MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008340	GTC	2	6	281609	281614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319408
7002	NC_008340	TCC	2	6	281685	281690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319408
7003	NC_008340	GCC	2	6	281699	281704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319408
7004	NC_008340	GAT	2	6	281726	281731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319408
7005	NC_008340	CTT	2	6	281795	281800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319408
7006	NC_008340	CGG	2	6	281869	281874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319408
7007	NC_008340	CCA	2	6	281893	281898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319408
7008	NC_008340	CG	3	6	281907	281912	0 %	0 %	50 %	50 %	114319408
7009	NC_008340	GCC	2	6	281925	281930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319408
7010	NC_008340	GCC	3	9	281958	281966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319408
7011	NC_008340	TGG	2	6	282016	282021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319408
7012	NC_008340	CGGGG	2	10	282040	282049	0 %	0 %	80 %	20 %	114319408
7013	NC_008340	TTG	2	6	282108	282113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_008340	TGATT	2	10	282148	282157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_008340	TAT	2	6	282158	282163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_008340	CCG	2	6	282166	282171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_008340	CAGGG	2	10	282227	282236	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7018	NC_008340	CGG	2	6	282252	282257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_008340	TAA	2	6	282262	282267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_008340	GCA	2	6	282340	282345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_008340	CCG	2	6	282365	282370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319409
7022	NC_008340	TGA	2	6	282422	282427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319409
7023	NC_008340	TCG	2	6	282555	282560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319409
7024	NC_008340	CGG	2	6	282571	282576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319409
7025	NC_008340	GCA	3	9	282577	282585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319409
7026	NC_008340	TCC	2	6	282630	282635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319409
7027	NC_008340	CGG	2	6	282657	282662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_008340	CAG	2	6	282690	282695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_008340	GCC	2	6	282751	282756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7030	NC_008340	CGC	2	6	282770	282775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_008340	ACG	2	6	282798	282803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_008340	GCA	2	6	282824	282829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_008340	TCA	2	6	282875	282880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_008340	CCT	2	6	282881	282886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_008340	CGC	2	6	282905	282910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_008340	GGTG	2	8	282911	282918	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_008340	GTC	2	6	282972	282977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_008340	CG	3	6	282982	282987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_008340	GT	3	6	283032	283037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_008340	TGGC	2	8	283055	283062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_008340	AAT	2	6	283080	283085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_008340	CCG	2	6	283121	283126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_008340	GAG	2	6	283154	283159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_008340	GCA	2	6	283205	283210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_008340	GCC	2	6	283229	283234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_008340	TGA	2	6	283253	283258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319410
7047	NC_008340	GCT	2	6	283278	283283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319410
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7053	NC_008340	ACGCC	2	10	283464	283473	20 %	0 %	20 %	60 %	114319410
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7056	NC_008340	CTT	2	6	283677	283682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319410
7057	NC_008340	GGC	2	6	283714	283719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
7058	NC_008340	CCG	2	6	283724	283729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
7059	NC_008340	CCG	2	6	283782	283787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319410
7060	NC_008340	GC	3	6	283797	283802	0 %	0 %	50 %	50 %	114319410
7061	NC_008340	CGA	2	6	283893	283898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319410
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7063	NC_008340	CGG	2	6	284031	284036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
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7065	NC_008340	CGG	2	6	284102	284107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
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7067	NC_008340	GGC	2	6	284166	284171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319410
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7070	NC_008340	ATG	2	6	284295	284300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_008340	T	6	6	284353	284358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_008340	GAGGG	2	10	284505	284514	20 %	0 %	80 %	0 %	114319411
7073	NC_008340	TCC	2	6	284517	284522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319411
7074	NC_008340	TGA	2	6	284618	284623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319411
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7076	NC_008340	ATC	2	6	284635	284640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319411
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7079	NC_008340	GAG	2	6	284743	284748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319411
7080	NC_008340	GAG	2	6	284759	284764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319411
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7083	NC_008340	CTG	2	6	284891	284896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319411
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7087	NC_008340	GGCAG	2	10	285145	285154	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7088	NC_008340	CG	3	6	285179	285184	0 %	0 %	50 %	50 %	114319412
7089	NC_008340	GCA	2	6	285207	285212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319412
7090	NC_008340	GCA	2	6	285294	285299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319412
7091	NC_008340	CGG	2	6	285316	285321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319412
7092	NC_008340	GCC	2	6	285602	285607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319413
7093	NC_008340	ATG	2	6	285803	285808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319413
7094	NC_008340	CTG	2	6	285917	285922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319413
7095	NC_008340	AGC	2	6	285959	285964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319414
7096	NC_008340	TGA	2	6	285986	285991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319414
7097	NC_008340	GTC	2	6	285994	285999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319414
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7099	NC_008340	GGA	2	6	286149	286154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319414
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7102	NC_008340	TCA	2	6	286496	286501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_008340	GTG	2	6	286559	286564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_008340	CTT	2	6	286584	286589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_008340	T	7	7	286592	286598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_008340	CAT	2	6	286612	286617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_008340	GCT	2	6	286748	286753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319415
