MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008340	GACC	2	8	646691	646698	25 %	0 %	25 %	50 %	114319754
16002	NC_008340	ACG	2	6	646735	646740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319754
16003	NC_008340	CG	3	6	646748	646753	0 %	0 %	50 %	50 %	114319754
16004	NC_008340	CAA	2	6	646787	646792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319754
16005	NC_008340	CAC	2	6	646808	646813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319754
16006	NC_008340	CGA	2	6	646826	646831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319754
16007	NC_008340	GCA	2	6	646856	646861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319754
16008	NC_008340	TG	3	6	646887	646892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_008340	GGC	2	6	646928	646933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_008340	T	8	8	646953	646960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_008340	TCC	2	6	646969	646974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16012	NC_008340	GTG	2	6	647014	647019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_008340	GGGT	2	8	647035	647042	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_008340	A	7	7	647090	647096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_008340	CAG	2	6	647135	647140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_008340	AC	3	6	647150	647155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16017	NC_008340	CGG	2	6	647249	647254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319755
16018	NC_008340	CGA	2	6	647334	647339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319755
16019	NC_008340	CAG	2	6	647349	647354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319755
16020	NC_008340	CTT	2	6	647427	647432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319755
16021	NC_008340	CAC	2	6	647487	647492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319755
16022	NC_008340	TCCT	2	8	647497	647504	0 %	50 %	0 %	50 %	114319755
16023	NC_008340	GGC	2	6	647515	647520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319755
16024	NC_008340	CGG	2	6	647535	647540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319755
16025	NC_008340	CCA	2	6	647636	647641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319755
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16029	NC_008340	GGA	2	6	647973	647978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319755
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16035	NC_008340	ACT	2	6	648194	648199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319755
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16039	NC_008340	CGCC	2	8	648333	648340	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16040	NC_008340	TTC	2	6	648353	648358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_008340	TGA	2	6	648383	648388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_008340	GGAAG	2	10	648423	648432	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_008340	TGCG	2	8	648448	648455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16044	NC_008340	TCT	2	6	648508	648513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319756
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16050	NC_008340	GCT	2	6	648721	648726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319756
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16052	NC_008340	GCC	2	6	648859	648864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16053	NC_008340	GCT	2	6	648974	648979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319757
16054	NC_008340	G	6	6	648983	648988	0 %	0 %	100 %	0 %	114319757
16055	NC_008340	CGC	2	6	649022	649027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319757
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16057	NC_008340	TTC	2	6	649117	649122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319757
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16097	NC_008340	GCG	2	6	650393	650398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16105	NC_008340	TGGGG	2	10	650676	650685	0 %	20 %	80 %	0 %	114319758
16106	NC_008340	G	6	6	650682	650687	0 %	0 %	100 %	0 %	114319758
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16111	NC_008340	TAG	2	6	650783	650788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319758
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16119	NC_008340	GCAC	2	8	651027	651034	25 %	0 %	25 %	50 %	114319758
16120	NC_008340	GGC	2	6	651058	651063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319758
16121	NC_008340	TGG	3	9	651111	651119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319758
16122	NC_008340	GCCG	2	8	651121	651128	0 %	0 %	50 %	50 %	114319758
16123	NC_008340	GCC	3	9	651161	651169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319758
16124	NC_008340	GCG	2	6	651186	651191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319758
16125	NC_008340	TGT	2	6	651192	651197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319758
16126	NC_008340	TCA	2	6	651213	651218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319758
16127	NC_008340	GC	3	6	651231	651236	0 %	0 %	50 %	50 %	114319758
16128	NC_008340	CGG	2	6	651237	651242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319758
16129	NC_008340	GCC	2	6	651248	651253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319758
16130	NC_008340	GGC	3	9	651271	651279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319758
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16134	NC_008340	GCAGGT	2	12	651384	651395	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319758
16135	NC_008340	CGGG	2	8	651406	651413	0 %	0 %	75 %	25 %	114319758
16136	NC_008340	CGG	2	6	651432	651437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319758
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16140	NC_008340	GCA	2	6	651552	651557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319759
16141	NC_008340	TCA	2	6	651582	651587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319759
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16147	NC_008340	CGGC	2	8	651769	651776	0 %	0 %	50 %	50 %	114319759
16148	NC_008340	CAC	2	6	651793	651798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319759
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16151	NC_008340	TGC	2	6	652025	652030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319759
16152	NC_008340	GCC	2	6	652037	652042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319759
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16154	NC_008340	CGG	3	9	652119	652127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319759
16155	NC_008340	GCA	2	6	652203	652208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319759
16156	NC_008340	CGGA	2	8	652285	652292	25 %	0 %	50 %	25 %	114319759
16157	NC_008340	TCCC	2	8	652332	652339	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16158	NC_008340	GGGGT	2	10	652400	652409	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16159	NC_008340	A	6	6	652423	652428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16160	NC_008340	GGAC	2	8	652455	652462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16161	NC_008340	GGA	2	6	652517	652522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319760
16162	NC_008340	GGCC	2	8	652657	652664	0 %	0 %	50 %	50 %	114319760
