MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 64298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_008578	CGG	2	6	2430624	2430629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929354
64002	NC_008578	AAC	2	6	2430698	2430703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117929354
64003	NC_008578	CGG	3	9	2430735	2430743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929354
64004	NC_008578	CCGG	2	8	2430755	2430762	0 %	0 %	50 %	50 %	117929354
64005	NC_008578	GCC	2	6	2430776	2430781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929354
64006	NC_008578	GCGT	2	8	2430791	2430798	0 %	25 %	50 %	25 %	117929354
64007	NC_008578	GCT	2	6	2430829	2430834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929354
64008	NC_008578	TCG	2	6	2430882	2430887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929354
64009	NC_008578	CGA	2	6	2430892	2430897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929354
64010	NC_008578	TTC	2	6	2430959	2430964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117929354
64011	NC_008578	GAT	2	6	2430984	2430989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117929354
64012	NC_008578	CGG	2	6	2431003	2431008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64013	NC_008578	GAG	2	6	2431060	2431065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64014	NC_008578	TCA	3	9	2431105	2431113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117929355
64015	NC_008578	CGC	2	6	2431151	2431156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929355
64016	NC_008578	TCGG	2	8	2431191	2431198	0 %	25 %	50 %	25 %	117929355
64017	NC_008578	GCGG	2	8	2431200	2431207	0 %	0 %	75 %	25 %	117929355
64018	NC_008578	TGA	2	6	2431213	2431218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117929355
64019	NC_008578	GA	3	6	2431281	2431286	50 %	0 %	50 %	0 %	117929355
64020	NC_008578	GTC	2	6	2431335	2431340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929355
64021	NC_008578	GGT	2	6	2431367	2431372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117929355
64022	NC_008578	CGA	2	6	2431379	2431384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929355
64023	NC_008578	ATC	2	6	2431410	2431415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117929355
64024	NC_008578	TTC	3	9	2431506	2431514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117929355
64025	NC_008578	CGT	2	6	2431532	2431537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929355
64026	NC_008578	GCG	2	6	2431543	2431548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929355
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64029	NC_008578	GCAA	2	8	2431629	2431636	50 %	0 %	25 %	25 %	117929355
64030	NC_008578	CGA	2	6	2431712	2431717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929355
64031	NC_008578	CGC	2	6	2431847	2431852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929355
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64034	NC_008578	GCG	2	6	2431974	2431979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929355
64035	NC_008578	TGGC	2	8	2431995	2432002	0 %	25 %	50 %	25 %	117929355
64036	NC_008578	CGG	2	6	2432103	2432108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64037	NC_008578	GAG	2	6	2432170	2432175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117929356
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64043	NC_008578	GTC	2	6	2432430	2432435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929356
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64047	NC_008578	CGGC	2	8	2432614	2432621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64048	NC_008578	CGG	2	6	2432658	2432663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64049	NC_008578	TGG	2	6	2432715	2432720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64050	NC_008578	CGT	2	6	2432725	2432730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64051	NC_008578	GTT	2	6	2432808	2432813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64052	NC_008578	TG	3	6	2432991	2432996	0 %	50 %	50 %	0 %	117929357
64053	NC_008578	CGC	2	6	2432999	2433004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929357
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64083	NC_008578	TGG	2	6	2434075	2434080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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64111	NC_008578	ACGGC	2	10	2435548	2435557	20 %	0 %	40 %	40 %	117929359
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64116	NC_008578	CGGC	2	8	2435865	2435872	0 %	0 %	50 %	50 %	117929359
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.