7108	NC_008340	GGT	2	6	286829	286834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319415
7109	NC_008340	TGC	2	6	286861	286866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319415
7110	NC_008340	CGCT	2	8	286871	286878	0 %	25 %	25 %	50 %	114319415
7111	NC_008340	CGC	2	6	286890	286895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319415
7112	NC_008340	AGT	2	6	286901	286906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319415
7113	NC_008340	TGG	2	6	286925	286930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319415
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7116	NC_008340	GGA	2	6	287192	287197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319415
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7118	NC_008340	GC	3	6	287346	287351	0 %	0 %	50 %	50 %	114319416
7119	NC_008340	GGC	2	6	287379	287384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319416
7120	NC_008340	GA	3	6	287407	287412	50 %	0 %	50 %	0 %	114319416
7121	NC_008340	GCT	2	6	287425	287430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319416
7122	NC_008340	GAC	2	6	287443	287448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319416
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7124	NC_008340	GGGC	2	8	287525	287532	0 %	0 %	75 %	25 %	114319416
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7246	NC_008340	GTG	2	6	292591	292596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319422
7247	NC_008340	GGC	2	6	292621	292626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319422
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7250	NC_008340	GCA	2	6	292803	292808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319422
7251	NC_008340	GGT	2	6	292852	292857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319422
7252	NC_008340	CGG	2	6	292898	292903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
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7254	NC_008340	CGG	2	6	292933	292938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
7255	NC_008340	TCG	2	6	292948	292953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
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7260	NC_008340	GCT	2	6	293120	293125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319423
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7270	NC_008340	CGG	2	6	293606	293611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319423
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7273	NC_008340	GTGG	2	8	293736	293743	0 %	25 %	75 %	0 %	114319423
7274	NC_008340	CCG	3	9	293746	293754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319423
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7290	NC_008340	CAG	2	6	294444	294449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
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7292	NC_008340	CGGG	2	8	294491	294498	0 %	0 %	75 %	25 %	114319423
7293	NC_008340	AGC	2	6	294565	294570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319423
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7312	NC_008340	GC	3	6	295224	295229	0 %	0 %	50 %	50 %	114319423
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7319	NC_008340	GC	3	6	295636	295641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7320	NC_008340	C	6	6	295675	295680	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7321	NC_008340	CCCA	2	8	295705	295712	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7322	NC_008340	GAG	2	6	295731	295736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7323	NC_008340	CGC	2	6	295770	295775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7324	NC_008340	GAG	2	6	295825	295830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7325	NC_008340	CGC	2	6	295864	295869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7326	NC_008340	GAG	2	6	295919	295924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7327	NC_008340	A	6	6	296075	296080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7328	NC_008340	GCG	2	6	296087	296092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7329	NC_008340	ACA	2	6	296113	296118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7330	NC_008340	TGTCGG	2	12	296191	296202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114319424
7331	NC_008340	GAT	2	6	296204	296209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319424
7332	NC_008340	TTG	4	12	296220	296231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319424
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7348	NC_008340	GGCG	2	8	296737	296744	0 %	0 %	75 %	25 %	114319424
7349	NC_008340	GCGG	2	8	296762	296769	0 %	0 %	75 %	25 %	114319424
7350	NC_008340	GCG	2	6	296787	296792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319424
7351	NC_008340	CCT	2	6	296809	296814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319424
7352	NC_008340	CAG	2	6	296831	296836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319424
7353	NC_008340	AGC	2	6	296853	296858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319424
7354	NC_008340	GTGG	2	8	296906	296913	0 %	25 %	75 %	0 %	114319424
7355	NC_008340	CGATGC	2	12	296956	296967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114319424
7356	NC_008340	CGG	2	6	296983	296988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319424
7357	NC_008340	TGG	2	6	297019	297024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319424
7358	NC_008340	GCA	2	6	297055	297060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319424
7359	NC_008340	GAT	2	6	297068	297073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319424
7360	NC_008340	TGA	2	6	297091	297096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319424
7361	NC_008340	ACC	2	6	297119	297124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319424
7362	NC_008340	CTC	3	9	297140	297148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319424
7363	NC_008340	TGGTC	2	10	297154	297163	0 %	40 %	40 %	20 %	114319424
7364	NC_008340	CTC	2	6	297170	297175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319424
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7366	NC_008340	ATG	2	6	297225	297230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319424
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7484	NC_008340	TGG	2	6	302115	302120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319428
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7487	NC_008340	ATC	2	6	302346	302351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319428
7488	NC_008340	GGTG	2	8	302362	302369	0 %	25 %	75 %	0 %	114319428
7489	NC_008340	GCA	2	6	302374	302379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319428
7490	NC_008340	GGC	2	6	302408	302413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319428
7491	NC_008340	GGC	2	6	302425	302430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319428
7492	NC_008340	TCG	2	6	302451	302456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319428
7493	NC_008340	CCA	2	6	302485	302490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319428
7494	NC_008340	CAT	2	6	302501	302506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319428
7495	NC_008340	CGC	2	6	302560	302565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319428
7496	NC_008340	GCA	2	6	302596	302601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319428
7497	NC_008340	GGC	2	6	302633	302638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319428
7498	NC_008340	CGC	2	6	302641	302646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319428
7499	NC_008340	CGACGC	2	12	302647	302658	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114319428
7500	NC_008340	CGG	3	9	302677	302685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319428

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