MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 64298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008578	TCGG	2	8	211140	211147	0 %	25 %	50 %	25 %	117927407
5502	NC_008578	TCT	2	6	211231	211236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927407
5503	NC_008578	CCA	2	6	211240	211245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927407
5504	NC_008578	TCA	2	6	211268	211273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927407
5505	NC_008578	TGAT	2	8	211303	211310	25 %	50 %	25 %	0 %	117927407
5506	NC_008578	CCGG	2	8	211352	211359	0 %	0 %	50 %	50 %	117927407
5507	NC_008578	CGC	2	6	211391	211396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_008578	GAC	2	6	211452	211457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_008578	CG	3	6	211464	211469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_008578	CGG	2	6	211512	211517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927408
5511	NC_008578	TTC	2	6	211543	211548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927408
5512	NC_008578	GCAC	2	8	211704	211711	25 %	0 %	25 %	50 %	117927408
5513	NC_008578	GTC	2	6	211720	211725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927408
5514	NC_008578	GCC	2	6	211726	211731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927408
5515	NC_008578	TCG	2	6	211736	211741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927408
5516	NC_008578	GTCG	2	8	211867	211874	0 %	25 %	50 %	25 %	117927408
5517	NC_008578	CCGG	2	8	211915	211922	0 %	0 %	50 %	50 %	117927408
5518	NC_008578	TCC	2	6	211995	212000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_008578	GGC	2	6	212028	212033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_008578	CG	3	6	212044	212049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_008578	GCGCA	2	10	212058	212067	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5522	NC_008578	CGT	2	6	212068	212073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_008578	CGC	2	6	212082	212087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_008578	CG	3	6	212099	212104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_008578	GTC	2	6	212113	212118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_008578	GCC	2	6	212119	212124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_008578	CGC	2	6	212146	212151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_008578	GGC	2	6	212194	212199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927409
5529	NC_008578	CGA	2	6	212204	212209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927409
5530	NC_008578	CGG	2	6	212210	212215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927409
5531	NC_008578	GCG	2	6	212221	212226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927409
5532	NC_008578	GTT	2	6	212275	212280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117927409
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5535	NC_008578	CGC	2	6	212353	212358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927409
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5538	NC_008578	CG	3	6	212430	212435	0 %	0 %	50 %	50 %	117927409
5539	NC_008578	CG	3	6	212465	212470	0 %	0 %	50 %	50 %	117927409
5540	NC_008578	CGG	2	6	212478	212483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927409
5541	NC_008578	GAC	2	6	212504	212509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927409
5542	NC_008578	TGG	2	6	212517	212522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927409
5543	NC_008578	CCGG	2	8	212538	212545	0 %	0 %	50 %	50 %	117927409
5544	NC_008578	GTT	2	6	212548	212553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117927409
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5550	NC_008578	TCG	2	6	212688	212693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927409
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5553	NC_008578	GCCAA	2	10	212761	212770	40 %	0 %	20 %	40 %	117927409
5554	NC_008578	TGCG	2	8	212835	212842	0 %	25 %	50 %	25 %	117927409
5555	NC_008578	ACG	2	6	212871	212876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927409
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5557	NC_008578	GC	3	6	212990	212995	0 %	0 %	50 %	50 %	117927409
5558	NC_008578	GCT	2	6	213046	213051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927409
5559	NC_008578	CGC	3	9	213052	213060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927409
5560	NC_008578	TCG	3	9	213066	213074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927409
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5565	NC_008578	CGC	3	9	213472	213480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927409
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5570	NC_008578	GCCG	2	8	213695	213702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_008578	GCCC	2	8	213770	213777	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5572	NC_008578	CGTC	2	8	213804	213811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_008578	GCAACC	2	12	213865	213876	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	117927410
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5579	NC_008578	CTG	2	6	214090	214095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927410
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5588	NC_008578	CTG	2	6	214382	214387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927410
