MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008340	GC	3	6	242972	242977	0 %	0 %	50 %	50 %	114319373
6002	NC_008340	GGA	2	6	243017	243022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319373
6003	NC_008340	CGGA	2	8	243098	243105	25 %	0 %	50 %	25 %	114319373
6004	NC_008340	CTGG	2	8	243111	243118	0 %	25 %	50 %	25 %	114319373
6005	NC_008340	G	6	6	243128	243133	0 %	0 %	100 %	0 %	114319373
6006	NC_008340	ACG	2	6	243163	243168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319373
6007	NC_008340	TGC	2	6	243262	243267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319373
6008	NC_008340	GCC	2	6	243315	243320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319373
6009	NC_008340	GGA	2	6	243392	243397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319373
6010	NC_008340	TGG	2	6	243406	243411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319373
6011	NC_008340	GTC	2	6	243463	243468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319374
6012	NC_008340	CCT	3	9	243513	243521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319374
6013	NC_008340	CGG	2	6	243566	243571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319374
6014	NC_008340	GGT	2	6	243582	243587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319374
6015	NC_008340	GCCG	2	8	243642	243649	0 %	0 %	50 %	50 %	114319374
6016	NC_008340	GTT	2	6	243666	243671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319374
6017	NC_008340	GTC	2	6	243691	243696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319374
6018	NC_008340	GGA	2	6	243699	243704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319374
6019	NC_008340	GTC	2	6	243877	243882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319374
6020	NC_008340	CAG	2	6	243883	243888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319374
6021	NC_008340	TCA	2	6	243948	243953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319374
6022	NC_008340	AGC	2	6	243985	243990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_008340	GCG	2	6	243991	243996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_008340	CAG	2	6	244017	244022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_008340	GGC	2	6	244032	244037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_008340	GGT	2	6	244073	244078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_008340	GCG	2	6	244212	244217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_008340	GC	3	6	244279	244284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_008340	GCC	2	6	244288	244293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_008340	TCC	2	6	244312	244317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_008340	GCC	2	6	244318	244323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_008340	GCGTTC	2	12	244326	244337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_008340	CGA	2	6	244348	244353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_008340	CTC	3	9	244362	244370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_008340	CTC	2	6	244380	244385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_008340	CCG	2	6	244409	244414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_008340	AGC	2	6	244456	244461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_008340	TGC	2	6	244566	244571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319375
6039	NC_008340	CCGGC	2	10	244584	244593	0 %	0 %	40 %	60 %	114319375
6040	NC_008340	TGGC	2	8	244614	244621	0 %	25 %	50 %	25 %	114319375
6041	NC_008340	CAT	2	6	244649	244654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319375
6042	NC_008340	GGC	2	6	244673	244678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319375
6043	NC_008340	GCT	2	6	244721	244726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319375
6044	NC_008340	GGC	2	6	244727	244732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319375
6045	NC_008340	CGG	3	9	244735	244743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319375
6046	NC_008340	GGGC	2	8	244789	244796	0 %	0 %	75 %	25 %	114319375
6047	NC_008340	CAG	3	9	244853	244861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
6048	NC_008340	GC	3	6	244867	244872	0 %	0 %	50 %	50 %	114319375
6049	NC_008340	G	6	6	244876	244881	0 %	0 %	100 %	0 %	114319375
6050	NC_008340	CCT	2	6	244891	244896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319375
6051	NC_008340	CCT	2	6	244960	244965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319375
6052	NC_008340	GTGG	2	8	244973	244980	0 %	25 %	75 %	0 %	114319375
6053	NC_008340	CTGG	2	8	245000	245007	0 %	25 %	50 %	25 %	114319375
6054	NC_008340	AGC	2	6	245016	245021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
6055	NC_008340	GGT	2	6	245050	245055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319375
6056	NC_008340	GTA	2	6	245102	245107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319375
6057	NC_008340	ACG	2	6	245121	245126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
6058	NC_008340	CAT	2	6	245135	245140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319375
6059	NC_008340	G	6	6	245183	245188	0 %	0 %	100 %	0 %	114319375
6060	NC_008340	GCA	2	6	245215	245220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319375
6061	NC_008340	GTT	2	6	245260	245265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319375
6062	NC_008340	G	6	6	245349	245354	0 %	0 %	100 %	0 %	114319375
6063	NC_008340	CG	3	6	245387	245392	0 %	0 %	50 %	50 %	114319375
6064	NC_008340	TCA	2	6	245395	245400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319375
6065	NC_008340	GTT	2	6	245413	245418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319375
6066	NC_008340	G	6	6	245461	245466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_008340	TTCG	2	8	245495	245502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_008340	GGC	3	9	245595	245603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_008340	TCGCT	2	10	245610	245619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6070	NC_008340	GC	3	6	245627	245632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_008340	T	6	6	245634	245639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_008340	TGC	2	6	245649	245654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_008340	TGGCCT	2	12	245781	245792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319376
6074	NC_008340	CCT	2	6	245805	245810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319376
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6080	NC_008340	GAA	2	6	245986	245991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319376
6081	NC_008340	GCC	2	6	246010	246015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319376
6082	NC_008340	CAT	2	6	246073	246078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319376
