MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008340	GAGCGC	2	12	524202	524213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319632
13002	NC_008340	AGA	2	6	524221	524226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319632
13003	NC_008340	CCG	2	6	524231	524236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319632
13004	NC_008340	CAG	2	6	524292	524297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319632
13005	NC_008340	GGC	2	6	524438	524443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319632
13006	NC_008340	CAGG	2	8	524507	524514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13007	NC_008340	CGT	2	6	524604	524609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319633
13008	NC_008340	GAAG	2	8	524641	524648	50 %	0 %	50 %	0 %	114319633
13009	NC_008340	CGG	2	6	524674	524679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319633
13010	NC_008340	GAA	2	6	524686	524691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319633
13011	NC_008340	CTA	2	6	524716	524721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319633
13012	NC_008340	TGA	2	6	524853	524858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319633
13013	NC_008340	GCC	2	6	524867	524872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319633
13014	NC_008340	GGT	2	6	524888	524893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319633
13015	NC_008340	TCT	2	6	524910	524915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319633
13016	NC_008340	GCAG	2	8	525062	525069	25 %	0 %	50 %	25 %	114319634
13017	NC_008340	GC	3	6	525107	525112	0 %	0 %	50 %	50 %	114319634
13018	NC_008340	CTGG	2	8	525120	525127	0 %	25 %	50 %	25 %	114319634
13019	NC_008340	ACC	2	6	525129	525134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319634
13020	NC_008340	AAC	2	6	525147	525152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319634
13021	NC_008340	GAACCT	2	12	525233	525244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114319634
13022	NC_008340	CCAG	2	8	525307	525314	25 %	0 %	25 %	50 %	114319634
13023	NC_008340	TCG	2	6	525322	525327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319634
13024	NC_008340	CGC	2	6	525362	525367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319634
13025	NC_008340	GCC	2	6	525386	525391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319634
13026	NC_008340	AAG	3	9	525453	525461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319634
13027	NC_008340	GCG	2	6	525502	525507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319635
13028	NC_008340	GC	3	6	525509	525514	0 %	0 %	50 %	50 %	114319635
13029	NC_008340	CGC	2	6	525570	525575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319635
13030	NC_008340	ATC	2	6	525593	525598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319635
13031	NC_008340	CGG	2	6	525607	525612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319635
13032	NC_008340	CGC	2	6	525625	525630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319635
13033	NC_008340	GCC	2	6	525803	525808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319635
13034	NC_008340	GGCC	2	8	525814	525821	0 %	0 %	50 %	50 %	114319635
13035	NC_008340	GTC	2	6	525917	525922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319636
13036	NC_008340	CGGC	2	8	525928	525935	0 %	0 %	50 %	50 %	114319636
13037	NC_008340	GCCG	2	8	526015	526022	0 %	0 %	50 %	50 %	114319636
13038	NC_008340	CAGC	2	8	526136	526143	25 %	0 %	25 %	50 %	114319636
13039	NC_008340	CAT	2	6	526159	526164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319636
13040	NC_008340	CGG	2	6	526168	526173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319636
13041	NC_008340	GC	3	6	526180	526185	0 %	0 %	50 %	50 %	114319636
13042	NC_008340	GGT	2	6	526195	526200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319636
13043	NC_008340	GTG	2	6	526253	526258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319636
13044	NC_008340	CCA	2	6	526263	526268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319636
13045	NC_008340	GACG	2	8	526279	526286	25 %	0 %	50 %	25 %	114319636
13046	NC_008340	CCG	2	6	526312	526317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319636
13047	NC_008340	AAG	2	6	526322	526327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319636
13048	NC_008340	GAC	2	6	526353	526358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319637
13049	NC_008340	AGC	2	6	526364	526369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319637
13050	NC_008340	GCA	2	6	526388	526393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319637
13051	NC_008340	GCCA	2	8	526408	526415	25 %	0 %	25 %	50 %	114319637
13052	NC_008340	TG	3	6	526423	526428	0 %	50 %	50 %	0 %	114319637
13053	NC_008340	GGTCTG	2	12	526432	526443	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114319637
13054	NC_008340	CGC	2	6	526444	526449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319637
13055	NC_008340	ATCA	2	8	526450	526457	50 %	25 %	0 %	25 %	114319637
13056	NC_008340	GTG	3	9	526462	526470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319637
13057	NC_008340	CAA	2	6	526500	526505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319637
13058	NC_008340	CCT	2	6	526515	526520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319637
13059	NC_008340	GAG	2	6	526528	526533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319637
13060	NC_008340	TCCG	2	8	526557	526564	0 %	25 %	25 %	50 %	114319638
13061	NC_008340	GCC	2	6	526565	526570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319638
13062	NC_008340	CCG	2	6	526629	526634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319638
13063	NC_008340	CTG	2	6	526814	526819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319638
13064	NC_008340	CAT	2	6	526837	526842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319638
13065	NC_008340	GC	3	6	526891	526896	0 %	0 %	50 %	50 %	114319638
13066	NC_008340	GGC	2	6	526948	526953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319638
13067	NC_008340	CGG	2	6	526984	526989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319639
13068	NC_008340	TGG	2	6	527133	527138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319639
