MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008340	GTC	2	6	479496	479501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319592
12002	NC_008340	CCA	2	6	479555	479560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319592
12003	NC_008340	CAGC	2	8	479592	479599	25 %	0 %	25 %	50 %	114319592
12004	NC_008340	GATCAG	2	12	479604	479615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114319592
12005	NC_008340	ATG	2	6	479659	479664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319592
12006	NC_008340	GCG	2	6	479764	479769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319592
12007	NC_008340	GAT	2	6	479787	479792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319592
12008	NC_008340	AGC	2	6	479874	479879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319593
12009	NC_008340	ACC	2	6	479895	479900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319593
12010	NC_008340	AGG	2	6	479923	479928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319593
12011	NC_008340	CCA	2	6	480013	480018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319593
12012	NC_008340	GTC	2	6	480038	480043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319593
12013	NC_008340	C	6	6	480073	480078	0 %	0 %	0 %	100 %	114319593
12014	NC_008340	TCG	2	6	480120	480125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319593
12015	NC_008340	GCCG	2	8	480293	480300	0 %	0 %	50 %	50 %	114319593
12016	NC_008340	CAGC	2	8	480304	480311	25 %	0 %	25 %	50 %	114319593
12017	NC_008340	CCG	2	6	480340	480345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12018	NC_008340	GGT	2	6	480446	480451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319594
12019	NC_008340	GCCTCC	2	12	480490	480501	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319594
12020	NC_008340	CAGGGC	2	12	480513	480524	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319594
12021	NC_008340	CAG	2	6	480585	480590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319594
12022	NC_008340	GGT	2	6	480620	480625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319594
12023	NC_008340	GGA	2	6	480626	480631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319594
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12025	NC_008340	GCT	2	6	480701	480706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319594
12026	NC_008340	GCC	2	6	480715	480720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319594
12027	NC_008340	GGT	2	6	480753	480758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319594
12028	NC_008340	ATG	2	6	480772	480777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319594
12029	NC_008340	CGG	2	6	480899	480904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319594
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12032	NC_008340	G	6	6	480980	480985	0 %	0 %	100 %	0 %	114319594
12033	NC_008340	CAT	2	6	481002	481007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319594
12034	NC_008340	CAG	2	6	481083	481088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319594
12035	NC_008340	CCGC	2	8	481090	481097	0 %	0 %	25 %	75 %	114319594
12036	NC_008340	GAC	2	6	481110	481115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319594
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12038	NC_008340	GCC	2	6	481180	481185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319594
12039	NC_008340	CCA	2	6	481193	481198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319594
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12041	NC_008340	GTG	2	6	481309	481314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319594
12042	NC_008340	CG	3	6	481315	481320	0 %	0 %	50 %	50 %	114319594
12043	NC_008340	GAA	2	6	481350	481355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319594
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12050	NC_008340	GCG	2	6	481592	481597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319594
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12052	NC_008340	GGC	2	6	481698	481703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319594
12053	NC_008340	GGCC	2	8	481716	481723	0 %	0 %	50 %	50 %	114319594
12054	NC_008340	ACC	2	6	481840	481845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319594
12055	NC_008340	GCA	2	6	481877	481882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319594
12056	NC_008340	GCA	3	9	481913	481921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319594
12057	NC_008340	C	6	6	481960	481965	0 %	0 %	0 %	100 %	114319594
12058	NC_008340	GCT	2	6	481980	481985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319594
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12060	NC_008340	C	7	7	482015	482021	0 %	0 %	0 %	100 %	114319594
12061	NC_008340	CAG	2	6	482103	482108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319594
12062	NC_008340	GCT	2	6	482118	482123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319594
12063	NC_008340	GCC	2	6	482127	482132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12064	NC_008340	TGT	2	6	482144	482149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_008340	GCA	2	6	482193	482198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12066	NC_008340	TCG	2	6	482217	482222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319595
12067	NC_008340	TGC	2	6	482250	482255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319595
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12069	NC_008340	TCCC	2	8	482338	482345	0 %	25 %	0 %	75 %	114319595
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12071	NC_008340	TTC	2	6	482414	482419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319595
12072	NC_008340	ACGGC	2	10	482430	482439	20 %	0 %	40 %	40 %	114319595
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12077	NC_008340	TGG	2	6	482715	482720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319595
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12080	NC_008340	GCCACC	2	12	482820	482831	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114319595
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12084	NC_008340	TGC	2	6	483015	483020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319595
12085	NC_008340	GCG	2	6	483082	483087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319595
12086	NC_008340	CGGC	2	8	483147	483154	0 %	0 %	50 %	50 %	114319595
12087	NC_008340	TGC	2	6	483222	483227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319595
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12089	NC_008340	TGT	2	6	483312	483317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12090	NC_008340	TGG	2	6	483390	483395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319596
12091	NC_008340	GCC	3	9	483407	483415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319596
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12093	NC_008340	GAC	2	6	483449	483454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319596
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12095	NC_008340	ACC	2	6	483674	483679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319596
12096	NC_008340	TGCGGC	2	12	483680	483691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319596
12097	NC_008340	C	6	6	483749	483754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12098	NC_008340	TGT	2	6	483769	483774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_008340	CCCA	2	8	483821	483828	25 %	0 %	0 %	75 %	114319597
12100	NC_008340	GCG	2	6	483829	483834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
12101	NC_008340	GC	3	6	483842	483847	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
12102	NC_008340	GCCA	2	8	483897	483904	25 %	0 %	25 %	50 %	114319597
12103	NC_008340	CCAG	2	8	483922	483929	25 %	0 %	25 %	50 %	114319597
12104	NC_008340	GTG	2	6	483951	483956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319597
12105	NC_008340	GCC	3	9	483993	484001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319597
12106	NC_008340	GCC	3	9	484031	484039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319597
12107	NC_008340	CAG	2	6	484112	484117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319597
12108	NC_008340	CGG	2	6	484217	484222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
12109	NC_008340	CAG	2	6	484247	484252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319597
12110	NC_008340	CCG	2	6	484253	484258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319597
12111	NC_008340	AGC	2	6	484260	484265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319597
12112	NC_008340	GC	3	6	484276	484281	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
12113	NC_008340	C	6	6	484281	484286	0 %	0 %	0 %	100 %	114319597
12114	NC_008340	GTCCC	2	10	484314	484323	0 %	20 %	20 %	60 %	114319597
12115	NC_008340	TGC	2	6	484326	484331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319597
12116	NC_008340	C	6	6	484428	484433	0 %	0 %	0 %	100 %	114319597
12117	NC_008340	CG	3	6	484445	484450	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
12118	NC_008340	TCC	2	6	484452	484457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319597
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12120	NC_008340	GC	3	6	484501	484506	0 %	0 %	50 %	50 %	114319597
12121	NC_008340	CGG	3	9	484530	484538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319597
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12237	NC_008340	GTT	2	6	490450	490455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12238	NC_008340	AGG	2	6	490542	490547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12242	NC_008340	TCC	2	6	490909	490914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12243	NC_008340	ACCG	2	8	490932	490939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12244	NC_008340	ACTT	2	8	491075	491082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12246	NC_008340	AC	3	6	491432	491437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12248	NC_008340	AAC	2	6	491469	491474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12252	NC_008340	CG	3	6	491608	491613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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