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5592	NC_008578	ACGCAC	2	12	214503	214514	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	117927410
5593	NC_008578	CGC	2	6	214562	214567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927410
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5604	NC_008578	CG	3	6	214944	214949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_008578	CG	3	6	215007	215012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_008578	TCA	2	6	215028	215033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_008578	TG	3	6	215051	215056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_008578	ACG	2	6	215057	215062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_008578	CGG	2	6	215073	215078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927411
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5613	NC_008578	CGT	2	6	215246	215251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927411
5614	NC_008578	GCGG	2	8	215260	215267	0 %	0 %	75 %	25 %	117927411
5615	NC_008578	ATC	2	6	215283	215288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927411
5616	NC_008578	GGTC	2	8	215380	215387	0 %	25 %	50 %	25 %	117927411
5617	NC_008578	G	6	6	215393	215398	0 %	0 %	100 %	0 %	117927411
5618	NC_008578	GCC	2	6	215408	215413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927411
5619	NC_008578	GCC	2	6	215417	215422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927411
5620	NC_008578	CGA	2	6	215437	215442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927411
5621	NC_008578	GTGCG	2	10	215455	215464	0 %	20 %	60 %	20 %	117927411
5622	NC_008578	GCG	3	9	215462	215470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927411
5623	NC_008578	TGC	2	6	215472	215477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927411
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5740	NC_008578	GC	3	6	220020	220025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5741	NC_008578	CGC	2	6	220036	220041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5742	NC_008578	GAC	3	9	220092	220100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927415
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5744	NC_008578	GGC	2	6	220185	220190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927415
5745	NC_008578	TCG	2	6	220193	220198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
5746	NC_008578	TCG	2	6	220214	220219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
5747	NC_008578	TGG	2	6	220234	220239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927415
5748	NC_008578	TGC	2	6	220265	220270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
5749	NC_008578	GCT	2	6	220290	220295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
5750	NC_008578	GGC	2	6	220305	220310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927415
5751	NC_008578	GC	3	6	220331	220336	0 %	0 %	50 %	50 %	117927415
5752	NC_008578	TGC	2	6	220340	220345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
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5761	NC_008578	TTC	2	6	220519	220524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927415
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5766	NC_008578	TCG	2	6	220685	220690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
5767	NC_008578	CGT	2	6	220734	220739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
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5771	NC_008578	CT	3	6	220884	220889	0 %	50 %	0 %	50 %	117927415
5772	NC_008578	GCG	2	6	220905	220910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927415
5773	NC_008578	TGGTC	2	10	220922	220931	0 %	40 %	40 %	20 %	117927415
5774	NC_008578	TGCAT	2	10	220948	220957	20 %	40 %	20 %	20 %	117927415
5775	NC_008578	GTG	2	6	220988	220993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927415
5776	NC_008578	TGCC	2	8	221069	221076	0 %	25 %	25 %	50 %	117927415
5777	NC_008578	CGC	2	6	221097	221102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927415
5778	NC_008578	CGA	2	6	221148	221153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927415
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5780	NC_008578	CTGT	2	8	221388	221395	0 %	50 %	25 %	25 %	117927415
5781	NC_008578	TGAA	2	8	221510	221517	50 %	25 %	25 %	0 %	117927415
5782	NC_008578	CG	3	6	221539	221544	0 %	0 %	50 %	50 %	117927415
5783	NC_008578	CCG	2	6	221562	221567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927415
5784	NC_008578	GGCG	2	8	221611	221618	0 %	0 %	75 %	25 %	117927415
5785	NC_008578	CAT	2	6	221634	221639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927415
5786	NC_008578	CG	3	6	221641	221646	0 %	0 %	50 %	50 %	117927415
5787	NC_008578	GGTG	2	8	221675	221682	0 %	25 %	75 %	0 %	117927415
5788	NC_008578	CCGG	2	8	221718	221725	0 %	0 %	50 %	50 %	117927415
5789	NC_008578	CTG	2	6	221758	221763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927415
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5794	NC_008578	TCG	2	6	222114	222119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927416
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5800	NC_008578	GCG	2	6	222260	222265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927416
5801	NC_008578	GCG	2	6	222300	222305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927416
5802	NC_008578	GAT	2	6	222322	222327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927416
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5812	NC_008578	TCG	2	6	222600	222605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927416
