MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008340	GTG	2	6	322457	322462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319442
8002	NC_008340	GCT	2	6	322468	322473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
8003	NC_008340	TGC	2	6	322506	322511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
8004	NC_008340	CTG	2	6	322520	322525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319442
8005	NC_008340	GC	3	6	322546	322551	0 %	0 %	50 %	50 %	114319442
8006	NC_008340	GGA	2	6	322555	322560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
8007	NC_008340	AGG	2	6	322734	322739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
8008	NC_008340	GAG	2	6	322748	322753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
8009	NC_008340	CTGGCG	2	12	322805	322816	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319442
8010	NC_008340	GAC	2	6	322829	322834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
8011	NC_008340	GGC	2	6	322864	322869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319442
8012	NC_008340	CGG	2	6	322887	322892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319442
8013	NC_008340	AGG	2	6	322914	322919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
8014	NC_008340	TGT	2	6	322926	322931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319442
8015	NC_008340	GGGCC	2	10	322939	322948	0 %	0 %	60 %	40 %	114319442
8016	NC_008340	GC	3	6	323071	323076	0 %	0 %	50 %	50 %	114319442
8017	NC_008340	GAC	2	6	323096	323101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319442
8018	NC_008340	GGA	2	6	323155	323160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
8019	NC_008340	GCC	2	6	323349	323354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
8020	NC_008340	GAG	2	6	323357	323362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319442
8021	NC_008340	GC	4	8	323363	323370	0 %	0 %	50 %	50 %	114319442
8022	NC_008340	GCC	2	6	323381	323386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319442
8023	NC_008340	ACC	2	6	323403	323408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319442
8024	NC_008340	GGC	2	6	323475	323480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319443
8025	NC_008340	GAC	2	6	323521	323526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319443
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8027	NC_008340	GCC	2	6	323596	323601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319443
8028	NC_008340	GA	3	6	323654	323659	50 %	0 %	50 %	0 %	114319443
8029	NC_008340	GC	3	6	323676	323681	0 %	0 %	50 %	50 %	114319443
8030	NC_008340	C	6	6	323681	323686	0 %	0 %	0 %	100 %	114319443
8031	NC_008340	GC	3	6	323699	323704	0 %	0 %	50 %	50 %	114319443
8032	NC_008340	GGGC	2	8	323712	323719	0 %	0 %	75 %	25 %	114319443
8033	NC_008340	ACC	2	6	323737	323742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319443
8034	NC_008340	TGG	2	6	323783	323788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319443
8035	NC_008340	CCGG	2	8	323887	323894	0 %	0 %	50 %	50 %	114319443
8036	NC_008340	GGT	2	6	323928	323933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319443
8037	NC_008340	CGG	2	6	323974	323979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319443
8038	NC_008340	GTG	2	6	324013	324018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319443
8039	NC_008340	GGCC	2	8	324061	324068	0 %	0 %	50 %	50 %	114319444
8040	NC_008340	GCC	3	9	324103	324111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
8041	NC_008340	ATC	2	6	324121	324126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319444
8042	NC_008340	GCG	2	6	324200	324205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319444
8043	NC_008340	GCC	2	6	324227	324232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
8044	NC_008340	CGTG	2	8	324248	324255	0 %	25 %	50 %	25 %	114319444
8045	NC_008340	CCGC	2	8	324256	324263	0 %	0 %	25 %	75 %	114319444
8046	NC_008340	CTG	2	6	324264	324269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319444
8047	NC_008340	ACC	2	6	324276	324281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319444
8048	NC_008340	GGC	3	9	324330	324338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319444
8049	NC_008340	GCG	2	6	324343	324348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319444
8050	NC_008340	CGC	2	6	324359	324364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
8051	NC_008340	TGC	2	6	324370	324375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319444
8052	NC_008340	GCTG	2	8	324419	324426	0 %	25 %	50 %	25 %	114319444
8053	NC_008340	TGG	2	6	324541	324546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319444
8054	NC_008340	CCG	2	6	324571	324576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
8055	NC_008340	CGC	2	6	324584	324589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319444
8056	NC_008340	GC	3	6	324610	324615	0 %	0 %	50 %	50 %	114319444
8057	NC_008340	GTGC	2	8	324672	324679	0 %	25 %	50 %	25 %	114319444
8058	NC_008340	GCCG	2	8	324812	324819	0 %	0 %	50 %	50 %	114319444
8059	NC_008340	CTC	2	6	324854	324859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319444
8060	NC_008340	CTTG	2	8	324860	324867	0 %	50 %	25 %	25 %	114319444
8061	NC_008340	GTG	2	6	324877	324882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319444
