MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78503	NC_008340	CTG	2	6	3171053	3171058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321935
78504	NC_008340	TCG	2	6	3171063	3171068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321935
78505	NC_008340	CGG	2	6	3171134	3171139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321935
78506	NC_008340	GCT	2	6	3171154	3171159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321935
78507	NC_008340	GATG	2	8	3171260	3171267	25 %	25 %	50 %	0 %	114321935
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78510	NC_008340	CGT	2	6	3171331	3171336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321935
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78514	NC_008340	CCT	2	6	3171652	3171657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321935
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78518	NC_008340	T	8	8	3171832	3171839	0 %	100 %	0 %	0 %	114321935
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78521	NC_008340	TGC	2	6	3171931	3171936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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78523	NC_008340	GCCC	2	8	3171990	3171997	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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78527	NC_008340	TGG	2	6	3172049	3172054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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78591	NC_008340	GC	3	6	3174502	3174507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78592	NC_008340	GC	3	6	3174532	3174537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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78969	NC_008340	GGC	2	6	3190511	3190516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321953
78970	NC_008340	GAC	2	6	3190545	3190550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321953
78971	NC_008340	CGC	2	6	3190634	3190639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321953
78972	NC_008340	CGC	2	6	3190641	3190646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321953
78973	NC_008340	CGG	2	6	3190670	3190675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321953
78974	NC_008340	CGC	2	6	3190712	3190717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321953
78975	NC_008340	GCAG	2	8	3190718	3190725	25 %	0 %	50 %	25 %	114321953
78976	NC_008340	TGG	2	6	3190744	3190749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321953
78977	NC_008340	CGG	2	6	3190795	3190800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321953
78978	NC_008340	CCGGC	2	10	3190816	3190825	0 %	0 %	40 %	60 %	114321953
78979	NC_008340	GTG	2	6	3190913	3190918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321953
78980	NC_008340	GGA	2	6	3191027	3191032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321953
78981	NC_008340	GCC	2	6	3191061	3191066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321953
78982	NC_008340	CG	3	6	3191074	3191079	0 %	0 %	50 %	50 %	114321953
78983	NC_008340	CCG	2	6	3191085	3191090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321953
78984	NC_008340	GGGC	2	8	3191100	3191107	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78985	NC_008340	CAG	2	6	3191140	3191145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321954
78986	NC_008340	GTCG	2	8	3191242	3191249	0 %	25 %	50 %	25 %	114321954
78987	NC_008340	CCGG	2	8	3191256	3191263	0 %	0 %	50 %	50 %	114321954
78988	NC_008340	GAT	2	6	3191284	3191289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321954
78989	NC_008340	CGT	2	6	3191355	3191360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321954
78990	NC_008340	GCG	2	6	3191365	3191370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321954
78991	NC_008340	CCGC	2	8	3191385	3191392	0 %	0 %	25 %	75 %	114321954
78992	NC_008340	GCCC	2	8	3191415	3191422	0 %	0 %	25 %	75 %	114321954
78993	NC_008340	CAC	2	6	3191497	3191502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321954
78994	NC_008340	GGCG	2	8	3191547	3191554	0 %	0 %	75 %	25 %	114321954
78995	NC_008340	CCCGC	2	10	3191635	3191644	0 %	0 %	20 %	80 %	114321954
78996	NC_008340	AGT	2	6	3191646	3191651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321954
78997	NC_008340	GCA	2	6	3191655	3191660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321954
78998	NC_008340	GCG	2	6	3191667	3191672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321954
78999	NC_008340	CG	3	6	3191679	3191684	0 %	0 %	50 %	50 %	114321954
79000	NC_008340	TCC	2	6	3191701	3191706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321954

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