13069	NC_008340	AGC	3	9	527139	527147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319639
13070	NC_008340	CAT	2	6	527221	527226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319639
13071	NC_008340	TCC	2	6	527237	527242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319639
13072	NC_008340	CAT	3	9	527245	527253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319639
13073	NC_008340	GCT	2	6	527257	527262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319639
13074	NC_008340	CGG	2	6	527265	527270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319639
13075	NC_008340	AAG	2	6	527294	527299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319639
13076	NC_008340	GCC	2	6	527313	527318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319639
13077	NC_008340	GGC	2	6	527410	527415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319639
13078	NC_008340	GGCC	2	8	527424	527431	0 %	0 %	50 %	50 %	114319639
13079	NC_008340	TCA	2	6	527439	527444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319639
13080	NC_008340	ATC	3	9	527531	527539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319639
13081	NC_008340	TCG	2	6	527550	527555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319639
13082	NC_008340	CGG	2	6	527575	527580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319639
13083	NC_008340	GGT	2	6	527653	527658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319639
13084	NC_008340	GTG	2	6	527666	527671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319639
13085	NC_008340	CG	3	6	527710	527715	0 %	0 %	50 %	50 %	114319639
13086	NC_008340	GCA	2	6	527719	527724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319639
13087	NC_008340	AGC	2	6	527750	527755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319639
13088	NC_008340	GCTGAA	2	12	527764	527775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114319639
13089	NC_008340	CCG	2	6	527792	527797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319639
13090	NC_008340	GGC	2	6	527884	527889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319639
13091	NC_008340	CAT	2	6	527938	527943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319639
13092	NC_008340	CTT	2	6	527944	527949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319639
13093	NC_008340	CTT	2	6	527953	527958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319639
13094	NC_008340	CGG	2	6	527991	527996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319639
13095	NC_008340	TGA	2	6	528072	528077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319639
13096	NC_008340	G	6	6	528093	528098	0 %	0 %	100 %	0 %	114319639
13097	NC_008340	CCG	2	6	528111	528116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319639
13098	NC_008340	TCTG	2	8	528117	528124	0 %	50 %	25 %	25 %	114319639
13099	NC_008340	CGG	2	6	528169	528174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319639
13100	NC_008340	CTG	2	6	528182	528187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319639
13101	NC_008340	ATCGTC	2	12	528191	528202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114319639
13102	NC_008340	TGA	2	6	528261	528266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319639
13103	NC_008340	CCGG	2	8	528293	528300	0 %	0 %	50 %	50 %	114319639
13104	NC_008340	GGC	2	6	528325	528330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_008340	GC	3	6	528347	528352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13106	NC_008340	CGC	2	6	528484	528489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319640
13107	NC_008340	GTG	2	6	528496	528501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319640
13108	NC_008340	CGGC	2	8	528519	528526	0 %	0 %	50 %	50 %	114319640
13109	NC_008340	AGC	2	6	528530	528535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319640
13110	NC_008340	GCA	2	6	528559	528564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_008340	GA	3	6	528614	528619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_008340	AGGC	2	8	528732	528739	25 %	0 %	50 %	25 %	114319641
13113	NC_008340	CGT	2	6	528833	528838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319641
13114	NC_008340	GCT	2	6	528876	528881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319641
13115	NC_008340	CCCGTA	2	12	528942	528953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319641
13116	NC_008340	GGCA	2	8	528973	528980	25 %	0 %	50 %	25 %	114319641
13117	NC_008340	GCCC	2	8	528993	529000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13118	NC_008340	AGC	2	6	529065	529070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319642
13119	NC_008340	GGT	2	6	529104	529109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319642
13120	NC_008340	CAA	2	6	529140	529145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319642
13121	NC_008340	TGGCC	2	10	529179	529188	0 %	20 %	40 %	40 %	114319642
13122	NC_008340	CGG	2	6	529200	529205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319642
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13124	NC_008340	CGG	2	6	529343	529348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319642
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13126	NC_008340	GCCG	2	8	529421	529428	0 %	0 %	50 %	50 %	114319642
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13144	NC_008340	AG	3	6	530125	530130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13230	NC_008340	GC	3	6	533872	533877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13231	NC_008340	GCG	3	9	533920	533928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13232	NC_008340	T	7	7	533929	533935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_008340	GCC	2	6	533937	533942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13234	NC_008340	AGC	2	6	533947	533952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13235	NC_008340	GC	3	6	533962	533967	0 %	0 %	50 %	50 %	114319649
13236	NC_008340	CTT	2	6	533983	533988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319649
13237	NC_008340	GGA	2	6	534061	534066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319649
13238	NC_008340	AGGCC	2	10	534091	534100	20 %	0 %	40 %	40 %	114319649
13239	NC_008340	GGT	2	6	534132	534137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319649
