MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 61368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_008260	CACCG	2	10	2277773	2277782	20 %	0 %	20 %	60 %	110834851
44503	NC_008260	GCC	2	6	2277825	2277830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834851
44504	NC_008260	CAT	2	6	2277962	2277967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834851
44505	NC_008260	CCA	2	6	2278051	2278056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834851
44506	NC_008260	ACT	2	6	2278089	2278094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834851
44507	NC_008260	GCC	2	6	2278137	2278142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834851
44508	NC_008260	CAA	2	6	2278157	2278162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834851
44509	NC_008260	AGC	2	6	2278179	2278184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834851
44510	NC_008260	ATG	2	6	2278281	2278286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834851
44511	NC_008260	CGG	2	6	2278301	2278306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834851
44512	NC_008260	TGGC	2	8	2278399	2278406	0 %	25 %	50 %	25 %	110834851
44513	NC_008260	C	6	6	2278408	2278413	0 %	0 %	0 %	100 %	110834851
44514	NC_008260	CAG	2	6	2278502	2278507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834851
44515	NC_008260	CCG	2	6	2278638	2278643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834851
44516	NC_008260	ATC	2	6	2278673	2278678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44517	NC_008260	CTT	2	6	2278798	2278803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110834852
44518	NC_008260	GCC	2	6	2278827	2278832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834852
44519	NC_008260	T	7	7	2278868	2278874	0 %	100 %	0 %	0 %	110834852
44520	NC_008260	TCG	2	6	2278944	2278949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834852
44521	NC_008260	CAC	2	6	2279015	2279020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834852
44522	NC_008260	TCCA	2	8	2279054	2279061	25 %	25 %	0 %	50 %	110834852
44523	NC_008260	CAC	2	6	2279090	2279095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834852
44524	NC_008260	T	7	7	2279101	2279107	0 %	100 %	0 %	0 %	110834852
44525	NC_008260	GCTGG	2	10	2279119	2279128	0 %	20 %	60 %	20 %	110834852
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44527	NC_008260	TGG	2	6	2279311	2279316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834852
44528	NC_008260	CAA	2	6	2279359	2279364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44529	NC_008260	CA	3	6	2279437	2279442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44530	NC_008260	A	11	11	2279467	2279477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44531	NC_008260	TGC	2	6	2279518	2279523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44532	NC_008260	GTG	2	6	2279610	2279615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44533	NC_008260	CAG	2	6	2279632	2279637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44534	NC_008260	TCG	2	6	2279667	2279672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44535	NC_008260	CT	3	6	2279811	2279816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44536	NC_008260	GAA	2	6	2279829	2279834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44537	NC_008260	AAG	2	6	2279882	2279887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44538	NC_008260	A	7	7	2279924	2279930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44539	NC_008260	A	8	8	2279962	2279969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44540	NC_008260	GGC	2	6	2280134	2280139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834853
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44542	NC_008260	CGG	2	6	2280236	2280241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834853
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44544	NC_008260	GGC	2	6	2280265	2280270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834853
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44550	NC_008260	GGCT	2	8	2280531	2280538	0 %	25 %	50 %	25 %	110834853
44551	NC_008260	CCG	2	6	2280572	2280577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834853
44552	NC_008260	GTAG	2	8	2280636	2280643	25 %	25 %	50 %	0 %	110834853
44553	NC_008260	TCT	2	6	2280686	2280691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110834853
44554	NC_008260	GTG	2	6	2280718	2280723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834853
44555	NC_008260	GGC	2	6	2280826	2280831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834853
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44558	NC_008260	GCT	2	6	2280872	2280877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834853
44559	NC_008260	GCT	2	6	2280905	2280910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834853
44560	NC_008260	TGC	3	9	2280928	2280936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834853
44561	NC_008260	CGGC	2	8	2281016	2281023	0 %	0 %	50 %	50 %	110834853
44562	NC_008260	TTC	2	6	2281078	2281083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44563	NC_008260	T	8	8	2281154	2281161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44564	NC_008260	ACCT	2	8	2281185	2281192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44565	NC_008260	A	6	6	2281203	2281208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44566	NC_008260	TA	3	6	2281217	2281222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44567	NC_008260	TTA	2	6	2281223	2281228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44568	NC_008260	AATA	2	8	2281248	2281255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44569	NC_008260	TACTGA	2	12	2281282	2281293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44570	NC_008260	ACG	2	6	2281383	2281388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44571	NC_008260	CGTT	2	8	2281467	2281474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44572	NC_008260	ACG	2	6	2281488	2281493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44573	NC_008260	AC	3	6	2281589	2281594	50 %	0 %	0 %	50 %	110834854