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6091	NC_008340	TCA	2	6	246414	246419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319376
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6094	NC_008340	GAT	2	6	246481	246486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319376
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6096	NC_008340	CGG	2	6	246555	246560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319376
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6098	NC_008340	GAT	2	6	246679	246684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319376
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6106	NC_008340	GCCC	2	8	246936	246943	0 %	0 %	25 %	75 %	114319376
6107	NC_008340	GTT	2	6	246952	246957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319376
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6109	NC_008340	GTA	2	6	247029	247034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319377
6110	NC_008340	GCGG	2	8	247040	247047	0 %	0 %	75 %	25 %	114319377
6111	NC_008340	CAG	2	6	247062	247067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319377
6112	NC_008340	GAT	2	6	247089	247094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319377
6113	NC_008340	TGGG	2	8	247145	247152	0 %	25 %	75 %	0 %	114319377
6114	NC_008340	CA	3	6	247161	247166	50 %	0 %	0 %	50 %	114319377
6115	NC_008340	TCGTCC	2	12	247195	247206	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114319377
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6118	NC_008340	GCT	2	6	247391	247396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319377
6119	NC_008340	ACGC	2	8	247410	247417	25 %	0 %	25 %	50 %	114319377
6120	NC_008340	GCC	2	6	247482	247487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319377
6121	NC_008340	TGCA	2	8	247552	247559	25 %	25 %	25 %	25 %	114319377
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6123	NC_008340	GTT	2	6	247647	247652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319377
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6245	NC_008340	CAT	2	6	252950	252955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319381
6246	NC_008340	CAC	2	6	252969	252974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319381
6247	NC_008340	CGCC	2	8	253016	253023	0 %	0 %	25 %	75 %	114319381
6248	NC_008340	CCG	2	6	253024	253029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319381
6249	NC_008340	CTC	2	6	253048	253053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319381
6250	NC_008340	GGGGA	2	10	253071	253080	20 %	0 %	80 %	0 %	114319381
6251	NC_008340	GATG	2	8	253142	253149	25 %	25 %	50 %	0 %	114319381
6252	NC_008340	GGT	2	6	253166	253171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319381
6253	NC_008340	CG	3	6	253183	253188	0 %	0 %	50 %	50 %	114319381
6254	NC_008340	CAC	2	6	253235	253240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319381
6255	NC_008340	CTG	2	6	253251	253256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319381
6256	NC_008340	GCCG	2	8	253265	253272	0 %	0 %	50 %	50 %	114319381
6257	NC_008340	TGG	2	6	253275	253280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319381
6258	NC_008340	CGG	2	6	253287	253292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319381
6259	NC_008340	GCT	2	6	253304	253309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319381
6260	NC_008340	GGCTG	2	10	253357	253366	0 %	20 %	60 %	20 %	114319381
6261	NC_008340	GCG	2	6	253373	253378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319381
6262	NC_008340	CGA	2	6	253385	253390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319381
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6265	NC_008340	CGGC	2	8	253496	253503	0 %	0 %	50 %	50 %	114319381
6266	NC_008340	CAA	2	6	253529	253534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319381
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6269	NC_008340	TGG	2	6	253618	253623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319381
6270	NC_008340	CTG	2	6	253632	253637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319381
6271	NC_008340	TCG	2	6	253651	253656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319381
6272	NC_008340	CTG	2	6	253662	253667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319381
6273	NC_008340	GGA	2	6	253688	253693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319381
6274	NC_008340	GGA	2	6	253703	253708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319381
6275	NC_008340	GGA	2	6	253712	253717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319381
6276	NC_008340	CTG	2	6	253728	253733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319381
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6278	NC_008340	CTG	2	6	253836	253841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319381
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6280	NC_008340	GGTCG	2	10	253872	253881	0 %	20 %	60 %	20 %	114319381
6281	NC_008340	ACG	2	6	253930	253935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319381
6282	NC_008340	CCG	2	6	253948	253953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319381
6283	NC_008340	AGC	2	6	254041	254046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319381
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6291	NC_008340	TCA	2	6	254385	254390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319382
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6293	NC_008340	AGG	2	6	254430	254435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319382
6294	NC_008340	G	6	6	254512	254517	0 %	0 %	100 %	0 %	114319382
6295	NC_008340	GAG	2	6	254531	254536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319382
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6305	NC_008340	CTG	2	6	254885	254890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319382
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6307	NC_008340	CCAC	2	8	254967	254974	25 %	0 %	0 %	75 %	114319382
6308	NC_008340	TGG	2	6	254991	254996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319382
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6312	NC_008340	GGC	2	6	255115	255120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319382
6313	NC_008340	GGA	2	6	255136	255141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319382
6314	NC_008340	AGG	2	6	255168	255173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319382
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6316	NC_008340	CAC	2	6	255185	255190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319382
6317	NC_008340	GCCAT	2	10	255216	255225	20 %	20 %	20 %	40 %	114319382
6318	NC_008340	CGG	2	6	255267	255272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319382
6319	NC_008340	GAC	2	6	255281	255286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319382
6320	NC_008340	CGT	2	6	255341	255346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319382