8062	NC_008340	CAA	2	6	324938	324943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_008340	AGC	2	6	325034	325039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_008340	ACCGCA	2	12	325052	325063	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_008340	ATG	2	6	325097	325102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319445
8066	NC_008340	GGTC	2	8	325180	325187	0 %	25 %	50 %	25 %	114319445
8067	NC_008340	TGG	2	6	325209	325214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
8068	NC_008340	GTCCA	2	10	325253	325262	20 %	20 %	20 %	40 %	114319445
8069	NC_008340	TCA	2	6	325302	325307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319445
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8071	NC_008340	GCC	2	6	325331	325336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319445
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8073	NC_008340	TGG	2	6	325422	325427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
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8075	NC_008340	TGC	2	6	325539	325544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319445
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8078	NC_008340	GC	3	6	325612	325617	0 %	0 %	50 %	50 %	114319445
8079	NC_008340	GAC	2	6	325640	325645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319445
8080	NC_008340	GCCG	2	8	325671	325678	0 %	0 %	50 %	50 %	114319445
8081	NC_008340	CAT	2	6	325705	325710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319445
8082	NC_008340	CAT	2	6	325735	325740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319445
8083	NC_008340	CGA	2	6	325744	325749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319445
8084	NC_008340	TGG	2	6	325752	325757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
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8086	NC_008340	GGC	2	6	325780	325785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319445
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8088	NC_008340	ACCC	2	8	325832	325839	25 %	0 %	0 %	75 %	114319445
8089	NC_008340	TGG	2	6	325893	325898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319445
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8091	NC_008340	GCG	2	6	325987	325992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319445
8092	NC_008340	CCG	2	6	326061	326066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_008340	GGC	2	6	326067	326072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_008340	GCC	2	6	326085	326090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8095	NC_008340	TGAAA	2	10	326146	326155	60 %	20 %	20 %	0 %	114319446
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8105	NC_008340	GCCT	3	12	326543	326554	0 %	25 %	25 %	50 %	114319446
8106	NC_008340	GCCG	2	8	326635	326642	0 %	0 %	50 %	50 %	114319446
8107	NC_008340	GACCAC	2	12	326675	326686	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114319446
8108	NC_008340	GGT	2	6	326689	326694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319446
8109	NC_008340	CAAGGC	2	12	326713	326724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319446
8110	NC_008340	CGA	2	6	326725	326730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319446
8111	NC_008340	GGC	2	6	326737	326742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319446
8112	NC_008340	GAG	2	6	326759	326764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319446
8113	NC_008340	CGC	2	6	326786	326791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_008340	TGAC	2	8	326813	326820	25 %	25 %	25 %	25 %	114319447
8115	NC_008340	TCG	2	6	326843	326848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319447
8116	NC_008340	GCC	2	6	326924	326929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319447
8117	NC_008340	CGG	2	6	326931	326936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319447
8118	NC_008340	TTC	2	6	327067	327072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319447
8119	NC_008340	TGG	2	6	327095	327100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319447
8120	NC_008340	ACG	2	6	327104	327109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319447
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8122	NC_008340	AGGTC	2	10	327126	327135	20 %	20 %	40 %	20 %	114319447
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8251	NC_008340	GAG	2	6	332167	332172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319452
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8368	NC_008340	TACC	2	8	336782	336789	25 %	25 %	0 %	50 %	114319455
8369	NC_008340	GTG	4	12	336840	336851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319455
8370	NC_008340	AGG	4	12	336853	336864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319455
8371	NC_008340	CCTGG	2	10	336869	336878	0 %	20 %	40 %	40 %	114319455
8372	NC_008340	CGG	2	6	336902	336907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319455
8373	NC_008340	AGC	2	6	336910	336915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319455
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8377	NC_008340	ACC	2	6	337113	337118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319456
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8380	NC_008340	GCCATG	2	12	337182	337193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319456
8381	NC_008340	TGG	2	6	337231	337236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319456
8382	NC_008340	ACC	2	6	337260	337265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319456
8383	NC_008340	TGA	2	6	337279	337284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319456
