MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008340	CCGCC	2	10	565205	565214	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14002	NC_008340	GGC	2	6	565251	565256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_008340	CAG	2	6	565301	565306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_008340	ACA	2	6	565330	565335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319679
14005	NC_008340	CCGCC	2	10	565339	565348	0 %	0 %	20 %	80 %	114319679
14006	NC_008340	GCA	2	6	565352	565357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319679
14007	NC_008340	TCG	2	6	565405	565410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319679
14008	NC_008340	CAG	2	6	565422	565427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319679
14009	NC_008340	GCC	2	6	565449	565454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319679
14010	NC_008340	GCT	2	6	565472	565477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319679
14011	NC_008340	CTG	2	6	565515	565520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319679
14012	NC_008340	GGC	2	6	565523	565528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319679
14013	NC_008340	GCC	2	6	565560	565565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319679
14014	NC_008340	GCC	2	6	565595	565600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319679
14015	NC_008340	GAG	2	6	565683	565688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319679
14016	NC_008340	CTT	2	6	565691	565696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319679
14017	NC_008340	GCG	2	6	565723	565728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319679
14018	NC_008340	CCG	2	6	565751	565756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319679
14019	NC_008340	TC	3	6	565766	565771	0 %	50 %	0 %	50 %	114319679
14020	NC_008340	TGC	2	6	565777	565782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319679
14021	NC_008340	GGC	2	6	565944	565949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319679
14022	NC_008340	GCT	2	6	565958	565963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319679
14023	NC_008340	GGC	2	6	565988	565993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319679
14024	NC_008340	GCG	2	6	565997	566002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319679
14025	NC_008340	GCG	2	6	566035	566040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319679
14026	NC_008340	TTGG	2	8	566068	566075	0 %	50 %	50 %	0 %	114319680
14027	NC_008340	GGCG	2	8	566076	566083	0 %	0 %	75 %	25 %	114319680
14028	NC_008340	GCG	2	6	566103	566108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319680
14029	NC_008340	TGC	2	6	566120	566125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319680
14030	NC_008340	CAG	2	6	566184	566189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319680
14031	NC_008340	CAGC	2	8	566193	566200	25 %	0 %	25 %	50 %	114319680
14032	NC_008340	GGC	2	6	566217	566222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319680
14033	NC_008340	GCG	2	6	566283	566288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319680
14034	NC_008340	AGC	2	6	566317	566322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319680
14035	NC_008340	CAC	2	6	566334	566339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319680
14036	NC_008340	CAG	3	9	566394	566402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319680
14037	NC_008340	GCC	3	9	566484	566492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319681
14038	NC_008340	CTC	2	6	566531	566536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319681
14039	NC_008340	CGGC	2	8	566553	566560	0 %	0 %	50 %	50 %	114319681
14040	NC_008340	TGGC	2	8	566574	566581	0 %	25 %	50 %	25 %	114319681
14041	NC_008340	CGC	2	6	566596	566601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319681
14042	NC_008340	CCA	2	6	566641	566646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319681
14043	NC_008340	GTG	2	6	566657	566662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319681
14044	NC_008340	CAG	2	6	566663	566668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319681
14045	NC_008340	GCA	2	6	566671	566676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319681
14046	NC_008340	GCC	2	6	566702	566707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319681
14047	NC_008340	CGGC	2	8	566737	566744	0 %	0 %	50 %	50 %	114319681
14048	NC_008340	GTC	2	6	566867	566872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319681
14049	NC_008340	GGGC	2	8	566885	566892	0 %	0 %	75 %	25 %	114319681
14050	NC_008340	CGG	2	6	566939	566944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319681
14051	NC_008340	CTC	2	6	566981	566986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319681
14052	NC_008340	CGG	2	6	567016	567021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_008340	ATC	2	6	567069	567074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_008340	GGC	2	6	567153	567158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_008340	CCG	2	6	567173	567178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14056	NC_008340	TGC	2	6	567225	567230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319682
14057	NC_008340	CCG	2	6	567306	567311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319682
14058	NC_008340	TGCC	2	8	567315	567322	0 %	25 %	25 %	50 %	114319682
14059	NC_008340	GCT	2	6	567354	567359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319682
14060	NC_008340	GCT	2	6	567372	567377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319682
14061	NC_008340	CGC	2	6	567399	567404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319682
14062	NC_008340	TCT	2	6	567413	567418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319682
14063	NC_008340	TGT	2	6	567446	567451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319682
14064	NC_008340	GGT	2	6	567480	567485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319682
14065	NC_008340	GCA	3	9	567486	567494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319682
14066	NC_008340	GGA	2	6	567498	567503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319682
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14068	NC_008340	GGC	2	6	567516	567521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319682
14069	NC_008340	GGT	2	6	567531	567536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319682
