MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 64298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008578	CGG	2	6	19378	19383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927231
502	NC_008578	TCG	2	6	19411	19416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927231
503	NC_008578	CGA	2	6	19441	19446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927231
504	NC_008578	GCG	2	6	19497	19502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927231
505	NC_008578	GCG	2	6	19569	19574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927231
506	NC_008578	CGC	2	6	19598	19603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927231
507	NC_008578	CGT	3	9	19736	19744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927231
508	NC_008578	CT	3	6	19761	19766	0 %	50 %	0 %	50 %	117927231
509	NC_008578	TGG	2	6	19789	19794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927231
510	NC_008578	GCG	2	6	19869	19874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927231
511	NC_008578	TGA	2	6	19876	19881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927231
512	NC_008578	CGG	2	6	19898	19903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927231
513	NC_008578	GGAGA	2	10	19997	20006	40 %	0 %	60 %	0 %	117927231
514	NC_008578	ACG	2	6	20017	20022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927231
515	NC_008578	CGA	2	6	20068	20073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927231
516	NC_008578	GCA	2	6	20116	20121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927231
517	NC_008578	ACG	2	6	20139	20144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927231
518	NC_008578	C	6	6	20148	20153	0 %	0 %	0 %	100 %	117927231
519	NC_008578	CCG	2	6	20233	20238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927231
520	NC_008578	GCC	2	6	20246	20251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927231
521	NC_008578	AGT	2	6	20269	20274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927231
522	NC_008578	CGT	2	6	20332	20337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927231
523	NC_008578	GAC	2	6	20349	20354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927231
524	NC_008578	CGA	2	6	20377	20382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927231
525	NC_008578	C	6	6	20386	20391	0 %	0 %	0 %	100 %	117927231
526	NC_008578	GGT	2	6	20434	20439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927231
527	NC_008578	CTTGG	2	10	20450	20459	0 %	40 %	40 %	20 %	117927231
528	NC_008578	GGA	2	6	20467	20472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927231
529	NC_008578	CGG	2	6	20526	20531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927231
530	NC_008578	CAC	3	9	20551	20559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927232
531	NC_008578	CGG	2	6	20591	20596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927232
532	NC_008578	CGA	2	6	20650	20655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
533	NC_008578	GCC	2	6	20656	20661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927232
534	NC_008578	CGT	2	6	20677	20682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927232
535	NC_008578	CGA	4	12	20718	20729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
536	NC_008578	CGG	2	6	20760	20765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927232
537	NC_008578	CG	3	6	20803	20808	0 %	0 %	50 %	50 %	117927232
538	NC_008578	GAC	2	6	20827	20832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
539	NC_008578	CTC	2	6	20872	20877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927232
540	NC_008578	GAT	2	6	20890	20895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927232
541	NC_008578	GGC	2	6	20928	20933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927232
542	NC_008578	CCG	2	6	20960	20965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927232
543	NC_008578	GTC	2	6	21005	21010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927232
544	NC_008578	GGT	2	6	21069	21074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927232
545	NC_008578	AGAGC	2	10	21099	21108	40 %	0 %	40 %	20 %	117927232
546	NC_008578	ACC	2	6	21116	21121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927232
547	NC_008578	ATG	2	6	21152	21157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927232
548	NC_008578	GAA	2	6	21160	21165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927232
549	NC_008578	GAA	2	6	21169	21174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927232
550	NC_008578	CCAG	2	8	21225	21232	25 %	0 %	25 %	50 %	117927232
551	NC_008578	CGA	2	6	21234	21239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
552	NC_008578	CTG	2	6	21290	21295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927232
553	NC_008578	CGA	2	6	21321	21326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
554	NC_008578	CGA	2	6	21336	21341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
555	NC_008578	AGC	2	6	21454	21459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
556	NC_008578	GAG	2	6	21460	21465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927232
557	NC_008578	CGG	2	6	21509	21514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927232
558	NC_008578	GATG	2	8	21627	21634	25 %	25 %	50 %	0 %	117927232
559	NC_008578	AGC	2	6	21656	21661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
560	NC_008578	GCA	2	6	21672	21677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
561	NC_008578	CGA	2	6	21798	21803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
562	NC_008578	GCG	2	6	21812	21817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927232
563	NC_008578	GAT	2	6	21823	21828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927232
564	NC_008578	GAG	2	6	21835	21840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927232
565	NC_008578	CGC	2	6	21858	21863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927232
566	NC_008578	GCGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	117927232
567	NC_008578	GCA	2	6	21897	21902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927232
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569	NC_008578	GCT	2	6	22016	22021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
570	NC_008578	CGA	2	6	22022	22027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
571	NC_008578	TCCGC	2	10	22028	22037	0 %	20 %	20 %	60 %	117927233
572	NC_008578	GTC	2	6	22114	22119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
573	NC_008578	GGA	2	6	22131	22136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927233
574	NC_008578	ACG	4	12	22177	22188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