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8393	NC_008340	TGC	2	6	337702	337707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319456
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8397	NC_008340	TCT	2	6	337780	337785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319456
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8399	NC_008340	CAT	2	6	337811	337816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319456
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8423	NC_008340	CGG	2	6	338669	338674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8424	NC_008340	CGC	2	6	338690	338695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8425	NC_008340	GGC	2	6	338722	338727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8426	NC_008340	CGTG	2	8	338771	338778	0 %	25 %	50 %	25 %	114319457
8427	NC_008340	TGG	2	6	338815	338820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319457
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8435	NC_008340	GGGC	2	8	339100	339107	0 %	0 %	75 %	25 %	114319457
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8440	NC_008340	G	6	6	339355	339360	0 %	0 %	100 %	0 %	114319458
8441	NC_008340	CA	3	6	339371	339376	50 %	0 %	0 %	50 %	114319458
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8445	NC_008340	GGGC	2	8	339449	339456	0 %	0 %	75 %	25 %	114319458
8446	NC_008340	TCA	3	9	339488	339496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319458
8447	NC_008340	TGA	3	9	339500	339508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319458
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8450	NC_008340	CCAG	2	8	339698	339705	25 %	0 %	25 %	50 %	114319458
8451	NC_008340	GGT	2	6	339720	339725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319458
8452	NC_008340	CCG	2	6	339740	339745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319458
8453	NC_008340	CTGGAC	2	12	339757	339768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319458
8454	NC_008340	TCC	2	6	339815	339820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319458
8455	NC_008340	GCG	2	6	339827	339832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319458
8456	NC_008340	CAC	2	6	339850	339855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319458
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8460	NC_008340	TGG	2	6	339896	339901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319458
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8464	NC_008340	GCT	3	9	340167	340175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319458
8465	NC_008340	CGG	2	6	340201	340206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8466	NC_008340	GTGACG	2	12	340211	340222	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8467	NC_008340	CAC	2	6	340255	340260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319459
8468	NC_008340	CCA	2	6	340278	340283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319459
8469	NC_008340	ACC	3	9	340298	340306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319459
8470	NC_008340	GC	3	6	340331	340336	0 %	0 %	50 %	50 %	114319459
8471	NC_008340	CGC	2	6	340343	340348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319459
8472	NC_008340	CGG	2	6	340377	340382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319459
8473	NC_008340	GAT	2	6	340399	340404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319459
8474	NC_008340	GAC	2	6	340420	340425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319459
8475	NC_008340	ATG	2	6	340451	340456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319459
8476	NC_008340	CTG	4	12	340591	340602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319460
8477	NC_008340	GGT	2	6	340695	340700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319460
8478	NC_008340	AGC	2	6	340715	340720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319460
8479	NC_008340	CCA	2	6	340740	340745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319460
8480	NC_008340	GGCCA	2	10	340750	340759	20 %	0 %	40 %	40 %	114319460
8481	NC_008340	GGT	2	6	340770	340775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319460
8482	NC_008340	TGG	2	6	340790	340795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319460
8483	NC_008340	TGC	2	6	340832	340837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319460
8484	NC_008340	TGG	2	6	340874	340879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319460
8485	NC_008340	GGC	2	6	340896	340901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319460
8486	NC_008340	CCT	2	6	340937	340942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319460
8487	NC_008340	TGG	2	6	340952	340957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319460
8488	NC_008340	GAG	2	6	341011	341016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319460
8489	NC_008340	CGCT	2	8	341019	341026	0 %	25 %	25 %	50 %	114319460
8490	NC_008340	CCG	2	6	341031	341036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319460
8491	NC_008340	GGT	2	6	341085	341090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319460
8492	NC_008340	CGG	2	6	341123	341128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319460
8493	NC_008340	TGC	2	6	341156	341161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319460
8494	NC_008340	TGG	2	6	341216	341221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319460
8495	NC_008340	CTGG	2	8	341226	341233	0 %	25 %	50 %	25 %	114319460
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