MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008782	GTGC	2	8	404172	404179	0 %	25 %	50 %	25 %	121592822
11502	NC_008782	GC	3	6	404178	404183	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11503	NC_008782	GTGG	2	8	404207	404214	0 %	25 %	75 %	0 %	121592822
11504	NC_008782	GCGATG	2	12	404230	404241	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121592822
11505	NC_008782	TGG	2	6	404266	404271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592822
11506	NC_008782	CCAG	2	8	404275	404282	25 %	0 %	25 %	50 %	121592822
11507	NC_008782	GTG	2	6	404295	404300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592822
11508	NC_008782	CGGG	2	8	404354	404361	0 %	0 %	75 %	25 %	121592822
11509	NC_008782	CTGG	2	8	404378	404385	0 %	25 %	50 %	25 %	121592822
11510	NC_008782	CGAC	2	8	404404	404411	25 %	0 %	25 %	50 %	121592822
11511	NC_008782	GC	3	6	404430	404435	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11512	NC_008782	GGA	2	6	404453	404458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592822
11513	NC_008782	GC	3	6	404484	404489	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11514	NC_008782	GCG	2	6	404495	404500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592822
11515	NC_008782	C	6	6	404503	404508	0 %	0 %	0 %	100 %	121592822
11516	NC_008782	GCGA	2	8	404511	404518	25 %	0 %	50 %	25 %	121592822
11517	NC_008782	GCA	2	6	404524	404529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592822
11518	NC_008782	TGGG	2	8	404532	404539	0 %	25 %	75 %	0 %	121592822
11519	NC_008782	CGC	3	9	404573	404581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592822
11520	NC_008782	AC	3	6	404603	404608	50 %	0 %	0 %	50 %	121592822
11521	NC_008782	GGC	2	6	404646	404651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592822
11522	NC_008782	ACC	2	6	404658	404663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592822
11523	NC_008782	CTG	2	6	404712	404717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592822
11524	NC_008782	CGC	2	6	404721	404726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592822
11525	NC_008782	CGGG	2	8	404728	404735	0 %	0 %	75 %	25 %	121592822
11526	NC_008782	CG	3	6	404831	404836	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11527	NC_008782	CG	3	6	404906	404911	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11528	NC_008782	ACGC	2	8	404920	404927	25 %	0 %	25 %	50 %	121592822
11529	NC_008782	GGA	2	6	404933	404938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592822
11530	NC_008782	CG	3	6	404956	404961	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11531	NC_008782	GC	3	6	404976	404981	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11532	NC_008782	GGC	2	6	404984	404989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592822
11533	NC_008782	CG	3	6	405001	405006	0 %	0 %	50 %	50 %	121592822
11534	NC_008782	GCG	2	6	405198	405203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_008782	GAC	2	6	405206	405211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_008782	GACT	2	8	405220	405227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11537	NC_008782	GCC	2	6	405237	405242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11538	NC_008782	GTCC	2	8	405343	405350	0 %	25 %	25 %	50 %	121592823
11539	NC_008782	CAT	2	6	405403	405408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592823
11540	NC_008782	GAAG	2	8	405421	405428	50 %	0 %	50 %	0 %	121592823
11541	NC_008782	AAG	2	6	405449	405454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592823
11542	NC_008782	CCG	2	6	405499	405504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592823
11543	NC_008782	GCA	2	6	405539	405544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592823
11544	NC_008782	CGA	2	6	405692	405697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592824
11545	NC_008782	AAG	2	6	405795	405800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592824
11546	NC_008782	GGC	2	6	405834	405839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592824
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11552	NC_008782	AGGCC	2	10	406244	406253	20 %	0 %	40 %	40 %	121592825
11553	NC_008782	ACA	2	6	406384	406389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592825
11554	NC_008782	CAC	2	6	406469	406474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592825
11555	NC_008782	CGA	2	6	406487	406492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592825
11556	NC_008782	GCC	2	6	406599	406604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592826
11557	NC_008782	CGC	2	6	406610	406615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592826
11558	NC_008782	CGA	2	6	406661	406666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592826
11559	NC_008782	GTC	2	6	406753	406758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592826
11560	NC_008782	GCAG	2	8	406857	406864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_008782	GA	3	6	406865	406870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_008782	ACA	2	6	406872	406877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592827
11563	NC_008782	CTT	2	6	406959	406964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592827
11564	NC_008782	GAAGT	2	10	407024	407033	40 %	20 %	40 %	0 %	121592827
11565	NC_008782	TAC	2	6	407072	407077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592827
11566	NC_008782	ACG	2	6	407192	407197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592827
11567	NC_008782	TGA	2	6	407208	407213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592827
11568	NC_008782	GC	4	8	407225	407232	0 %	0 %	50 %	50 %	121592827
11569	NC_008782	GAG	2	6	407282	407287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_008782	GAC	2	6	407357	407362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592828
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11574	NC_008782	TGG	2	6	407520	407525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592828
