MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008340	GCG	2	6	400235	400240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319521
10002	NC_008340	GCT	2	6	400266	400271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10003	NC_008340	GGA	2	6	400338	400343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
10004	NC_008340	CCG	2	6	400351	400356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319521
10005	NC_008340	TGC	2	6	400415	400420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10006	NC_008340	GAG	2	6	400423	400428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
10007	NC_008340	CG	3	6	400461	400466	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10008	NC_008340	CTG	2	6	400510	400515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10009	NC_008340	CGG	2	6	400605	400610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319521
10010	NC_008340	CGGC	2	8	400615	400622	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10011	NC_008340	GC	4	8	400648	400655	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10012	NC_008340	CCGGC	2	10	400709	400718	0 %	0 %	40 %	60 %	114319521
10013	NC_008340	GCC	2	6	400723	400728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319521
10014	NC_008340	GA	3	6	400760	400765	50 %	0 %	50 %	0 %	114319521
10015	NC_008340	GGA	2	6	400917	400922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
10016	NC_008340	CGG	2	6	400926	400931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319521
10017	NC_008340	ACC	2	6	401066	401071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319521
10018	NC_008340	CGC	2	6	401106	401111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319521
10019	NC_008340	TGGCCG	2	12	401114	401125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319521
10020	NC_008340	GGC	3	9	401127	401135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319521
10021	NC_008340	CGG	2	6	401196	401201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319521
10022	NC_008340	CGG	2	6	401234	401239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319521
10023	NC_008340	CGG	3	9	401270	401278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319521
10024	NC_008340	GAG	2	6	401293	401298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
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10026	NC_008340	GCA	2	6	401332	401337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319521
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10028	NC_008340	GCA	2	6	401347	401352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319521
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10032	NC_008340	GGCC	2	8	401499	401506	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10033	NC_008340	CGA	2	6	401544	401549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10034	NC_008340	ACG	2	6	401552	401557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10035	NC_008340	TGG	2	6	401561	401566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319521
10036	NC_008340	GC	3	6	401574	401579	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10037	NC_008340	CGGC	2	8	401601	401608	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10038	NC_008340	GGCG	2	8	401610	401617	0 %	0 %	75 %	25 %	114319521
10039	NC_008340	CCT	2	6	401655	401660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319521
10040	NC_008340	CGGC	2	8	401672	401679	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10041	NC_008340	GTG	2	6	401710	401715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319521
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10043	NC_008340	CGGGA	2	10	401758	401767	20 %	0 %	60 %	20 %	114319521
10044	NC_008340	GCC	2	6	401772	401777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319521
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10051	NC_008340	CGA	2	6	401949	401954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10052	NC_008340	AGC	2	6	401982	401987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10053	NC_008340	GCT	2	6	402018	402023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10054	NC_008340	TCG	2	6	402074	402079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10055	NC_008340	TGG	2	6	402143	402148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319521
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10057	NC_008340	CCG	2	6	402161	402166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319521
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10059	NC_008340	CGCC	2	8	402210	402217	0 %	0 %	25 %	75 %	114319521
10060	NC_008340	CTG	2	6	402283	402288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319521
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10072	NC_008340	GAG	2	6	402751	402756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
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10090	NC_008340	GAG	2	6	403423	403428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
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10105	NC_008340	AGG	2	6	404168	404173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
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10109	NC_008340	GGCC	2	8	404279	404286	0 %	0 %	50 %	50 %	114319521
10110	NC_008340	G	6	6	404287	404292	0 %	0 %	100 %	0 %	114319521
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10116	NC_008340	CCGC	2	8	404648	404655	0 %	0 %	25 %	75 %	114319521
10117	NC_008340	AGC	2	6	404684	404689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10118	NC_008340	CCG	3	9	404826	404834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319521
10119	NC_008340	TGG	2	6	404912	404917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319521
10120	NC_008340	CGT	2	6	404923	404928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319521
10121	NC_008340	GAG	3	9	404938	404946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319521
10122	NC_008340	GCG	3	9	404988	404996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319522
10123	NC_008340	GGC	2	6	405011	405016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319522