16163	NC_008340	CTG	2	6	652719	652724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319760
16164	NC_008340	CTG	2	6	652727	652732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319760
16165	NC_008340	CCG	2	6	652733	652738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319760
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16177	NC_008340	CCG	2	6	653104	653109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319761
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16184	NC_008340	GCT	2	6	653396	653401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319761
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16186	NC_008340	GGGCC	2	10	653422	653431	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16187	NC_008340	GCGG	2	8	653442	653449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16188	NC_008340	GCC	2	6	653465	653470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16189	NC_008340	GAT	2	6	653477	653482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16190	NC_008340	GCC	2	6	653485	653490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16191	NC_008340	CATTC	2	10	653495	653504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16192	NC_008340	GC	3	6	653520	653525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16193	NC_008340	CG	4	8	653527	653534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16194	NC_008340	CGAAG	2	10	653568	653577	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16195	NC_008340	AAG	2	6	653597	653602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319762
16196	NC_008340	GTG	2	6	653603	653608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319762
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16199	NC_008340	CCG	2	6	653691	653696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319762
16200	NC_008340	GAG	2	6	653711	653716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319762
16201	NC_008340	AAG	2	6	653732	653737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319762
16202	NC_008340	CGA	2	6	653770	653775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319762
16203	NC_008340	GAG	2	6	653783	653788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319762
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16209	NC_008340	GGC	2	6	654223	654228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319762
16210	NC_008340	AT	3	6	654244	654249	50 %	50 %	0 %	0 %	114319762
16211	NC_008340	GCG	2	6	654267	654272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319762
16212	NC_008340	CGC	2	6	654307	654312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319762
16213	NC_008340	GCT	2	6	654313	654318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319762
16214	NC_008340	TCG	2	6	654369	654374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319762
16215	NC_008340	GCT	2	6	654405	654410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319762
16216	NC_008340	GGC	2	6	654422	654427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319762
16217	NC_008340	CTG	2	6	654434	654439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319762
16218	NC_008340	TGG	2	6	654542	654547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319762
16219	NC_008340	GTG	2	6	654608	654613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319762
16220	NC_008340	TGG	2	6	654645	654650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319762
16221	NC_008340	GACCA	2	10	654680	654689	40 %	0 %	20 %	40 %	114319762
16222	NC_008340	GAT	2	6	654704	654709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319762
16223	NC_008340	CCTGCG	2	12	654760	654771	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319762
16224	NC_008340	GCG	2	6	654781	654786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319762
16225	NC_008340	CGG	2	6	654805	654810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16226	NC_008340	CGGTCT	2	12	654855	654866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319763
16227	NC_008340	GTC	2	6	654907	654912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319763
16228	NC_008340	GTT	2	6	654924	654929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319763
16229	NC_008340	TCC	2	6	654935	654940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319763
16230	NC_008340	GCA	2	6	654951	654956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319763
16231	NC_008340	CGT	2	6	654987	654992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319763
16232	NC_008340	TC	3	6	654998	655003	0 %	50 %	0 %	50 %	114319763
16233	NC_008340	CAG	2	6	655048	655053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319763
16234	NC_008340	G	7	7	655075	655081	0 %	0 %	100 %	0 %	114319763
16235	NC_008340	CGG	2	6	655090	655095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319763
16236	NC_008340	GAT	2	6	655225	655230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319763
16237	NC_008340	CCA	2	6	655335	655340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319763
16238	NC_008340	GCA	2	6	655368	655373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319763
16239	NC_008340	CCG	2	6	655382	655387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319763
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16241	NC_008340	GCCC	2	8	655438	655445	0 %	0 %	25 %	75 %	114319764
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16481	NC_008340	CAT	2	6	664560	664565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319774
16482	NC_008340	CGG	2	6	664567	664572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319774
16483	NC_008340	TTG	2	6	664633	664638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319774
16484	NC_008340	CAA	2	6	664721	664726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16485	NC_008340	GCA	2	6	664793	664798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319775
16486	NC_008340	CCGA	2	8	664818	664825	25 %	0 %	25 %	50 %	114319775
16487	NC_008340	GCG	2	6	664950	664955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319775
16488	NC_008340	GGC	2	6	664958	664963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319775
16489	NC_008340	GGC	2	6	664967	664972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319775
16490	NC_008340	AGC	2	6	665029	665034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319775
16491	NC_008340	CG	3	6	665035	665040	0 %	0 %	50 %	50 %	114319775
16492	NC_008340	CTGCGG	2	12	665052	665063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319775
16493	NC_008340	GCCGG	2	10	665094	665103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16494	NC_008340	GGC	2	6	665144	665149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319776
16495	NC_008340	CGT	3	9	665164	665172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319776
16496	NC_008340	CCG	2	6	665173	665178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319776
16497	NC_008340	GTG	2	6	665181	665186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319776
16498	NC_008340	CTG	2	6	665225	665230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319776
16499	NC_008340	TGC	2	6	665247	665252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319776
16500	NC_008340	GCC	2	6	665285	665290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319776

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