MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 115736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_008570	CAG	2	6	1223779	1223784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620872
30003	NC_008570	GTG	2	6	1223788	1223793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117620872
30004	NC_008570	GCA	2	6	1223796	1223801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620872
30005	NC_008570	CGG	2	6	1223805	1223810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117620872
30006	NC_008570	GCG	2	6	1223813	1223818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117620872
30007	NC_008570	GCGCT	2	10	1223836	1223845	0 %	20 %	40 %	40 %	117620872
30008	NC_008570	GCC	2	6	1223846	1223851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620872
30009	NC_008570	GC	3	6	1223873	1223878	0 %	0 %	50 %	50 %	117620872
30010	NC_008570	GCC	2	6	1223911	1223916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620872
30011	NC_008570	ACG	2	6	1223921	1223926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620872
30012	NC_008570	TCG	2	6	1223954	1223959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620872
30013	NC_008570	CCA	2	6	1223973	1223978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117620872
30014	NC_008570	CAG	2	6	1224023	1224028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620872
30015	NC_008570	CAC	2	6	1224037	1224042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117620872
30016	NC_008570	CGA	2	6	1224069	1224074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620872
30017	NC_008570	CCA	2	6	1224108	1224113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117620872
30018	NC_008570	CCG	2	6	1224154	1224159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30019	NC_008570	TGGC	2	8	1224221	1224228	0 %	25 %	50 %	25 %	117618856
30020	NC_008570	CAG	2	6	1224238	1224243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30021	NC_008570	CGG	2	6	1224315	1224320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618856
30022	NC_008570	CCA	2	6	1224327	1224332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618856
30023	NC_008570	GCA	2	6	1224348	1224353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30024	NC_008570	TCG	2	6	1224356	1224361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30025	NC_008570	CTG	2	6	1224415	1224420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30026	NC_008570	GC	3	6	1224523	1224528	0 %	0 %	50 %	50 %	117618856
30027	NC_008570	GCC	2	6	1224566	1224571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618856
30028	NC_008570	GCG	2	6	1224587	1224592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618856
30029	NC_008570	GCC	2	6	1224602	1224607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618856
30030	NC_008570	GAT	2	6	1224700	1224705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618856
30031	NC_008570	GCA	3	9	1224759	1224767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30032	NC_008570	GTCG	2	8	1224778	1224785	0 %	25 %	50 %	25 %	117618856
30033	NC_008570	GCG	2	6	1224801	1224806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618856
30034	NC_008570	TCA	2	6	1224837	1224842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618856
30035	NC_008570	CAG	2	6	1224844	1224849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30036	NC_008570	GCTG	2	8	1224867	1224874	0 %	25 %	50 %	25 %	117618856
30037	NC_008570	TGA	2	6	1224894	1224899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618856
30038	NC_008570	GCA	2	6	1224966	1224971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30039	NC_008570	TGGCC	2	10	1224981	1224990	0 %	20 %	40 %	40 %	117618856
30040	NC_008570	CGC	2	6	1225017	1225022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618856
30041	NC_008570	CAG	2	6	1225039	1225044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618856
30042	NC_008570	G	6	6	1225053	1225058	0 %	0 %	100 %	0 %	117618856
30043	NC_008570	AGG	2	6	1225059	1225064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117618856
30044	NC_008570	GA	3	6	1225112	1225117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_008570	TCAA	2	8	1225119	1225126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30046	NC_008570	TGC	2	6	1225211	1225216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30047	NC_008570	CGG	2	6	1225284	1225289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30048	NC_008570	GCA	2	6	1225297	1225302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30049	NC_008570	AGCAG	2	10	1225384	1225393	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30050	NC_008570	GAG	2	6	1225456	1225461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30051	NC_008570	GTG	2	6	1225565	1225570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619299
30052	NC_008570	GCCGAT	2	12	1225615	1225626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117619299
30053	NC_008570	GC	3	6	1225656	1225661	0 %	0 %	50 %	50 %	117619299
30054	NC_008570	AAG	2	6	1225780	1225785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117619299
30055	NC_008570	GCC	2	6	1225825	1225830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619299
30056	NC_008570	CGA	2	6	1225839	1225844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619299
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30058	NC_008570	GAC	2	6	1225870	1225875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619299
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30060	NC_008570	TGA	2	6	1225948	1225953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619299
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30062	NC_008570	A	7	7	1226001	1226007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30065	NC_008570	AGT	2	6	1226076	1226081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620259
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30071	NC_008570	GA	3	6	1226543	1226548	50 %	0 %	50 %	0 %	117620259
30072	NC_008570	ACC	2	6	1226689	1226694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117620259
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30076	NC_008570	CAGC	2	8	1226850	1226857	25 %	0 %	25 %	50 %	117620259
30077	NC_008570	AAAT	2	8	1226967	1226974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30078	NC_008570	GATCAG	2	12	1227103	1227114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	117618583
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30082	NC_008570	GCA	4	12	1227207	1227218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618583
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30084	NC_008570	GAT	2	6	1227331	1227336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618583
30085	NC_008570	CAG	2	6	1227343	1227348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618583
