MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 61368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_008260	CCA	2	6	2856557	2856562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835379
56002	NC_008260	GCT	2	6	2856674	2856679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835379
56003	NC_008260	GTA	2	6	2856685	2856690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835379
56004	NC_008260	GAT	2	6	2856749	2856754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835379
56005	NC_008260	CAA	2	6	2856758	2856763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835379
56006	NC_008260	A	6	6	2856814	2856819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56007	NC_008260	T	7	7	2856883	2856889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56008	NC_008260	TGCC	2	8	2856921	2856928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56009	NC_008260	C	6	6	2856989	2856994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56010	NC_008260	G	6	6	2857000	2857005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56011	NC_008260	CTGTC	2	10	2857032	2857041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56012	NC_008260	GA	3	6	2857120	2857125	50 %	0 %	50 %	0 %	110835380
56013	NC_008260	TCA	2	6	2857127	2857132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835380
56014	NC_008260	GAT	2	6	2857153	2857158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835380
56015	NC_008260	GAG	2	6	2857159	2857164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110835380
56016	NC_008260	GCAC	2	8	2857255	2857262	25 %	0 %	25 %	50 %	110835380
56017	NC_008260	TCA	2	6	2857280	2857285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835380
56018	NC_008260	ATG	2	6	2857294	2857299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835380
56019	NC_008260	GCT	2	6	2857320	2857325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835380
56020	NC_008260	CTC	2	6	2857462	2857467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110835380
56021	NC_008260	ACA	2	6	2857469	2857474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835380
56022	NC_008260	CAA	2	6	2857543	2857548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835380
56023	NC_008260	GTA	2	6	2857559	2857564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835380
56024	NC_008260	TAA	2	6	2857610	2857615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56025	NC_008260	CTG	2	6	2857708	2857713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835381
56026	NC_008260	ATT	2	6	2857717	2857722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110835381
56027	NC_008260	CGA	2	6	2857890	2857895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835381
56028	NC_008260	ACCG	2	8	2857912	2857919	25 %	0 %	25 %	50 %	110835381
56029	NC_008260	ATCA	2	8	2858005	2858012	50 %	25 %	0 %	25 %	110835381
56030	NC_008260	GAT	2	6	2858020	2858025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835381
56031	NC_008260	GT	3	6	2858063	2858068	0 %	50 %	50 %	0 %	110835381
56032	NC_008260	GAC	2	6	2858158	2858163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835381
56033	NC_008260	TATT	2	8	2858169	2858176	25 %	75 %	0 %	0 %	110835381
56034	NC_008260	AGG	2	6	2858225	2858230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110835381
56035	NC_008260	GCT	2	6	2858268	2858273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835381
56036	NC_008260	A	6	6	2858285	2858290	100 %	0 %	0 %	0 %	110835381
56037	NC_008260	AAAT	2	8	2858330	2858337	75 %	25 %	0 %	0 %	110835381
56038	NC_008260	TTC	2	6	2858355	2858360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835381
56039	NC_008260	TTA	2	6	2858405	2858410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110835381
56040	NC_008260	A	6	6	2858487	2858492	100 %	0 %	0 %	0 %	110835381
56041	NC_008260	ATG	2	6	2858503	2858508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835381
56042	NC_008260	CTG	2	6	2858524	2858529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835381
56043	NC_008260	ATT	2	6	2858566	2858571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110835381
56044	NC_008260	CCAG	2	8	2858598	2858605	25 %	0 %	25 %	50 %	110835381
56045	NC_008260	CCTG	2	8	2858629	2858636	0 %	25 %	25 %	50 %	110835381
56046	NC_008260	CTAC	2	8	2858713	2858720	25 %	25 %	0 %	50 %	110835381
56047	NC_008260	CGA	2	6	2858856	2858861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835381
56048	NC_008260	CAG	2	6	2858890	2858895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835381
56049	NC_008260	CTT	2	6	2858907	2858912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835381
56050	NC_008260	CAC	2	6	2858913	2858918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835381
56051	NC_008260	CAT	2	6	2858967	2858972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835381
56052	NC_008260	CAC	2	6	2858977	2858982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835381
56053	NC_008260	GGC	2	6	2858983	2858988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110835381