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11583	NC_008782	AGC	2	6	407858	407863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592829
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11587	NC_008782	GCA	2	6	407975	407980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592829
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11589	NC_008782	ATC	2	6	408070	408075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592829
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11591	NC_008782	AGCGG	2	10	408207	408216	20 %	0 %	60 %	20 %	121592829
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11594	NC_008782	CGCTG	2	10	408341	408350	0 %	20 %	40 %	40 %	121592830
11595	NC_008782	GGT	2	6	408353	408358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592830
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11602	NC_008782	ATG	2	6	408525	408530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592830
11603	NC_008782	CAT	2	6	408554	408559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592830
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11605	NC_008782	GC	3	6	408575	408580	0 %	0 %	50 %	50 %	121592830
11606	NC_008782	ACA	2	6	408643	408648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592830
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11608	NC_008782	CAA	2	6	408770	408775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592831
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11612	NC_008782	G	6	6	409080	409085	0 %	0 %	100 %	0 %	121592832
11613	NC_008782	CTG	2	6	409161	409166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592832
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11619	NC_008782	GCCTG	2	10	409375	409384	0 %	20 %	40 %	40 %	121592832
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11621	NC_008782	CCG	2	6	409459	409464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592833
11622	NC_008782	CTG	2	6	409478	409483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592833
11623	NC_008782	GTTG	2	8	409489	409496	0 %	50 %	50 %	0 %	121592833
11624	NC_008782	GC	3	6	409509	409514	0 %	0 %	50 %	50 %	121592833
11625	NC_008782	GCA	2	6	409549	409554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592833
11626	NC_008782	GTT	2	6	409555	409560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121592833
11627	NC_008782	CAG	2	6	409568	409573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592833
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11638	NC_008782	TCG	2	6	410100	410105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592833
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11654	NC_008782	CG	3	6	410479	410484	0 %	0 %	50 %	50 %	121592833
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11663	NC_008782	GCT	2	6	410686	410691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592833
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11667	NC_008782	ATC	2	6	410918	410923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592834
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11727	NC_008782	TTTTTG	2	12	414234	414245	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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11731	NC_008782	CG	3	6	414276	414281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11732	NC_008782	CGGA	2	8	414293	414300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11733	NC_008782	TGT	2	6	414311	414316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11734	NC_008782	CGA	2	6	414353	414358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592840
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11737	NC_008782	GTC	2	6	414567	414572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592840
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11861	NC_008782	GCT	2	6	419203	419208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592843
11862	NC_008782	CGG	2	6	419230	419235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592843
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11980	NC_008782	CGG	3	9	422577	422585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592848
11981	NC_008782	CGAC	2	8	422609	422616	25 %	0 %	25 %	50 %	121592848
11982	NC_008782	CAC	2	6	422622	422627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592848
11983	NC_008782	GGA	2	6	422640	422645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592848
11984	NC_008782	ACGTGA	2	12	422705	422716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121592848
11985	NC_008782	TGC	2	6	422735	422740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592848
11986	NC_008782	GCC	2	6	422761	422766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592848
11987	NC_008782	GGT	2	6	422817	422822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592848
11988	NC_008782	CG	3	6	422867	422872	0 %	0 %	50 %	50 %	121592848
11989	NC_008782	GC	3	6	422895	422900	0 %	0 %	50 %	50 %	121592848
11990	NC_008782	GTC	2	6	422944	422949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592848
11991	NC_008782	GTG	2	6	422962	422967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592848
11992	NC_008782	CG	4	8	423018	423025	0 %	0 %	50 %	50 %	121592848
11993	NC_008782	GGT	2	6	423063	423068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592848
11994	NC_008782	GGCGC	2	10	423094	423103	0 %	0 %	60 %	40 %	121592848
11995	NC_008782	AGC	2	6	423104	423109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592848
11996	NC_008782	CGC	2	6	423132	423137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592848
11997	NC_008782	GGC	2	6	423138	423143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592848
11998	NC_008782	GCT	2	6	423169	423174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11999	NC_008782	GCCC	2	8	423228	423235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12000	NC_008782	T	6	6	423266	423271	0 %	100 %	0 %	0 %	121592849

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