MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008340	ACG	2	6	459320	459325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11502	NC_008340	CGA	2	6	459393	459398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11503	NC_008340	GCT	2	6	459444	459449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11504	NC_008340	CAC	2	6	459456	459461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319571
11505	NC_008340	GC	3	6	459528	459533	0 %	0 %	50 %	50 %	114319571
11506	NC_008340	CGGCC	2	10	459585	459594	0 %	0 %	40 %	60 %	114319571
11507	NC_008340	CCA	2	6	459677	459682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319571
11508	NC_008340	TGG	2	6	459689	459694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319571
11509	NC_008340	TCG	2	6	459701	459706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11510	NC_008340	GGTG	2	8	459714	459721	0 %	25 %	75 %	0 %	114319571
11511	NC_008340	TGGC	2	8	459733	459740	0 %	25 %	50 %	25 %	114319571
11512	NC_008340	CCG	2	6	459859	459864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
11513	NC_008340	GAC	2	6	459916	459921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319572
11514	NC_008340	GC	3	6	459930	459935	0 %	0 %	50 %	50 %	114319572
11515	NC_008340	GGC	2	6	460008	460013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319572
11516	NC_008340	TGG	2	6	460031	460036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319572
11517	NC_008340	CTG	2	6	460126	460131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319572
11518	NC_008340	GCC	2	6	460145	460150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319572
11519	NC_008340	TGG	2	6	460163	460168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319572
11520	NC_008340	GCC	2	6	460213	460218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319572
11521	NC_008340	CCGA	2	8	460294	460301	25 %	0 %	25 %	50 %	114319572
11522	NC_008340	CG	3	6	460339	460344	0 %	0 %	50 %	50 %	114319572
11523	NC_008340	GTG	3	9	460345	460353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319572
11524	NC_008340	TCC	2	6	460451	460456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319572
11525	NC_008340	CCG	2	6	460469	460474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319572
11526	NC_008340	GCC	2	6	460483	460488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319572
11527	NC_008340	GGGC	2	8	460554	460561	0 %	0 %	75 %	25 %	114319572
11528	NC_008340	GCGG	2	8	460571	460578	0 %	0 %	75 %	25 %	114319572
11529	NC_008340	TCG	2	6	460601	460606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319572
11530	NC_008340	GTG	2	6	460651	460656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319572
11531	NC_008340	CCG	3	9	460692	460700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319572
11532	NC_008340	AC	3	6	460714	460719	50 %	0 %	0 %	50 %	114319572
11533	NC_008340	C	6	6	460758	460763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11534	NC_008340	AGT	2	6	460783	460788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319573
11535	NC_008340	CGAC	2	8	460789	460796	25 %	0 %	25 %	50 %	114319573
11536	NC_008340	GCCG	2	8	460825	460832	0 %	0 %	50 %	50 %	114319573
11537	NC_008340	GGA	2	6	460837	460842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319573
11538	NC_008340	GCA	2	6	460843	460848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319573
11539	NC_008340	GCC	2	6	460892	460897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319573
11540	NC_008340	GGA	2	6	460939	460944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319573
11541	NC_008340	GGGCGT	2	12	460981	460992	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114319573
11542	NC_008340	CGGC	2	8	461104	461111	0 %	0 %	50 %	50 %	114319573
11543	NC_008340	CGA	2	6	461182	461187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319573
11544	NC_008340	TCG	2	6	461289	461294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319573
11545	NC_008340	GCC	2	6	461315	461320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319573
11546	NC_008340	GCG	2	6	461400	461405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319573
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11550	NC_008340	TGC	2	6	461553	461558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319573
11551	NC_008340	CGA	2	6	461668	461673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319573
11552	NC_008340	CCG	2	6	461689	461694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319573
11553	NC_008340	CGA	3	9	461710	461718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319573
11554	NC_008340	CGCC	2	8	461791	461798	0 %	0 %	25 %	75 %	114319573
11555	NC_008340	GGA	2	6	461902	461907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319573
11556	NC_008340	CGG	3	9	461950	461958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319573
11557	NC_008340	TCT	2	6	461988	461993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319573
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11560	NC_008340	AGG	2	6	462144	462149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319573
11561	NC_008340	GGC	2	6	462209	462214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319573
11562	NC_008340	CCCACG	2	12	462227	462238	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_008340	CGG	2	6	462269	462274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_008340	GGT	2	6	462288	462293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_008340	GAT	2	6	462296	462301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_008340	CGGGC	2	10	462302	462311	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11567	NC_008340	GC	3	6	462354	462359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_008340	AGCGA	2	10	462367	462376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11569	NC_008340	CGC	3	9	462382	462390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11570	NC_008340	GCCCG	2	10	462437	462446	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11571	NC_008340	ATC	2	6	462447	462452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_008340	CAC	2	6	462454	462459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_008340	CAG	2	6	462524	462529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319574
11574	NC_008340	CCGC	2	8	462592	462599	0 %	0 %	25 %	75 %	114319574
11575	NC_008340	GGCC	2	8	462623	462630	0 %	0 %	50 %	50 %	114319574
11576	NC_008340	ACC	2	6	462691	462696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319574
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11578	NC_008340	ATCC	2	8	462773	462780	25 %	25 %	0 %	50 %	114319574
11579	NC_008340	GCC	2	6	462795	462800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319574
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11581	NC_008340	GCC	2	6	462948	462953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319574
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11587	NC_008340	CGCCC	2	10	463253	463262	0 %	0 %	20 %	80 %	114319574
11588	NC_008340	CGG	2	6	463304	463309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319574
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11591	NC_008340	TGC	2	6	463477	463482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319574
11592	NC_008340	CCGC	2	8	463507	463514	0 %	0 %	25 %	75 %	114319574
11593	NC_008340	ACC	2	6	463530	463535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319574
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11600	NC_008340	G	6	6	463678	463683	0 %	0 %	100 %	0 %	114319574
11601	NC_008340	GCT	2	6	463826	463831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319574
11602	NC_008340	CG	3	6	463890	463895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_008340	GCG	2	6	463933	463938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319575
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11605	NC_008340	TCC	2	6	464015	464020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319575
11606	NC_008340	GGGC	2	8	464057	464064	0 %	0 %	75 %	25 %	114319575
11607	NC_008340	CCT	2	6	464076	464081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319575
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11611	NC_008340	GTC	2	6	464245	464250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11613	NC_008340	CGG	2	6	464293	464298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_008340	GCT	2	6	464383	464388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319576
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11616	NC_008340	GAT	2	6	464480	464485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319576
11617	NC_008340	CGG	2	6	464486	464491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319576
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11619	NC_008340	GTT	2	6	464582	464587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319576
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11984	NC_008340	GTGG	2	8	478282	478289	0 %	25 %	75 %	0 %	114319589
11985	NC_008340	GCT	2	6	478321	478326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319589
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11987	NC_008340	ACCG	2	8	478536	478543	25 %	0 %	25 %	50 %	114319590
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11989	NC_008340	GCT	2	6	478649	478654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319590
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11991	NC_008340	GCT	2	6	478764	478769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11992	NC_008340	ACTG	2	8	478871	478878	25 %	25 %	25 %	25 %	114319591
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