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30098	NC_008570	GCC	2	6	1227746	1227751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618583
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30101	NC_008570	GTG	2	6	1227803	1227808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618583
30102	NC_008570	CAG	2	6	1227838	1227843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618583
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30105	NC_008570	GCGCCG	2	12	1227911	1227922	0 %	0 %	50 %	50 %	117618583
30106	NC_008570	ATC	2	6	1227929	1227934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618583
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30112	NC_008570	CAG	2	6	1228129	1228134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618583
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30114	NC_008570	CAGC	2	8	1228168	1228175	25 %	0 %	25 %	50 %	117618583
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30116	NC_008570	CCA	2	6	1228203	1228208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618583
30117	NC_008570	CAG	3	9	1228321	1228329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618583
30118	NC_008570	GCGA	2	8	1228391	1228398	25 %	0 %	50 %	25 %	117618583
30119	NC_008570	CTC	2	6	1228440	1228445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30120	NC_008570	CCGT	2	8	1228554	1228561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30121	NC_008570	GAT	2	6	1228613	1228618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30122	NC_008570	CTG	2	6	1228619	1228624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30123	NC_008570	GCA	2	6	1228648	1228653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30124	NC_008570	CGG	2	6	1228696	1228701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30125	NC_008570	ACA	2	6	1228729	1228734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30126	NC_008570	TC	3	6	1228771	1228776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30127	NC_008570	CCT	2	6	1228852	1228857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30128	NC_008570	GC	3	6	1228928	1228933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30129	NC_008570	TCCGC	2	10	1228951	1228960	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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30150	NC_008570	CTC	2	6	1229521	1229526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30151	NC_008570	CTG	2	6	1229580	1229585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619442
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30197	NC_008570	TAA	2	6	1231942	1231947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30198	NC_008570	A	7	7	1231981	1231987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30199	NC_008570	GAT	2	6	1232006	1232011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30201	NC_008570	CAT	2	6	1232126	1232131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30203	NC_008570	TCG	2	6	1232162	1232167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30204	NC_008570	AACC	2	8	1232187	1232194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30221	NC_008570	TGCG	2	8	1233099	1233106	0 %	25 %	50 %	25 %	117620378
30222	NC_008570	CAT	2	6	1233118	1233123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117620378
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30226	NC_008570	CT	3	6	1233281	1233286	0 %	50 %	0 %	50 %	117620378
30227	NC_008570	TGA	2	6	1233291	1233296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620378
30228	NC_008570	TCA	2	6	1233306	1233311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117620378
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30230	NC_008570	CTG	3	9	1233401	1233409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620378
30231	NC_008570	CTT	2	6	1233587	1233592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621223
30232	NC_008570	GCG	2	6	1233656	1233661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621223
30233	NC_008570	GCC	2	6	1233701	1233706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621223
30234	NC_008570	CGAT	2	8	1233720	1233727	25 %	25 %	25 %	25 %	117621223
30235	NC_008570	ATG	2	6	1233737	1233742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621223
30236	NC_008570	TGGC	2	8	1233752	1233759	0 %	25 %	50 %	25 %	117621223
30237	NC_008570	CGC	2	6	1233811	1233816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621223
30238	NC_008570	CTG	2	6	1233875	1233880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621223
30239	NC_008570	GCA	2	6	1233915	1233920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621223
30240	NC_008570	TGC	2	6	1233934	1233939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621223
30241	NC_008570	CTT	2	6	1234033	1234038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621223
30242	NC_008570	GCC	2	6	1234069	1234074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621223
30243	NC_008570	GTG	2	6	1234118	1234123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621223
30244	NC_008570	GGT	2	6	1234142	1234147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621223
30245	NC_008570	TTC	2	6	1234196	1234201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621223
30246	NC_008570	GGC	2	6	1234289	1234294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621223
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30248	NC_008570	CCTT	2	8	1234347	1234354	0 %	50 %	0 %	50 %	117621223
30249	NC_008570	TGA	2	6	1234392	1234397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621223
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30251	NC_008570	CAT	2	6	1234447	1234452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621223
30252	NC_008570	TGA	2	6	1234461	1234466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621223
30253	NC_008570	CTG	2	6	1234487	1234492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621223
30254	NC_008570	GGC	2	6	1234559	1234564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621223
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30259	NC_008570	ATG	2	6	1234703	1234708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621223
30260	NC_008570	GGA	2	6	1234779	1234784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621223
30261	NC_008570	TAA	2	6	1234799	1234804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621223
30262	NC_008570	AAGCA	2	10	1234923	1234932	60 %	0 %	20 %	20 %	117619697
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30264	NC_008570	GGC	2	6	1235081	1235086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619697
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30271	NC_008570	GCG	2	6	1235329	1235334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619697
30272	NC_008570	TCG	2	6	1235365	1235370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619697