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5818	NC_008578	CCGG	2	8	222811	222818	0 %	0 %	50 %	50 %	117927417
5819	NC_008578	GCG	3	9	222838	222846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927417
5820	NC_008578	CGGC	2	8	222888	222895	0 %	0 %	50 %	50 %	117927417
5821	NC_008578	GGA	2	6	222909	222914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927417
5822	NC_008578	TGG	2	6	222938	222943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927417
5823	NC_008578	CG	3	6	223032	223037	0 %	0 %	50 %	50 %	117927417
5824	NC_008578	GGT	2	6	223215	223220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927417
5825	NC_008578	CGGC	2	8	223249	223256	0 %	0 %	50 %	50 %	117927417
5826	NC_008578	GCGG	2	8	223266	223273	0 %	0 %	75 %	25 %	117927417
5827	NC_008578	GGC	2	6	223284	223289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927417
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5830	NC_008578	CTG	2	6	223378	223383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927417
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5832	NC_008578	ATC	2	6	223426	223431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927417
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5834	NC_008578	CGA	2	6	223518	223523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927417
5835	NC_008578	CGC	2	6	223551	223556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927417
5836	NC_008578	GC	3	6	223560	223565	0 %	0 %	50 %	50 %	117927417
5837	NC_008578	CGG	2	6	223669	223674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927417
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5840	NC_008578	GGT	2	6	223723	223728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927417
5841	NC_008578	GGCG	2	8	223740	223747	0 %	0 %	75 %	25 %	117927417
5842	NC_008578	GTC	2	6	223749	223754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927417
5843	NC_008578	CGGC	2	8	223763	223770	0 %	0 %	50 %	50 %	117927417
5844	NC_008578	GTTGG	2	10	223827	223836	0 %	40 %	60 %	0 %	117927418
5845	NC_008578	TCG	3	9	223840	223848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927418
5846	NC_008578	GTC	2	6	224031	224036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927418
5847	NC_008578	CGG	2	6	224134	224139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927418
5848	NC_008578	CGC	2	6	224189	224194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927418
5849	NC_008578	GCC	2	6	224228	224233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927418
5850	NC_008578	CCG	2	6	224253	224258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927418
5851	NC_008578	CGGGA	2	10	224273	224282	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5852	NC_008578	CGG	2	6	224291	224296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5853	NC_008578	CGG	2	6	224298	224303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5854	NC_008578	GAC	2	6	224348	224353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927419
5855	NC_008578	CTG	2	6	224359	224364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927419
5856	NC_008578	CGC	2	6	224372	224377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927419
5857	NC_008578	CACC	2	8	224378	224385	25 %	0 %	0 %	75 %	117927419
5858	NC_008578	GCCG	2	8	224418	224425	0 %	0 %	50 %	50 %	117927419
5859	NC_008578	GCG	2	6	224445	224450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927419
5860	NC_008578	ACG	2	6	224467	224472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927419
5861	NC_008578	TCG	2	6	224473	224478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927419
5862	NC_008578	GCT	2	6	224522	224527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927419
5863	NC_008578	GCCC	2	8	224544	224551	0 %	0 %	25 %	75 %	117927419
5864	NC_008578	CGA	2	6	224552	224557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927419
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5866	NC_008578	TCT	2	6	224582	224587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927419
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5982	NC_008578	CTC	2	6	229151	229156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927423
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5984	NC_008578	GCC	2	6	229227	229232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927423
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5986	NC_008578	GC	4	8	229265	229272	0 %	0 %	50 %	50 %	117927423
5987	NC_008578	GGTCG	2	10	229303	229312	0 %	20 %	60 %	20 %	117927423
5988	NC_008578	GCCG	2	8	229375	229382	0 %	0 %	50 %	50 %	117927423
5989	NC_008578	CCG	2	6	229520	229525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927424
5990	NC_008578	GC	3	6	229564	229569	0 %	0 %	50 %	50 %	117927424
5991	NC_008578	CG	3	6	229570	229575	0 %	0 %	50 %	50 %	117927424
5992	NC_008578	TGC	2	6	229597	229602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927424
5993	NC_008578	GCC	2	6	229615	229620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927424
5994	NC_008578	CGC	2	6	229664	229669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927424
5995	NC_008578	TCG	2	6	229670	229675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927424
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5999	NC_008578	CGT	2	6	229827	229832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927424
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