MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008340	GCC	3	9	441173	441181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319555
11002	NC_008340	GGCC	2	8	441193	441200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11003	NC_008340	CA	3	6	441239	441244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_008340	GCTAG	2	10	441257	441266	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11005	NC_008340	CCG	2	6	441286	441291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_008340	GA	3	6	441328	441333	50 %	0 %	50 %	0 %	114319556
11007	NC_008340	CCG	2	6	441388	441393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
11008	NC_008340	CGA	2	6	441428	441433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
11009	NC_008340	GCC	2	6	441454	441459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
11010	NC_008340	CAA	2	6	441476	441481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319556
11011	NC_008340	GCC	3	9	441522	441530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
11012	NC_008340	ACG	2	6	441553	441558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
11013	NC_008340	GGA	2	6	441620	441625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319556
11014	NC_008340	CGA	2	6	441647	441652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
11015	NC_008340	GGA	2	6	441653	441658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319556
11016	NC_008340	GGC	2	6	441659	441664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319556
11017	NC_008340	AAGG	2	8	441669	441676	50 %	0 %	50 %	0 %	114319556
11018	NC_008340	ATC	2	6	441684	441689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319556
11019	NC_008340	CAAC	2	8	441725	441732	50 %	0 %	0 %	50 %	114319556
11020	NC_008340	CCGGCA	2	12	441787	441798	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319556
11021	NC_008340	GTG	2	6	441858	441863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319556
11022	NC_008340	CGG	2	6	441874	441879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319556
11023	NC_008340	ACG	2	6	441955	441960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319556
11024	NC_008340	GGGT	2	8	441988	441995	0 %	25 %	75 %	0 %	114319556
11025	NC_008340	G	6	6	442009	442014	0 %	0 %	100 %	0 %	114319556
11026	NC_008340	TCA	2	6	442069	442074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319556
11027	NC_008340	CCG	2	6	442147	442152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319556
11028	NC_008340	TGC	2	6	442225	442230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319556
11029	NC_008340	CTT	2	6	442256	442261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319556
11030	NC_008340	CCGC	2	8	442264	442271	0 %	0 %	25 %	75 %	114319556
11031	NC_008340	GTG	2	6	442275	442280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319556
11032	NC_008340	CCTGGA	2	12	442344	442355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319557
11033	NC_008340	TGG	2	6	442367	442372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
11034	NC_008340	GGC	2	6	442398	442403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
11035	NC_008340	CCG	2	6	442407	442412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319557
11036	NC_008340	GGC	2	6	442431	442436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
11037	NC_008340	G	6	6	442438	442443	0 %	0 %	100 %	0 %	114319557
11038	NC_008340	GTG	2	6	442474	442479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
11039	NC_008340	GCC	2	6	442493	442498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319557
11040	NC_008340	GGT	2	6	442620	442625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
11041	NC_008340	TGG	2	6	442679	442684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319557
11042	NC_008340	CTG	2	6	442702	442707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319557
11043	NC_008340	GGC	2	6	442722	442727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
11044	NC_008340	GGA	2	6	442728	442733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319557
11045	NC_008340	GCG	2	6	442758	442763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319557
11046	NC_008340	GGCC	2	8	442770	442777	0 %	0 %	50 %	50 %	114319557
11047	NC_008340	TGA	2	6	442895	442900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319558
11048	NC_008340	CGA	2	6	442933	442938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11049	NC_008340	ATCGC	2	10	442946	442955	20 %	20 %	20 %	40 %	114319558
11050	NC_008340	CTG	2	6	442993	442998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11051	NC_008340	GATG	2	8	443031	443038	25 %	25 %	50 %	0 %	114319558
11052	NC_008340	TGGCC	2	10	443043	443052	0 %	20 %	40 %	40 %	114319558
11053	NC_008340	GC	3	6	443089	443094	0 %	0 %	50 %	50 %	114319558
11054	NC_008340	CAT	2	6	443097	443102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319558
11055	NC_008340	TGC	2	6	443126	443131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11056	NC_008340	GCC	2	6	443142	443147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319558
11057	NC_008340	TGC	2	6	443156	443161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11058	NC_008340	GGT	2	6	443166	443171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319558
11059	NC_008340	GAT	2	6	443215	443220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319558
11060	NC_008340	TGC	2	6	443249	443254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11061	NC_008340	GGA	2	6	443265	443270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319558
11062	NC_008340	GGA	2	6	443274	443279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319558
11063	NC_008340	GCCC	2	8	443303	443310	0 %	0 %	25 %	75 %	114319558
11064	NC_008340	GTG	2	6	443386	443391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319558
11065	NC_008340	CGG	2	6	443400	443405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319558
11066	NC_008340	CGA	3	9	443460	443468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11067	NC_008340	GGA	2	6	443544	443549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319558
11068	NC_008340	CGG	2	6	443601	443606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319558
11069	NC_008340	TGG	2	6	443609	443614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319558
11070	NC_008340	GTC	2	6	443618	443623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11071	NC_008340	CGA	2	6	443643	443648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319558
11072	NC_008340	GCTGGA	2	12	443652	443663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319558