56054	NC_008260	GACC	2	8	2859054	2859061	25 %	0 %	25 %	50 %	110835381
56055	NC_008260	CAA	2	6	2859113	2859118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835382
56056	NC_008260	AGA	2	6	2859139	2859144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110835382
56057	NC_008260	TGCCAT	2	12	2859151	2859162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110835382
56058	NC_008260	C	8	8	2859177	2859184	0 %	0 %	0 %	100 %	110835382
56059	NC_008260	ACG	2	6	2859343	2859348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835382
56060	NC_008260	CAA	2	6	2859353	2859358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835382
56061	NC_008260	ACC	2	6	2859362	2859367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835382
56062	NC_008260	GC	3	6	2859405	2859410	0 %	0 %	50 %	50 %	110835382
56063	NC_008260	CAT	2	6	2859518	2859523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835382
56064	NC_008260	CAA	2	6	2859539	2859544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835382
56065	NC_008260	ACCG	2	8	2859617	2859624	25 %	0 %	25 %	50 %	110835382
56066	NC_008260	CAC	2	6	2859682	2859687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835382
56067	NC_008260	GAA	2	6	2859710	2859715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110835382
56068	NC_008260	TGA	2	6	2859742	2859747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835382
56069	NC_008260	CGA	2	6	2859809	2859814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56070	NC_008260	ATCC	2	8	2859837	2859844	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56071	NC_008260	TCG	2	6	2859869	2859874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56072	NC_008260	TCT	2	6	2859896	2859901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56073	NC_008260	A	7	7	2859921	2859927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56074	NC_008260	TGA	2	6	2859968	2859973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56075	NC_008260	GGCA	2	8	2859982	2859989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56076	NC_008260	CAC	2	6	2860002	2860007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56077	NC_008260	C	6	6	2860011	2860016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56078	NC_008260	CCCA	2	8	2860160	2860167	25 %	0 %	0 %	75 %	110835383
56079	NC_008260	GAA	2	6	2860190	2860195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110835383
56080	NC_008260	AAT	2	6	2860280	2860285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110835383
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56082	NC_008260	ATC	2	6	2860359	2860364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835383
56083	NC_008260	CAA	2	6	2860421	2860426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835383
56084	NC_008260	GAA	2	6	2860427	2860432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110835383
56085	NC_008260	TGA	2	6	2860462	2860467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835383
56086	NC_008260	AAC	2	6	2860533	2860538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835383
56087	NC_008260	CG	3	6	2860569	2860574	0 %	0 %	50 %	50 %	110835383
56088	NC_008260	TCC	2	6	2860578	2860583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110835383
56089	NC_008260	TGC	2	6	2860656	2860661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56090	NC_008260	GCA	2	6	2860675	2860680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56091	NC_008260	CTT	2	6	2860744	2860749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835383
56092	NC_008260	AG	3	6	2860923	2860928	50 %	0 %	50 %	0 %	110835383
56093	NC_008260	CGG	2	6	2861147	2861152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110835383
56094	NC_008260	GTAC	2	8	2861178	2861185	25 %	25 %	25 %	25 %	110835383
56095	NC_008260	ATC	2	6	2861240	2861245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835383
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56100	NC_008260	CGG	2	6	2861471	2861476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110835383
56101	NC_008260	CTG	2	6	2861483	2861488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56102	NC_008260	ATA	2	6	2861508	2861513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110835383
56103	NC_008260	CA	3	6	2861564	2861569	50 %	0 %	0 %	50 %	110835383
56104	NC_008260	ACG	2	6	2861591	2861596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56105	NC_008260	CAC	2	6	2861629	2861634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835383
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56107	NC_008260	CAA	2	6	2861714	2861719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835383
56108	NC_008260	ACC	2	6	2861730	2861735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835383
56109	NC_008260	ACTGG	2	10	2861765	2861774	20 %	20 %	40 %	20 %	110835383
56110	NC_008260	CTG	3	9	2861797	2861805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56111	NC_008260	CAT	2	6	2861900	2861905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835383
