MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_008340	ACCG	2	8	3025171	3025178	25 %	0 %	25 %	50 %	114321819
75003	NC_008340	C	7	7	3025211	3025217	0 %	0 %	0 %	100 %	114321819
75004	NC_008340	GCCAG	2	10	3025226	3025235	20 %	0 %	40 %	40 %	114321819
75005	NC_008340	CGG	2	6	3025238	3025243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321819
75006	NC_008340	GAT	2	6	3025260	3025265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321819
75007	NC_008340	GCCAG	2	10	3025271	3025280	20 %	0 %	40 %	40 %	114321819
75008	NC_008340	CGC	2	6	3025287	3025292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321819
75009	NC_008340	CGG	2	6	3025318	3025323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321819
75010	NC_008340	AGC	2	6	3025333	3025338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321819
75011	NC_008340	CAG	2	6	3025347	3025352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321819
75012	NC_008340	CAC	2	6	3025353	3025358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321819
75013	NC_008340	GGCC	2	8	3025448	3025455	0 %	0 %	50 %	50 %	114321819
75014	NC_008340	CAC	2	6	3025458	3025463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321819
75015	NC_008340	GACG	2	8	3025515	3025522	25 %	0 %	50 %	25 %	114321819
75016	NC_008340	C	6	6	3025548	3025553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75017	NC_008340	GCC	2	6	3025595	3025600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75018	NC_008340	CGCC	2	8	3025619	3025626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75019	NC_008340	TCG	2	6	3025745	3025750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321820
75020	NC_008340	CCG	2	6	3025853	3025858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321820
75021	NC_008340	TCG	2	6	3025874	3025879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321820
75022	NC_008340	GAG	2	6	3025900	3025905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114321820
75023	NC_008340	GCT	2	6	3026091	3026096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321820
75024	NC_008340	GGCC	2	8	3026106	3026113	0 %	0 %	50 %	50 %	114321820
75025	NC_008340	TGG	2	6	3026114	3026119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321820
75026	NC_008340	CAT	2	6	3026145	3026150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321820
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75028	NC_008340	CTG	2	6	3026203	3026208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321820
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75032	NC_008340	TGA	2	6	3026432	3026437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321820
75033	NC_008340	CAT	2	6	3026532	3026537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321820
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75035	NC_008340	CG	3	6	3026586	3026591	0 %	0 %	50 %	50 %	114321820
75036	NC_008340	CTG	2	6	3026614	3026619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321820
75037	NC_008340	TGA	2	6	3026624	3026629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321820
75038	NC_008340	GCCA	2	8	3026633	3026640	25 %	0 %	25 %	50 %	114321820
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75040	NC_008340	TGC	2	6	3026732	3026737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321820
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75042	NC_008340	CGGG	2	8	3026779	3026786	0 %	0 %	75 %	25 %	114321820
75043	NC_008340	GCCACC	2	12	3026791	3026802	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321820
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75050	NC_008340	CTG	2	6	3027108	3027113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75051	NC_008340	CGGG	2	8	3027135	3027142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75052	NC_008340	GCA	2	6	3027181	3027186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75053	NC_008340	GC	3	6	3027203	3027208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75054	NC_008340	AGCGA	2	10	3027216	3027225	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75055	NC_008340	CGC	3	9	3027231	3027239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75056	NC_008340	CCCG	2	8	3027303	3027310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75057	NC_008340	CAC	2	6	3027332	3027337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75058	NC_008340	ACC	2	6	3027349	3027354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75059	NC_008340	CGGCT	2	10	3027379	3027388	0 %	20 %	40 %	40 %	114321821
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75118	NC_008340	GCT	2	6	3029847	3029852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321822
75119	NC_008340	CAC	2	6	3029860	3029865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321822
75120	NC_008340	ATC	2	6	3029926	3029931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321822
75121	NC_008340	GGC	2	6	3029985	3029990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321822
75122	NC_008340	CT	3	6	3030022	3030027	0 %	50 %	0 %	50 %	114321822
75123	NC_008340	TGC	2	6	3030074	3030079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321822
75124	NC_008340	GGC	2	6	3030168	3030173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321822
75125	NC_008340	CGA	2	6	3030204	3030209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321822
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75128	NC_008340	GGC	2	6	3030330	3030335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321822
