MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_008782	GC	3	6	352321	352326	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10003	NC_008782	TGG	2	6	352340	352345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592776
10004	NC_008782	GCC	2	6	352391	352396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592776
10005	NC_008782	GCC	2	6	352399	352404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592776
10006	NC_008782	ACG	2	6	352472	352477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10007	NC_008782	GC	3	6	352518	352523	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10008	NC_008782	CTG	2	6	352548	352553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10009	NC_008782	CG	3	6	352660	352665	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10010	NC_008782	TAC	2	6	352780	352785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592776
10011	NC_008782	TCG	2	6	352838	352843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10012	NC_008782	GC	3	6	352871	352876	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10013	NC_008782	GAC	2	6	352903	352908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10014	NC_008782	GGT	2	6	353004	353009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592776
10015	NC_008782	ACC	2	6	353027	353032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592776
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10017	NC_008782	GC	3	6	353052	353057	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10018	NC_008782	GGC	2	6	353067	353072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592776
10019	NC_008782	TGC	2	6	353108	353113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10020	NC_008782	GTG	2	6	353128	353133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592776
10021	NC_008782	GAG	2	6	353143	353148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592776
10022	NC_008782	GC	3	6	353163	353168	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10023	NC_008782	CTG	2	6	353233	353238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10024	NC_008782	AAC	2	6	353293	353298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592776
10025	NC_008782	GC	3	6	353332	353337	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10026	NC_008782	TGC	2	6	353348	353353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592776
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10029	NC_008782	TGC	3	9	353438	353446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10030	NC_008782	CGGC	2	8	353480	353487	0 %	0 %	50 %	50 %	121592776
10031	NC_008782	ACG	2	6	353498	353503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10032	NC_008782	GCC	3	9	353527	353535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592776
10033	NC_008782	ACG	2	6	353549	353554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592776
10034	NC_008782	TGG	2	6	353567	353572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592776
10035	NC_008782	ACG	2	6	353573	353578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592776
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10039	NC_008782	CGG	2	6	353709	353714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592777
10040	NC_008782	TGGCCG	2	12	353765	353776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121592777
10041	NC_008782	GTGCCC	2	12	353791	353802	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121592777
10042	NC_008782	CGC	2	6	353819	353824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592777
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10049	NC_008782	GGCG	2	8	354102	354109	0 %	0 %	75 %	25 %	121592777
10050	NC_008782	CAG	2	6	354121	354126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592777
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10052	NC_008782	GCTGG	2	10	354159	354168	0 %	20 %	60 %	20 %	121592777
10053	NC_008782	GC	3	6	354172	354177	0 %	0 %	50 %	50 %	121592777
10054	NC_008782	AGCG	2	8	354181	354188	25 %	0 %	50 %	25 %	121592777
10055	NC_008782	CGCGTG	2	12	354214	354225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121592777
10056	NC_008782	GAC	2	6	354244	354249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592777
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10062	NC_008782	GCA	2	6	354676	354681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592778
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10065	NC_008782	GGCC	2	8	354931	354938	0 %	0 %	50 %	50 %	121592778
10066	NC_008782	CTA	2	6	354940	354945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592778
10067	NC_008782	TGC	2	6	354981	354986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592778
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10069	NC_008782	TTGG	2	8	355001	355008	0 %	50 %	50 %	0 %	121592778
10070	NC_008782	GC	3	6	355013	355018	0 %	0 %	50 %	50 %	121592778
10071	NC_008782	CGC	2	6	355035	355040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_008782	GC	3	6	355053	355058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_008782	GC	3	6	355065	355070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_008782	T	6	6	355071	355076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_008782	GCG	2	6	355098	355103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_008782	GCG	4	12	355149	355160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_008782	TCC	3	9	355220	355228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121592779
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10080	NC_008782	CGC	2	6	355268	355273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592779
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10083	NC_008782	TGC	2	6	355400	355405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592779
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10087	NC_008782	T	6	6	355485	355490	0 %	100 %	0 %	0 %	121592779
10088	NC_008782	GC	3	6	355517	355522	0 %	0 %	50 %	50 %	121592779
10089	NC_008782	CGA	2	6	355524	355529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592779