56112	NC_008260	GAT	2	6	2861915	2861920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110835383
56113	NC_008260	CCA	2	6	2861929	2861934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835383
56114	NC_008260	AG	3	6	2862035	2862040	50 %	0 %	50 %	0 %	110835383
56115	NC_008260	CCA	2	6	2862043	2862048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835383
56116	NC_008260	CCG	2	6	2862148	2862153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110835383
56117	NC_008260	TTG	2	6	2862200	2862205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110835383
56118	NC_008260	GCG	2	6	2862319	2862324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110835383
56119	NC_008260	CTG	2	6	2862453	2862458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56120	NC_008260	A	7	7	2862467	2862473	100 %	0 %	0 %	0 %	110835383
56121	NC_008260	CTG	2	6	2862509	2862514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56122	NC_008260	T	6	6	2862574	2862579	0 %	100 %	0 %	0 %	110835383
56123	NC_008260	AACT	2	8	2862593	2862600	50 %	25 %	0 %	25 %	110835383
56124	NC_008260	CGT	2	6	2862613	2862618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835383
56125	NC_008260	A	6	6	2862735	2862740	100 %	0 %	0 %	0 %	110835383
56126	NC_008260	TCT	2	6	2862784	2862789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835383
56127	NC_008260	ATC	2	6	2862833	2862838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835383
56128	NC_008260	CTT	2	6	2862952	2862957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835383
56129	NC_008260	TCA	2	6	2862991	2862996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835383
56130	NC_008260	G	6	6	2863010	2863015	0 %	0 %	100 %	0 %	110835383
56131	NC_008260	AAT	2	6	2863070	2863075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110835383
56132	NC_008260	T	6	6	2863098	2863103	0 %	100 %	0 %	0 %	110835383
56133	NC_008260	GA	3	6	2863116	2863121	50 %	0 %	50 %	0 %	110835383
56134	NC_008260	GCA	2	6	2863346	2863351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835384
56135	NC_008260	CA	3	6	2863429	2863434	50 %	0 %	0 %	50 %	110835384
56136	NC_008260	CGT	2	6	2863545	2863550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835384
56137	NC_008260	CGAG	2	8	2863584	2863591	25 %	0 %	50 %	25 %	110835384
56138	NC_008260	CCG	2	6	2863595	2863600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110835384
56139	NC_008260	CCGGG	2	10	2863639	2863648	0 %	0 %	60 %	40 %	110835384
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56141	NC_008260	CCTGC	2	10	2863757	2863766	0 %	20 %	20 %	60 %	110835384
56142	NC_008260	CAA	2	6	2863769	2863774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835384
56143	NC_008260	GCA	2	6	2864032	2864037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835384
56144	NC_008260	CAT	2	6	2864054	2864059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835384
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56146	NC_008260	CCA	2	6	2864111	2864116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835384
56147	NC_008260	CCG	2	6	2864207	2864212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110835384
56148	NC_008260	AG	3	6	2864213	2864218	50 %	0 %	50 %	0 %	110835384
56149	NC_008260	CGGG	2	8	2864235	2864242	0 %	0 %	75 %	25 %	110835384
56150	NC_008260	ACA	2	6	2864288	2864293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835384
56151	NC_008260	GCC	2	6	2864299	2864304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110835384
56152	NC_008260	GCA	2	6	2864327	2864332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835384
56153	NC_008260	ATT	2	6	2864362	2864367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110835384
56154	NC_008260	TTA	2	6	2864456	2864461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56155	NC_008260	GGC	2	6	2864566	2864571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110835385
56156	NC_008260	GTT	2	6	2864578	2864583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110835385
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56165	NC_008260	AAGGAA	2	12	2865122	2865133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110835385
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56168	NC_008260	CCG	2	6	2865260	2865265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56169	NC_008260	CGT	2	6	2865435	2865440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835387
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56171	NC_008260	GCGA	2	8	2865552	2865559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56172	NC_008260	AT	3	6	2865591	2865596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56173	NC_008260	CATGG	2	10	2865603	2865612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56174	NC_008260	ACTT	2	8	2865615	2865622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56175	NC_008260	TTTA	2	8	2865628	2865635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56176	NC_008260	GCCC	2	8	2865666	2865673	0 %	0 %	25 %	75 %	110835388