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13241	NC_008340	CAG	2	6	534170	534175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319649
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13246	NC_008340	GCC	2	6	534266	534271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319649
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13348	NC_008340	CGA	2	6	538726	538731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13353	NC_008340	CTA	2	6	538910	538915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319653
13354	NC_008340	GC	3	6	538926	538931	0 %	0 %	50 %	50 %	114319653
13355	NC_008340	GAG	3	9	538989	538997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319653
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13357	NC_008340	GAC	2	6	539052	539057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319653
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13359	NC_008340	GGT	2	6	539093	539098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319653
13360	NC_008340	CCGGC	2	10	539141	539150	0 %	0 %	40 %	60 %	114319653
13361	NC_008340	GCT	2	6	539234	539239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319653
13362	NC_008340	CGAC	2	8	539307	539314	25 %	0 %	25 %	50 %	114319653
13363	NC_008340	CGA	2	6	539363	539368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319653
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13366	NC_008340	GCC	2	6	539400	539405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319653
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13369	NC_008340	GCC	3	9	539427	539435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319653
13370	NC_008340	GTAG	2	8	539517	539524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13372	NC_008340	ATTCA	2	10	539578	539587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13373	NC_008340	ACC	2	6	539618	539623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13374	NC_008340	CCT	2	6	539654	539659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13375	NC_008340	GCC	2	6	539747	539752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13376	NC_008340	GCC	2	6	539776	539781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13377	NC_008340	GAT	2	6	539871	539876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319654
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13384	NC_008340	GCCG	2	8	540194	540201	0 %	0 %	50 %	50 %	114319654
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13392	NC_008340	GTG	2	6	540654	540659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319655
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13398	NC_008340	ACGC	2	8	540955	540962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13399	NC_008340	AT	3	6	540987	540992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13400	NC_008340	ACA	2	6	540997	541002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13401	NC_008340	TGC	2	6	541109	541114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13402	NC_008340	GTC	2	6	541130	541135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13405	NC_008340	G	6	6	541239	541244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13406	NC_008340	AC	3	6	541262	541267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13407	NC_008340	GT	3	6	541304	541309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13408	NC_008340	TGTA	2	8	541326	541333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13410	NC_008340	CCGT	2	8	541404	541411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13411	NC_008340	GCC	2	6	541506	541511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13429	NC_008340	GACG	2	8	542636	542643	25 %	0 %	50 %	25 %	114319656
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13464	NC_008340	CGA	2	6	544348	544353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319657
13465	NC_008340	CGGGG	2	10	544393	544402	0 %	0 %	80 %	20 %	114319657
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13468	NC_008340	TGGCC	2	10	544588	544597	0 %	20 %	40 %	40 %	114319658
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13473	NC_008340	CCGA	2	8	544802	544809	25 %	0 %	25 %	50 %	114319658
13474	NC_008340	CGG	2	6	544827	544832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319658
13475	NC_008340	ATG	2	6	544892	544897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319658
13476	NC_008340	TTCAGC	2	12	544907	544918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114319658
13477	NC_008340	TGC	2	6	544977	544982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319659
13478	NC_008340	TGG	2	6	544989	544994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319659
13479	NC_008340	TTG	2	6	545018	545023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319659
13480	NC_008340	GTCGG	2	10	545027	545036	0 %	20 %	60 %	20 %	114319659
13481	NC_008340	GC	3	6	545085	545090	0 %	0 %	50 %	50 %	114319659
13482	NC_008340	GCC	4	12	545108	545119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319659
13483	NC_008340	GGC	2	6	545171	545176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319659
13484	NC_008340	GCG	2	6	545186	545191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319659
13485	NC_008340	CCGAT	2	10	545193	545202	20 %	20 %	20 %	40 %	114319659
13486	NC_008340	GCT	2	6	545203	545208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319659
13487	NC_008340	ATG	2	6	545210	545215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319659
13488	NC_008340	CTG	2	6	545246	545251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319659
13489	NC_008340	G	6	6	545258	545263	0 %	0 %	100 %	0 %	114319659
13490	NC_008340	TGG	2	6	545265	545270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319659
13491	NC_008340	CTG	2	6	545285	545290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319659
13492	NC_008340	GGT	2	6	545317	545322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319659
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13498	NC_008340	CTGG	2	8	545443	545450	0 %	25 %	50 %	25 %	114319659
13499	NC_008340	GCG	2	6	545501	545506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319659
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