MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008340	CTG	2	6	502873	502878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319609
12502	NC_008340	TGC	2	6	502979	502984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319609
12503	NC_008340	CGC	2	6	503034	503039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319609
12504	NC_008340	GGC	2	6	503043	503048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319609
12505	NC_008340	TCG	2	6	503069	503074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319609
12506	NC_008340	GGC	2	6	503104	503109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319609
12507	NC_008340	CG	3	6	503186	503191	0 %	0 %	50 %	50 %	114319609
12508	NC_008340	GAA	2	6	503247	503252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319609
12509	NC_008340	CAT	2	6	503295	503300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319609
12510	NC_008340	TCGAGG	2	12	503327	503338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319609
12511	NC_008340	GAA	2	6	503415	503420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319609
12512	NC_008340	CCA	3	9	503432	503440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319609
12513	NC_008340	GCC	2	6	503503	503508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_008340	ACA	2	6	503546	503551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_008340	ACC	2	6	503651	503656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_008340	CCGG	2	8	503672	503679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12517	NC_008340	GCC	2	6	503714	503719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_008340	CGG	2	6	503728	503733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_008340	AGG	2	6	503753	503758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_008340	T	6	6	503759	503764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_008340	AGG	2	6	503826	503831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319610
12522	NC_008340	CGGC	2	8	503868	503875	0 %	0 %	50 %	50 %	114319610
12523	NC_008340	CAG	2	6	503894	503899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319610
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12525	NC_008340	GCGG	2	8	503950	503957	0 %	0 %	75 %	25 %	114319610
12526	NC_008340	TGCA	2	8	503978	503985	25 %	25 %	25 %	25 %	114319610
12527	NC_008340	GCT	3	9	504004	504012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319610
12528	NC_008340	GGA	2	6	504025	504030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319610
12529	NC_008340	GCC	2	6	504038	504043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319610
12530	NC_008340	GC	3	6	504044	504049	0 %	0 %	50 %	50 %	114319610
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12533	NC_008340	TGC	2	6	504180	504185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319610
12534	NC_008340	CCA	2	6	504189	504194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319610
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12536	NC_008340	GGC	2	6	504262	504267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319610
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12538	NC_008340	AGA	2	6	504391	504396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319611
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12540	NC_008340	GCC	2	6	504485	504490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319611
12541	NC_008340	GCC	3	9	504506	504514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319611
12542	NC_008340	CGAGGC	2	12	504520	504531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319611
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12550	NC_008340	AAGG	2	8	504674	504681	50 %	0 %	50 %	0 %	114319611
12551	NC_008340	GAG	2	6	504701	504706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319611
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12553	NC_008340	GAC	2	6	504766	504771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_008340	TGG	2	6	504797	504802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_008340	TGCC	2	8	504837	504844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12556	NC_008340	TG	3	6	504909	504914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_008340	ACC	2	6	504922	504927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12558	NC_008340	CGG	2	6	504943	504948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_008340	AAG	2	6	505012	505017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319612
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12562	NC_008340	CG	3	6	505262	505267	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
12563	NC_008340	AAG	2	6	505355	505360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319612
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12565	NC_008340	TCG	2	6	505492	505497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
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12570	NC_008340	CTG	2	6	505621	505626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
12571	NC_008340	CG	3	6	505627	505632	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
12572	NC_008340	CAG	2	6	505648	505653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319612
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12578	NC_008340	TCG	2	6	505886	505891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319612
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12588	NC_008340	GAC	2	6	506326	506331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319612
12589	NC_008340	ACC	2	6	506336	506341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319612
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12592	NC_008340	GGC	3	9	506493	506501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319612
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12594	NC_008340	CTC	2	6	506520	506525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319612
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12600	NC_008340	CGGC	2	8	506877	506884	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
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12604	NC_008340	TGG	2	6	507095	507100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319612
12605	NC_008340	GC	3	6	507124	507129	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
12606	NC_008340	GCG	2	6	507161	507166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319612
12607	NC_008340	ACG	3	9	507209	507217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319612
12608	NC_008340	GGCG	2	8	507225	507232	0 %	0 %	75 %	25 %	114319612
12609	NC_008340	GTG	2	6	507325	507330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319612
