MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

< Previous12...3132333435363738394041...4849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_004842	TCT	2	6	879199	879204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417040
17502	NC_004842	CAT	2	6	879226	879231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417040
17503	NC_004842	GTA	2	6	879237	879242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417040
17504	NC_004842	TAC	2	6	879272	879277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417040
17505	NC_004842	GCT	2	6	879366	879371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417040
17506	NC_004842	CAG	2	6	879388	879393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417040
17507	NC_004842	CAG	2	6	879397	879402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417040
17508	NC_004842	AGC	2	6	879425	879430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417040
17509	NC_004842	ACA	2	6	879447	879452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417040
17510	NC_004842	CCA	2	6	879468	879473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417040
17511	NC_004842	TGG	2	6	879535	879540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417040
17512	NC_004842	TGG	2	6	879595	879600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417040
17513	NC_004842	TTA	2	6	879618	879623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417040
17514	NC_004842	CAG	2	6	879634	879639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417040
17515	NC_004842	CAG	2	6	879652	879657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417040
17516	NC_004842	TTC	2	6	879706	879711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417040
17517	NC_004842	TC	3	6	879722	879727	0 %	50 %	0 %	50 %	56417040
17518	NC_004842	CTT	2	6	879784	879789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417040
17519	NC_004842	ATA	2	6	879859	879864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417040
17520	NC_004842	ATG	2	6	879897	879902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417040
17521	NC_004842	ACA	2	6	879908	879913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417040
17522	NC_004842	ACA	2	6	879925	879930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417040
17523	NC_004842	CAT	2	6	879962	879967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417040
17524	NC_004842	TGC	3	9	880016	880024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417040
17525	NC_004842	TG	3	6	880053	880058	0 %	50 %	50 %	0 %	56417040
17526	NC_004842	C	11	11	880074	880084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17527	NC_004842	CCTG	2	8	880129	880136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17528	NC_004842	TTA	2	6	880159	880164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17529	NC_004842	A	6	6	880237	880242	100 %	0 %	0 %	0 %	56417041
17530	NC_004842	CGCA	2	8	880280	880287	25 %	0 %	25 %	50 %	56417041
17531	NC_004842	CAT	2	6	880355	880360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417041
17532	NC_004842	ATT	2	6	880376	880381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417041
17533	NC_004842	AGT	2	6	880503	880508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417041
17534	NC_004842	TACC	2	8	880626	880633	25 %	25 %	0 %	50 %	56417041
17535	NC_004842	CAT	2	6	880636	880641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417041
17536	NC_004842	CAA	2	6	880706	880711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417041
17537	NC_004842	GCA	2	6	880759	880764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417041
17538	NC_004842	TCA	2	6	880797	880802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417041
17539	NC_004842	CCG	2	6	880815	880820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417041
17540	NC_004842	ACC	2	6	880824	880829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417041
17541	NC_004842	CT	3	6	880841	880846	0 %	50 %	0 %	50 %	56417041
17542	NC_004842	CAA	2	6	880862	880867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417041
17543	NC_004842	TCC	2	6	880947	880952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417041
17544	NC_004842	ACT	2	6	880980	880985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417041
17545	NC_004842	ATC	2	6	881083	881088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417042
17546	NC_004842	TGGT	2	8	881089	881096	0 %	50 %	50 %	0 %	56417042
17547	NC_004842	TGT	2	6	881097	881102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417042
17548	NC_004842	ACG	2	6	881111	881116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417042
17549	NC_004842	TGGT	2	8	881123	881130	0 %	50 %	50 %	0 %	56417042
17550	NC_004842	G	6	6	881131	881136	0 %	0 %	100 %	0 %	56417042
17551	NC_004842	GC	3	6	881167	881172	0 %	0 %	50 %	50 %	56417042
17552	NC_004842	GTG	2	6	881266	881271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417042
17553	NC_004842	AGCA	2	8	881319	881326	50 %	0 %	25 %	25 %	56417042
17554	NC_004842	GT	3	6	881502	881507	0 %	50 %	50 %	0 %	56417042
17555	NC_004842	GTCA	2	8	881511	881518	25 %	25 %	25 %	25 %	56417042
17556	NC_004842	CA	3	6	881542	881547	50 %	0 %	0 %	50 %	56417042
17557	NC_004842	AGG	2	6	881548	881553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417042
17558	NC_004842	GA	3	6	881601	881606	50 %	0 %	50 %	0 %	56417042
17559	NC_004842	CCGG	2	8	881617	881624	0 %	0 %	50 %	50 %	56417042
17560	NC_004842	ACC	2	6	881709	881714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417042
17561	NC_004842	AGC	2	6	881728	881733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417042
17562	NC_004842	TTTTC	2	10	881785	881794	0 %	80 %	0 %	20 %	56417042
17563	NC_004842	CCT	2	6	881891	881896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417042
17564	NC_004842	CAT	2	6	881900	881905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417042