575	NC_008578	ACC	2	6	22226	22231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927233
576	NC_008578	CCG	2	6	22237	22242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
577	NC_008578	GCG	2	6	22249	22254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
578	NC_008578	GAT	2	6	22263	22268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927233
579	NC_008578	CCG	2	6	22299	22304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
580	NC_008578	TCG	2	6	22315	22320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
581	NC_008578	ACG	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
582	NC_008578	ACGA	2	8	22336	22343	50 %	0 %	25 %	25 %	117927233
583	NC_008578	GCC	2	6	22346	22351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
584	NC_008578	GCC	3	9	22363	22371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
585	NC_008578	TGG	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927233
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587	NC_008578	GCC	2	6	22428	22433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927233
588	NC_008578	GAT	2	6	22434	22439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927233
589	NC_008578	TCG	2	6	22468	22473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
590	NC_008578	ACG	2	6	22474	22479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
591	NC_008578	CGG	2	6	22544	22549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
592	NC_008578	TCG	2	6	22552	22557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
593	NC_008578	GAC	2	6	22599	22604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
594	NC_008578	CGT	2	6	22676	22681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
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596	NC_008578	TCG	2	6	22744	22749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
597	NC_008578	TCG	2	6	22759	22764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
598	NC_008578	TG	3	6	22801	22806	0 %	50 %	50 %	0 %	117927233
599	NC_008578	GTG	2	6	22894	22899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927233
600	NC_008578	CGCC	2	8	22953	22960	0 %	0 %	25 %	75 %	117927233
601	NC_008578	CAG	2	6	22991	22996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927233
602	NC_008578	TCG	2	6	23008	23013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927233
603	NC_008578	GCG	2	6	23015	23020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
604	NC_008578	CGG	2	6	23057	23062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927233
605	NC_008578	CCCA	2	8	23067	23074	25 %	0 %	0 %	75 %	117927233
606	NC_008578	GTC	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008578	CGG	2	6	23234	23239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927234
608	NC_008578	TCG	2	6	23331	23336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
609	NC_008578	TCC	2	6	23345	23350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927234
610	NC_008578	CG	3	6	23367	23372	0 %	0 %	50 %	50 %	117927234
611	NC_008578	CG	3	6	23381	23386	0 %	0 %	50 %	50 %	117927234
612	NC_008578	TCG	2	6	23405	23410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
613	NC_008578	CGCC	2	8	23434	23441	0 %	0 %	25 %	75 %	117927234
614	NC_008578	CGT	2	6	23455	23460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
615	NC_008578	GC	4	8	23512	23519	0 %	0 %	50 %	50 %	117927234
616	NC_008578	CTG	2	6	23533	23538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
617	NC_008578	TCG	2	6	23539	23544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927234
618	NC_008578	GAT	2	6	23623	23628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927234
619	NC_008578	GT	3	6	23726	23731	0 %	50 %	50 %	0 %	117927235
620	NC_008578	AGG	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927235
621	NC_008578	GCG	2	6	23780	23785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
622	NC_008578	GTTG	2	8	23820	23827	0 %	50 %	50 %	0 %	117927235
623	NC_008578	GGTC	2	8	23834	23841	0 %	25 %	50 %	25 %	117927235
624	NC_008578	G	6	6	23848	23853	0 %	0 %	100 %	0 %	117927235
625	NC_008578	CGG	2	6	23881	23886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
626	NC_008578	GAC	2	6	23940	23945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927235
627	NC_008578	GAT	2	6	23991	23996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927235
628	NC_008578	GCCG	2	8	23999	24006	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
629	NC_008578	GGC	2	6	24021	24026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
630	NC_008578	CGGC	2	8	24032	24039	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
631	NC_008578	CGG	2	6	24062	24067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
632	NC_008578	CGG	3	9	24111	24119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
633	NC_008578	CTG	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927235
634	NC_008578	CGG	2	6	24170	24175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927235
635	NC_008578	CGA	2	6	24176	24181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927235
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639	NC_008578	GCGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	117927235
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643	NC_008578	CG	5	10	24477	24486	0 %	0 %	50 %	50 %	117927235
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645	NC_008578	CCT	2	6	24547	24552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_008578	CGGCTT	2	12	24558	24569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_008578	CTG	2	6	24574	24579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_008578	GTT	2	6	24671	24676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
649	NC_008578	GT	3	6	24738	24743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
650	NC_008578	C	6	6	24768	24773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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652	NC_008578	GTG	2	6	24830	24835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927236
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656	NC_008578	CTG	2	6	24928	24933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927236
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750	NC_008578	ACG	2	6	28044	28049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927237
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999	NC_008578	CCG	2	6	37179	37184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927244
1000	NC_008578	TCG	2	6	37205	37210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927244

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