10124	NC_008340	CAGAC	2	10	405052	405061	40 %	0 %	20 %	40 %	114319522
10125	NC_008340	GCT	3	9	405065	405073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319522
10126	NC_008340	GGT	2	6	405083	405088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319522
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10129	NC_008340	GGCG	2	8	405166	405173	0 %	0 %	75 %	25 %	114319522
10130	NC_008340	GCC	2	6	405219	405224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319522
10131	NC_008340	GGCC	2	8	405235	405242	0 %	0 %	50 %	50 %	114319522
10132	NC_008340	TCG	2	6	405250	405255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319522
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10135	NC_008340	GCCGG	2	10	405389	405398	0 %	0 %	60 %	40 %	114319522
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10147	NC_008340	C	7	7	405796	405802	0 %	0 %	0 %	100 %	114319523
10148	NC_008340	GGGGC	2	10	405830	405839	0 %	0 %	80 %	20 %	114319523
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10151	NC_008340	GCGCC	2	10	405926	405935	0 %	0 %	40 %	60 %	114319523
10152	NC_008340	CGC	2	6	406027	406032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319523
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10156	NC_008340	CGC	2	6	406116	406121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319523
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10197	NC_008340	CGGGG	2	10	407997	408006	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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10226	NC_008340	GC	4	8	409141	409148	0 %	0 %	50 %	50 %	114319525
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10230	NC_008340	GCACCA	2	12	409329	409340	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114319525
10231	NC_008340	AGC	2	6	409361	409366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319525
10232	NC_008340	GAT	2	6	409378	409383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319525
10233	NC_008340	GCGCC	2	10	409407	409416	0 %	0 %	40 %	60 %	114319525
10234	NC_008340	CCA	2	6	409425	409430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319525
10235	NC_008340	GC	3	6	409464	409469	0 %	0 %	50 %	50 %	114319525
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10237	NC_008340	CAC	3	9	409649	409657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319526
10238	NC_008340	GC	3	6	409740	409745	0 %	0 %	50 %	50 %	114319526
10239	NC_008340	CCG	2	6	409753	409758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319526
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10241	NC_008340	GCC	2	6	409833	409838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319526
10242	NC_008340	GCA	2	6	409852	409857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319526
10243	NC_008340	CTC	2	6	409868	409873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319526
10244	NC_008340	GCGG	2	8	409891	409898	0 %	0 %	75 %	25 %	114319526
10245	NC_008340	CGC	2	6	409921	409926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319526
10246	NC_008340	TGG	2	6	409972	409977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319526
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10261	NC_008340	GGC	2	6	410315	410320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319526
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10270	NC_008340	GCT	2	6	410706	410711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10295	NC_008340	GCT	2	6	411540	411545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10331	NC_008340	GACC	2	8	413034	413041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10332	NC_008340	CCGG	2	8	413104	413111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10333	NC_008340	CAGCG	2	10	413117	413126	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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10348	NC_008340	GC	3	6	413485	413490	0 %	0 %	50 %	50 %	114319529
10349	NC_008340	GAA	2	6	413497	413502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319529
10350	NC_008340	CCG	2	6	413537	413542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319529
10351	NC_008340	CGA	2	6	413557	413562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319529
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10354	NC_008340	CAC	2	6	413617	413622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319529
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10362	NC_008340	CCT	2	6	413754	413759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319529
10363	NC_008340	TCG	2	6	413768	413773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319529
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10469	NC_008340	G	6	6	418155	418160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10472	NC_008340	CGTC	2	8	418334	418341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10473	NC_008340	GTGCA	2	10	418372	418381	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10474	NC_008340	AGG	2	6	418467	418472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319535
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10480	NC_008340	GAT	2	6	418897	418902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319535
10481	NC_008340	CGG	2	6	418906	418911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319535
10482	NC_008340	GTG	2	6	418931	418936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319535
10483	NC_008340	CTG	2	6	418982	418987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319535
10484	NC_008340	CGC	2	6	419017	419022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319535
10485	NC_008340	CAC	5	15	419059	419073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319535
10486	NC_008340	CG	3	6	419094	419099	0 %	0 %	50 %	50 %	114319535
10487	NC_008340	GGGC	2	8	419173	419180	0 %	0 %	75 %	25 %	114319535
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10490	NC_008340	GGC	2	6	419324	419329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319535
10491	NC_008340	TGG	2	6	419358	419363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319535
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