MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_008782	GC	5	10	554720	554729	0 %	0 %	50 %	50 %	121592961
15503	NC_008782	TGC	2	6	554752	554757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592961
15504	NC_008782	GTG	2	6	554781	554786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592961
15505	NC_008782	CACG	2	8	554795	554802	25 %	0 %	25 %	50 %	121592961
15506	NC_008782	CGC	2	6	554807	554812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592961
15507	NC_008782	GC	3	6	554811	554816	0 %	0 %	50 %	50 %	121592961
15508	NC_008782	GAG	2	6	554829	554834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592961
15509	NC_008782	GCG	2	6	554839	554844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592961
15510	NC_008782	CG	3	6	554853	554858	0 %	0 %	50 %	50 %	121592961
15511	NC_008782	GC	3	6	554874	554879	0 %	0 %	50 %	50 %	121592961
15512	NC_008782	GCGCC	2	10	554881	554890	0 %	0 %	40 %	60 %	121592961
15513	NC_008782	GC	3	6	554934	554939	0 %	0 %	50 %	50 %	121592961
15514	NC_008782	CAC	2	6	554961	554966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592961
15515	NC_008782	CGC	2	6	554971	554976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592961
15516	NC_008782	GC	3	6	555034	555039	0 %	0 %	50 %	50 %	121592961
15517	NC_008782	GGC	2	6	555067	555072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592961
15518	NC_008782	CAT	2	6	555092	555097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592961
15519	NC_008782	GTG	2	6	555177	555182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592961
15520	NC_008782	CGC	2	6	555191	555196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592961
15521	NC_008782	AGC	2	6	555217	555222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592961
15522	NC_008782	CGC	2	6	555226	555231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592961
15523	NC_008782	GC	3	6	555246	555251	0 %	0 %	50 %	50 %	121592962
15524	NC_008782	GGC	2	6	555252	555257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592962
15525	NC_008782	GCC	2	6	555275	555280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592962
15526	NC_008782	ACGCCC	2	12	555287	555298	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	121592962
15527	NC_008782	CCG	2	6	555327	555332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592962
15528	NC_008782	CGC	2	6	555357	555362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592962
15529	NC_008782	GC	3	6	555379	555384	0 %	0 %	50 %	50 %	121592962
15530	NC_008782	TGG	2	6	555399	555404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592962
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15532	NC_008782	GC	3	6	555517	555522	0 %	0 %	50 %	50 %	121592962
15533	NC_008782	GCC	2	6	555529	555534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592962
15534	NC_008782	CGG	2	6	555535	555540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592962
15535	NC_008782	CGG	2	6	555543	555548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592962
15536	NC_008782	TGT	2	6	555552	555557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121592962
15537	NC_008782	GCG	2	6	555564	555569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592962
15538	NC_008782	CGCGG	2	10	555583	555592	0 %	0 %	60 %	40 %	121592962
15539	NC_008782	CG	3	6	555593	555598	0 %	0 %	50 %	50 %	121592962
15540	NC_008782	ACA	2	6	555621	555626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592962
15541	NC_008782	GGC	2	6	555708	555713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592962
15542	NC_008782	T	6	6	555736	555741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_008782	A	7	7	555748	555754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_008782	GCG	2	6	555826	555831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592963
15545	NC_008782	GGGT	2	8	555867	555874	0 %	25 %	75 %	0 %	121592963
15546	NC_008782	TTG	2	6	555885	555890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121592963
15547	NC_008782	TTG	2	6	555912	555917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121592963
15548	NC_008782	CTT	2	6	555932	555937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592963
15549	NC_008782	CGC	2	6	555958	555963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592963
15550	NC_008782	CAC	2	6	555965	555970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592963
15551	NC_008782	GCA	2	6	556049	556054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592963
15552	NC_008782	GGTGC	2	10	556086	556095	0 %	20 %	60 %	20 %	121592963
15553	NC_008782	GCG	2	6	556224	556229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592963
15554	NC_008782	GCC	2	6	556253	556258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592963
15555	NC_008782	TGA	2	6	556282	556287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592963
15556	NC_008782	TC	3	6	556309	556314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15557	NC_008782	CTT	2	6	556315	556320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_008782	GCG	2	6	556414	556419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_008782	AGGCAA	2	12	556429	556440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15560	NC_008782	A	6	6	556439	556444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_008782	GTT	2	6	556507	556512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121592964
15562	NC_008782	CGCAG	2	10	556516	556525	20 %	0 %	40 %	40 %	121592964
15563	NC_008782	CTG	2	6	556538	556543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592964
15564	NC_008782	CCTG	2	8	556603	556610	0 %	25 %	25 %	50 %	121592964
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15570	NC_008782	CTG	2	6	556808	556813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592964
15571	NC_008782	CG	3	6	556825	556830	0 %	0 %	50 %	50 %	121592964
15572	NC_008782	GTG	2	6	556841	556846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592964
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15585	NC_008782	TGGG	2	8	557307	557314	0 %	25 %	75 %	0 %	121592965
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15588	NC_008782	GCA	2	6	557359	557364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592965
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15590	NC_008782	GC	3	6	557406	557411	0 %	0 %	50 %	50 %	121592965
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15609	NC_008782	GGGT	2	8	558024	558031	0 %	25 %	75 %	0 %	121592966
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15620	NC_008782	GGC	2	6	558690	558695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592967
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15622	NC_008782	GGT	2	6	558752	558757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592967
15623	NC_008782	GCT	2	6	558860	558865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592967
15624	NC_008782	CTG	2	6	558873	558878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592967
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15627	NC_008782	CGT	2	6	558971	558976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592967
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15642	NC_008782	CTG	2	6	559473	559478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592967
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15644	NC_008782	GACC	2	8	559535	559542	25 %	0 %	25 %	50 %	121592967