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56179	NC_008260	CAC	2	6	2865771	2865776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835388
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56181	NC_008260	TTC	2	6	2865837	2865842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835388
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56188	NC_008260	ACC	2	6	2866110	2866115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56189	NC_008260	CT	3	6	2866142	2866147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56190	NC_008260	C	6	6	2866227	2866232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56191	NC_008260	A	8	8	2866255	2866262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56192	NC_008260	TTTTTC	2	12	2866287	2866298	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56193	NC_008260	CCGAC	2	10	2866299	2866308	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56194	NC_008260	GCCC	2	8	2866333	2866340	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56195	NC_008260	CAG	2	6	2866348	2866353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56199	NC_008260	CGT	2	6	2866479	2866484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56200	NC_008260	GAC	2	6	2866548	2866553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56202	NC_008260	GC	3	6	2866693	2866698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56203	NC_008260	AAC	2	6	2866730	2866735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110835389
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56221	NC_008260	GC	3	6	2867747	2867752	0 %	0 %	50 %	50 %	110835389
56222	NC_008260	TTC	2	6	2867875	2867880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835389
56223	NC_008260	GGTT	2	8	2867902	2867909	0 %	50 %	50 %	0 %	110835389
56224	NC_008260	CA	3	6	2867921	2867926	50 %	0 %	0 %	50 %	110835389
56225	NC_008260	CTG	2	6	2867929	2867934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56226	NC_008260	GAT	2	6	2867949	2867954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56227	NC_008260	GGA	2	6	2867963	2867968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56228	NC_008260	TGC	2	6	2867993	2867998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56229	NC_008260	A	6	6	2868075	2868080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56230	NC_008260	CCGG	2	8	2868092	2868099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56231	NC_008260	T	6	6	2868103	2868108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56232	NC_008260	TTGC	2	8	2868124	2868131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56233	NC_008260	TTA	2	6	2868140	2868145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110835390
56234	NC_008260	CTT	2	6	2868208	2868213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110835390
56235	NC_008260	ACC	2	6	2868258	2868263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835390
56236	NC_008260	CCA	2	6	2868330	2868335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835390
56237	NC_008260	TCG	2	6	2868336	2868341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835390
56238	NC_008260	CACC	2	8	2868409	2868416	25 %	0 %	0 %	75 %	110835390
56239	NC_008260	ATC	2	6	2868419	2868424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835390
56240	NC_008260	CCA	2	6	2868535	2868540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835390
56241	NC_008260	AGC	2	6	2868561	2868566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110835390
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56246	NC_008260	CCA	2	6	2868708	2868713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110835390
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56259	NC_008260	GC	3	6	2869324	2869329	0 %	0 %	50 %	50 %	110835390
56260	NC_008260	TTCAA	2	10	2869365	2869374	40 %	40 %	0 %	20 %	110835390
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56265	NC_008260	A	6	6	2869927	2869932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56268	NC_008260	CAC	2	6	2870001	2870006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56269	NC_008260	CAT	2	6	2870090	2870095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56301	NC_008260	TGC	2	6	2871836	2871841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835393
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56304	NC_008260	GC	3	6	2872230	2872235	0 %	0 %	50 %	50 %	110835394
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56474	NC_008260	TTA	2	6	2880926	2880931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110835402
56475	NC_008260	GCT	2	6	2880987	2880992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110835402
56476	NC_008260	GA	3	6	2881236	2881241	50 %	0 %	50 %	0 %	110835402
56477	NC_008260	ATC	3	9	2881310	2881318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110835402
56478	NC_008260	TGCA	2	8	2881336	2881343	25 %	25 %	25 %	25 %	110835402
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56481	NC_008260	GC	3	6	2881503	2881508	0 %	0 %	50 %	50 %	110835402
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