MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_008340	TCCA	2	8	359286	359293	25 %	25 %	0 %	50 %	114319479
9003	NC_008340	CGG	2	6	359331	359336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319479
9004	NC_008340	G	7	7	359373	359379	0 %	0 %	100 %	0 %	114319479
9005	NC_008340	GGA	2	6	359413	359418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319479
9006	NC_008340	CCT	2	6	359479	359484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9007	NC_008340	CGG	2	6	359486	359491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_008340	CCG	2	6	359513	359518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9009	NC_008340	TCG	2	6	359567	359572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_008340	TTG	2	6	359622	359627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319480
9011	NC_008340	GCA	2	6	359674	359679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9012	NC_008340	TGG	2	6	359688	359693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319480
9013	NC_008340	GTG	2	6	359707	359712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319480
9014	NC_008340	CTG	2	6	359738	359743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9015	NC_008340	GGA	2	6	359755	359760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319480
9016	NC_008340	CGA	2	6	359797	359802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9017	NC_008340	GCA	2	6	359803	359808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9018	NC_008340	CGC	2	6	359815	359820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319480
9019	NC_008340	AGC	2	6	359928	359933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9020	NC_008340	CCG	2	6	359942	359947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319480
9021	NC_008340	GC	3	6	359969	359974	0 %	0 %	50 %	50 %	114319480
9022	NC_008340	GCC	2	6	359984	359989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319480
9023	NC_008340	GCC	2	6	360002	360007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319480
9024	NC_008340	CTG	2	6	360014	360019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9025	NC_008340	GAC	2	6	360044	360049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9026	NC_008340	TCG	2	6	360117	360122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9027	NC_008340	CGG	2	6	360176	360181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319480
9028	NC_008340	GCC	2	6	360227	360232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319480
9029	NC_008340	CG	3	6	360249	360254	0 %	0 %	50 %	50 %	114319480
9030	NC_008340	ACG	2	6	360306	360311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319480
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9032	NC_008340	CGA	2	6	360412	360417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319480
9033	NC_008340	GTT	2	6	360445	360450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319480
9034	NC_008340	CCGG	2	8	360514	360521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_008340	TGT	2	6	360538	360543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_008340	CG	3	6	360561	360566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9037	NC_008340	GCCG	2	8	360567	360574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_008340	CAGCGC	2	12	360726	360737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319481
9039	NC_008340	G	6	6	360748	360753	0 %	0 %	100 %	0 %	114319481
9040	NC_008340	GAG	2	6	360843	360848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319481
9041	NC_008340	TGC	2	6	361015	361020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319481
9042	NC_008340	TGA	2	6	361024	361029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319481
9043	NC_008340	GAG	2	6	361086	361091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319481
9044	NC_008340	CTG	3	9	361104	361112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319481
9045	NC_008340	GCTG	2	8	361252	361259	0 %	25 %	50 %	25 %	114319481
9046	NC_008340	GCGG	2	8	361379	361386	0 %	0 %	75 %	25 %	114319481
9047	NC_008340	CAG	2	6	361437	361442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_008340	GACTT	2	10	361461	361470	20 %	40 %	20 %	20 %	114319482
9049	NC_008340	TGCGC	2	10	361474	361483	0 %	20 %	40 %	40 %	114319482
9050	NC_008340	GGT	2	6	361485	361490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319482
9051	NC_008340	CTT	2	6	361496	361501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319482
9052	NC_008340	GC	3	6	361535	361540	0 %	0 %	50 %	50 %	114319482
9053	NC_008340	TGT	2	6	361546	361551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319482
9054	NC_008340	CGG	2	6	361581	361586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319482
9055	NC_008340	TCC	2	6	361701	361706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319482
9056	NC_008340	GTC	2	6	361748	361753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319482
9057	NC_008340	CCG	2	6	361768	361773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319482
9058	NC_008340	GGCC	2	8	361783	361790	0 %	0 %	50 %	50 %	114319482
9059	NC_008340	CGG	2	6	361813	361818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319482
9060	NC_008340	ATC	2	6	361821	361826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319482
9061	NC_008340	GGTC	2	8	361852	361859	0 %	25 %	50 %	25 %	114319482
9062	NC_008340	ATG	2	6	361896	361901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319482
9063	NC_008340	CCT	2	6	361915	361920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9064	NC_008340	CGA	2	6	362042	362047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_008340	GTG	2	6	362089	362094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319483
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9067	NC_008340	TGC	2	6	362105	362110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319483
9068	NC_008340	TGG	3	9	362111	362119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319483
9069	NC_008340	GGCA	2	8	362159	362166	25 %	0 %	50 %	25 %	114319483
9070	NC_008340	CCG	2	6	362192	362197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319483
9071	NC_008340	GCC	2	6	362286	362291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319483
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9073	NC_008340	CA	3	6	362333	362338	50 %	0 %	0 %	50 %	114319483
9074	NC_008340	GCCC	2	8	362339	362346	0 %	0 %	25 %	75 %	114319483
9075	NC_008340	CGG	2	6	362387	362392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319483
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9080	NC_008340	GGC	2	6	362531	362536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319483
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9090	NC_008340	TGG	2	6	362825	362830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319483
9091	NC_008340	CCCGG	2	10	362859	362868	0 %	0 %	40 %	60 %	114319483
9092	NC_008340	GC	4	8	362883	362890	0 %	0 %	50 %	50 %	114319483
9093	NC_008340	GAGC	2	8	362919	362926	25 %	0 %	50 %	25 %	114319484
9094	NC_008340	TGG	2	6	362939	362944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319484
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9096	NC_008340	GCCTG	2	10	362987	362996	0 %	20 %	40 %	40 %	114319484
9097	NC_008340	CCGG	2	8	363006	363013	0 %	0 %	50 %	50 %	114319484
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9112	NC_008340	CAT	3	9	363621	363629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319484
9113	NC_008340	GGA	2	6	363660	363665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319484
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9117	NC_008340	CAG	2	6	363738	363743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319484
9118	NC_008340	GGGCG	2	10	363789	363798	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9119	NC_008340	TCGC	2	8	363805	363812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9120	NC_008340	GGGC	2	8	363828	363835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9121	NC_008340	TTG	2	6	363848	363853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_008340	CCCCA	2	10	363861	363870	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
9123	NC_008340	AGG	2	6	363888	363893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9234	NC_008340	GGA	2	6	369370	369375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9239	NC_008340	CCT	2	6	369732	369737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9243	NC_008340	CGA	2	6	369977	369982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9244	NC_008340	GTC	2	6	370110	370115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9377	NC_008340	ACC	2	6	377372	377377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319494
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9484	NC_008340	G	6	6	381207	381212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9485	NC_008340	CA	3	6	381422	381427	50 %	0 %	0 %	50 %	114319499
9486	NC_008340	GCA	2	6	381590	381595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319499
9487	NC_008340	AGC	2	6	381604	381609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319499
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9489	NC_008340	CAGG	2	8	381729	381736	25 %	0 %	50 %	25 %	114319499
9490	NC_008340	CGA	2	6	381737	381742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319499
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9492	NC_008340	CAG	2	6	381804	381809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319499
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9495	NC_008340	CTGG	2	8	381986	381993	0 %	25 %	50 %	25 %	114319500
9496	NC_008340	TCC	2	6	382029	382034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319500
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9498	NC_008340	GCT	2	6	382082	382087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319500
9499	NC_008340	GC	3	6	382106	382111	0 %	0 %	50 %	50 %	114319500
9500	NC_008340	GCC	2	6	382128	382133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319500

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