44574	NC_008260	GGC	2	6	2281611	2281616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834854
44575	NC_008260	CAT	2	6	2281671	2281676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834854
44576	NC_008260	CAT	2	6	2281728	2281733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834854
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44588	NC_008260	CGA	2	6	2282359	2282364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834855
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44590	NC_008260	CGA	2	6	2282440	2282445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834855
44591	NC_008260	GCT	2	6	2282455	2282460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834855
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44593	NC_008260	GCC	2	6	2282549	2282554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834855
44594	NC_008260	T	6	6	2282676	2282681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44595	NC_008260	GCA	2	6	2282695	2282700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44597	NC_008260	TC	3	6	2282800	2282805	0 %	50 %	0 %	50 %	110834856
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44600	NC_008260	CTG	2	6	2282981	2282986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834856
44601	NC_008260	GGT	2	6	2283061	2283066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834856
44602	NC_008260	TGC	2	6	2283144	2283149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834856
44603	NC_008260	GCC	2	6	2283159	2283164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834856
44604	NC_008260	CCA	2	6	2283364	2283369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834856
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44606	NC_008260	TGC	2	6	2283415	2283420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834856
44607	NC_008260	GCGCTG	2	12	2283522	2283533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110834856
44608	NC_008260	CTCG	2	8	2283604	2283611	0 %	25 %	25 %	50 %	110834856
44609	NC_008260	CCA	2	6	2283613	2283618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834856
44610	NC_008260	CGG	2	6	2283666	2283671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834856
44611	NC_008260	CAG	2	6	2283758	2283763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834856
44612	NC_008260	CAC	2	6	2283764	2283769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834856
44613	NC_008260	TTG	2	6	2283821	2283826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44614	NC_008260	TAG	2	6	2283864	2283869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44615	NC_008260	GCT	2	6	2283901	2283906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44616	NC_008260	TCA	2	6	2283930	2283935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44617	NC_008260	A	6	6	2283978	2283983	100 %	0 %	0 %	0 %	110834857
44618	NC_008260	CATC	2	8	2283991	2283998	25 %	25 %	0 %	50 %	110834857
44619	NC_008260	GAT	2	6	2284051	2284056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834857
44620	NC_008260	CTT	2	6	2284131	2284136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110834857
44621	NC_008260	GAC	2	6	2284276	2284281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834857
44622	NC_008260	CAA	2	6	2284308	2284313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834857
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44624	NC_008260	TGG	2	6	2284427	2284432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834857
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44626	NC_008260	AGCGCC	2	12	2284544	2284555	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110834857
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44630	NC_008260	TACC	2	8	2284719	2284726	25 %	25 %	0 %	50 %	110834857
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44635	NC_008260	AAAAG	2	10	2284838	2284847	80 %	0 %	20 %	0 %	110834857
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44646	NC_008260	CA	3	6	2285440	2285445	50 %	0 %	0 %	50 %	110834858
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44648	NC_008260	CATC	2	8	2285544	2285551	25 %	25 %	0 %	50 %	110834858
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44650	NC_008260	A	6	6	2285614	2285619	100 %	0 %	0 %	0 %	110834858
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44659	NC_008260	GCA	2	6	2285970	2285975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834859
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44667	NC_008260	CAA	3	9	2286494	2286502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44721	NC_008260	AGC	2	6	2289552	2289557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834862
44722	NC_008260	CAT	2	6	2289559	2289564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834862
44723	NC_008260	CAT	2	6	2289584	2289589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834862
44724	NC_008260	ACA	2	6	2289671	2289676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834863
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44730	NC_008260	GCA	2	6	2289898	2289903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834863
44731	NC_008260	CG	3	6	2289904	2289909	0 %	0 %	50 %	50 %	110834863
44732	NC_008260	GGCC	2	8	2289956	2289963	0 %	0 %	50 %	50 %	110834863
44733	NC_008260	CCA	2	6	2290073	2290078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834863
