MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_004842	GCC	2	6	955367	955372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417099
19003	NC_004842	TC	3	6	955389	955394	0 %	50 %	0 %	50 %	56417099
19004	NC_004842	GGC	2	6	955435	955440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417099
19005	NC_004842	CAA	2	6	955505	955510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417099
19006	NC_004842	CGC	2	6	955563	955568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417099
19007	NC_004842	TGC	2	6	955596	955601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417099
19008	NC_004842	CAG	2	6	955608	955613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417099
19009	NC_004842	TCT	2	6	955620	955625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417099
19010	NC_004842	TACA	2	8	955643	955650	50 %	25 %	0 %	25 %	56417099
19011	NC_004842	TAAA	2	8	955730	955737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_004842	GCG	2	6	955967	955972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_004842	TGC	2	6	955988	955993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_004842	AC	3	6	956002	956007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19015	NC_004842	CGC	2	6	956021	956026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19016	NC_004842	GGC	2	6	956080	956085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19017	NC_004842	GCC	2	6	956089	956094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19018	NC_004842	CAC	2	6	956104	956109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19019	NC_004842	CCG	2	6	956122	956127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19020	NC_004842	ACACTT	2	12	956162	956173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_004842	TGA	2	6	956376	956381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417100
19022	NC_004842	ATG	2	6	956395	956400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417100
19023	NC_004842	CTT	3	9	956424	956432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417100
19024	NC_004842	CTG	3	9	956455	956463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417100
19025	NC_004842	CTG	2	6	956559	956564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417100
19026	NC_004842	ACC	2	6	956570	956575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417100
19027	NC_004842	TCCA	2	8	956600	956607	25 %	25 %	0 %	50 %	56417100
19028	NC_004842	AGCA	2	8	956752	956759	50 %	0 %	25 %	25 %	56417100
19029	NC_004842	CGT	2	6	956803	956808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417100
19030	NC_004842	C	6	6	956841	956846	0 %	0 %	0 %	100 %	56417100
19031	NC_004842	CAA	2	6	956937	956942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417100
19032	NC_004842	CT	3	6	956944	956949	0 %	50 %	0 %	50 %	56417100
19033	NC_004842	GGC	2	6	956975	956980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417100
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19035	NC_004842	TGCCT	2	10	957078	957087	0 %	40 %	20 %	40 %	56417100
19036	NC_004842	ATC	2	6	957088	957093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417100
19037	NC_004842	TGT	2	6	957099	957104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417100
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19039	NC_004842	ATT	2	6	957206	957211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417100
19040	NC_004842	TG	3	6	957219	957224	0 %	50 %	50 %	0 %	56417100
19041	NC_004842	A	7	7	957303	957309	100 %	0 %	0 %	0 %	56417100
19042	NC_004842	CCCT	2	8	957334	957341	0 %	25 %	0 %	75 %	56417100
19043	NC_004842	GTG	2	6	957361	957366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417100
19044	NC_004842	CTT	2	6	957532	957537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417100
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19046	NC_004842	TCG	2	6	957608	957613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417100
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19048	NC_004842	CTT	2	6	957840	957845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417100
19049	NC_004842	GC	3	6	957906	957911	0 %	0 %	50 %	50 %	56417100
19050	NC_004842	CAC	2	6	957936	957941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417100
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19052	NC_004842	CCA	2	6	958050	958055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417100
19053	NC_004842	CAC	2	6	958180	958185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417100
19054	NC_004842	AATGC	2	10	958325	958334	40 %	20 %	20 %	20 %	56417100
19055	NC_004842	GA	3	6	958378	958383	50 %	0 %	50 %	0 %	56417100
19056	NC_004842	TCT	2	6	958409	958414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417100
19057	NC_004842	TAT	2	6	958420	958425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417100
19058	NC_004842	CAG	2	6	958450	958455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417100
19059	NC_004842	CTG	2	6	958515	958520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417100
19060	NC_004842	AGG	2	6	958524	958529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417100
19061	NC_004842	CCT	2	6	958539	958544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417100
19062	NC_004842	CTCTT	2	10	958559	958568	0 %	60 %	0 %	40 %	56417100
19063	NC_004842	TTC	2	6	958595	958600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417100
19064	NC_004842	CTAT	2	8	958622	958629	25 %	50 %	0 %	25 %	56417100
19065	NC_004842	CCA	2	6	958665	958670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19066	NC_004842	TAC	2	6	958685	958690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19068	NC_004842	AGCA	2	8	958786	958793	50 %	0 %	25 %	25 %	56417101