12610	NC_008340	TGG	2	6	507401	507406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319612
12611	NC_008340	GTG	2	6	507463	507468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319612
12612	NC_008340	AGG	2	6	507470	507475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319612
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12615	NC_008340	CG	4	8	507516	507523	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
12616	NC_008340	GAG	2	6	507541	507546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319612
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12619	NC_008340	GAG	2	6	507691	507696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319612
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12621	NC_008340	GC	3	6	507705	507710	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
12622	NC_008340	GCAG	2	8	507846	507853	25 %	0 %	50 %	25 %	114319612
12623	NC_008340	GGC	2	6	507858	507863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319612
12624	NC_008340	GC	4	8	507927	507934	0 %	0 %	50 %	50 %	114319612
12625	NC_008340	TGG	2	6	507935	507940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319612
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12630	NC_008340	AAG	2	6	508132	508137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319612
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12720	NC_008340	CGTGAG	2	12	512079	512090	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319613
12721	NC_008340	CACC	2	8	512180	512187	25 %	0 %	0 %	75 %	114319613
12722	NC_008340	ATC	2	6	512190	512195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319613
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12725	NC_008340	TGG	2	6	512407	512412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319613
12726	NC_008340	ACT	2	6	512461	512466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319613
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12728	NC_008340	ATC	2	6	512484	512489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319613
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12732	NC_008340	GAG	2	6	512724	512729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319613
12733	NC_008340	GGTGA	2	10	512784	512793	20 %	20 %	60 %	0 %	114319613
12734	NC_008340	TCC	2	6	512824	512829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319613
12735	NC_008340	CTG	2	6	512832	512837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
12736	NC_008340	TGC	2	6	512944	512949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
12737	NC_008340	GCG	2	6	512992	512997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
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12739	NC_008340	GGC	2	6	513044	513049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
12740	NC_008340	TGC	2	6	513079	513084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
12741	NC_008340	GAC	2	6	513146	513151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319613
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12743	NC_008340	TCG	2	6	513220	513225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319613
12744	NC_008340	CGG	2	6	513238	513243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319613
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12852	NC_008340	GATC	2	8	517860	517867	25 %	25 %	25 %	25 %	114319618
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12859	NC_008340	CGTC	2	8	518125	518132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12860	NC_008340	GCC	2	6	518142	518147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12861	NC_008340	CCG	2	6	518148	518153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12862	NC_008340	CGG	2	6	518161	518166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12863	NC_008340	G	6	6	518165	518170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12864	NC_008340	TTG	2	6	518177	518182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12965	NC_008340	AG	3	6	522407	522412	50 %	0 %	50 %	0 %	114319627
12966	NC_008340	TCG	2	6	522526	522531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319627
12967	NC_008340	TGA	2	6	522584	522589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319627
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12977	NC_008340	ACC	2	6	522925	522930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319629
12978	NC_008340	GC	4	8	522953	522960	0 %	0 %	50 %	50 %	114319629
12979	NC_008340	AAG	2	6	523066	523071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319629
12980	NC_008340	CGT	3	9	523089	523097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319629
12981	NC_008340	CGC	2	6	523105	523110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319629
12982	NC_008340	GCC	2	6	523156	523161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319629
12983	NC_008340	TGC	2	6	523163	523168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319629
12984	NC_008340	CAT	2	6	523248	523253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319629
12985	NC_008340	CGA	2	6	523309	523314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319630
12986	NC_008340	CGT	2	6	523315	523320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319630
12987	NC_008340	CAT	2	6	523321	523326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319630
12988	NC_008340	GTG	2	6	523409	523414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319630
12989	NC_008340	GCA	2	6	523438	523443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319630
12990	NC_008340	CGG	2	6	523453	523458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319630
12991	NC_008340	CAT	2	6	523459	523464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319630
12992	NC_008340	GGA	2	6	523552	523557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319630
12993	NC_008340	CAA	2	6	523585	523590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319630
12994	NC_008340	AAG	2	6	523757	523762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319631
12995	NC_008340	GC	3	6	523773	523778	0 %	0 %	50 %	50 %	114319631
12996	NC_008340	TCA	2	6	523926	523931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319631
12997	NC_008340	GCCGC	2	10	523937	523946	0 %	0 %	40 %	60 %	114319631
12998	NC_008340	ATCACC	2	12	524078	524089	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114319631
12999	NC_008340	ACG	2	6	524090	524095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319631
13000	NC_008340	CGA	2	6	524104	524109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319631

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