44734	NC_008260	ATA	2	6	2290082	2290087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110834863
44735	NC_008260	CGT	2	6	2290144	2290149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834863
44736	NC_008260	TCA	3	9	2290228	2290236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834863
44737	NC_008260	TTTC	2	8	2290306	2290313	0 %	75 %	0 %	25 %	110834863
44738	NC_008260	CCT	2	6	2290325	2290330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110834863
44739	NC_008260	CA	3	6	2290335	2290340	50 %	0 %	0 %	50 %	110834863
44740	NC_008260	CAGTGC	2	12	2290347	2290358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110834863
44741	NC_008260	CGC	2	6	2290554	2290559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834864
44742	NC_008260	CTG	2	6	2290561	2290566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834864
44743	NC_008260	GTT	2	6	2290597	2290602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110834864
44744	NC_008260	TTGC	2	8	2290609	2290616	0 %	50 %	25 %	25 %	110834864
44745	NC_008260	GGT	2	6	2290633	2290638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834864
44746	NC_008260	CCG	2	6	2290665	2290670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834864
44747	NC_008260	GTC	2	6	2290828	2290833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834864
44748	NC_008260	CTG	2	6	2290962	2290967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834864
44749	NC_008260	CTA	2	6	2291007	2291012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834864
44750	NC_008260	GTCT	2	8	2291032	2291039	0 %	50 %	25 %	25 %	110834864
44751	NC_008260	ACA	2	6	2291114	2291119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110834865
44752	NC_008260	T	7	7	2291152	2291158	0 %	100 %	0 %	0 %	110834865
44753	NC_008260	GTG	2	6	2291245	2291250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834865
44754	NC_008260	AAG	2	6	2291294	2291299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834865
44755	NC_008260	CCG	2	6	2291330	2291335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110834865
44756	NC_008260	TGG	2	6	2291426	2291431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110834865
44757	NC_008260	TCAGTT	2	12	2291528	2291539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	110834865
44758	NC_008260	TCA	2	6	2291551	2291556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834865
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44761	NC_008260	CGG	2	6	2291627	2291632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834865
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44764	NC_008260	GGCCA	2	10	2291703	2291712	20 %	0 %	40 %	40 %	110834865
44765	NC_008260	T	9	9	2291736	2291744	0 %	100 %	0 %	0 %	110834865
44766	NC_008260	ACAGCC	2	12	2291764	2291775	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	110834865
44767	NC_008260	CCA	2	6	2291780	2291785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110834865
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44773	NC_008260	TCA	2	6	2291982	2291987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110834866
44774	NC_008260	CTC	2	6	2291991	2291996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110834867
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44779	NC_008260	AGCC	2	8	2292381	2292388	25 %	0 %	25 %	50 %	110834867
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44782	NC_008260	TAA	2	6	2292495	2292500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44784	NC_008260	GAG	2	6	2292567	2292572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44787	NC_008260	CGA	2	6	2292869	2292874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834868
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44797	NC_008260	GCCGT	2	10	2293329	2293338	0 %	20 %	40 %	40 %	110834868
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44823	NC_008260	TGT	2	6	2294612	2294617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44825	NC_008260	AACCTG	2	12	2294770	2294781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110834869
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44839	NC_008260	TCGC	2	8	2295413	2295420	0 %	25 %	25 %	50 %	110834870
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44843	NC_008260	ACCGG	2	10	2295749	2295758	20 %	0 %	40 %	40 %	110834871
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44847	NC_008260	A	6	6	2296017	2296022	100 %	0 %	0 %	0 %	110834871
44848	NC_008260	CGA	2	6	2296064	2296069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834871
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44851	NC_008260	GCA	2	6	2296128	2296133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834871
44852	NC_008260	GGC	3	9	2296134	2296142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110834871
44853	NC_008260	TGA	2	6	2296163	2296168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110834871
44854	NC_008260	GCT	2	6	2296178	2296183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110834871
44855	NC_008260	GCA	2	6	2296259	2296264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110834871
44856	NC_008260	CCACG	2	10	2296266	2296275	20 %	0 %	20 %	60 %	110834871
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44864	NC_008260	AGA	2	6	2296670	2296675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110834871
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44870	NC_008260	AC	3	6	2296986	2296991	50 %	0 %	0 %	50 %	110834871
44871	NC_008260	TAT	2	6	2297020	2297025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44872	NC_008260	AGCGA	2	10	2297140	2297149	40 %	0 %	40 %	20 %	110834872
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