MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_008340	GCT	2	6	3151537	3151542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321921
78002	NC_008340	GCC	2	6	3151557	3151562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321921
78003	NC_008340	GTG	2	6	3151592	3151597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321921
78004	NC_008340	CCA	2	6	3151615	3151620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321921
78005	NC_008340	GGT	2	6	3151651	3151656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321921
78006	NC_008340	GGT	2	6	3151679	3151684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321921
78007	NC_008340	GCA	2	6	3151702	3151707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321921
78008	NC_008340	CTG	2	6	3151760	3151765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321921
78009	NC_008340	AGCG	2	8	3151827	3151834	25 %	0 %	50 %	25 %	114321921
78010	NC_008340	GGTA	2	8	3151852	3151859	25 %	25 %	50 %	0 %	114321921
78011	NC_008340	TGC	2	6	3151983	3151988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321921
78012	NC_008340	CGG	2	6	3152015	3152020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321921
78013	NC_008340	GGC	2	6	3152177	3152182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321921
78014	NC_008340	GCC	2	6	3152197	3152202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321921
78015	NC_008340	CGT	2	6	3152206	3152211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321921
78016	NC_008340	CGT	2	6	3152233	3152238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321921
78017	NC_008340	GCC	3	9	3152244	3152252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321921
78018	NC_008340	GCGCC	2	10	3152266	3152275	0 %	0 %	40 %	60 %	114321921
78019	NC_008340	GGC	2	6	3152279	3152284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321921
78020	NC_008340	CCA	2	6	3152338	3152343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321921
78021	NC_008340	GC	3	6	3152500	3152505	0 %	0 %	50 %	50 %	114321921
78022	NC_008340	CCA	2	6	3152506	3152511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321921
78023	NC_008340	GCGCC	2	10	3152537	3152546	0 %	0 %	40 %	60 %	114321921
78024	NC_008340	GC	4	8	3152547	3152554	0 %	0 %	50 %	50 %	114321921
78025	NC_008340	CAT	2	6	3152558	3152563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321921
78026	NC_008340	CA	3	6	3152656	3152661	50 %	0 %	0 %	50 %	114321921
78027	NC_008340	GGC	2	6	3152662	3152667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321921
78028	NC_008340	GCG	2	6	3152708	3152713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321921
78029	NC_008340	GGCG	2	8	3152748	3152755	0 %	0 %	75 %	25 %	114321921
78030	NC_008340	CGT	2	6	3152792	3152797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78031	NC_008340	CTA	2	6	3152807	3152812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78032	NC_008340	ATC	2	6	3152869	3152874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321922
78033	NC_008340	AGC	2	6	3152909	3152914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321922
78034	NC_008340	GCC	2	6	3152936	3152941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321922
78035	NC_008340	GGT	3	9	3152943	3152951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321922
78036	NC_008340	GCG	2	6	3152954	3152959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321922
78037	NC_008340	GTG	2	6	3152977	3152982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321922
78038	NC_008340	GCC	3	9	3152983	3152991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321922
78039	NC_008340	CGC	2	6	3153004	3153009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321922
78040	NC_008340	GCC	2	6	3153043	3153048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321922
78041	NC_008340	TGG	2	6	3153146	3153151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321922
78042	NC_008340	CGG	2	6	3153199	3153204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321922
78043	NC_008340	GGC	2	6	3153205	3153210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321922
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78047	NC_008340	GGC	2	6	3153378	3153383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321922
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78049	NC_008340	CTG	2	6	3153481	3153486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321922
78050	NC_008340	GC	3	6	3153495	3153500	0 %	0 %	50 %	50 %	114321922
78051	NC_008340	CCG	2	6	3153567	3153572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321922
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78053	NC_008340	CAA	2	6	3153618	3153623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321922
78054	NC_008340	CGG	2	6	3153626	3153631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321922
78055	NC_008340	GCC	2	6	3153670	3153675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321922
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78058	NC_008340	CCGG	2	8	3153837	3153844	0 %	0 %	50 %	50 %	114321922
78059	NC_008340	GCT	2	6	3153849	3153854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321922
78060	NC_008340	GGCC	2	8	3153922	3153929	0 %	0 %	50 %	50 %	114321923
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78062	NC_008340	C	6	6	3153995	3154000	0 %	0 %	0 %	100 %	114321923
78063	NC_008340	ACC	2	6	3154001	3154006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321923
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78067	NC_008340	GCT	2	6	3154165	3154170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321923
78068	NC_008340	GCT	2	6	3154191	3154196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321923
78069	NC_008340	GCG	2	6	3154308	3154313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78070	NC_008340	AGCGA	2	10	3154384	3154393	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78071	NC_008340	CG	3	6	3154399	3154404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78072	NC_008340	CGC	2	6	3154469	3154474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78073	NC_008340	GGT	2	6	3154631	3154636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321924
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78076	NC_008340	ACC	2	6	3154731	3154736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321924
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78082	NC_008340	AGG	2	6	3154894	3154899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321924
78083	NC_008340	GGA	2	6	3154916	3154921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321924
78084	NC_008340	CAT	2	6	3154934	3154939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321924
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78088	NC_008340	TGG	2	6	3154996	3155001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321924
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78091	NC_008340	GCCG	2	8	3155163	3155170	0 %	0 %	50 %	50 %	114321924
78092	NC_008340	C	6	6	3155182	3155187	0 %	0 %	0 %	100 %	114321924
78093	NC_008340	CG	3	6	3155235	3155240	0 %	0 %	50 %	50 %	114321924
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78099	NC_008340	CAT	2	6	3155339	3155344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321924
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78101	NC_008340	GAG	2	6	3155400	3155405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321924
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78105	NC_008340	CCG	2	6	3155652	3155657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321925
78106	NC_008340	GCG	2	6	3155676	3155681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321925
78107	NC_008340	GCCCT	2	10	3155705	3155714	0 %	20 %	20 %	60 %	114321925
78108	NC_008340	GGA	2	6	3155731	3155736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321925
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78114	NC_008340	GCCG	2	8	3155889	3155896	0 %	0 %	50 %	50 %	114321925
78115	NC_008340	TGG	2	6	3155916	3155921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321925
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78236	NC_008340	GCT	2	6	3160618	3160623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321926
78237	NC_008340	GAG	2	6	3160649	3160654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321926
78238	NC_008340	GC	3	6	3160706	3160711	0 %	0 %	50 %	50 %	114321926
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78336	NC_008340	GCCC	2	8	3164815	3164822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78337	NC_008340	CTC	2	6	3164836	3164841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321931
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78342	NC_008340	C	7	7	3164998	3165004	0 %	0 %	0 %	100 %	114321931
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78465	NC_008340	ATG	2	6	3169389	3169394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321933
78466	NC_008340	GCA	2	6	3169417	3169422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321933
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78491	NC_008340	ACC	2	6	3170617	3170622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321934
78492	NC_008340	ACG	2	6	3170632	3170637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321934
78493	NC_008340	ATC	2	6	3170638	3170643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321934
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78497	NC_008340	GCC	2	6	3170855	3170860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321935
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78500	NC_008340	GCCG	2	8	3170950	3170957	0 %	0 %	50 %	50 %	114321935

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