75129	NC_008340	GGT	2	6	3030369	3030374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321822
75130	NC_008340	GCC	2	6	3030455	3030460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321822
75131	NC_008340	GCGA	2	8	3030495	3030502	25 %	0 %	50 %	25 %	114321822
75132	NC_008340	GC	3	6	3030588	3030593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75133	NC_008340	GTCA	2	8	3030600	3030607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75134	NC_008340	CTG	2	6	3030678	3030683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321823
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75137	NC_008340	TGA	2	6	3030764	3030769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321823
75138	NC_008340	CGT	2	6	3030785	3030790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321823
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75140	NC_008340	T	8	8	3030972	3030979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75141	NC_008340	GCG	2	6	3031056	3031061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75142	NC_008340	CAG	2	6	3031087	3031092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75143	NC_008340	C	7	7	3031117	3031123	0 %	0 %	0 %	100 %	114321824
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75145	NC_008340	GGCC	2	8	3031351	3031358	0 %	0 %	50 %	50 %	114321824
75146	NC_008340	CTG	2	6	3031439	3031444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321824
75147	NC_008340	CGA	2	6	3031465	3031470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321824
75148	NC_008340	CCG	2	6	3031502	3031507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321824
75149	NC_008340	GCC	2	6	3031512	3031517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321824
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75154	NC_008340	GTG	2	6	3031844	3031849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321824
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75156	NC_008340	TGC	2	6	3031875	3031880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321824
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75165	NC_008340	CAA	2	6	3032183	3032188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75166	NC_008340	CGT	2	6	3032189	3032194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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75187	NC_008340	ACA	2	6	3033077	3033082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321825
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75191	NC_008340	CCG	2	6	3033267	3033272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321825
75192	NC_008340	TCG	2	6	3033275	3033280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321825
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75195	NC_008340	CCT	2	6	3033332	3033337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75196	NC_008340	TCA	2	6	3033341	3033346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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75198	NC_008340	GGTGGG	2	12	3033449	3033460	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75199	NC_008340	GGTGGG	2	12	3033478	3033489	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75200	NC_008340	CTTCCG	2	12	3033548	3033559	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75201	NC_008340	TTC	2	6	3033571	3033576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75202	NC_008340	CGA	2	6	3033590	3033595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75203	NC_008340	GCC	2	6	3033615	3033620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75204	NC_008340	GCT	3	9	3033818	3033826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321826
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75207	NC_008340	CTG	2	6	3033963	3033968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321826
75208	NC_008340	TCGG	2	8	3033979	3033986	0 %	25 %	50 %	25 %	114321826
75209	NC_008340	CGG	3	9	3033984	3033992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321826
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75211	NC_008340	CGC	2	6	3034022	3034027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321826
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75214	NC_008340	GCC	2	6	3034182	3034187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321826
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75216	NC_008340	GCT	2	6	3034289	3034294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321826
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75218	NC_008340	ATC	2	6	3034323	3034328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321826
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75220	NC_008340	CGG	2	6	3034498	3034503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321826
75221	NC_008340	ATC	2	6	3034506	3034511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321826
75222	NC_008340	CTG	2	6	3034512	3034517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321826
75223	NC_008340	ACCTGG	2	12	3034576	3034587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321826
75224	NC_008340	GCG	2	6	3034653	3034658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321826
75225	NC_008340	GCG	2	6	3034663	3034668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321826
75226	NC_008340	CTGG	2	8	3034748	3034755	0 %	25 %	50 %	25 %	114321826
75227	NC_008340	TGG	2	6	3034783	3034788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321826