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10092	NC_008782	ACG	2	6	355562	355567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592779
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10094	NC_008782	CCG	2	6	355593	355598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592779
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10100	NC_008782	GCGG	2	8	355749	355756	0 %	0 %	75 %	25 %	121592779
10101	NC_008782	GCCT	2	8	355773	355780	0 %	25 %	25 %	50 %	121592779
10102	NC_008782	CGC	2	6	355796	355801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592779
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10105	NC_008782	GC	3	6	355878	355883	0 %	0 %	50 %	50 %	121592780
10106	NC_008782	GCC	2	6	355900	355905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592780
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10111	NC_008782	CGG	2	6	356063	356068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592780
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10113	NC_008782	CGA	2	6	356216	356221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592780
10114	NC_008782	GGCC	2	8	356222	356229	0 %	0 %	50 %	50 %	121592780
10115	NC_008782	CG	3	6	356239	356244	0 %	0 %	50 %	50 %	121592780
10116	NC_008782	GCG	2	6	356255	356260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592780
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10119	NC_008782	GCG	2	6	356329	356334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592780
10120	NC_008782	CG	5	10	356354	356363	0 %	0 %	50 %	50 %	121592780
10121	NC_008782	CTG	2	6	356388	356393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592780
10122	NC_008782	CAT	2	6	356444	356449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592780
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10241	NC_008782	ACC	3	9	360996	361004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592785
10242	NC_008782	GC	3	6	361111	361116	0 %	0 %	50 %	50 %	121592785
10243	NC_008782	GGC	3	9	361155	361163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592785
10244	NC_008782	G	6	6	361169	361174	0 %	0 %	100 %	0 %	121592785
10245	NC_008782	CAC	2	6	361211	361216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592785
10246	NC_008782	CGG	2	6	361241	361246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592785
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10249	NC_008782	CG	3	6	361345	361350	0 %	0 %	50 %	50 %	121592785
10250	NC_008782	CTG	2	6	361446	361451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592785
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10254	NC_008782	CCGCA	2	10	361578	361587	20 %	0 %	20 %	60 %	121592785
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10259	NC_008782	CCG	2	6	361721	361726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592785
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10261	NC_008782	GTGGA	2	10	361773	361782	20 %	20 %	60 %	0 %	121592785
10262	NC_008782	GCC	2	6	361796	361801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592785
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10264	NC_008782	GC	3	6	361913	361918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10265	NC_008782	TCAG	2	8	361941	361948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10266	NC_008782	CCGT	2	8	361970	361977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10268	NC_008782	GCCA	2	8	362026	362033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10269	NC_008782	TGGG	2	8	362041	362048	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10270	NC_008782	ACCG	2	8	362070	362077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10271	NC_008782	TAA	2	6	362145	362150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10272	NC_008782	ACG	2	6	362190	362195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10274	NC_008782	CCT	2	6	362215	362220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10275	NC_008782	CCT	2	6	362238	362243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10277	NC_008782	CCG	3	9	362305	362313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592786
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10481	NC_008782	CGCC	2	8	368990	368997	0 %	0 %	25 %	75 %	121592792
10482	NC_008782	GC	3	6	369014	369019	0 %	0 %	50 %	50 %	121592792
10483	NC_008782	GCC	2	6	369049	369054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592792
10484	NC_008782	CCA	2	6	369074	369079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592792
10485	NC_008782	GC	3	6	369120	369125	0 %	0 %	50 %	50 %	121592792
10486	NC_008782	GCC	3	9	369136	369144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592792
10487	NC_008782	CGG	2	6	369146	369151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592792
10488	NC_008782	CAG	2	6	369162	369167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592792
10489	NC_008782	CAG	2	6	369174	369179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592792
10490	NC_008782	CGCGCA	2	12	369182	369193	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121592792
10491	NC_008782	TGG	2	6	369275	369280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592792
10492	NC_008782	CTCCAC	2	12	369357	369368	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	121592792
10493	NC_008782	CG	3	6	369416	369421	0 %	0 %	50 %	50 %	121592792
10494	NC_008782	CCT	2	6	369422	369427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121592792
10495	NC_008782	CAG	2	6	369501	369506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592792
10496	NC_008782	CG	3	6	369507	369512	0 %	0 %	50 %	50 %	121592792
10497	NC_008782	TGGC	2	8	369520	369527	0 %	25 %	50 %	25 %	121592792
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10499	NC_008782	CAG	2	6	369561	369566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592792
10500	NC_008782	CAG	2	6	369573	369578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592792

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