MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008340	CCG	2	6	419790	419795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319536
10502	NC_008340	TGC	2	6	419871	419876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319536
10503	NC_008340	GGC	2	6	419917	419922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319536
10504	NC_008340	GC	3	6	419947	419952	0 %	0 %	50 %	50 %	114319536
10505	NC_008340	GGA	2	6	420001	420006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319536
10506	NC_008340	GC	3	6	420115	420120	0 %	0 %	50 %	50 %	114319536
10507	NC_008340	CCG	2	6	420142	420147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319537
10508	NC_008340	GGGCC	2	10	420161	420170	0 %	0 %	60 %	40 %	114319537
10509	NC_008340	CGC	2	6	420183	420188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319537
10510	NC_008340	GCA	2	6	420191	420196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319537
10511	NC_008340	GCC	2	6	420197	420202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319537
10512	NC_008340	CCG	2	6	420214	420219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319537
10513	NC_008340	TCG	2	6	420250	420255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319537
10514	NC_008340	GCGG	2	8	420272	420279	0 %	0 %	75 %	25 %	114319537
10515	NC_008340	GCG	2	6	420331	420336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319537
10516	NC_008340	CCA	2	6	420368	420373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319537
10517	NC_008340	CTG	2	6	420402	420407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319537
10518	NC_008340	CGGC	2	8	420409	420416	0 %	0 %	50 %	50 %	114319537
10519	NC_008340	GTG	2	6	420426	420431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319537
10520	NC_008340	GACC	2	8	420440	420447	25 %	0 %	25 %	50 %	114319537
10521	NC_008340	GGCC	2	8	420461	420468	0 %	0 %	50 %	50 %	114319537
10522	NC_008340	GC	3	6	420485	420490	0 %	0 %	50 %	50 %	114319537
10523	NC_008340	GGC	3	9	420530	420538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319537
10524	NC_008340	GGC	2	6	420574	420579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319537
10525	NC_008340	CGG	2	6	420598	420603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319537
10526	NC_008340	GGCG	2	8	420688	420695	0 %	0 %	75 %	25 %	114319537
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10529	NC_008340	GCCGC	2	10	420788	420797	0 %	0 %	40 %	60 %	114319537
10530	NC_008340	GCC	2	6	420885	420890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319537
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10533	NC_008340	TGG	2	6	421012	421017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319537
10534	NC_008340	GGCCG	2	10	421019	421028	0 %	0 %	60 %	40 %	114319537
10535	NC_008340	TGG	2	6	421060	421065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319537
10536	NC_008340	GCT	2	6	421073	421078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319537
10537	NC_008340	CGCGG	2	10	421106	421115	0 %	0 %	60 %	40 %	114319537
10538	NC_008340	GCT	2	6	421118	421123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319537
10539	NC_008340	GCCAGC	2	12	421150	421161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319537
10540	NC_008340	TGG	2	6	421186	421191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319537
10541	NC_008340	GTT	2	6	421247	421252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_008340	CGC	2	6	421344	421349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319538
10543	NC_008340	GTCT	2	8	421405	421412	0 %	50 %	25 %	25 %	114319538
10544	NC_008340	CCG	2	6	421415	421420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319538
10545	NC_008340	CGC	2	6	421443	421448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319538
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10550	NC_008340	CCG	2	6	421607	421612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319538
10551	NC_008340	CGC	2	6	421665	421670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319538
10552	NC_008340	ATC	2	6	421819	421824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319538
10553	NC_008340	CTG	2	6	421843	421848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319538
10554	NC_008340	CGGC	2	8	421850	421857	0 %	0 %	50 %	50 %	114319538
10555	NC_008340	GGT	2	6	421864	421869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319538
10556	NC_008340	CGA	2	6	421950	421955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319539
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10567	NC_008340	CGCA	2	8	422273	422280	25 %	0 %	25 %	50 %	114319539
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10573	NC_008340	GC	3	6	422754	422759	0 %	0 %	50 %	50 %	114319539
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10578	NC_008340	CGA	2	6	422877	422882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319539
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10591	NC_008340	GGCC	2	8	423267	423274	0 %	0 %	50 %	50 %	114319540
10592	NC_008340	CGG	2	6	423312	423317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319540
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10604	NC_008340	GGCG	2	8	423695	423702	0 %	0 %	75 %	25 %	114319541
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10610	NC_008340	GCT	2	6	423860	423865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319541
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10614	NC_008340	CCG	2	6	424105	424110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10615	NC_008340	GAG	2	6	424187	424192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_008340	CGG	2	6	424200	424205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_008340	GTG	2	6	424263	424268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319542
10618	NC_008340	GAC	2	6	424281	424286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319542
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10620	NC_008340	CTG	2	6	424293	424298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319542
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10622	NC_008340	CTG	2	6	424317	424322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319542
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10965	NC_008340	CGG	2	6	439684	439689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319555
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10973	NC_008340	ACGTGG	2	12	440127	440138	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319555
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10982	NC_008340	GGC	2	6	440509	440514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319555
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10985	NC_008340	GGCC	2	8	440608	440615	0 %	0 %	50 %	50 %	114319555
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