MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77001	NC_008340	GGC	2	6	3111631	3111636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321890
77002	NC_008340	GCA	2	6	3111672	3111677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321890
77003	NC_008340	GTA	2	6	3111679	3111684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321890
77004	NC_008340	TCG	2	6	3111686	3111691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321890
77005	NC_008340	CCT	2	6	3111696	3111701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321890
77006	NC_008340	TCG	2	6	3111713	3111718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321890
77007	NC_008340	GCC	2	6	3111729	3111734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321890
77008	NC_008340	AGA	2	6	3111750	3111755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321890
77009	NC_008340	CGA	2	6	3111765	3111770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321890
77010	NC_008340	CCA	2	6	3111864	3111869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321890
77011	NC_008340	ACC	2	6	3111908	3111913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321890
77012	NC_008340	TGC	2	6	3111920	3111925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321890
77013	NC_008340	C	6	6	3111929	3111934	0 %	0 %	0 %	100 %	114321890
77014	NC_008340	CCCGGC	2	12	3111978	3111989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321890
77015	NC_008340	GTA	2	6	3112036	3112041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321890
77016	NC_008340	GTT	2	6	3112048	3112053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114321890
77017	NC_008340	CGG	3	9	3112071	3112079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321890
77018	NC_008340	TCG	2	6	3112088	3112093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321890
77019	NC_008340	AGGGCC	2	12	3112121	3112132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321890
77020	NC_008340	GCG	3	9	3112136	3112144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321890
77021	NC_008340	CAC	2	6	3112156	3112161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321890
77022	NC_008340	GCAG	2	8	3112182	3112189	25 %	0 %	50 %	25 %	114321890
77023	NC_008340	C	6	6	3112241	3112246	0 %	0 %	0 %	100 %	114321891
77024	NC_008340	GC	3	6	3112255	3112260	0 %	0 %	50 %	50 %	114321891
77025	NC_008340	ACC	2	6	3112315	3112320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321891
77026	NC_008340	GGC	2	6	3112326	3112331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321891
77027	NC_008340	ATG	2	6	3112333	3112338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321891
77028	NC_008340	GCG	2	6	3112376	3112381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321891
77029	NC_008340	GGC	2	6	3112620	3112625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321891
77030	NC_008340	GCA	2	6	3112643	3112648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77031	NC_008340	ATC	3	9	3112687	3112695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321891
77032	NC_008340	ACG	3	9	3112702	3112710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77033	NC_008340	GAG	2	6	3112728	3112733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321891
77034	NC_008340	CCA	2	6	3112742	3112747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321891
77035	NC_008340	GCG	2	6	3112811	3112816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321891
77036	NC_008340	CGC	2	6	3112874	3112879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321891
77037	NC_008340	GCGG	2	8	3112943	3112950	0 %	0 %	75 %	25 %	114321891
77038	NC_008340	CAG	2	6	3112968	3112973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77039	NC_008340	TCC	2	6	3113014	3113019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321891
77040	NC_008340	GCC	2	6	3113091	3113096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321891
77041	NC_008340	CGC	2	6	3113118	3113123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321891
77042	NC_008340	GCC	2	6	3113173	3113178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321891
77043	NC_008340	AGC	2	6	3113191	3113196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77044	NC_008340	CAG	2	6	3113235	3113240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77045	NC_008340	GTC	2	6	3113241	3113246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77046	NC_008340	GCC	2	6	3113302	3113307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321891
77047	NC_008340	GCTC	2	8	3113387	3113394	0 %	25 %	25 %	50 %	114321891
77048	NC_008340	GATCTG	2	12	3113526	3113537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114321891
77049	NC_008340	CCA	4	12	3113555	3113566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321891
77050	NC_008340	ACC	2	6	3113616	3113621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321891
77051	NC_008340	GCA	2	6	3113627	3113632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77052	NC_008340	TGC	2	6	3113651	3113656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77053	NC_008340	GCG	2	6	3113716	3113721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321891
77054	NC_008340	CCA	2	6	3113759	3113764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321891
77055	NC_008340	CCG	2	6	3113785	3113790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321891
77056	NC_008340	CGG	2	6	3113802	3113807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321891
77057	NC_008340	CAG	2	6	3113820	3113825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77058	NC_008340	GGT	2	6	3113844	3113849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321891
77059	NC_008340	CCGC	2	8	3113903	3113910	0 %	0 %	25 %	75 %	114321891
77060	NC_008340	GTC	2	6	3113913	3113918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77061	NC_008340	ACC	2	6	3113968	3113973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321891
77062	NC_008340	ATG	2	6	3114010	3114015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321891
77063	NC_008340	CAG	2	6	3114039	3114044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77064	NC_008340	TGG	2	6	3114050	3114055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321891
77065	NC_008340	TGGCCA	2	12	3114065	3114076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77066	NC_008340	GCA	2	6	3114077	3114082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
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77068	NC_008340	GAA	2	6	3114111	3114116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321891
77069	NC_008340	GAT	2	6	3114135	3114140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321891
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77071	NC_008340	CTG	2	6	3114171	3114176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321891
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77073	NC_008340	TGCGG	2	10	3114381	3114390	0 %	20 %	60 %	20 %	114321891
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77080	NC_008340	CGA	3	9	3114611	3114619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
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77082	NC_008340	GCA	2	6	3114686	3114691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321891
77083	NC_008340	ACC	3	9	3114742	3114750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321891
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77085	NC_008340	CGG	2	6	3114778	3114783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321891
77086	NC_008340	TCC	2	6	3114824	3114829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77087	NC_008340	AT	3	6	3114927	3114932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77088	NC_008340	C	6	6	3114944	3114949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77089	NC_008340	CGC	2	6	3114964	3114969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77090	NC_008340	ATC	2	6	3114981	3114986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77091	NC_008340	GAC	2	6	3115010	3115015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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77097	NC_008340	CG	3	6	3115168	3115173	0 %	0 %	50 %	50 %	114321892
77098	NC_008340	ACC	2	6	3115198	3115203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321892
77099	NC_008340	GCA	2	6	3115219	3115224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321892
77100	NC_008340	CGGC	2	8	3115227	3115234	0 %	0 %	50 %	50 %	114321892
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77104	NC_008340	GCCTGG	2	12	3115420	3115431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321892
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77106	NC_008340	CTG	2	6	3115485	3115490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321892
77107	NC_008340	CCGG	2	8	3115535	3115542	0 %	0 %	50 %	50 %	114321892
77108	NC_008340	GCT	2	6	3115598	3115603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321892
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77112	NC_008340	CCG	2	6	3115809	3115814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321892
77113	NC_008340	CG	3	6	3115925	3115930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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77115	NC_008340	GCCG	2	8	3115993	3116000	0 %	0 %	50 %	50 %	114321893
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77351	NC_008340	GCAC	2	8	3125540	3125547	25 %	0 %	25 %	50 %	114321901
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77411	NC_008340	GC	3	6	3127848	3127853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77412	NC_008340	CGA	2	6	3127997	3128002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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77420	NC_008340	GCC	2	6	3128211	3128216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321902
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77451	NC_008340	CAG	2	6	3129251	3129256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321903
77452	NC_008340	CCG	2	6	3129366	3129371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321903
77453	NC_008340	CTG	2	6	3129380	3129385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321903
77454	NC_008340	GAG	2	6	3129386	3129391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321903
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77458	NC_008340	TCGC	2	8	3129466	3129473	0 %	25 %	25 %	50 %	114321903
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