17565	NC_004842	AGA	2	6	881956	881961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417042
17566	NC_004842	CCA	2	6	881979	881984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417042
17567	NC_004842	GCA	2	6	882080	882085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417042
17568	NC_004842	CA	3	6	882166	882171	50 %	0 %	0 %	50 %	56417042
17569	NC_004842	AAG	2	6	882181	882186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417042
17570	NC_004842	GAG	2	6	882235	882240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417042
17571	NC_004842	CGTT	2	8	882305	882312	0 %	50 %	25 %	25 %	56417042
17572	NC_004842	AT	3	6	882330	882335	50 %	50 %	0 %	0 %	56417042
17573	NC_004842	TGAT	2	8	882344	882351	25 %	50 %	25 %	0 %	56417042
17574	NC_004842	GTT	2	6	882387	882392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417042
17575	NC_004842	AGG	2	6	882487	882492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417042
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17577	NC_004842	GGTT	2	8	882530	882537	0 %	50 %	50 %	0 %	56417042
17578	NC_004842	CA	3	6	882566	882571	50 %	0 %	0 %	50 %	56417042
17579	NC_004842	GA	3	6	882608	882613	50 %	0 %	50 %	0 %	56417042
17580	NC_004842	GTT	2	6	882630	882635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417042
17581	NC_004842	CAG	2	6	882696	882701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417042
17582	NC_004842	AGC	2	6	882759	882764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417042
17583	NC_004842	AGA	2	6	882783	882788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417042
17584	NC_004842	AGG	2	6	882845	882850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417042
17585	NC_004842	GCT	2	6	882892	882897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417042
17586	NC_004842	AGG	2	6	882898	882903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417042
17587	NC_004842	CAG	2	6	882920	882925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417042
17588	NC_004842	ATA	2	6	882940	882945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417042
17589	NC_004842	TAGC	2	8	882981	882988	25 %	25 %	25 %	25 %	56417042
17590	NC_004842	GCC	2	6	882994	882999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17591	NC_004842	GCT	2	6	883033	883038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17592	NC_004842	GCA	2	6	883077	883082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17593	NC_004842	GA	3	6	883091	883096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_004842	CACC	2	8	883107	883114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17595	NC_004842	GC	3	6	883118	883123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17596	NC_004842	GCG	3	9	883267	883275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17597	NC_004842	GC	3	6	883310	883315	0 %	0 %	50 %	50 %	56417043
17598	NC_004842	ACA	2	6	883316	883321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417043
17599	NC_004842	CGG	2	6	883326	883331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417043
17600	NC_004842	G	6	6	883330	883335	0 %	0 %	100 %	0 %	56417043
17601	NC_004842	GCCC	2	8	883590	883597	0 %	0 %	25 %	75 %	56417043
17602	NC_004842	CGT	2	6	883704	883709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417043
17603	NC_004842	GCG	2	6	883757	883762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417043
17604	NC_004842	TAC	2	6	883864	883869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417043
17605	NC_004842	TAA	2	6	883927	883932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417043
17606	NC_004842	GTA	2	6	883994	883999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417043
17607	NC_004842	TC	4	8	884081	884088	0 %	50 %	0 %	50 %	56417043
17608	NC_004842	TTG	2	6	884126	884131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417043
17609	NC_004842	GC	3	6	884216	884221	0 %	0 %	50 %	50 %	56417043
17610	NC_004842	CG	3	6	884265	884270	0 %	0 %	50 %	50 %	56417043
17611	NC_004842	AAT	2	6	884283	884288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17612	NC_004842	GTA	2	6	884358	884363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417044
17613	NC_004842	CTTC	2	8	884381	884388	0 %	50 %	0 %	50 %	56417044
17614	NC_004842	GAG	2	6	884436	884441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417044
17615	NC_004842	ACC	2	6	884479	884484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417044
17616	NC_004842	G	6	6	884506	884511	0 %	0 %	100 %	0 %	56417044
17617	NC_004842	CAA	2	6	884515	884520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417044
17618	NC_004842	GA	3	6	884549	884554	50 %	0 %	50 %	0 %	56417044
17619	NC_004842	GTG	2	6	884566	884571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417044
17620	NC_004842	C	6	6	884574	884579	0 %	0 %	0 %	100 %	56417044
17621	NC_004842	CAAG	2	8	884594	884601	50 %	0 %	25 %	25 %	56417044
17622	NC_004842	A	6	6	884607	884612	100 %	0 %	0 %	0 %	56417044
17623	NC_004842	CCT	2	6	884619	884624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417044
17624	NC_004842	TGG	2	6	884654	884659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417044
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17993	NC_004842	TCA	2	6	903316	903321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17994	NC_004842	CAC	2	6	903375	903380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17995	NC_004842	CAG	2	6	903394	903399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17997	NC_004842	CTC	2	6	903471	903476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17998	NC_004842	ACC	2	6	903558	903563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417064
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18000	NC_004842	ACA	2	6	903624	903629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417064

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