	580374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592984
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16137	NC_008782	GCCC	2	8	580487	580494	0 %	0 %	25 %	75 %	121592984
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16143	NC_008782	GCA	2	6	580708	580713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592984
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16145	NC_008782	TGC	2	6	580753	580758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592984
16146	NC_008782	TGC	2	6	580768	580773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592984
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16153	NC_008782	AGC	2	6	581008	581013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592984
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16158	NC_008782	GCT	2	6	581153	581158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592984
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16161	NC_008782	GC	3	6	581252	581257	0 %	0 %	50 %	50 %	121592984
16162	NC_008782	GCTGCA	2	12	581261	581272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121592984
16163	NC_008782	CTG	3	9	581277	581285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592984
16164	NC_008782	TGCG	2	8	581358	581365	0 %	25 %	50 %	25 %	121592984
16165	NC_008782	CTG	3	9	581376	581384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592984
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16229	NC_008782	GCCCTG	2	12	583780	583791	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121592986
16230	NC_008782	GGC	2	6	583849	583854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592986
16231	NC_008782	CGC	3	9	583875	583883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592986
16232	NC_008782	GCC	2	6	583884	583889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592986
16233	NC_008782	CGG	2	6	583893	583898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592986
16234	NC_008782	GGC	2	6	583913	583918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592986
16235	NC_008782	CGC	2	6	583926	583931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592986
16236	NC_008782	CCG	3	9	583934	583942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592986
16237	NC_008782	CGG	2	6	583959	583964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592986
16238	NC_008782	C	6	6	583972	583977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16239	NC_008782	ACC	2	6	583992	583997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592987
16240	NC_008782	GCC	2	6	584014	584019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592987
16241	NC_008782	ACC	2	6	584023	584028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592987
16242	NC_008782	CTT	2	6	584033	584038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592987
16243	NC_008782	CGC	2	6	584039	584044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592987
16244	NC_008782	TGG	2	6	584050	584055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592987
16245	NC_008782	ACT	2	6	584065	584070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592987
16246	NC_008782	TGG	2	6	584119	584124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592987
16247	NC_008782	CGG	2	6	584210	584215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592987
16248	NC_008782	TCA	2	6	584218	584223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592987
16249	NC_008782	TGC	2	6	584233	584238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592987
16250	NC_008782	TCA	2	6	584281	584286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592987
16251	NC_008782	GCTGG	2	10	584327	584336	0 %	20 %	60 %	20 %	121592987
16252	NC_008782	CTG	2	6	584436	584441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592987
16253	NC_008782	CTG	2	6	584490	584495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592987
16254	NC_008782	GC	3	6	584504	584509	0 %	0 %	50 %	50 %	121592987
16255	NC_008782	CGGC	2	8	584564	584571	0 %	0 %	50 %	50 %	121592987
16256	NC_008782	TCA	2	6	584581	584586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592987
16257	NC_008782	TGC	2	6	584593	584598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592987
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16259	NC_008782	GC	4	8	584634	584641	0 %	0 %	50 %	50 %	121592987
16260	NC_008782	CGGG	3	12	584646	584657	0 %	0 %	75 %	25 %	121592987
16261	NC_008782	CGC	2	6	584677	584682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592987
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16263	NC_008782	GCT	3	9	584708	584716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592987
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16267	NC_008782	CG	3	6	584877	584882	0 %	0 %	50 %	50 %	121592987
16268	NC_008782	TGC	2	6	584920	584925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592987
16269	NC_008782	GCC	2	6	584960	584965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592987
16270	NC_008782	CTG	3	9	585015	585023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592987
16271	NC_008782	ACC	2	6	585055	585060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592987
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16273	NC_008782	CTGAG	2	10	585099	585108	20 %	20 %	40 %	20 %	121592987
16274	NC_008782	GCAG	2	8	585114	585121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16275	NC_008782	GAT	2	6	585194	585199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16277	NC_008782	A	6	6	585225	585230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16278	NC_008782	GGC	2	6	585245	585250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16279	NC_008782	TAC	2	6	585307	585312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16280	NC_008782	CGGG	2	8	585334	585341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16281	NC_008782	C	6	6	585346	585351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16282	NC_008782	T	6	6	585363	585368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16283	NC_008782	CAC	2	6	585404	585409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592988
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16342	NC_008782	GACAGC	2	12	587565	587576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592988
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16348	NC_008782	GC	3	6	587846	587851	0 %	0 %	50 %	50 %	121592988
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16351	NC_008782	CGC	2	6	587923	587928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592988
16352	NC_008782	ACCA	2	8	588021	588028	50 %	0 %	0 %	50 %	121592988
16353	NC_008782	ACA	2	6	588049	588054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592988
16354	NC_008782	GCA	2	6	588071	588076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592988
16355	NC_008782	CCTGAC	2	12	588101	588112	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121592988
16356	NC_008782	GAA	2	6	588114	588119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592988
16357	NC_008782	TAC	2	6	588258	588263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592988
16358	NC_008782	CGA	2	6	588298	588303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592988
16359	NC_008782	CCGATG	2	12	588397	588408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121592988
16360	NC_008782	CGA	2	6	588431	588436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592988
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