11073	NC_008340	GCG	2	6	443697	443702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319558
11074	NC_008340	GACG	2	8	443748	443755	25 %	0 %	50 %	25 %	114319558
11075	NC_008340	G	6	6	443777	443782	0 %	0 %	100 %	0 %	114319559
11076	NC_008340	GCC	2	6	443797	443802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
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11078	NC_008340	CTG	2	6	443820	443825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319559
11079	NC_008340	TGG	2	6	443830	443835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
11080	NC_008340	GCC	2	6	443841	443846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
11081	NC_008340	CGC	2	6	443863	443868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
11082	NC_008340	TGG	2	6	443874	443879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
11083	NC_008340	GCT	2	6	443888	443893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319559
11084	NC_008340	GGT	2	6	443900	443905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
11085	NC_008340	CTG	2	6	443913	443918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319559
11086	NC_008340	GCG	2	6	443919	443924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319559
11087	NC_008340	CG	3	6	443937	443942	0 %	0 %	50 %	50 %	114319559
11088	NC_008340	GCC	2	6	443952	443957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
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11090	NC_008340	CGG	2	6	444023	444028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319559
11091	NC_008340	CGC	3	9	444031	444039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
11092	NC_008340	ACC	2	6	444054	444059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319559
11093	NC_008340	GCC	2	6	444060	444065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
11094	NC_008340	CTG	2	6	444096	444101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319559
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11096	NC_008340	GGCCC	2	10	444122	444131	0 %	0 %	40 %	60 %	114319559
11097	NC_008340	GCC	2	6	444138	444143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319559
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11099	NC_008340	GTGG	2	8	444170	444177	0 %	25 %	75 %	0 %	114319559
11100	NC_008340	GCTG	2	8	444196	444203	0 %	25 %	50 %	25 %	114319559
11101	NC_008340	TGGG	2	8	444255	444262	0 %	25 %	75 %	0 %	114319559
11102	NC_008340	CTGG	2	8	444299	444306	0 %	25 %	50 %	25 %	114319559
11103	NC_008340	GCT	2	6	444308	444313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319559
11104	NC_008340	CGG	2	6	444317	444322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319559
11105	NC_008340	GCCG	2	8	444340	444347	0 %	0 %	50 %	50 %	114319559
11106	NC_008340	G	6	6	444364	444369	0 %	0 %	100 %	0 %	114319559
11107	NC_008340	TGG	2	6	444370	444375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
11108	NC_008340	TCGGCG	2	12	444394	444405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319559
11109	NC_008340	CGG	2	6	444436	444441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319559
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11115	NC_008340	TGG	2	6	444727	444732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319559
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11120	NC_008340	ACG	2	6	444988	444993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319559
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11131	NC_008340	GGCC	2	8	445320	445327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11150	NC_008340	CGC	3	9	446013	446021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11218	NC_008340	CTG	3	9	448742	448750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319562
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11230	NC_008340	CTG	2	6	449057	449062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319562
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11233	NC_008340	TGC	3	9	449181	449189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319562
11234	NC_008340	GCCGA	2	10	449210	449219	20 %	0 %	40 %	40 %	114319562
11235	NC_008340	CGA	2	6	449224	449229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319562
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11237	NC_008340	GCG	2	6	449240	449245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319562
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11239	NC_008340	CTG	2	6	449299	449304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319563
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11350	NC_008340	GCC	2	6	453240	453245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11358	NC_008340	GCT	2	6	453517	453522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319568
11359	NC_008340	CGG	2	6	453533	453538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319568
11360	NC_008340	GTT	2	6	453547	453552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319568
11361	NC_008340	GCC	2	6	453576	453581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319568
11362	NC_008340	GCT	2	6	453613	453618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319568
11363	NC_008340	CTG	2	6	453623	453628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319568
11364	NC_008340	GCTG	2	8	453633	453640	0 %	25 %	50 %	25 %	114319568
11365	NC_008340	GAC	2	6	453677	453682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319568
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11367	NC_008340	GGCG	2	8	453718	453725	0 %	0 %	75 %	25 %	114319568
11368	NC_008340	AGG	2	6	453738	453743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319568
11369	NC_008340	GCTG	2	8	453744	453751	0 %	25 %	50 %	25 %	114319568
11370	NC_008340	GC	3	6	453752	453757	0 %	0 %	50 %	50 %	114319568
11371	NC_008340	GCG	2	6	453763	453768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319568
11372	NC_008340	CTT	2	6	453769	453774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319568
11373	NC_008340	ATCT	2	8	453854	453861	25 %	50 %	0 %	25 %	114319569
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11376	NC_008340	TGC	2	6	453978	453983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319569
11377	NC_008340	GC	4	8	454001	454008	0 %	0 %	50 %	50 %	114319569
11378	NC_008340	AGG	2	6	454026	454031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319569
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11380	NC_008340	CGT	2	6	454072	454077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319569