19069	NC_004842	ATC	2	6	958807	958812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417101
19070	NC_004842	ATG	2	6	958934	958939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417101
19071	NC_004842	CGC	2	6	959035	959040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417101
19072	NC_004842	GC	3	6	959063	959068	0 %	0 %	50 %	50 %	56417101
19073	NC_004842	TGT	2	6	959122	959127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417101
19074	NC_004842	TA	3	6	959177	959182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19075	NC_004842	CGC	2	6	959238	959243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19076	NC_004842	TTG	2	6	959352	959357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19077	NC_004842	TTG	2	6	959392	959397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19078	NC_004842	TGA	2	6	959398	959403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19080	NC_004842	GGCC	2	8	959529	959536	0 %	0 %	50 %	50 %	56417102
19081	NC_004842	TGT	2	6	959640	959645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417102
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19083	NC_004842	ATC	2	6	959661	959666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417102
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19085	NC_004842	TCGC	2	8	959689	959696	0 %	25 %	25 %	50 %	56417102
19086	NC_004842	TGC	2	6	959745	959750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417102
19087	NC_004842	GAAA	2	8	959753	959760	75 %	0 %	25 %	0 %	56417102
19088	NC_004842	CA	3	6	959808	959813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19089	NC_004842	GC	3	6	959981	959986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19090	NC_004842	TATG	2	8	959990	959997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_004842	CTCC	2	8	959998	960005	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19092	NC_004842	AAT	2	6	960008	960013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_004842	AT	3	6	960044	960049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19094	NC_004842	CGTG	2	8	960076	960083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19095	NC_004842	TTTA	2	8	960157	960164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_004842	GTA	2	6	960187	960192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_004842	GAT	2	6	960202	960207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_004842	AGT	2	6	960225	960230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_004842	CTG	2	6	960339	960344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19100	NC_004842	CAT	2	6	960380	960385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19101	NC_004842	AAT	2	6	960416	960421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_004842	ATC	2	6	960435	960440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19103	NC_004842	ACC	2	6	960474	960479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19104	NC_004842	GCC	2	6	960480	960485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19105	NC_004842	GGC	2	6	960498	960503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19106	NC_004842	A	6	6	960651	960656	100 %	0 %	0 %	0 %	56417103
19107	NC_004842	ACT	2	6	960670	960675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417103
19108	NC_004842	ATG	2	6	960718	960723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417103
19109	NC_004842	ATTAC	2	10	960781	960790	40 %	40 %	0 %	20 %	56417103
19110	NC_004842	ATC	2	6	960813	960818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417103
19111	NC_004842	GCC	2	6	960825	960830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417103
19112	NC_004842	CCG	2	6	960832	960837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417103
19113	NC_004842	CCT	2	6	960847	960852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417103
19114	NC_004842	CCA	2	6	960889	960894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417103
19115	NC_004842	TAC	2	6	960953	960958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417103
19116	NC_004842	TAC	2	6	960977	960982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417103
19117	NC_004842	CTCTTA	2	12	961006	961017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56417103
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19120	NC_004842	AACA	2	8	961135	961142	75 %	0 %	0 %	25 %	56417103
19121	NC_004842	CT	3	6	961178	961183	0 %	50 %	0 %	50 %	56417104
19122	NC_004842	AAG	2	6	961295	961300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417104
19123	NC_004842	CG	3	6	961419	961424	0 %	0 %	50 %	50 %	56417104
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19372	NC_004842	ACA	2	6	972744	972749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19478	NC_004842	TGCA	2	8	978130	978137	25 %	25 %	25 %	25 %	56417121
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19494	NC_004842	CCA	2	6	979023	979028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417122
19495	NC_004842	CTA	2	6	979281	979286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417122
19496	NC_004842	TTCT	2	8	979295	979302	0 %	75 %	0 %	25 %	56417122
19497	NC_004842	A	6	6	979310	979315	100 %	0 %	0 %	0 %	56417122
19498	NC_004842	G	6	6	979326	979331	0 %	0 %	100 %	0 %	56417122
19499	NC_004842	CAG	2	6	979344	979349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417122
19500	NC_004842	GC	3	6	979370	979375	0 %	0 %	50 %	50 %	56417122

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