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30275	NC_008570	CAA	2	6	1235622	1235627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117620038
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30277	NC_008570	TGA	2	6	1235699	1235704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620038
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30287	NC_008570	CTG	4	12	1236109	1236120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620038
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30296	NC_008570	TCA	2	6	1236551	1236556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618100
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30300	NC_008570	GGAAA	2	10	1236807	1236816	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30301	NC_008570	ATT	2	6	1236828	1236833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117618547
30302	NC_008570	CTG	2	6	1236861	1236866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618547
30303	NC_008570	TGG	2	6	1236871	1236876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618547
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30319	NC_008570	ATC	2	6	1237440	1237445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618547
30320	NC_008570	CAT	3	9	1237484	1237492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618547
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30324	NC_008570	GGT	3	9	1237656	1237664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618547
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30329	NC_008570	CTG	2	6	1238022	1238027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618547
30330	NC_008570	TGG	2	6	1238036	1238041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618547
30331	NC_008570	GCA	2	6	1238155	1238160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621535
30332	NC_008570	TCA	2	6	1238200	1238205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621535
30333	NC_008570	TGC	2	6	1238239	1238244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621535
30334	NC_008570	GGT	3	9	1238327	1238335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621535
30335	NC_008570	CG	3	6	1238348	1238353	0 %	0 %	50 %	50 %	117621535
30336	NC_008570	GGT	2	6	1238354	1238359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621535
30337	NC_008570	GACC	2	8	1238455	1238462	25 %	0 %	25 %	50 %	117621535
30338	NC_008570	CGA	2	6	1238474	1238479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621535
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30340	NC_008570	GCCGAT	2	12	1238538	1238549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117621535
30341	NC_008570	TC	3	6	1238585	1238590	0 %	50 %	0 %	50 %	117621535
30342	NC_008570	TGG	2	6	1238662	1238667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621535
30343	NC_008570	TC	3	6	1238845	1238850	0 %	50 %	0 %	50 %	117621535
30344	NC_008570	CCT	2	6	1238917	1238922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621535
30345	NC_008570	AGCCT	2	10	1238976	1238985	20 %	20 %	20 %	40 %	117621535
30346	NC_008570	GAT	2	6	1239030	1239035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621535
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30348	NC_008570	T	7	7	1239108	1239114	0 %	100 %	0 %	0 %	117620992
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30464	NC_008570	CTG	2	6	1243481	1243486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621405
30465	NC_008570	GAG	2	6	1243493	1243498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621405
30466	NC_008570	CGAC	2	8	1243551	1243558	25 %	0 %	25 %	50 %	117621405
30467	NC_008570	GCT	2	6	1243561	1243566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621405
30468	NC_008570	GC	3	6	1243568	1243573	0 %	0 %	50 %	50 %	117621405
30469	NC_008570	AGCG	2	8	1243652	1243659	25 %	0 %	50 %	25 %	117621405
30470	NC_008570	CGA	2	6	1243717	1243722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621405
30471	NC_008570	GC	3	6	1243768	1243773	0 %	0 %	50 %	50 %	117621405
30472	NC_008570	GCT	3	9	1243816	1243824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621405
30473	NC_008570	CTG	2	6	1243874	1243879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621405
30474	NC_008570	CGC	2	6	1243892	1243897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621405
30475	NC_008570	CCA	2	6	1243971	1243976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621405
30476	NC_008570	GGC	2	6	1243987	1243992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621405
30477	NC_008570	GGCC	2	8	1244050	1244057	0 %	0 %	50 %	50 %	117621405
30478	NC_008570	AGC	2	6	1244121	1244126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621405
30479	NC_008570	TGG	2	6	1244175	1244180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621405
30480	NC_008570	CTG	2	6	1244265	1244270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617575
30481	NC_008570	CGGTGC	2	12	1244276	1244287	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117617575
30482	NC_008570	CTG	2	6	1244325	1244330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617575
30483	NC_008570	GCCGG	2	10	1244331	1244340	0 %	0 %	60 %	40 %	117617575
30484	NC_008570	GGT	2	6	1244348	1244353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117617575
30485	NC_008570	GC	4	8	1244381	1244388	0 %	0 %	50 %	50 %	117617575
30486	NC_008570	CCG	2	6	1244406	1244411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117617575
30487	NC_008570	GGGC	2	8	1244498	1244505	0 %	0 %	75 %	25 %	117617575
30488	NC_008570	GGC	2	6	1244510	1244515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117617575
30489	NC_008570	TGC	2	6	1244549	1244554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617575
30490	NC_008570	CTG	2	6	1244646	1244651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617575
30491	NC_008570	CCG	2	6	1244713	1244718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117617575
30492	NC_008570	AGC	2	6	1244769	1244774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117617575
30493	NC_008570	GTGA	2	8	1244778	1244785	25 %	25 %	50 %	0 %	117617575
30494	NC_008570	GGC	2	6	1244804	1244809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117617575
30495	NC_008570	ACG	2	6	1244870	1244875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30496	NC_008570	AGG	2	6	1244876	1244881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30497	NC_008570	GGCG	2	8	1244917	1244924	0 %	0 %	75 %	25 %	117618639
30498	NC_008570	CTG	2	6	1244945	1244950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618639
30499	NC_008570	GGC	2	6	1244974	1244979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618639
30500	NC_008570	GGC	2	6	1245004	1245009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618639

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