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11385	NC_008340	GGCG	2	8	454294	454301	0 %	0 %	75 %	25 %	114319569
11386	NC_008340	GCCGC	2	10	454317	454326	0 %	0 %	40 %	60 %	114319569
11387	NC_008340	TCG	2	6	454332	454337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319569
11388	NC_008340	GCC	2	6	454388	454393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319569
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11390	NC_008340	CGG	2	6	454540	454545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319570
11391	NC_008340	TGG	2	6	454550	454555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319570
11392	NC_008340	GTG	2	6	454576	454581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319570
11393	NC_008340	TGC	2	6	454586	454591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319570
11394	NC_008340	GGC	2	6	454602	454607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319570
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11396	NC_008340	GGCC	2	8	454699	454706	0 %	0 %	50 %	50 %	114319570
11397	NC_008340	C	7	7	454708	454714	0 %	0 %	0 %	100 %	114319570
11398	NC_008340	CGA	2	6	454722	454727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319570
11399	NC_008340	GCT	2	6	454728	454733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319570
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11402	NC_008340	ACC	2	6	454801	454806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319570
11403	NC_008340	GGA	2	6	454878	454883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319570
11404	NC_008340	CGG	2	6	454886	454891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319570
11405	NC_008340	GC	3	6	454905	454910	0 %	0 %	50 %	50 %	114319570
11406	NC_008340	GCT	2	6	454923	454928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319570
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11424	NC_008340	TCC	2	6	455732	455737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319570
11425	NC_008340	CGC	2	6	455761	455766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319570
11426	NC_008340	TGG	2	6	455768	455773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319570
11427	NC_008340	GGC	2	6	455778	455783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319570
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11429	NC_008340	CTG	2	6	455800	455805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319570
11430	NC_008340	CG	3	6	455929	455934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11431	NC_008340	TGGG	2	8	455947	455954	0 %	25 %	75 %	0 %	114319571
11432	NC_008340	GC	3	6	456030	456035	0 %	0 %	50 %	50 %	114319571
11433	NC_008340	CTG	2	6	456049	456054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319571
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11440	NC_008340	GGT	2	6	456378	456383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319571
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11447	NC_008340	GCT	2	6	456717	456722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319571
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11449	NC_008340	GGC	2	6	456839	456844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319571
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11459	NC_008340	TGG	2	6	457396	457401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319571
11460	NC_008340	GAGGGC	2	12	457405	457416	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114319571
11461	NC_008340	TGGACG	2	12	457427	457438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319571
11462	NC_008340	GCCG	2	8	457489	457496	0 %	0 %	50 %	50 %	114319571
11463	NC_008340	GCC	2	6	457506	457511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
11464	NC_008340	CCGC	2	8	457559	457566	0 %	0 %	25 %	75 %	114319571
11465	NC_008340	GCC	2	6	457587	457592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
11466	NC_008340	GCC	2	6	457594	457599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
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11470	NC_008340	GCCGAG	2	12	457774	457785	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319571
11471	NC_008340	CCGC	2	8	457964	457971	0 %	0 %	25 %	75 %	114319571
11472	NC_008340	ACG	2	6	457979	457984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11473	NC_008340	CAA	2	6	458136	458141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319571
11474	NC_008340	GC	3	6	458197	458202	0 %	0 %	50 %	50 %	114319571
11475	NC_008340	CGA	2	6	458238	458243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11476	NC_008340	G	6	6	458273	458278	0 %	0 %	100 %	0 %	114319571
11477	NC_008340	GC	3	6	458285	458290	0 %	0 %	50 %	50 %	114319571
11478	NC_008340	GGCT	2	8	458317	458324	0 %	25 %	50 %	25 %	114319571
11479	NC_008340	GAC	2	6	458389	458394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11480	NC_008340	TGCGCC	2	12	458396	458407	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319571
11481	NC_008340	AGC	2	6	458410	458415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11482	NC_008340	GGA	2	6	458421	458426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319571
11483	NC_008340	CCG	2	6	458462	458467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
11484	NC_008340	CCG	2	6	458633	458638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
11485	NC_008340	GCTG	2	8	458645	458652	0 %	25 %	50 %	25 %	114319571
11486	NC_008340	CTGG	2	8	458688	458695	0 %	25 %	50 %	25 %	114319571
11487	NC_008340	AGC	2	6	458705	458710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319571
11488	NC_008340	GCC	2	6	458757	458762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
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11490	NC_008340	GCC	2	6	458836	458841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
11491	NC_008340	GGC	2	6	458858	458863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319571
11492	NC_008340	CGC	2	6	458916	458921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571
11493	NC_008340	TGCG	2	8	458930	458937	0 %	25 %	50 %	25 %	114319571
11494	NC_008340	TGGACC	2	12	458957	458968	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319571
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11497	NC_008340	CGGC	2	8	459033	459040	0 %	0 %	50 %	50 %	114319571
11498	NC_008340	ATCG	2	8	459076	459083	25 %	25 %	25 %	25 %	114319571
11499	NC_008340	CACCG	2	10	459214	459223	20 %	0 %	20 %	60 %	114319571
11500	NC_008340	GCC	2	6	459233	459238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319571

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