15645	NC_008782	CG	3	6	559574	559579	0 %	0 %	50 %	50 %	121592967
15646	NC_008782	GCCG	2	8	559607	559614	0 %	0 %	50 %	50 %	121592967
15647	NC_008782	GCA	2	6	559676	559681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592967
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15651	NC_008782	GC	3	6	559870	559875	0 %	0 %	50 %	50 %	121592968
15652	NC_008782	CGC	3	9	559900	559908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592968
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15655	NC_008782	CGC	2	6	559963	559968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592968
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15660	NC_008782	TGC	2	6	560217	560222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592968
15661	NC_008782	CGA	2	6	560257	560262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592968
15662	NC_008782	CTG	2	6	560291	560296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592968
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15683	NC_008782	ACA	2	6	560951	560956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592969
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15685	NC_008782	GCT	2	6	560982	560987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592969
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15712	NC_008782	TC	3	6	562130	562135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15713	NC_008782	TGG	2	6	562183	562188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592971
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15721	NC_008782	GC	3	6	562524	562529	0 %	0 %	50 %	50 %	121592971
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15729	NC_008782	TGC	2	6	562933	562938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592971
15730	NC_008782	CTG	2	6	563007	563012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592971
15731	NC_008782	CGG	2	6	563033	563038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592971
15732	NC_008782	GCTGAG	2	12	563050	563061	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121592971
15733	NC_008782	CCTG	2	8	563153	563160	0 %	25 %	25 %	50 %	121592972
15734	NC_008782	CGA	2	6	563243	563248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592972
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15736	NC_008782	GAT	2	6	563409	563414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592972
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15738	NC_008782	GGC	2	6	563459	563464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592972
15739	NC_008782	TGG	2	6	563538	563543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592972
15740	NC_008782	GCT	2	6	563618	563623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592972
15741	NC_008782	T	6	6	563654	563659	0 %	100 %	0 %	0 %	121592972
15742	NC_008782	AGC	2	6	563749	563754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592972
15743	NC_008782	CTG	2	6	563787	563792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592972
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15745	NC_008782	TGC	2	6	563863	563868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592972
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15747	NC_008782	CGG	2	6	563893	563898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592972
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15749	NC_008782	GC	3	6	563967	563972	0 %	0 %	50 %	50 %	121592972
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15754	NC_008782	GCTGG	2	10	564056	564065	0 %	20 %	60 %	20 %	121592972
15755	NC_008782	GC	3	6	564093	564098	0 %	0 %	50 %	50 %	121592972
15756	NC_008782	CAG	2	6	564099	564104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592972
15757	NC_008782	GCTGG	2	10	564119	564128	0 %	20 %	60 %	20 %	121592972
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15764	NC_008782	T	6	6	564488	564493	0 %	100 %	0 %	0 %	121592972
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15771	NC_008782	CTG	2	6	564744	564749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592972
15772	NC_008782	CGA	2	6	564800	564805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592972
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15793	NC_008782	CG	3	6	565748	565753	0 %	0 %	50 %	50 %	121592972
15794	NC_008782	CG	3	6	565821	565826	0 %	0 %	50 %	50 %	121592972
15795	NC_008782	CAAG	2	8	565829	565836	50 %	0 %	25 %	25 %	121592972
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15800	NC_008782	CAG	3	9	566175	566183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592973
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15859	NC_008782	CTG	2	6	568367	568372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592975
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15862	NC_008782	GCT	2	6	568498	568503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592975
15863	NC_008782	ATC	2	6	568508	568513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592975
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15877	NC_008782	GCCG	2	8	569062	569069	0 %	0 %	50 %	50 %	121592975
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15972	NC_008782	GAA	2	6	574098	574103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592979
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15980	NC_008782	AGC	2	6	574335	574340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592979
15981	NC_008782	CTG	3	9	574356	574364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592979
15982	NC_008782	GTC	2	6	574383	574388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592979
15983	NC_008782	GCG	2	6	574481	574486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592979
15984	NC_008782	CGC	2	6	574524	574529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592979
15985	NC_008782	CGAGAC	2	12	574565	574576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592979
15986	NC_008782	TGCA	2	8	574588	574595	25 %	25 %	25 %	25 %	121592979
15987	NC_008782	CTG	2	6	574737	574742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592979
15988	NC_008782	CTG	2	6	574773	574778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592979
15989	NC_008782	CCG	2	6	574846	574851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592979
15990	NC_008782	GCT	2	6	575026	575031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592980
15991	NC_008782	CGGC	2	8	575052	575059	0 %	0 %	50 %	50 %	121592980
15992	NC_008782	GTG	2	6	575063	575068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592980
15993	NC_008782	GCT	2	6	575077	575082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592980
15994	NC_008782	GC	3	6	575123	575128	0 %	0 %	50 %	50 %	121592980
15995	NC_008782	GCC	3	9	575144	575152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592980
15996	NC_008782	TGG	2	6	575162	575167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592980
15997	NC_008782	GCT	2	6	575175	575180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592980
15998	NC_008782	GCCAG	2	10	575199	575208	20 %	0 %	40 %	40 %	121592980
15999	NC_008782	CAC	2	6	575233	575238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592980
16000	NC_008782	CGC	2	6	575275	575280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592980

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