14070	NC_008340	GCT	2	6	567540	567545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319682
14071	NC_008340	CTG	2	6	567565	567570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319682
14072	NC_008340	ATG	2	6	567571	567576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319682
14073	NC_008340	GCC	2	6	567577	567582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319682
14074	NC_008340	AATG	2	8	567594	567601	50 %	25 %	25 %	0 %	114319682
14075	NC_008340	GCCG	2	8	567626	567633	0 %	0 %	50 %	50 %	114319682
14076	NC_008340	TCG	2	6	567791	567796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319682
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14078	NC_008340	CGC	3	9	567882	567890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319682
14079	NC_008340	GGC	2	6	567900	567905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319682
14080	NC_008340	GGC	2	6	567969	567974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319682
14081	NC_008340	GTG	2	6	568015	568020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319682
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14083	NC_008340	CGGC	2	8	568079	568086	0 %	0 %	50 %	50 %	114319682
14084	NC_008340	GGCG	2	8	568136	568143	0 %	0 %	75 %	25 %	114319682
14085	NC_008340	CGG	2	6	568193	568198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319682
14086	NC_008340	TGC	2	6	568214	568219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319682
14087	NC_008340	CCGGGC	2	12	568239	568250	0 %	0 %	50 %	50 %	114319682
14088	NC_008340	GGCGAG	2	12	568264	568275	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114319682
14089	NC_008340	TCCC	2	8	568293	568300	0 %	25 %	0 %	75 %	114319682
14090	NC_008340	GCC	2	6	568354	568359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319682
14091	NC_008340	CCGG	2	8	568482	568489	0 %	0 %	50 %	50 %	114319682
14092	NC_008340	T	6	6	568541	568546	0 %	100 %	0 %	0 %	114319683
14093	NC_008340	T	6	6	568572	568577	0 %	100 %	0 %	0 %	114319683
14094	NC_008340	TGG	2	6	568636	568641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319683
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14099	NC_008340	ACC	2	6	568794	568799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14100	NC_008340	CCA	2	6	568871	568876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14101	NC_008340	GGC	2	6	568925	568930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319684
14102	NC_008340	GCC	3	9	568944	568952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319684
14103	NC_008340	GGCC	2	8	568958	568965	0 %	0 %	50 %	50 %	114319684
14104	NC_008340	GC	3	6	568993	568998	0 %	0 %	50 %	50 %	114319684
14105	NC_008340	GCAAC	2	10	569039	569048	40 %	0 %	20 %	40 %	114319684
14106	NC_008340	GGC	2	6	569079	569084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319684
14107	NC_008340	TGG	2	6	569101	569106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319684
14108	NC_008340	ATC	2	6	569140	569145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319684
14109	NC_008340	CCA	2	6	569146	569151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319684
14110	NC_008340	GC	3	6	569163	569168	0 %	0 %	50 %	50 %	114319684
14111	NC_008340	CTT	2	6	569204	569209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319684
14112	NC_008340	TGA	3	9	569241	569249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319684
14113	NC_008340	GGA	2	6	569273	569278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319685
14114	NC_008340	CGG	3	9	569301	569309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319685
14115	NC_008340	GCA	2	6	569419	569424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319685
14116	NC_008340	GC	3	6	569438	569443	0 %	0 %	50 %	50 %	114319685
14117	NC_008340	TGC	2	6	569445	569450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319685
14118	NC_008340	CAT	2	6	569482	569487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319685
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14120	NC_008340	GGC	2	6	569533	569538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319685
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14475	NC_008340	AGCC	2	8	584214	584221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14476	NC_008340	CCT	2	6	584290	584295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14477	NC_008340	TTC	2	6	584340	584345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14480	NC_008340	TCA	2	6	584536	584541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14481	NC_008340	AGCGA	2	10	584547	584556	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14482	NC_008340	GCG	2	6	584558	584563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14483	NC_008340	TCG	2	6	584640	584645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319698
14484	NC_008340	TCC	2	6	584670	584675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319698
14485	NC_008340	CCA	2	6	584755	584760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319698
14486	NC_008340	TCG	2	6	584889	584894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319698
14487	NC_008340	G	6	6	584902	584907	0 %	0 %	100 %	0 %	114319698
14488	NC_008340	AGC	2	6	584928	584933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319698
14489	NC_008340	AGG	2	6	584940	584945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319698
14490	NC_008340	ATG	2	6	584961	584966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319698
14491	NC_008340	TTG	2	6	585057	585062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14492	NC_008340	GTG	2	6	585202	585207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319699
14493	NC_008340	TGG	2	6	585242	585247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319699
14494	NC_008340	CGG	2	6	585347	585352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319699
14495	NC_008340	GCCCG	2	10	585419	585428	0 %	0 %	40 %	60 %	114319699
14496	NC_008340	GCA	2	6	585452	585457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319699
14497	NC_008340	GGTCCG	2	12	585470	585481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319699
14498	NC_008340	CG	3	6	585499	585504	0 %	0 %	50 %	50 %	114319699
14499	NC_008340	CCA	2	6	585512	585517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319699
14500	NC_008340	GC	3	6	585614	585619	0 %	0 %	50 %	50 %	114319699

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