6321	NC_008340	CGG	2	6	255385	255390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319382
6322	NC_008340	CCG	2	6	255405	255410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319382
6323	NC_008340	GAA	2	6	255451	255456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319382
6324	NC_008340	GGC	2	6	255486	255491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6325	NC_008340	GGC	2	6	255547	255552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6326	NC_008340	CAA	2	6	255612	255617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319383
6327	NC_008340	AG	3	6	255625	255630	50 %	0 %	50 %	0 %	114319383
6328	NC_008340	CGC	2	6	255673	255678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6329	NC_008340	TGG	2	6	255707	255712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319383
6330	NC_008340	AGG	2	6	255713	255718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319383
6331	NC_008340	CCA	2	6	255746	255751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319383
6332	NC_008340	GGT	2	6	255769	255774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319383
6333	NC_008340	ACG	2	6	255785	255790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6334	NC_008340	GCC	2	6	255811	255816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6335	NC_008340	CCTGGC	2	12	255852	255863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319383
6336	NC_008340	GCC	3	9	255874	255882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6337	NC_008340	TGC	2	6	255887	255892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6338	NC_008340	TGA	2	6	256025	256030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319383
6339	NC_008340	CTG	2	6	256108	256113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6340	NC_008340	GGT	2	6	256137	256142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319383
6341	NC_008340	GCG	2	6	256164	256169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319383
6342	NC_008340	ATG	2	6	256196	256201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319383
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6345	NC_008340	GCT	2	6	256290	256295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6346	NC_008340	GGT	2	6	256346	256351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319383
6347	NC_008340	GCC	2	6	256378	256383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6348	NC_008340	GCCC	2	8	256390	256397	0 %	0 %	25 %	75 %	114319383
6349	NC_008340	CTG	2	6	256405	256410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6350	NC_008340	ACT	2	6	256439	256444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319383
6351	NC_008340	TCG	2	6	256469	256474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6352	NC_008340	CAC	2	6	256488	256493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319383
6353	NC_008340	GCC	2	6	256497	256502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6354	NC_008340	GCC	2	6	256534	256539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6355	NC_008340	GGA	2	6	256551	256556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319383
6356	NC_008340	CGA	2	6	256560	256565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6357	NC_008340	GCC	2	6	256570	256575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6358	NC_008340	CCG	2	6	256622	256627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319383
6359	NC_008340	CTG	2	6	256675	256680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319383
6360	NC_008340	GGC	2	6	256698	256703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319383
6361	NC_008340	CGA	2	6	256751	256756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319384
6362	NC_008340	TCT	2	6	256837	256842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319384
6363	NC_008340	ACCATC	2	12	256848	256859	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114319384
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6365	NC_008340	GCC	2	6	256894	256899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319384
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6432	NC_008340	GGT	2	6	259852	259857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319387
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6453	NC_008340	GTG	2	6	260504	260509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319387
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6459	NC_008340	GC	3	6	260791	260796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6462	NC_008340	CCA	2	6	260915	260920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319388
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6469	NC_008340	G	6	6	261150	261155	0 %	0 %	100 %	0 %	114319388
6470	NC_008340	GCG	2	6	261167	261172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319388
6471	NC_008340	GCCGG	2	10	261268	261277	0 %	0 %	60 %	40 %	114319388
6472	NC_008340	GCCC	2	8	261279	261286	0 %	0 %	25 %	75 %	114319388
6473	NC_008340	CGA	2	6	261288	261293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319388
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6481	NC_008340	ATC	2	6	261572	261577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319389
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6484	NC_008340	CGC	2	6	261658	261663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6485	NC_008340	CAG	2	6	261664	261669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6486	NC_008340	GCCA	2	8	261683	261690	25 %	0 %	25 %	50 %	114319389
6487	NC_008340	AGC	2	6	261716	261721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6488	NC_008340	GCC	2	6	261744	261749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6489	NC_008340	CAGGAC	2	12	261763	261774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6490	NC_008340	CAG	2	6	261823	261828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6491	NC_008340	GGCCAG	2	12	261844	261855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319389
6492	NC_008340	CGC	3	9	261859	261867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6493	NC_008340	GCA	2	6	261873	261878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319389
6494	NC_008340	ACC	2	6	261890	261895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
6495	NC_008340	CCG	2	6	261910	261915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319389
6496	NC_008340	AAG	2	6	261923	261928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319389
6497	NC_008340	CAA	2	6	261958	261963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319389
6498	NC_008340	CCA	2	6	261966	261971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319389
6499	NC_008340	CGG	2	6	261978	261983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319389
6500	NC_008340	CAGGGC	2	12	262051	262062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319389

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