MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75501	NC_008340	CGA	2	6	3047836	3047841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75502	NC_008340	CGG	2	6	3047892	3047897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321834
75503	NC_008340	AC	3	6	3047905	3047910	50 %	0 %	0 %	50 %	114321834
75504	NC_008340	ACG	2	6	3047925	3047930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75505	NC_008340	GCC	2	6	3047991	3047996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321834
75506	NC_008340	GAC	2	6	3048074	3048079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75507	NC_008340	AGG	2	6	3048153	3048158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321834
75508	NC_008340	GGT	2	6	3048165	3048170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321834
75509	NC_008340	GC	3	6	3048259	3048264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75510	NC_008340	ATG	2	6	3048296	3048301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75511	NC_008340	GAG	2	6	3048310	3048315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75512	NC_008340	CCA	2	6	3048317	3048322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321835
75513	NC_008340	CCT	2	6	3048348	3048353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321835
75514	NC_008340	TCC	3	9	3048368	3048376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321835
75515	NC_008340	CGG	2	6	3048450	3048455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321835
75516	NC_008340	TGA	2	6	3048665	3048670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321835
75517	NC_008340	CGC	2	6	3048705	3048710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321835
75518	NC_008340	GAC	2	6	3048715	3048720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321835
75519	NC_008340	GAC	2	6	3048802	3048807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321835
75520	NC_008340	CGG	2	6	3048848	3048853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321835
75521	NC_008340	G	6	6	3049005	3049010	0 %	0 %	100 %	0 %	114321835
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75527	NC_008340	CGA	2	6	3049248	3049253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321835
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75531	NC_008340	GCGG	2	8	3049456	3049463	0 %	0 %	75 %	25 %	114321835
75532	NC_008340	ATC	2	6	3049517	3049522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321835
75533	NC_008340	GGC	2	6	3049747	3049752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321835
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75537	NC_008340	ACTG	2	8	3050029	3050036	25 %	25 %	25 %	25 %	114321835
75538	NC_008340	ACTGGG	2	12	3050124	3050135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321835
75539	NC_008340	GGC	2	6	3050170	3050175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321835
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75541	NC_008340	AAC	3	9	3050410	3050418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321835
75542	NC_008340	ATG	2	6	3050474	3050479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321835
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75551	NC_008340	TCCA	2	8	3050830	3050837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75552	NC_008340	CTT	2	6	3050871	3050876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75553	NC_008340	TGG	2	6	3051014	3051019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321836
75554	NC_008340	CGA	2	6	3051069	3051074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321836
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75563	NC_008340	CG	3	6	3051398	3051403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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75570	NC_008340	CGC	2	6	3051882	3051887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321837
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75965	NC_008340	GCGG	2	8	3068086	3068093	0 %	0 %	75 %	25 %	114321849
75966	NC_008340	CAG	2	6	3068197	3068202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321849
75967	NC_008340	CG	4	8	3068245	3068252	0 %	0 %	50 %	50 %	114321849
75968	NC_008340	CCA	2	6	3068253	3068258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321849
75969	NC_008340	CAGC	2	8	3068278	3068285	25 %	0 %	25 %	50 %	114321849
75970	NC_008340	GAT	2	6	3068305	3068310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321849
75971	NC_008340	AGC	2	6	3068321	3068326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321849
75972	NC_008340	GGC	2	6	3068338	3068343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321849
75973	NC_008340	GCA	2	6	3068445	3068450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321849
75974	NC_008340	CTC	2	6	3068482	3068487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321849
75975	NC_008340	GC	3	6	3068541	3068546	0 %	0 %	50 %	50 %	114321849
75976	NC_008340	TCG	2	6	3068648	3068653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321849
75977	NC_008340	GCA	2	6	3068691	3068696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321849
75978	NC_008340	ACC	2	6	3068787	3068792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75979	NC_008340	AGG	2	6	3068797	3068802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321850
75980	NC_008340	CCG	2	6	3068824	3068829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321850
75981	NC_008340	CTG	2	6	3068877	3068882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321850
75982	NC_008340	CTG	2	6	3068895	3068900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321850
75983	NC_008340	CCG	2	6	3068941	3068946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321850
75984	NC_008340	TCT	2	6	3068971	3068976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321850
75985	NC_008340	CAG	2	6	3068982	3068987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321850
75986	NC_008340	GCC	2	6	3069003	3069008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321850
75987	NC_008340	CCG	2	6	3069020	3069025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321850
75988	NC_008340	CTGG	2	8	3069044	3069051	0 %	25 %	50 %	25 %	114321850
75989	NC_008340	CACGG	2	10	3069082	3069091	20 %	0 %	40 %	40 %	114321850
75990	NC_008340	GAG	2	6	3069126	3069131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321850
75991	NC_008340	TCT	2	6	3069154	3069159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321850
75992	NC_008340	TGG	2	6	3069172	3069177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321850
75993	NC_008340	CGGC	2	8	3069191	3069198	0 %	0 %	50 %	50 %	114321850
75994	NC_008340	AGG	2	6	3069199	3069204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321850
75995	NC_008340	CGG	2	6	3069251	3069256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321850
75996	NC_008340	GCC	2	6	3069257	3069262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321850
75997	NC_008340	GCT	2	6	3069311	3069316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321850
75998	NC_008340	CTG	2	6	3069363	3069368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321850
75999	NC_008340	CTT	2	6	3069398	3069403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321850
76000	NC_008340	TGC	2	6	3069406	3069411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321850

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