75228	NC_008340	CGG	2	6	3034814	3034819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321826
75229	NC_008340	TC	3	6	3034847	3034852	0 %	50 %	0 %	50 %	114321826
75230	NC_008340	TGA	2	6	3034906	3034911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321826
75231	NC_008340	TGG	2	6	3034948	3034953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321826
75232	NC_008340	CTT	2	6	3034976	3034981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114321826
75233	NC_008340	TCC	2	6	3035014	3035019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114321826
75234	NC_008340	ACT	2	6	3035027	3035032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321826
75235	NC_008340	ACGC	2	8	3035106	3035113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75236	NC_008340	AAT	2	6	3035181	3035186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75237	NC_008340	AT	3	6	3035196	3035201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75238	NC_008340	AGG	2	6	3035217	3035222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75239	NC_008340	GA	3	6	3035230	3035235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75240	NC_008340	GC	3	6	3035253	3035258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75241	NC_008340	CCTCG	2	10	3035525	3035534	0 %	20 %	20 %	60 %	114321827
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75266	NC_008340	AC	3	6	3036509	3036514	50 %	0 %	0 %	50 %	114321828
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75337	NC_008340	CGAT	2	8	3039713	3039720	25 %	25 %	25 %	25 %	114321830
75338	NC_008340	GC	3	6	3039910	3039915	0 %	0 %	50 %	50 %	114321830
75339	NC_008340	CAA	2	6	3039916	3039921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321830
75340	NC_008340	CTG	2	6	3039949	3039954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321830
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75347	NC_008340	GCA	2	6	3040347	3040352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321830
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75352	NC_008340	ATC	2	6	3040648	3040653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321830
75353	NC_008340	GCT	2	6	3040683	3040688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321830
75354	NC_008340	ACA	2	6	3040821	3040826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321830
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75372	NC_008340	GCA	2	6	3041562	3041567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321830
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75397	NC_008340	CCAGA	2	10	3042553	3042562	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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75464	NC_008340	CGA	2	6	3045805	3045810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
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75468	NC_008340	TGA	2	6	3046050	3046055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114321834
75469	NC_008340	CGC	2	6	3046090	3046095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321834
75470	NC_008340	GTG	2	6	3046098	3046103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114321834
75471	NC_008340	AAC	2	6	3046154	3046159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321834
75472	NC_008340	GAC	2	6	3046274	3046279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75473	NC_008340	ACT	2	6	3046305	3046310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114321834
75474	NC_008340	CGA	2	6	3046336	3046341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75475	NC_008340	CAGCGA	2	12	3046366	3046377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
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75480	NC_008340	AAC	2	6	3046604	3046609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321834
75481	NC_008340	AGTG	2	8	3046687	3046694	25 %	25 %	50 %	0 %	114321834
75482	NC_008340	GCTT	2	8	3046698	3046705	0 %	50 %	25 %	25 %	114321834
75483	NC_008340	ACG	2	6	3046725	3046730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75484	NC_008340	CGA	2	6	3046936	3046941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
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75487	NC_008340	CGC	2	6	3047100	3047105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321834
75488	NC_008340	CTGGGG	2	12	3047188	3047199	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321834
75489	NC_008340	CGA	2	6	3047236	3047241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75490	NC_008340	G	6	6	3047263	3047268	0 %	0 %	100 %	0 %	114321834
75491	NC_008340	AC	3	6	3047305	3047310	50 %	0 %	0 %	50 %	114321834
75492	NC_008340	GAC	2	6	3047387	3047392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75493	NC_008340	GGGT	2	8	3047409	3047416	0 %	25 %	75 %	0 %	114321834
75494	NC_008340	AGCGAC	2	12	3047417	3047428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75495	NC_008340	AGTG	2	8	3047437	3047444	25 %	25 %	50 %	0 %	114321834
75496	NC_008340	GAC	2	6	3047474	3047479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75497	NC_008340	CAA	2	6	3047536	3047541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114321834
75498	NC_008340	AGTG	2	8	3047587	3047594	25 %	25 %	50 %	0 %	114321834
75499	NC_008340	ACG	2	6	3047625	3047630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
75500	NC_008340	ACTG	2	8	3047723	3047730	25 %	25 %	25 %	25 %	114321834

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